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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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161 | 2024-08-06 |
Concepts and Application of DNA Origami and DNA Self-Assembly: A Systematic Review
2021, Applied bionics and biomechanics
IF:1.8Q3
DOI:10.1155/2021/9112407
PMID:34824603
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综述 | 本文简要介绍了DNA折纸及DNA自组装的概念和应用 | 探讨了DNA计算的新兴分支及其在多个领域中的应用 | 没有详细讨论DNA计算模型的具体实现 | 探讨DNA自组装在新计算技术中的应用 | DNA折纸和自组装结构的应用 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
162 | 2024-08-06 |
Encoding scheme for data storage and retrieval on DNA computers
2020-Sep, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2020.0157
PMID:33010141
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研究论文 | 本文提出了一种用于DNA计算机的数据存储和检索的编码方案 | 提出了一种具有可控冗余和可靠性的DNA数据存储编码方案 | 研究中未提及与现有存储介质的性能比较 | 探索有效的数据存储技术以应对不断增长的数据量 | DNA作为信息存储的介质 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | NA | 实验数据 | 三种不同类型的数据,冗余值为0.75 |
163 | 2024-08-06 |
RNA secondary structured logic gates for profiling the microRNA cancer biomarkers
2020-May, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2019.0150
PMID:32338625
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研究论文 | 本研究提出了一种用于检测微RNA癌症生物标志物的RNA二级结构逻辑门 | 创新点在于提出了多输入肝癌生物传感器,并使用RNA二级结构作为计算模块 | 文章中未提及任何具体的局限性 | 研究的目的是早期检测癌症病,特别是肝癌 | 本研究的对象是微RNA和肝癌生物标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | DNA计算 | 逻辑门 | NA | NA |
164 | 2024-08-06 |
Endogenous microRNA triggered enzyme-free DNA logic self-assembly for amplified bioimaging and enhanced gene therapy via in situ generation of siRNAs
2021-Sep-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01040-x
PMID:34565382
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研究论文 | 本文开发了一种由特定内源性microRNA触发的无酶DNA扩增策略,以增强宫颈癌的基因治疗效果 | 提出了一种利用内源性miRNA激活的DNA电路进行siRNA的原位生成,为癌症诊断和基因治疗提供了一个通用的平台 | 该研究未提及具体的临床应用和长期效果评估 | 研究旨在提升siRNA的传递效率与基因沉默效果,以改善癌症治疗 | 针对宫颈癌细胞进行miR-21的敏感分析与siRNA的生成 | 数字病理学 | 宫颈癌 | DNA逻辑电路 | NA | 荧光信号 | HeLa细胞 |
165 | 2024-08-06 |
A self-contained and self-explanatory DNA storage system
2021-09-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97570-3
PMID:34508146
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研究论文 | 提出了一种自包含和自解释的DNA存储系统 | 创新性地设计了一种DNA文件格式,实现了无需外部工具的数据恢复 | 未提及该系统在实际应用中的具体限制 | 解决传统DNA存储系统在超长期存储和恢复上的不确定性问题 | DNA存储系统及其数据恢复方法 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | NA | 数据文件 | 通过实验数据进行验证 |
166 | 2024-08-06 |
Correcting Errors in Image Encryption Based on DNA Coding
2018-Jul-27, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules23081878
PMID:30060471
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研究论文 | 本文提出一种新颖的方法用于纠正基于DNA编码的图像加密中的错误 | 提出了一种新方法,通过DNA编码降低DNA序列的相似性并纠正图像加密和解密过程中的错误 | NA | 研究图像加密中错误的纠正方法 | 图像加密中的错误 | 数字病理学 | NA | DNA计算 | NA | 图像 | 实验结果显示应用了相关数据,但具体样本数量未提及 |
167 | 2024-08-06 |
DNA Bloom Filter enables anti-contamination and file version control for DNA-based data storage
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae125
PMID:38555478
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研究论文 | 本文提出利用Bloom Filter在DNA存储中实现抗污染和文件版本控制 | 创新地应用了Bloom Filter作为一种空间高效的概率数据结构来实现DNA存储中的抗错误功能 | 未具体说明其他可能的限制 | 探讨如何提高DNA存储的准确性并降低存储成本 | 原始正确的DNA序列和相应的数据结构 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | Bloom Filter | DNA序列 | 实验结果未具体说明样本数量 |
168 | 2024-08-06 |
High-density information storage and random access scheme using synthetic DNA
2021-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-021-02882-w
PMID:34194912
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成DNA的高密度信息存储和随机访问方案 | 提出了一种基于码本的DNA映射方法和基于编码内容的随机访问方法,该方案提升了信息存储密度 | 合成DNA的高成本和低随机访问效率仍然是主要缺点 | 研究下一代存储技术中的DNA存储方案 | 针对合成DNA的存储密度和随机访问效率进行研究 | 计算机视觉 | NA | NA | 卷积神经网络 | NA | 实验中与现有DNA信息存储方法进行比较 |
169 | 2024-08-06 |
DNA nanotechnology provides an avenue for the construction of programmable dynamic molecular systems
2021, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v18.013
PMID:34123692
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综述 | 文章概述了基于DNA的自组装系统的最新研究,并强调其动态特性 | 探讨了利用DNA纳米技术构建可编程动态分子系统的前沿进展 | 未明确指出具体的实验数据和实例 | 研究基于DNA的自组装系统在生物工程中的应用 | 人工设计的DNA自组装系统 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
170 | 2024-08-06 |
Low cost DNA data storage using photolithographic synthesis and advanced information reconstruction and error correction
2020-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19148-3
PMID:33093494
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研究论文 | 本文展示了一种利用光引导合成的低成本DNA数据存储系统 | 创新点在于提出了一种成本更低、潜在速度更快的高误差合成技术,并开发了一套编码和重建信息的算法管道 | 所使用的高误差合成技术在速度优化时会导致较高的序列错误率 | 研究DNA作为一种长期存储介质的潜力,并改善当前DNA数据存储系统的成本和速度问题 | 研究对象为DNA数据存储系统及其信息编码和重建过程 | 数字病理学 | NA | 光引导合成 | NA | 文件数据 | 1个文件(包含莫扎特的乐谱) |
171 | 2024-08-06 |
Sequence-to-function deep learning frameworks for engineered riboregulators
2020-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18676-2
PMID:33028819
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研究论文 | 本文介绍了用于优化和重新设计脚趾开关的新型深度学习框架。 | 提出了Sequence-based Toehold Optimization and Redesign Model (STORM)和Nucleic-Acid Speech (NuSpeak)两种独特且协同的深度学习架构,优化脚趾开关的功能。 | 对设计规则的理解仍然有限,可能影响深度学习模型的应用范围。 | 研究新的生物电路组件设计方法,特别是脚趾开关的优化。 | 本文的研究对象是可编程的核酸传感器——脚趾开关。 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 卷积神经网络 | NA | 使用稀疏训练数据进行实验验证 |
172 | 2024-08-06 |
Image Encryption Based on Pixel-Level Diffusion with Dynamic Filtering and DNA-Level Permutation with 3D Latin Cubes
2019-Mar-24, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e21030319
PMID:33267033
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研究论文 | 本文提出了一种结合超混沌系统、像素级动态滤波和DNA计算的新型图像加密方法DFDLC | 创新点在于将5D超混沌系统与动态滤波和DNA计算结合到图像加密过程中 | NA | 研究图像安全中的图像加密技术 | 对公共测试图像进行加密实验 | 计算机视觉 | NA | DNA计算 | 超混沌系统 | 图像 | 大量公共测试图像 |
173 | 2024-08-06 |
Noise control for molecular computing
2018-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0199
PMID:29997258
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研究论文 | 本文提出了一种用于分子计算的噪声控制方法。 | 开发了一种算法,通过结构性修改反应网络,引入可控的状态依赖噪声,同时保留确定性动力学。 | 尚未提及具体的实验验证或应用范围,可能限制实际应用的推广。 | 旨在通过控制系统内部噪声,促进生化网络在随机水平上的设计。 | 针对生化反应网络的设计与优化。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 反应网络数据 | 未指定样本数量 |
174 | 2024-08-06 |
Isothermal Reciprocal Catalytic DNA Circuit for Sensitive Analysis of Kanamycin
2024-Mar-27, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00261
PMID:38470333
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研究论文 | 本文提出了一种用于敏感分析氟康唑的等温互促催化DNA电路 | 本文开发了一种稳健的互促催化DNA电路,实现了高效的信号放大和细菌抗生素检测 | 当前方法对设计复杂度和信号增益的限制尚未完全解决 | 开发一种高效的抗生素检测方法 | 该研究对象为氟康唑在缓冲液及食品样本中的检测 | 数字病理学 | NA | DNA扩增电路 | NA | 样本分析 | 包括牛奶、蜂蜜和鱼的食品样本 |
175 | 2024-08-06 |
Recurrent architecture for adaptive regulation of learning in the insect brain
2020-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0607-9
PMID:32203499
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研究论文 | 本研究提供了果蝇幼虫学习中心的多巴胺能神经元的突触分辨率连通组图 | 探索了多巴胺能神经元活动的调控机制,并发现了与不同记忆系统相关的反馈神经元群体 | 研究主要集中在果蝇幼虫的神经回路,可能无法直接推广到其他物种 | 揭示驱动学习的多巴胺能神经元的上游电路 | 研究果蝇幼虫中多巴胺能神经元的电路连接和功能 | 数字病理学 | NA | 电路建模 | NA | 突触连接组 | 果蝇幼虫的学习中心神经元群体 |
176 | 2024-08-06 |
An Intelligent Optimization Algorithm for Constructing a DNA Storage Code: NOL-HHO
2020-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062191
PMID:32235762
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研究论文 | 本文提出了一种改进的哈里斯猎鹰优化算法NOL-HHO,用于构建DNA存储编码 | 引入了非线性控制参数策略和随机反向学习策略以增强算法性能 | 未提及具体的局限性 | 提升DNA存储编码的下界,以促进DNA存储技术的发展 | 23个广泛使用的基准函数 | 计算机视觉 | NA | NA | 哈里斯猎鹰优化算法 | NA | 23个基准函数 |
177 | 2024-08-06 |
Detection, molecular typing and phylogenetic analysis of Leishmania isolated from cases of leishmaniasis among Syrian refugees in Lebanon
2016-Jun, Parasite epidemiology and control
IF:2.0Q3
DOI:10.1016/j.parepi.2016.02.002
PMID:29988171
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研究论文 | 本文研究了从黎巴嫩叙利亚难民中分离出的利什曼原虫的检测、分子分型和系统发育分析 | 首次比较了两种不同的分子方法在黎巴嫩的利什曼原虫检测和识别中的效果 | 未能全面阐明皮肤利什曼病的流行病学情况 | 探讨在黎巴嫩的利什曼病流行情况以及检测方法的有效性 | 39个来自石蜡包埋(FFPE)组织的利什曼原虫分离株 | 数字病理学 | NA | ITS1-PCR RFLP和嵌套ITS1-5.8S rDNA基因扩增 | 邻接法(NJ) | DNA序列 | 39个FFPE样本 |
178 | 2024-08-06 |
A programming language for composable DNA circuits
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0072.focus
PMID:19535415
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计和模拟DNA电路的编程语言 | 提出了一种新的编程语言来支持基于链置换的DNA电路的设计与模拟 | 假设链没有任何次级结构,可能限制了模型的适用性 | 旨在促进DNA电路的设计及其自动编译到核苷酸序列 | 各种电路模型及其模拟,包括熵驱动的催化门和化学反应系统 | 数字病理学 | NA | 链置换 | NA | NA | NA |
179 | 2024-08-06 |
Protocols for dry DNA storage and shipment at room temperature
2013-Sep, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.12134
PMID:23789643
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研究论文 | 本研究评估了三种干态DNA稳定化系统在常温和56°C下的效果 | 提出了不同的干燥DNA存储和运输方案,为DNA长时间保存提供了新的思路 | 研究时间跨度长达4年,但在常温下存储的DNA质量尚需更多数据支持 | 制定成本效益高、有效的DNA提取物和PCR产品的运输及存储协议 | 对比不同的DNA存储方案对昆虫DNA的保护效果 | 数字病理学 | NA | PCR,选择性测序 | NA | DNA样本 | 96孔板的昆虫DNA样本 |
180 | 2024-08-06 |
BioCode: two biologically compatible Algorithms for embedding data in non-coding and coding regions of DNA
2013-Apr-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-14-121
PMID:23570444
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研究论文 | 本论文提出了两种新颖的DNA数据嵌入算法BioCode,分别在非编码DNA和编码DNA中操作。 | 提出的算法遵循更严格的生物学限制,提高了信息嵌入的生物相容性和稳健性。 | 目前的方法只考虑了基本的生物学约束,未能充分考虑存在的进一步生物学限制。 | 研究旨在开发可以在DNA中嵌入非遗传信息的鲁棒算法。 | 研究对象为DNA数据嵌入算法,特别关注在活体生物基因组中的信息嵌入。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |