生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 723 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
Storing Images in DNA via base128 Encoding
2024-03-11, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.3c01592
PMID:38385334
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研究论文 | 本文提出了一种通过base128编码将图像存储在DNA中的方法（DNA-base128），以提高图像存储的稳定性和重建率 | DNA-base128编码方法通过数据分割、概率统计和约束编码集关联，实现了内部错误纠正，减少了不期望的基序并降低了局部GC含量变异 | NA | 提高DNA存储方案在处理高度冗余和相关图像数据时的灵活性和一致性 | 图像数据的存储和重建 | 生物信息学 | NA | base128编码 | NA | 图像 | 未具体说明样本数量 |
| 82 | 2024-08-05 |
Spatially Localized Entropy-Driven Evolution of Nucleic Acid-Based Constitutional Dynamic Networks for Intracellular Imaging and Spatiotemporal Programmable Gene Therapy
2024-Jul-31, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c03651
PMID:39012486
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研究论文 | 介绍了一种基于DNA的宪法动态网络的熵驱动高通量进化，用于癌细胞的内源成像和空间编程基因治疗 | 提出了一种可编程的空间局部DNA电路，能够在肿瘤细胞内实现基因调控治疗 | 未提及研究的具体局限性 | 研究基于DNA的动态网络在癌细胞治疗中的应用 | 主要针对乳腺癌细胞和肿瘤-bearing小鼠进行实验 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DNA电路 | NA | NA | 涉及肿瘤-bearing小鼠 |
| 83 | 2024-08-05 |
Intelligent Cell Profiling and Precision Release: Multimolecular Marker-Activated Transmembrane DNA Computing Nanosystem
2024-05-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c01122
PMID:38691774
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研究论文 | 本研究开发了多分子标记激活的跨膜DNA计算系统（MTD）用于准确分类肿瘤细胞 | MTD系统利用细胞膜作为原生门控，能够直接在简单的空间事件后输出信号，省去了多步骤信号转换的需求 | NA | 提高肿瘤细胞的分类精度，以便于癌症诊断和治疗 | 主要针对MCF-7细胞及其他三种癌细胞系（HeLa和HepG2）进行研究 | 数字病理学 | 癌症 | DNA计算 | AND-AND逻辑门控制系统 | 影像信号 | 涉及四种细胞（MCF-7, HeLa, HepG2, 和 MCF-10A）的混合群体 |
| 84 | 2024-08-05 |
Spherical Nucleic Acid-Mediated Spatial Matching-Guided Nonenzymatic DNA Circuits for the Prediction and Prevention of Malignant Tumor Invasion
2024-05-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c00476
PMID:38663871
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研究论文 | 这篇文章展示了一种基于金纳米颗粒的球形核酸介导的空间匹配引导非酶DNA电路，用于有效筛查细胞内miRNA | 提出了一种新型的DNA电路，具有显著增强的核酸酶抵抗力和信号放大能力 | 在复杂生物介质中的表现尚未充分验证 | 精准预测和及时防止肿瘤发生 | 细胞内miRNA的检测，特别是活体内miRNA的成像 | 数字病理学 | 恶性肿瘤 | 金纳米颗粒 | 非酶DNA电路 | 荧光信号 | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
Endogenous AND Logic DNA Nanomachine for Highly Specific Cancer Cell Imaging
2024-05-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c00211
PMID:38656919
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研究论文 | 本研究构建了一种内源性AND逻辑DNA纳米机器，实现对癌细胞的高特异性成像 | 该研究结合了内源性酶驱动策略与逻辑响应和局部信号放大能力，克服了单一生物标志物传感策略的限制 | 局部DNA电路在特定影像癌细胞的能力受限于与单一生物标志物感应策略相关的信号泄漏问题 | 本研究旨在提高癌细胞成像的特异性以改善癌症的临床诊断和预后研究 | 研究对象为携带特定癌症相关生物标志物的癌细胞 | 数字病理学 | 癌症 | DNA电路 | 内源性AND逻辑DNA纳米机器 | 荧光信号 | NA |
| 86 | 2024-08-05 |
Multiply Guaranteed Catalytic DNA Circuit for Cancer-Cell-Selective Imaging of miRNA and Robust Evaluation of Drug Resistance
2024-04-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c00018
PMID:38529650
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研究论文 | 提出了一种新颖的DNA电路激活策略，用于选择性成像细胞内miRNA和评估药物耐药性 | 利用DNA修复酶（APE1）激活策略，增强了miRNA探测的信号与背景比，并提高了癌细胞的选择性成像 | 未提及特定的局限性 | 实现癌细胞选择性成像和药物耐受性评估的工具开发 | 研究癌细胞中的miRNA及其在药物耐药性中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | DNA电路 | NA | 荧光信号 | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
Explorer: efficient DNA coding by De Bruijn graph toward arbitrary local and global biochemical constraints
2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae363
PMID:39073829
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研究论文 | 本文提出了一种基于De Bruijn图的高效DNA编码算法Explorer。 | Explorer能够在各种生化约束下进行编码，同时提高编码效率和比特率，Codeformer显示出在解码效率上超越传统算法的能力。 | NA | 旨在开发高效的DNA编码方法以应对信息存储的挑战。 | 针对DNA存储中的复杂生化约束进行编码和解码的算法。 | 数字病理学 | NA | DNA编码 | Transformer | 序列 | NA |
| 88 | 2024-08-05 |
Bioinspired bio-voltage memristors
2020-04-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-15759-y
PMID:32313096
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研究论文 | 本研究展示了一种利用来自细菌Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线制造的扩散型忆阻器，其能够在生物电压下工作 | 首次展示了一种能够在40-100 mV生物电压下工作的忆阻器，且其性能接近生物神经元 | 未提及此忆阻器在其他生物系统中的应用效果 | 研究和开发在生物电压下工作的忆阻器，以模仿生物计算 | 探讨以Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线为基础的忆阻器的特性与功能 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 电压信号 | NA |
| 89 | 2024-08-05 |
Integrating Genomics into the Care of People with Palliative Needs: A Global Scoping Review of Policy Recommendations
2023, Public health genomics
IF:1.3Q4
DOI:10.1159/000527963
PMID:36380618
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研究论文 | 这篇文章回顾了与姑息护理需求患者整合基因组学的政策建议 | 发现将基因组学整合到姑息护理中的政策缺口 | 缺乏政策指导可能导致健康服务资金的不足，从而影响基因组学的应用 | 识别与姑息护理患者及其家庭整合基因组学的政策建议 | 涉及姑息护理和基因组政策的相关政策文件 | NA | NA | NA | NA | 政策文件 | 78个政策 |
| 90 | 2024-08-05 |
DNA nanotechnology assisted nanopore-based analysis
2020-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa095
PMID:32083656
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综述 | 本综述总结了DNA纳米技术在纳米孔分析中的应用潜力 | 本文创新点在于将DNA载体和DNA折纸结构结合，以提高纳米孔传感技术的能力和分辨率 | 本文未详细讨论纳米孔技术在实际应用中的所有挑战和局限性 | 探讨DNA纳米技术如何推动纳米孔检测技术的发展 | 相关的最新研究成果及其在纳米孔技术中的应用 | 纳米技术 | NA | 纳米孔技术 | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-05 |
Combinatorial constraint coding based on the EORS algorithm in DNA storage
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0255376
PMID:34324571
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研究论文 | 本文提出了一种基于EORS算法的DNA存储编码方法 | 提出的编码方法满足Hamming距离、GC含量和无运行长度约束，能够降低存储中的错误率 | 可能未充分探讨不同类型DNA合成和测序中的具体错误类型 | 解决DNA存储中数据编码的有效性问题 | 研究了使用EORS算法的DNA存储编码 | 数字病理学 | NA | EORS算法 | NA | NA | 通过模拟实验构建的DNA存储编码集 |
| 92 | 2024-08-05 |
High capacity DNA data storage with variable-length Oligonucleotides using repeat accumulate code and hybrid mapping
2019, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-019-0211-2
PMID:31832092
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研究论文 | 本文提出了一种使用变长寡核苷酸的高容量DNA数据存储方案 | 提出了一种新的编码系统，结合混合DNA映射方案和寡核苷酸级的重复累积编码，有效解决数据损失和腐败问题 | 未提及具体的实验范围限制 | 探讨高容量DNA数据存储的实用实施 | 开发一种新的DNA数据存储方案以提高信息容量 | 数字病理学 | NA | DNA映射 | NA | 数字数据 | 379.1 KB的数据 |
| 93 | 2024-08-05 |
Comparative Study of DNA Circuit System-Based Proportional and Exponential Amplification Strategies for Enzyme-Free and Rapid Detection of miRNA at Room Temperature
2018-Mar-31, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.7b01866
PMID:30023866
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研究论文 | 该研究比较了基于DNA电路系统的比例和指数放大策略在室温下快速检测miRNA的性能 | 提出了无酶等温检测系统，并展示了指数放大DNA电路系统在灵敏度和检测时间方面的优势 | 指数放大DNA电路系统在荧光噪声信号方面表现较差，存在泄漏反应的问题 | 开发基于循环miRNA的快速检测点-of-care测试系统 | 主要研究对象是靶miRNA（miR-141） | 数字病理学 | NA | 无酶等温检测系统 | DNA电路系统 | 荧光信号 | NA |
| 94 | 2024-08-05 |
Selective Activation of Cascade Assembly Amplification for DNA Methyltransferase Detection Using a Double-Loop Interlocked DNA Circuit
2024-Jul-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c02498
PMID:39024185
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研究论文 | 本研究设计了一个动态的DNA纳米设备，用于精确监测DNA腺苷甲基转移酶的活性 | 创新性地设计了一种双环互锁DNA电路，具备出色的灵敏度、特异性和稳定性 | 现有技术依赖DNA识别探针，易受DNA降解影响，且目标灵敏度和特异性有限 | 研究DNA腺苷甲基转移酶的活性监测方法 | 监测DNA腺苷甲基转移酶在复杂生物环境中的活性 | 数字病理学 | NA | DNA纳米技术 | 双环互锁DNA电路 | NA | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
A Janus-inspired amphichromatic system that kills two birds with one stone for operating a "DNA Janus Logic Pair" (DJLP) library
2019-Aug-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c9sc01865d
PMID:31588299
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研究论文 | 本文提出了一种受Janus启发的DNA Janus逻辑对(DJLP)库的双重操作系统 | 首次提出的DJLP概念将相反功能的DNA逻辑门分类为积极和消极，显著提升了操作效率和可视化输出 | 未明确说明系统在极端条件下的表现或局限性 | 研究目的在于改善现有DNA逻辑门的运行效率和可视化能力 | 该研究对象为具有不同功能的DNA逻辑门 | 计算机视觉 | NA | G-quadruplex DNAzyme (G4zyme) 及氧化3,3',5,5'-四甲基苯氨基(TMB) | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-05 |
Photonic crystal-enhanced fluorescence biosensor with logic gate operation based on one-pot cascade amplification DNA circuit for enzyme-free and ultrasensitive analysis of two microRNAs
2024-Sep-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.126428
PMID:38897009
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研究论文 | 开发了一种基于一锅级联扩增DNA电路的光子晶体增强荧光生物传感器，用于无酶和超灵敏分析两种微小RNA | 创新性地结合了生化识别扩增模块和物理增强模块，实现了双重逻辑门操作 | 在实际应用中可能仍需验证其适用性和稳定性 | 提高肿瘤早期筛查中微小RNA的检测灵敏度和操作简单性 | 针对两种与癌症相关的微小RNA进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 荧光传感器 | NA | 荧光信号 | NA |
| 97 | 2024-08-05 |
Neural Network Circuits for Bionic Associative Memory and Temporal Order Memory Based on DNA Strand Displacement
2024-Jul-16, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3425060
PMID:39012737
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研究论文 | 该文章构建了基于DNA链置换的仿生关联记忆和时间顺序记忆电路 | 通过DNA链置换反应实现了DNA分子层面的Pavlovian关联记忆，拓展了生物计算的发展和神经网络的应用场景 | NA | 探讨在DNA分子层面实现关联记忆和时间顺序记忆的可能性 | DNA链置换反应构建的各种记忆电路 | 计算机视觉 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-05 |
Erasable and Field Programmable DNA Circuits Based on Configurable Logic Blocks
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400011
PMID:38698560
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研究论文 | 该文章提出了一种基于可配置逻辑块的可擦除现场可编程DNA电路 | 该电路通过使用操作控制信号的夹子链条实现了可擦除和现场可编程的功能，能高效实现多种逻辑操作 | 目前仅展示了基本的与二进制计算相关的操作，可能缺乏其他复杂电路的示范 | 研究和开发一种新的可编程DNA电路，提高其在实际应用中的可行性 | 本研究对象是基于可配置逻辑块的DNA电路 | 数字病理学 | NA | DNA电路设计 | 可配置逻辑块 | NA | NA |
| 99 | 2024-08-05 |
High-Risk Sequence Prediction Model in DNA Storage: The LQSF Method
2024-Jul-08, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3424576
PMID:38976468
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研究论文 | 本文介绍了一种利用深度学习模型预测高风险序列的LQSF方法，以改善传统DNA存储技术中的错误修正问题 | LQSF方法通过主动过滤低质量序列，在编码阶段引入了积极的序列过滤，这是对传统方法的重大改进 | 未提及具体的限制因素 | 改善DNA存储技术中的错误修正，提高存储效率 | 高风险序列的预测与低质量序列的过滤 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 神经网络 | 序列数据 | 在多个数据集上进行了广泛的训练和测试，具体样本数量未提供 |
| 100 | 2024-08-05 |
An Exo III-powered closed-loop DNA circuit architecture for biosensing/imaging
2024-06-14, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-024-06476-0
PMID:38877347
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研究论文 | 本研究提出了一种Exo III驱动的闭环DNA电路架构，用于生物传感和成像 | 提出了一种新的Exo III驱动闭环DNA电路架构，集成了四个高效的AND逻辑门，提高了电路的操作效率与应用范围 | NA | 本研究旨在提高DNA逻辑电路的操作效率并扩展其应用领域 | 利用设计好的ECDC架构在体外智能确定miR-21 | 数字病理学 | 癌症 | DNA电路 | AND逻辑门 | NA | NA |