生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 845 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-05 |
Adaptive Arithmetic Coding-Based Encoding Method Toward High-Density DNA Storage
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0697
PMID:39544175
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研究论文 | 提出一种基于自适应算术编码的高密度DNA存储编码方法 | 将自适应算术编码应用于DNA存储，通过三阶段编码流程（压缩、纠错、映射）提高存储密度和数据完整性 | 仅通过仿真实验验证，未在实际生物环境中测试 | 开发高密度、高可靠性的DNA数据存储编码方法 | 文本、图片和音频等多种格式的数字文件 | DNA存储 | NA | 自适应算术编码(AAC)、预测部分匹配(PPM)、八进制汉明码 | NA | 文本、图像、音频 | 多种格式文件的编码验证 | DNA | 自适应算术编码, 八进制汉明码, 3-2码映射 | DNA计算 | 平均编码密度达每个核苷酸3.25个碱基，GC含量稳定在50%，同聚物长度不超过2 |
| 162 | 2025-10-05 |
Cost-Effective DNA Storage System with DNA Movable Type
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411354
PMID:39555674
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研究论文 | 提出了一种受活字印刷启发的DNA可移动类型存储系统，用于实现经济高效的大数据存储 | 引入DNA可移动类型概念，通过预制的DNA片段重复使用，避免每次存储都需要从头合成完整DNA序列 | 仅测试了43.7KB数据，尚未验证更大规模数据的存储能力 | 开发成本效益高的DNA数据存储系统 | 数字数据文件（文本、图像、音频、视频） | DNA存储技术 | NA | DNA合成、酶连接组装、喷墨打印技术 | NA | 多格式数据（文本、图像、音频、视频） | 43.7KB数据文件，使用350个DNA可移动类型 | DNA | 特定有效载荷、地址和校验和数据编码 | DNA计算 | 存储成本$122/MB，每个DNA可移动类型可重复使用10000次 |
| 163 | 2025-10-05 |
Locked Nucleic Acid-Enhanced Entropy-Driven Amplifier Combined with Catalytic Hybridization Reaction-Based DNA Circuit for Dual Amplified Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and Asymmetric Encryption of Gene Information
2025-Apr-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00529
PMID:40197003
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研究论文 | 开发了一种锁核酸增强的双信号放大策略，用于高对比度检测KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性并实现基因信息加密 | 结合熵驱动扩增与催化杂交反应实现双信号放大，并引入锁核酸修饰提升热力学稳定性和反应动力学 | 方法在人类血清样本中的应用潜力仅得到初步验证，需要更广泛的临床样本测试 | 开发高灵敏度单核苷酸多态性检测方法和基因信息加密技术 | KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性 | 分子计算 | 癌症（与KRAS基因突变相关） | 锁核酸技术、熵驱动扩增、催化杂交反应、荧光检测、共振瑞利散射 | DNA计算电路 | 基因序列信息 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 检测限0.19 fM，动态范围1 fM至0.1 nM |
| 164 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
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综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径，整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |
| 165 | 2025-10-05 |
What does a consent conversation for whole genome sequencing look like in the NHS Genomic Medicine Service? An observational study
2025-Apr, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01749-x
PMID:39592828
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观察性研究 | 本研究通过录音分析英国NHS基因组医学服务中全基因组测序知情同意对话的内容和结构 | 首次系统观察和记录NHS基因组医学服务中全基因组测序的知情同意对话实践 | 样本量较小(n=26)，仅关注儿童罕见病患者的父母，可能无法代表所有患者群体 | 了解全基因组测序知情同意对话的实际内容和结构 | 医疗专业人员与罕见病儿童父母之间的知情同意预约对话 | 基因组医学 | 罕见病 | 全基因组测序 | NA | 音频记录 | 26个知情同意预约，涉及7个NHS信托机构 | DNA | NA | NA | NA |
| 166 | 2025-10-05 |
Homogeneous Multicycle Cascaded DNA Circuit for Sensitive "Signal On-Off-Super On" PEC Biosensing
2025-Apr-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00373
PMID:40175284
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研究论文 | 开发基于均相多循环级联DNA电路和SnSe/CdS光阳极的“信号开-关-超开”PEC生物传感器，用于灵敏检测miRNA-222 | 提出新型“信号开-关-超开”检测策略，结合均相多循环级联DNA电路和Z型SnSe/CdS异质结，有效避免假响应和背景干扰 | 未提及实际临床样本验证和大规模应用测试 | 开发高灵敏度生物标志物检测平台用于早期疾病诊断 | 生物标志物miRNA-222 | 生物传感 | 癌症 | PEC生物传感、DNA电路、光敏剂标记 | NA | 电化学信号 | 线性范围1 fM至10 nM | DNA | NA | 分子计算 | 检测限0.3 fM，具有出色重现性、稳定性和灵敏度 |
| 167 | 2025-10-05 |
Programmable Primer Switching for Regulating Enzymatic DNA Circuits
2024-02-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c12000
PMID:38286819
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研究论文 | 提出一种通过引入可切换导线实现酶促DNA电路可编程调控的引物切换调控方法 | 开发了引物切换调控机制，无需重构基础电路框架即可通过添加切换导线实现复杂功能 | 未明确说明实验规模和数据量限制 | 开发更灵活便捷的酶促DNA电路调控方法 | 酶促DNA电路和引物调控机制 | DNA计算 | NA | DNA链置换反应(SDRs) | NA | 分子电路数据 | NA | DNA | NA | DNA计算,分子计算 | 支持级联、扇入/扇出、双轨、前馈和反馈等复杂电路功能 |
| 168 | 2025-10-05 |
Low-cost and automated magnetic bead-based DNA data writing via digital microfluidics
2025-Apr-08, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00106d
PMID:40070261
|
研究论文 | 开发了一种基于数字微流控和DNAzyme连接化学的低成本自动化DNA数据写入方法 | 将数字微流控平台与E47 DNAzyme连接化学相结合，实现了无需传统酶的室温连接过程，并开发了DNAzyme切割辅助的磁珠纯化方法 | 目前仅为概念验证阶段，尚未进行大规模实际应用测试 | 开发低成本自动化的DNA数据存储技术 | DNA数据存储系统的写入过程 | 分子计算 | NA | 数字微流控技术，DNAzyme连接化学，磁珠纯化 | NA | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 显著降低试剂输入量，减少所需储液器数量，简化系统布局 |
| 169 | 2025-10-05 |
Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform
2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309867
PMID:38048539
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控超大规模集成平台实现DNA存储数据快速读取的方法 | 结合微流控VLSI平台实现高度并行化DNA数据读取，并通过片上熔解曲线分析解码多状态DNA编码数据 | 未提及具体存储容量限制和错误率数据 | 开发快速、低成本的DNA数据检索技术 | DNA存储系统中的编码数据 | DNA存储技术 | NA | 微流控VLSI平台、熔解曲线分析、DNA识别技术 | NA | DNA编码数据 | NA | DNA | 多状态编码 | DNA计算 | 可扩展平台，支持高度并行数据读取 |
| 170 | 2025-10-05 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
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研究论文 | 开发了一种基于空间控制邻近分裂镊子开关的DNA电路构建策略，用于增强生物分子信号转导 | 利用双链镊子结构的刚性与发夹锁的阻碍效应协同作用，有效减少电路泄漏，并实现多类型靶标检测 | 未明确说明具体实验规模和应用场景的局限性 | 开发高效低泄漏的DNA电路构建方法，实现多功能生物分子信号转导 | 核酸、小分子和蛋白质等生物分子靶标 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应，邻近分裂镊子开关技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可扩展的复杂性，系统兼容性，适用于复杂转导网络构建 |
| 171 | 2025-10-05 |
A generative adversarial network for multiple reads reconstruction in DNA storage
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83806-5
PMID:39738820
|
研究论文 | 提出一种基于生成对抗网络的DNA存储多读段重建方法，将多读段转换为噪声图像并通过条件GAN生成共识序列 | 首次将生成对抗网络应用于DNA存储的多读段重建，能够处理第三代测序技术的高错误率数据 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的性能表现 | 解决DNA存储中因合成、PCR和测序过程导致的读段错误问题 | DNA存储系统中的多读段数据 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序，下一代测序 | GAN，条件生成对抗网络 | DNA测序读段，图像表示 | 两个真实数据集 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 可处理高达5.9%错误率的序列，在20%读段污染情况下仍保持鲁棒性 |
| 172 | 2025-10-05 |
Solving Minimum Spanning Tree Problems Based on DNA Chemical Reaction Networks
2025-Mar-18, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA链置换反应网络解决最小生成树问题的新型计算方法 | 首次将DNA链置换反应网络应用于图论中的最小生成树问题求解，创新性地整合了加权、阈值和求和三个反应模块 | 目前仅通过软件模拟验证，尚未进行实际生物实验验证 | 探索DNA计算在解决图论经典问题中的应用潜力 | 图论中的最小生成树问题 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应 | DNA化学反应网络模型 | DNA序列数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算,分子计算 | 通过荧光强度进行阈值筛选，能够处理复杂图论问题 |
| 173 | 2025-10-05 |
Converting an allocentric goal into an egocentric steering signal
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07006-3
PMID:38326612
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研究论文 | 本研究揭示了果蝇中央复合体中将世界坐标系的目标信号转换为身体坐标系转向信号的神经回路机制 | 首次在果蝇大脑中发现并描述了将朝向角度和目标角度比较生成转向信号的完整神经回路 | 研究主要基于果蝇模型，在更复杂动物中的适用性需要进一步验证 | 理解空间导航中不同坐标信号如何相互作用指导导航行为的神经机制 | 果蝇大脑中的EPG神经元、FC2神经元和PFL3神经元 | 神经科学 | NA | 光遗传学激活、突触传递干扰、定量分析 | 神经回路计算模型 | 神经元活动记录、行为数据 | 果蝇神经元回路 | NA | NA | 神经计算 | NA |
| 174 | 2025-10-05 |
Biotechnological tools boost the functional diversity of DNA-based data storage systems
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.02.002
PMID:40027441
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综述 | 本文总结了生物技术工具如何增强DNA数据存储系统的功能多样性 | 系统阐述了基于DNA分子序列特异性、封装和高维结构的生物技术工具如何实现随机访问、搜索和数据操作等新功能 | 使用生化反应会阻碍更精确高效信息存储系统的发展 | 探讨DNA数据存储系统的功能扩展和技术发展 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | 分子生物学、纳米技术 | NA | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、数据密度、访问时间、错误率、耐久性 |
| 175 | 2025-10-05 |
Three-Point-Star Deoxyribonucleic Acid Tiles with the Core Arm Length at Three Half-Turns for Two-Dimensional Archimedean Tilings and Beyond
2024-05-14, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.4c00985
PMID:38686650
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研究论文 | 本文报道了利用核心臂长为三个半螺旋的三点星DNA瓦片构建二维阿基米德铺砌和复杂镶嵌图案的研究 | 开发了新型3PSO DNA瓦片，通过中心交叉杂交编织结构实现了多种二维铺砌图案的构建，并首次将3PSO与4PSO、2PSO瓦片组合形成复杂镶嵌 | 研究中使用的DNA寡核苷酸支架长度固定为96-nt，可能限制了结构的多样性 | 探索新型DNA瓦片在构建复杂二维纳米结构中的应用 | 三点星DNA瓦片及其组装形成的二维纳米结构 | DNA纳米技术 | NA | DNA自组装技术，交叉杂交编织 | NA | 分子结构数据 | 使用96-nt长度的环形DNA寡核苷酸作为支架 | DNA | NA | DNA计算 | 能够构建复杂的二维镶嵌图案，在纳米制造、DNA计算和生物医学中具有广泛应用潜力 |
| 176 | 2025-10-05 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
|
研究论文 | 介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 将光响应性邻硝基苯基磷酸酯笼状DNA发夹与'静默'反应模块集成，实现光控瞬态DNA电路/网络的动态操作 | NA | 开发光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | DNA反应电路、宪法动态网络(CDN)、凝血酶催化纤维蛋白原凝固过程 | 分子计算 | NA | 光解保护技术、DNA计算 | 计算动力学模型 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算,分子计算 | NA |
| 177 | 2025-10-05 |
Programming and monitoring surface-confined DNA computing
2024-02, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.107080
PMID:38183684
|
综述 | 系统评述表面受限DNA计算的编程与监测方法及其应用 | 首次系统总结不同表面（DNA折纸、纳米颗粒、脂质膜和芯片）对DNA计算的限制效应及其操控方法 | 未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献的归纳分析 | 探讨表面受限DNA计算系统的设计原理、监测技术及应用前景 | 基于表面反应的DNA计算系统 | 分子计算 | NA | DNA计算，表面反应技术 | NA | 分子相互作用数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 相较于溶液体系具有更高的特异性和计算速度 |
| 178 | 2025-10-05 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种基于流式细胞分选技术的DNA数据存储方法，通过封装荧光DNA微粒增强数据稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装技术保护DNA结构完整性 | NA | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 封装荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞分选技术，层层自组装封装，微流控芯片 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高密度DNA负载，长期稳定性，随机读取能力 |
| 179 | 2025-10-05 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 开发了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于活体内microRNA成像和光热治疗 | 通过近红外激光功率调控实现时空选择性microRNA成像和成像引导的按需治疗 | 未明确说明实验样本数量和具体技术参数 | 开发精确癌症诊断和高效治疗的纳米诊疗平台 | microRNA-21和癌细胞 | 生物医学工程 | 癌症 | 熵驱动链置换反应、光热治疗、荧光成像 | DNA纳米平台 | 荧光信号、图像数据 | NA | DNA | DNA链置换编码 | 分子计算 | 时空选择性成像和按需治疗能力 |
| 180 | 2025-10-05 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
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研究论文 | 本研究揭示质子泵抑制剂奥美拉唑对类蛋白质自发放电特性的显著影响及其在非常规计算领域的应用潜力 | 首次发现奥美拉唑可调控类蛋白质的放电特性，并将其与布尔逻辑结合开拓生物计算新范式 | 研究仅聚焦单一药物作用，尚未系统探索其他质子调节剂的影响机制 | 探索药物调控下生物分子系统的计算潜力 | 类蛋白质（proteinoids）与奥美拉唑的相互作用系统 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑分析、电信号记录 | NA | 电生理信号 | NA | 蛋白质 | 布尔编码 | 分子计算, 生物计算 | 通过药物浓度调控实现放电模式的可编程性 |