生物计算机与DNA存储相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2024-08-05	Endogenous AND Logic DNA Nanomachine for Highly Specific Cancer Cell Imaging 2024-05-07, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c00211 PMID:38656919	研究论文	本研究构建了一种内源性AND逻辑DNA纳米机器，实现对癌细胞的高特异性成像	该研究结合了内源性酶驱动策略与逻辑响应和局部信号放大能力，克服了单一生物标志物传感策略的限制	局部DNA电路在特定影像癌细胞的能力受限于与单一生物标志物感应策略相关的信号泄漏问题	本研究旨在提高癌细胞成像的特异性以改善癌症的临床诊断和预后研究	研究对象为携带特定癌症相关生物标志物的癌细胞	数字病理学	癌症	DNA电路	内源性AND逻辑DNA纳米机器	荧光信号	NA
62	2024-08-05	Multiply Guaranteed Catalytic DNA Circuit for Cancer-Cell-Selective Imaging of miRNA and Robust Evaluation of Drug Resistance 2024-04-09, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c00018 PMID:38529650	研究论文	提出了一种新颖的DNA电路激活策略，用于选择性成像细胞内miRNA和评估药物耐药性	利用DNA修复酶（APE1）激活策略，增强了miRNA探测的信号与背景比，并提高了癌细胞的选择性成像	未提及特定的局限性	实现癌细胞选择性成像和药物耐受性评估的工具开发	研究癌细胞中的miRNA及其在药物耐药性中的作用	数字病理学	癌症	DNA电路	NA	荧光信号	NA
63	2024-08-05	Explorer: efficient DNA coding by De Bruijn graph toward arbitrary local and global biochemical constraints 2024-Jul-25, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1 DOI:10.1093/bib/bbae363 PMID:39073829	研究论文	本文提出了一种基于De Bruijn图的高效DNA编码算法Explorer。	Explorer能够在各种生化约束下进行编码，同时提高编码效率和比特率，Codeformer显示出在解码效率上超越传统算法的能力。	NA	旨在开发高效的DNA编码方法以应对信息存储的挑战。	针对DNA存储中的复杂生化约束进行编码和解码的算法。	数字病理学	NA	DNA编码	Transformer	序列	NA
64	2024-08-05	Bioinspired bio-voltage memristors 2020-04-20, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-020-15759-y PMID:32313096	研究论文	本研究展示了一种利用来自细菌Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线制造的扩散型忆阻器，其能够在生物电压下工作	首次展示了一种能够在40-100 mV生物电压下工作的忆阻器，且其性能接近生物神经元	未提及此忆阻器在其他生物系统中的应用效果	研究和开发在生物电压下工作的忆阻器，以模仿生物计算	探讨以Geobacter sulfurreducens的蛋白质纳米线为基础的忆阻器的特性与功能	计算机视觉	NA	NA	NA	电压信号	NA
65	2024-08-05	Integrating Genomics into the Care of People with Palliative Needs: A Global Scoping Review of Policy Recommendations 2023, Public health genomics IF:1.3Q4 DOI:10.1159/000527963 PMID:36380618	研究论文	这篇文章回顾了与姑息护理需求患者整合基因组学的政策建议	发现将基因组学整合到姑息护理中的政策缺口	缺乏政策指导可能导致健康服务资金的不足，从而影响基因组学的应用	识别与姑息护理患者及其家庭整合基因组学的政策建议	涉及姑息护理和基因组政策的相关政策文件	NA	NA	NA	NA	政策文件	78个政策
66	2024-08-05	DNA nanotechnology assisted nanopore-based analysis 2020-04-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaa095 PMID:32083656	综述	本综述总结了DNA纳米技术在纳米孔分析中的应用潜力	本文创新点在于将DNA载体和DNA折纸结构结合，以提高纳米孔传感技术的能力和分辨率	本文未详细讨论纳米孔技术在实际应用中的所有挑战和局限性	探讨DNA纳米技术如何推动纳米孔检测技术的发展	相关的最新研究成果及其在纳米孔技术中的应用	纳米技术	NA	纳米孔技术	NA	NA	NA
67	2024-08-05	Combinatorial constraint coding based on the EORS algorithm in DNA storage 2021, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0255376 PMID:34324571	研究论文	本文提出了一种基于EORS算法的DNA存储编码方法	提出的编码方法满足Hamming距离、GC含量和无运行长度约束，能够降低存储中的错误率	可能未充分探讨不同类型DNA合成和测序中的具体错误类型	解决DNA存储中数据编码的有效性问题	研究了使用EORS算法的DNA存储编码	数字病理学	NA	EORS算法	NA	NA	通过模拟实验构建的DNA存储编码集
68	2024-08-05	High capacity DNA data storage with variable-length Oligonucleotides using repeat accumulate code and hybrid mapping 2019, Journal of biological engineering IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13036-019-0211-2 PMID:31832092	研究论文	本文提出了一种使用变长寡核苷酸的高容量DNA数据存储方案	提出了一种新的编码系统，结合混合DNA映射方案和寡核苷酸级的重复累积编码，有效解决数据损失和腐败问题	未提及具体的实验范围限制	探讨高容量DNA数据存储的实用实施	开发一种新的DNA数据存储方案以提高信息容量	数字病理学	NA	DNA映射	NA	数字数据	379.1 KB的数据
69	2024-08-05	Comparative Study of DNA Circuit System-Based Proportional and Exponential Amplification Strategies for Enzyme-Free and Rapid Detection of miRNA at Room Temperature 2018-Mar-31, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.7b01866 PMID:30023866	研究论文	该研究比较了基于DNA电路系统的比例和指数放大策略在室温下快速检测miRNA的性能	提出了无酶等温检测系统，并展示了指数放大DNA电路系统在灵敏度和检测时间方面的优势	指数放大DNA电路系统在荧光噪声信号方面表现较差，存在泄漏反应的问题	开发基于循环miRNA的快速检测点-of-care测试系统	主要研究对象是靶miRNA（miR-141）	数字病理学	NA	无酶等温检测系统	DNA电路系统	荧光信号	NA
70	2024-08-05	Selective Activation of Cascade Assembly Amplification for DNA Methyltransferase Detection Using a Double-Loop Interlocked DNA Circuit 2024-Jul-18, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c02498 PMID:39024185	研究论文	本研究设计了一个动态的DNA纳米设备，用于精确监测DNA腺苷甲基转移酶的活性	创新性地设计了一种双环互锁DNA电路，具备出色的灵敏度、特异性和稳定性	现有技术依赖DNA识别探针，易受DNA降解影响，且目标灵敏度和特异性有限	研究DNA腺苷甲基转移酶的活性监测方法	监测DNA腺苷甲基转移酶在复杂生物环境中的活性	数字病理学	NA	DNA纳米技术	双环互锁DNA电路	NA	NA
71	2024-08-05	A Janus-inspired amphichromatic system that kills two birds with one stone for operating a "DNA Janus Logic Pair" (DJLP) library 2019-Aug-14, Chemical science IF:7.6Q1 DOI:10.1039/c9sc01865d PMID:31588299	研究论文	本文提出了一种受Janus启发的DNA Janus逻辑对(DJLP)库的双重操作系统	首次提出的DJLP概念将相反功能的DNA逻辑门分类为积极和消极，显著提升了操作效率和可视化输出	未明确说明系统在极端条件下的表现或局限性	研究目的在于改善现有DNA逻辑门的运行效率和可视化能力	该研究对象为具有不同功能的DNA逻辑门	计算机视觉	NA	G-quadruplex DNAzyme (G4zyme) 及氧化3,3',5,5'-四甲基苯氨基(TMB)	NA	NA	NA
72	2024-08-05	Photonic crystal-enhanced fluorescence biosensor with logic gate operation based on one-pot cascade amplification DNA circuit for enzyme-free and ultrasensitive analysis of two microRNAs 2024-Sep-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.126428 PMID:38897009	研究论文	开发了一种基于一锅级联扩增DNA电路的光子晶体增强荧光生物传感器，用于无酶和超灵敏分析两种微小RNA	创新性地结合了生化识别扩增模块和物理增强模块，实现了双重逻辑门操作	在实际应用中可能仍需验证其适用性和稳定性	提高肿瘤早期筛查中微小RNA的检测灵敏度和操作简单性	针对两种与癌症相关的微小RNA进行分析	数字病理学	癌症	荧光传感器	NA	荧光信号	NA
73	2024-08-05	Neural Network Circuits for Bionic Associative Memory and Temporal Order Memory Based on DNA Strand Displacement 2024-Jul-16, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3425060 PMID:39012737	研究论文	该文章构建了基于DNA链置换的仿生关联记忆和时间顺序记忆电路	通过DNA链置换反应实现了DNA分子层面的Pavlovian关联记忆，拓展了生物计算的发展和神经网络的应用场景	NA	探讨在DNA分子层面实现关联记忆和时间顺序记忆的可能性	DNA链置换反应构建的各种记忆电路	计算机视觉	NA	DNA链置换	NA	NA	NA
74	2024-08-05	Erasable and Field Programmable DNA Circuits Based on Configurable Logic Blocks 2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400011 PMID:38698560	研究论文	该文章提出了一种基于可配置逻辑块的可擦除现场可编程DNA电路	该电路通过使用操作控制信号的夹子链条实现了可擦除和现场可编程的功能，能高效实现多种逻辑操作	目前仅展示了基本的与二进制计算相关的操作，可能缺乏其他复杂电路的示范	研究和开发一种新的可编程DNA电路，提高其在实际应用中的可行性	本研究对象是基于可配置逻辑块的DNA电路	数字病理学	NA	DNA电路设计	可配置逻辑块	NA	NA
75	2024-08-05	High-Risk Sequence Prediction Model in DNA Storage: The LQSF Method 2024-Jul-08, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2024.3424576 PMID:38976468	研究论文	本文介绍了一种利用深度学习模型预测高风险序列的LQSF方法，以改善传统DNA存储技术中的错误修正问题	LQSF方法通过主动过滤低质量序列，在编码阶段引入了积极的序列过滤，这是对传统方法的重大改进	未提及具体的限制因素	改善DNA存储技术中的错误修正，提高存储效率	高风险序列的预测与低质量序列的过滤	数字病理学	NA	深度学习	神经网络	序列数据	在多个数据集上进行了广泛的训练和测试，具体样本数量未提供
76	2024-08-05	An Exo III-powered closed-loop DNA circuit architecture for biosensing/imaging 2024-06-14, Mikrochimica acta DOI:10.1007/s00604-024-06476-0 PMID:38877347	研究论文	本研究提出了一种Exo III驱动的闭环DNA电路架构，用于生物传感和成像	提出了一种新的Exo III驱动闭环DNA电路架构，集成了四个高效的AND逻辑门，提高了电路的操作效率与应用范围	NA	本研究旨在提高DNA逻辑电路的操作效率并扩展其应用领域	利用设计好的ECDC架构在体外智能确定miR-21	数字病理学	癌症	DNA电路	AND逻辑门	NA	NA
77	2024-08-05	DetSpace: a web server for engineering detectable pathways for bio-based chemical production 2024-Jul-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae287 PMID:38634809	研究论文	DetSpace是一个网络服务器，用于设计可检测的生物电路以促进生物基化学品的生产	提供了一种系统的方法来设计对特定目标化合物浓度响应的遗传电路	当前的生产效率在标度化过程中仍然面临挑战，如滴度、速率和产量	旨在提高生物基化学品的生产效率	研究生物电路的设计与应用	合成生物学	NA	生物传感器	NA	NA	NA
78	2024-08-06	Exploring the Potential of DNA Computing for Complex Big Data Problems: A Case Study on the Traveling Car Renter Problem 2024-Jul, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2024.3396142 PMID:38709614	研究论文	本文探讨了DNA计算在复杂大数据问题中的潜力，以旅行租车问题为例	采用基于Adleman-Lipton模型的DNA算法解决旅行租车问题，展现了DNA计算在处理NP难题中的独特优势	对该算法的性能依赖于模拟实验和特定实例的计算，可能不能普遍适用于所有情况	研究DNA计算在复杂问题中的应用潜力，尤其是在旅行租车问题中的应用	旅行租车问题（TCRP），作为旅行销售员问题的变种	计算机科学	NA	DNA计算	Adleman-Lipton模型	模拟数据	多个旅行租车问题实例
79	2024-08-06	Design of DNA Storage Coding Scheme With LDPC Codes and Interleaving 2024-Jul, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2024.3379976 PMID:38512749	研究论文	本文提出了一种新的DNA存储编码方案，使用低密度奇偶校验(平衡LDPC)编码和交织技术	该方法通过差分进化优化的交错LDPC编码确保了DNA存储的可靠性，并通过交织技术处理非均匀误差特征	本文未提及具体的限制	研究DNA存储系统中的编码方案以提高数据恢复性能	主要关注低密度奇偶校验代码和交织技术在DNA存储中的应用	NA	NA	低密度奇偶校验编码，交织技术	NA	NA	NA
80	2024-08-06	Leveraging Concentration Imbalance-Driven DNA Circuit as an Operational Amplifier to Enhance the Sensitivity of Hepatitis B Virus DNA Detection with Hybridization-Responsive DNA-Templated Silver Nanoclusters 2024-Jun-24, JACS Au IF:8.5Q1 DOI:10.1021/jacsau.4c00291 PMID:38938798	研究论文	本研究提出了一种通过浓度不平衡驱动的DNA电路来增强HBV DNA检测灵敏度的新方法	采用浓度不平衡驱动的DNA电路作为操作放大器，结合响应杂交的DNA模板银纳米簇，提升了检测灵敏度	NA	开发灵敏且可靠的HBV DNA检测方法	HBV感染及其相关疾病的分子诊断	数字病理学	肝炎	DNA模板银纳米簇	NA	NA	NA