生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 767 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-04-16 |
Programmable Primer Switching for Regulating Enzymatic DNA Circuits
2024-02-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c12000
PMID:38286819
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研究论文 | 提出了一种称为引物切换调控的方法，通过引入可切换的导线来实现酶促DNA电路的可编程和灵活调控 | 引入了可切换的导线来调控酶促DNA电路，无需重构基本电路框架即可实现复杂电路功能 | 缺乏方便和简单的引物控制机制，限制了酶促DNA电路的发展 | 开发更灵活的引物调控方法以促进酶促DNA电路的发展 | 酶促DNA电路 | DNA计算 | NA | DNA链置换反应(SDRs) | NA | NA | NA |
| 42 | 2025-04-15 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Apr-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 本文设计了一种基于DNA的电路，用于在原生细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 设计了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路，使原生细胞能够感知并响应活细胞释放的信号，自主调节与活细胞的相互作用 | 未提及具体实验规模或实际应用中的潜在限制 | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导，编程期望的细胞行为 | 原生细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 43 | 2025-04-12 |
Leveraging Demethylase Activation in DNA Circuits to Overcome Signal Leakage for Reliable MicroRNA Bioimaging
2025-Apr-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412843
PMID:40211605
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研究论文 | 设计了一种去甲基化酶激活的DNA组装（DAD）电路，用于可靠且稳健地成像细胞microRNA | 通过整合杂交链反应（HCR）放大器系统的顺序激活，DAD电路显著提高了信噪比，实现了高灵敏度的miRNA检测 | NA | 开发一种可靠的细胞内microRNA生物成像方法 | 细胞microRNA | 生物医学工程 | 癌症 | DNA电路、杂交链反应（HCR） | NA | 生物分子数据 | NA |
| 44 | 2025-04-11 |
Low-cost and automated magnetic bead-based DNA data writing via digital microfluidics
2025-Apr-08, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00106d
PMID:40070261
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研究论文 | 本研究介绍了一种集成数字微流控（DMF）平台和E47 DNAzyme连接化学的低成本、自动化DNA数据写入方法 | 利用DNAzyme作为生物催化剂，实现室温下无酶连接过程，显著降低成本，并通过DNAzyme辅助的磁珠纯化方法简化了传统纯化步骤 | 目前仅为概念验证阶段，尚未进行大规模商业化应用测试 | 开发低成本、自动化的DNA数据存储解决方案 | DNA数据存储技术 | 数字微流控技术 | NA | 数字微流控（DMF）、DNAzyme连接化学 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 45 | 2025-04-10 |
Effective IDS Error Correction Algorithms for DNA Storage Channels with Multiple Output Sequences
2025-Apr-08, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3558853
PMID:40198284
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研究论文 | 本文研究了DNA数据存储中针对多输出序列的IDS错误的有效校正算法 | 提出了分段渐进匹配(SPM)算法、基于隐马尔可夫模型的同步解码算法(SDH)和迭代外部解码(IED)算法，显著降低了误码率(BER) | 未提及算法在实际DNA存储系统中的实现和测试结果 | 提高DNA数据存储系统的解码性能和可靠性 | DNA数据存储中的IDS错误校正 | 生物信息学 | NA | DNA数据存储技术 | LDPC码, 隐马尔可夫模型(HMM) | DNA序列数据 | NA |
| 46 | 2025-04-06 |
High fault-tolerant DNA image storage system based on VAE
2025-Feb-21, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3544401
PMID:40031865
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研究论文 | 提出了一种基于VAE的高容错DNA图像存储系统，用于DNA存储中的图像压缩 | 1) 使用VAE将图像压缩为统一大小的潜在变量块，并通过SVD进一步压缩；2) 对潜在变量块中的浮点数进行量化，并对生成的三元序列应用旋转编码；3) 优化纠错方案以最佳恢复每种类型的错误 | 未提及具体实验样本量或实际应用中的潜在问题 | 降低基于DNA存储的图像压缩的错误率 | 图像数据 | 机器学习 | NA | VAE, SVD, 旋转编码 | VAE | 图像 | NA |
| 47 | 2025-04-03 |
Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform
2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309867
PMID:38048539
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研究论文 | 介绍了一种使用微流控超大规模集成（mVLSI）平台从DNA存储中快速检索信息的方法 | 利用mVLSI平台实现高度并行和快速的DNA数据读取，并通过芯片熔解曲线分析解码DNA中的多状态数据 | 未提及该方法在成本、准确率或大规模应用中的具体表现 | 开发一种快速、高效的DNA数据检索技术 | DNA存储的数据 | 生物技术 | NA | 微流控超大规模集成（mVLSI）平台、DNA识别、熔解曲线分析 | NA | DNA数据 | NA |
| 48 | 2025-03-29 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
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研究论文 | 本文开发了一种基于空间控制的邻近分裂镊子开关（PST）策略，用于增强DNA电路构建和多功能转导 | 利用双链镊子的刚性和发夹锁的阻碍效应，有效减少电路泄漏，并设计独立于目标结合序列的自由输出链，实现对多种靶标的适应性 | NA | 开发一种新型DNA电路构建和信号转导策略，以增强复杂核酸电路的构建和多功能转导 | DNA链置换反应和核酸电路 | 生物分子工程 | NA | DNA链置换反应 | NA | 核酸序列 | NA |
| 49 | 2025-03-27 |
A generative adversarial network for multiple reads reconstruction in DNA storage
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83806-5
PMID:39738820
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research paper | 该论文提出了一种基于生成对抗网络（GAN）的方法，用于DNA存储中多读数的重建，以解决测序过程中的错误问题 | 首次将GAN应用于DNA存储中的多读数重建，相比传统方法在第三代测序技术中表现更优 | 仅在两套真实数据集上进行了测试，未在其他数据集上验证其泛化能力 | 解决DNA存储中由于合成、PCR和测序过程导致的错误读数问题 | DNA存储中的多读数数据 | machine learning | NA | 第三代纳米孔测序技术 | GAN | DNA序列数据 | 两套真实数据集 |
| 50 | 2025-03-21 |
pH-Controlled DNA Switching Circuits with Multi-State Responsiveness for Logic Computation and Control
2025-Mar-20, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404541
PMID:39876816
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研究论文 | 本文提出了一种pH控制的多状态DNA开关电路构建策略，通过三链体的构象转变实现三种状态之间的动态调控，并构建了可切换的DNA电路用于逻辑计算和杂交链式反应（HCR）的控制 | 提出了一种pH控制的多状态DNA开关电路构建策略，能够通过三链体的构象转变实现三种状态之间的动态调控，并应用于逻辑计算和HCR的编程控制 | NA | 实现DNA电路功能的动态调控，构建复杂的化学反应网络（CRNs）以实现复杂功能 | DNA电路 | 生物计算 | NA | DNA开关电路，杂交链式反应（HCR） | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-03-21 |
Solving Minimum Spanning Tree Problems Based on DNA Chemical Reaction Networks
2025-Mar-18, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本文探讨了利用DNA链置换反应网络解决最小生成树问题，并提出了基于DNA链置换反应的计算模型 | 创新点在于将DNA链置换反应网络应用于解决图论中的最小生成树问题，并提出了一个基于DNA链置换反应的计算模型 | NA | 研究目的是探索DNA链置换反应网络在图论问题中的应用，特别是最小生成树问题 | 最小生成树问题 | 生物计算 | NA | DNA链置换反应 | 基于DNA链置换反应的计算模型 | DNA序列 | NA |
| 52 | 2025-03-13 |
A Multi-Input Molecular Classifier Based on Digital DNA Strand Displacement for Disease Diagnostics
2025-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202413198
PMID:39891016
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研究论文 | 本文介绍了一种基于数字DNA链置换（DDSD）的多输入分子分类器，用于疾病诊断 | 开发了DDSD方法，显著减少了使用的寡核苷酸种类，提供了稳健的分子分类器，并在临床血液样本中实现了高准确率 | NA | 提高基于价态的智能分子诊断和多路生物标志物检测的能力 | 细菌和病毒感染以及病原体类型的识别 | 分子计算 | 感染性疾病 | 数字DNA链置换（DDSD） | 分子分类器 | DNA序列 | 临床血液样本 |
| 53 | 2025-03-13 |
Converting an allocentric goal into an egocentric steering signal
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07006-3
PMID:38326612
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研究论文 | 本文描述了果蝇中央复合体中的一个神经元回路，该回路通过比较内部生成的头向角和目标角来生成以身体为中心的转向信号 | 揭示了果蝇大脑中如何将两个群体水平的外中心信号进行比较，以产生适合运动控制的内中心输出信号 | 研究仅限于果蝇模型，尚未在其他物种中验证 | 研究果蝇大脑中神经元回路如何将外中心目标转换为内中心转向信号 | 果蝇的神经元回路 | 神经科学 | NA | 光遗传学 | 神经元回路模型 | 神经元活动数据 | 果蝇 |
| 54 | 2025-03-05 |
Family of Mutually Uncorrelated Codes for DNA Storage Address Design
2025-Jan-16, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3530470
PMID:40030887
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研究论文 | 本文提出了一系列基于k-弱互不相关（k-WMU）码的方法，用于设计DNA存储的地址序列，以提高DNA存储的访问效率 | 提出了一种结合k-WMU码的0-m-统治编码方案，使地址序列避免生成二级结构，并扩展了k-WMU码以具备纠错功能，同时满足组合生物学约束 | 未提及具体实验样本量及实际应用中的验证结果 | 提高DNA存储系统的访问效率和鲁棒性 | DNA存储地址序列 | DNA存储 | NA | k-弱互不相关（k-WMU）码，0-m-统治编码方案 | NA | DNA序列 | NA |
| 55 | 2025-03-05 |
Biotechnological tools boost the functional diversity of DNA-based data storage systems
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.02.002
PMID:40027441
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研究论文 | 本文总结了生物技术工具如何基于DNA分子的序列特异性、封装和高维结构，促进DNA数据存储系统中各种功能的实现 | 探讨了生物技术工具在DNA数据存储系统中的创新应用，包括随机访问、搜索和数据操作等功能 | 使用生化反应限制了更精确和高效信息存储系统的发展 | 研究DNA数据存储系统的功能多样性和效率提升 | DNA分子及其在数据存储中的应用 | 生物技术 | NA | DNA序列特异性、封装、高维结构 | NA | DNA数据 | NA |
| 56 | 2025-03-01 |
Three-Point-Star Deoxyribonucleic Acid Tiles with the Core Arm Length at Three Half-Turns for Two-Dimensional Archimedean Tilings and Beyond
2024-05-14, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.4c00985
PMID:38686650
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研究论文 | 本文报道了使用新型三点星DNA瓦片构建二维阿基米德镶嵌图案及复杂镶嵌图案的研究 | 提出了一种新型三点星DNA瓦片（3PSO），并通过与四点星DNA瓦片（4PSO）和两点星DNA瓦片（2PSO）的组合，实现了复杂的镶嵌图案 | 未明确提及研究的局限性 | 探索DNA瓦片在纳米制造、纳米电子学、纳米光子学、生物医学传感、药物递送和治疗等领域的应用 | 三点星DNA瓦片（3PSO）及其与四点星DNA瓦片（4PSO）和两点星DNA瓦片（2PSO）的组合 | 纳米技术 | NA | DNA自组装技术 | NA | NA | NA |
| 57 | 2025-02-25 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 该方法结合了光响应性o-硝基苄基磷酸酯笼状DNA发夹与“静默”反应模块，实现了对DNA电路/网络动态瞬态操作的光调控 | NA | 研究目的是开发一种光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 研究对象是DNA反应电路和网络 | 生物化学 | NA | 光调控技术 | 计算动力学模型 | 实验数据 | NA |
| 58 | 2025-02-23 |
Programming and monitoring surface-confined DNA computing
2024-02, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.107080
PMID:38183684
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综述 | 本文系统回顾了基于表面的DNA计算系统的计算生物分子相互作用及其操作方法，并描述了这些系统的监测技术和应用 | 本文详细探讨了表面限制的DNA计算系统相较于溶液基系统的优势，如更高的特异性和计算速度 | 讨论了表面限制DNA计算的优势和挑战，但未具体指出其局限性 | 探讨基于表面的DNA计算系统的计算生物分子相互作用及其应用 | DNA origamis、纳米颗粒、脂质膜和芯片等表面限制的DNA计算系统 | 分子计算 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 59 | 2025-02-21 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种利用流式细胞术分选技术保护和检索DNA存储过程中数据的方法，通过封装荧光DNA微粒增强其稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞术分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装荧光DNA微粒以增强其稳定性和序列完整性 | 未提及具体的数据存储容量和长期稳定性测试的时间范围 | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞术分选（FCS），层层自组装 | NA | DNA数据 | 未提及具体样本数量 |
| 60 | 2025-02-21 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 本文介绍了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于体内微RNA成像和光热治疗 | 该平台通过近红外激光功率的变化实现时空控制的miRNA-21成像和成像引导的光热治疗，创新性地结合了光热转换和熵驱动链置换反应 | NA | 开发一种能够实现时空选择性miRNA成像和成像引导治疗的纳米诊疗平台，用于精确癌症诊断和高效治疗 | miRNA-21 | 生物医学工程 | 癌症 | 光热转换技术、熵驱动链置换反应 | NA | 荧光信号 | NA |