生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 879 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
Integrating lanthanide coordination polymer ratiometric fluorescence biosensors with a concatenated DNA circuit for locus-specific N6-methyladenosine quantification
2025-Mar-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06742h
PMID:39992289
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研究论文 | 开发了一种整合镧系配位聚合物比率荧光生物传感器与级联DNA电路的检测方法，用于准确定量分析癌症细胞和组织中位点特异性的N6-甲基腺嘌呤 | 首次将镧系配位聚合物比率荧光传感与点击化学驱动的级联DNA电路相结合，实现位点特异性m6A的高精度检测 | NA | 开发高灵敏度和准确性的位点特异性m6A定量检测技术 | 癌症细胞和组织中的N6-甲基腺嘌呤修饰 | 生物传感 | 癌症 | 比率荧光生物传感, 级联DNA电路, 点击化学 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 202 | 2025-10-05 |
Engineered Living Memory Microspheroid-Based Archival File System for Random Accessible In Vivo DNA Storage
2025-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202415358
PMID:39981833
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研究论文 | 提出一种基于工程化活记忆微球体的DNA存储系统，实现体内DNA数据的随机存取 | 首次将质粒功能与DNA数据以键值对格式结合，通过微流控技术快速封装细菌并实现基于荧光表达的文件检索 | 仅演示了2种文件类型的检索，系统容量和实际应用规模尚未验证 | 开发高效随机存取的DNA数据存储系统以满足EB-YB级数据存储需求 | DNA数据存储材料和检索系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控技术、冻干保存、荧光分选 | NA | DNA数据、图像文件 | 每种文件类型至少10个副本，使用N个光学通道 | DNA | 键值对格式 | DNA计算, 分子计算 | 支持EB-YB级数据库，室温存储，5分钟封装时间 |
| 203 | 2025-10-05 |
FEN1-assisted DNA logic amplifier circuit for fast and compact DNA computing
2024-Apr-23, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc00203b
PMID:38577866
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研究论文 | 本研究开发了基于FEN1酶催化信号放大的DNA逻辑放大器电路，用于实现快速紧凑的DNA计算 | 利用FEN1催化的信号放大反应构建DNA逻辑门，输入链浓度低于1 nM，比其他DNA逻辑电路低100倍以上 | NA | 开发快速紧凑的DNA计算方法 | DNA逻辑放大器电路 | 分子计算 | NA | FEN1酶催化信号放大 | DNA逻辑门（AND-OR、OR-AND、FAN-IN、FAN-OUT、4位平方根电路） | DNA链 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 输入浓度低于1 nM，快速紧凑的计算能力 |
| 204 | 2025-10-05 |
Integrating an entropy-driven DNA circuit with a tetrahedral scaffold as a generic in situ electrochemical biosensor for amplified detection of microRNAs
2025-Feb-24, The Analyst
DOI:10.1039/d4an01528b
PMID:39925032
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研究论文 | 开发了一种集成熵驱动DNA电路与四面体支架的通用电化学生物传感器，用于高灵敏度检测microRNAs | 将四面体DNA纳米结构同时用作电极表面的支架和熵驱动DNA电路的底物，实现了接近均相液相反应性能的界面反应 | 未明确说明生物样本的具体数量和类型，实验验证范围有限 | 开发高灵敏度、高特异性的microRNA检测方法用于早期癌症诊断 | 致癌相关microRNAs（如miR-96） | 生物传感器 | 癌症 | 熵驱动DNA电路，四面体DNA纳米结构，电化学检测，qRT-PCR | NA | 电化学信号，生物分子数据 | B[a]PDE暴露细胞的生物样本 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 检测限74 aM，动态范围100 aM至100 pM |
| 205 | 2025-10-05 |
Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues
2025-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117198
PMID:39893948
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研究论文 | 构建分层DNA电路用于临床组织中位点特异性m6A-MALAT1的单分子分析 | 首次构建分层DNA电路实现单分子水平m6A-MALAT1检测，结合VMC10-DNAzyme的高特异性识别和单分子检测的超高信噪比 | 未明确说明方法在复杂临床样本中的普适性验证 | 开发高灵敏度和特异性的位点特异性m6A RNA修饰检测方法 | 临床组织样本中的m6A-MALAT1 RNA修饰 | 分子诊断 | 乳腺癌 | 分层DNA电路，VMC10-DNAzyme，单分子检测 | NA | 分子检测信号 | 多种癌细胞系及乳腺癌患者与健康个体样本 | DNA | NA | 分子计算 | 检测灵敏度1.8 aM，动态范围7个数量级，可区分0.001% m6A-MALAT1 |
| 206 | 2025-10-05 |
pH-Controlled DNA Switching Circuits with Multi-State Responsiveness for Logic Computation and Control
2025-Mar-20, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404541
PMID:39876816
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研究论文 | 提出一种pH控制的多状态DNA开关电路构建策略，实现通过三链体构象转换的动态调控 | 利用三链体独特的pH响应特性构建多状态DNA开关电路，实现三种状态间的动态调控和对杂交链式反应的逻辑计算控制 | 未明确说明电路在复杂环境中的稳定性和实际生物应用中的具体限制 | 开发动态DNA电路构建策略，实现化学反应网络的智能响应和动态调控 | DNA开关电路、三链体结构、杂交链式反应(HCR) | 分子计算 | NA | DNA计算、三链体构象转换、toehold介导的链置换反应 | DNA开关电路 | 分子信号 | NA | DNA | 三链体构象编码 | DNA计算,分子计算 | 适用于大规模化学反应网络和DNA纳米结构自组装的动态调控 |
| 207 | 2025-10-05 |
A Multi-Input Molecular Classifier Based on Digital DNA Strand Displacement for Disease Diagnostics
2025-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202413198
PMID:39891016
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研究论文 | 开发了一种基于数字DNA链置换的分子计算方法，用于疾病诊断中的生物标志物分类 | 提出数字DNA链置换（DDSD）方法，通过DNA聚合酶延伸和链释放实现目标识别和价态操作，显著减少寡核苷酸使用数量 | 未明确说明临床样本的具体数量和类型，潜在泄漏风险虽已减少但仍存在 | 开发高效的分子计算系统用于疾病诊断和生物标志物检测 | 临床血液样本中的细菌和病毒感染生物标志物 | 分子计算 | 细菌和病毒感染 | DNA链置换，DNA聚合酶延伸 | 二元分类器，多类分类器 | 分子信号 | 临床血液样本（具体数量未明确） | DNA | 价态编码 | DNA计算，分子计算 | 可同时计算14个价态，最大价态25，通过级联DDSD和多路连接DDSD实现扩展 |
| 208 | 2025-10-05 |
Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway
2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.117109
PMID:39756268
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研究论文 | 提出一种基于谷胱甘肽激活的DNA电路，通过连续响应机制实现microRNA的高保真成像及相关调控通路的原位解析 | 通过将二硫键整合到预封闭核酸探针中，有效控制电路信号泄漏，实现时空选择性microRNA成像 | 未明确说明该系统的检测灵敏度极限和在实际生物样本中的验证范围 | 开发高保真生物分子成像技术，探索生物分子相互作用网络 | microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH）的相互作用 | 分子计算 | 癌症 | DNA电路技术，非酶催化信号放大 | 催化DNA电路 | 分子成像数据 | 多种癌细胞类型 | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可实现不同生物分子相互作用的稳健分析和探索 |
| 209 | 2025-10-05 |
Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification
2025-Jan-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c18752
PMID:39760699
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研究论文 | 开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，通过两步DNA电路放大实现啶虫脒的高灵敏检测 | 结合能量转移机制、两步DNA电路放大（熵驱动DNA循环和DNA步行器）和双模式传感策略，实现了超灵敏的农药检测 | 未明确说明实际样品检测的复杂基质干扰问题 | 开发高灵敏度和准确度的啶虫脒检测方法以保障食品安全 | 农药啶虫脒 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、电化学发光检测、DNA电路放大、核酸适配体识别 | NA | 化学传感信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | 检测范围0至1×10 M，检测限20.2 fM（PEC模式）和17.5 fM（ECL模式） |
| 210 | 2025-10-05 |
Instruction-responsive programmable assemblies with DNA origami block pieces
2025-Jan-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1193
PMID:39698832
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研究论文 | 本研究开发了具有八个可编程边缘的DNA折纸构建块，可通过指令集组装成特定二维阵列 | 设计了标准化的DNA折纸构建块和指令系统，实现了确定性和非确定性组装，并能执行布尔逻辑计算 | 未明确说明系统在更复杂结构组装中的效率和错误率 | 开发可编程的有限尺度DNA自组装系统 | DNA折纸构建块及其组装结构 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子结构数据 | NA | DNA | 二进制编码 | DNA计算,分子计算 | 双单元系统可生成48种不同DNA阵列，支持复杂二维结构组装 |
| 211 | 2025-10-05 |
Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics
2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202416004
PMID:39606901
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的集成化DNA数据存储系统，实现从合成到测序的完整流程 | 采用200纳米磁珠和数字微流控技术构建紧凑型DNA存储管道，结合三酶级联反应和重复焦磷酸测序，显著提升存储速度至49分钟/字节 | 概念验证仅存储8字节数据，样本规模较小 | 开发高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统 | DNA数据存储系统 | 分子计算 | NA | 数字微流控、焦磷酸测序、磷酰胺化学合成 | NA | 数字数据 | 8字节数据 | DNA | 霍夫曼编码, 里德-所罗门纠错码 | DNA计算 | 存储速度49分钟/字节，核苷酸准确率超过95% |
| 212 | 2025-10-05 |
Adaptive Arithmetic Coding-Based Encoding Method Toward High-Density DNA Storage
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0697
PMID:39544175
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研究论文 | 提出一种基于自适应算术编码的高密度DNA存储编码方法 | 将自适应算术编码应用于DNA存储，通过三阶段编码流程（压缩、纠错、映射）提高存储密度和数据完整性 | 仅通过仿真实验验证，未在实际生物环境中测试 | 开发高密度、高可靠性的DNA数据存储编码方法 | 文本、图片和音频等多种格式的数字文件 | DNA存储 | NA | 自适应算术编码(AAC)、预测部分匹配(PPM)、八进制汉明码 | NA | 文本、图像、音频 | 多种格式文件的编码验证 | DNA | 自适应算术编码, 八进制汉明码, 3-2码映射 | DNA计算 | 平均编码密度达每个核苷酸3.25个碱基，GC含量稳定在50%，同聚物长度不超过2 |
| 213 | 2025-10-05 |
Cost-Effective DNA Storage System with DNA Movable Type
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411354
PMID:39555674
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研究论文 | 提出了一种受活字印刷启发的DNA可移动类型存储系统，用于实现经济高效的大数据存储 | 引入DNA可移动类型概念，通过预制的DNA片段重复使用，避免每次存储都需要从头合成完整DNA序列 | 仅测试了43.7KB数据，尚未验证更大规模数据的存储能力 | 开发成本效益高的DNA数据存储系统 | 数字数据文件（文本、图像、音频、视频） | DNA存储技术 | NA | DNA合成、酶连接组装、喷墨打印技术 | NA | 多格式数据（文本、图像、音频、视频） | 43.7KB数据文件，使用350个DNA可移动类型 | DNA | 特定有效载荷、地址和校验和数据编码 | DNA计算 | 存储成本$122/MB，每个DNA可移动类型可重复使用10000次 |
| 214 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
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综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径，整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |
| 215 | 2025-10-05 |
Programmable Primer Switching for Regulating Enzymatic DNA Circuits
2024-02-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c12000
PMID:38286819
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研究论文 | 提出一种通过引入可切换导线实现酶促DNA电路可编程调控的引物切换调控方法 | 开发了引物切换调控机制，无需重构基础电路框架即可通过添加切换导线实现复杂功能 | 未明确说明实验规模和数据量限制 | 开发更灵活便捷的酶促DNA电路调控方法 | 酶促DNA电路和引物调控机制 | DNA计算 | NA | DNA链置换反应(SDRs) | NA | 分子电路数据 | NA | DNA | NA | DNA计算,分子计算 | 支持级联、扇入/扇出、双轨、前馈和反馈等复杂电路功能 |
| 216 | 2025-10-05 |
Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform
2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309867
PMID:38048539
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控超大规模集成平台实现DNA存储数据快速读取的方法 | 结合微流控VLSI平台实现高度并行化DNA数据读取，并通过片上熔解曲线分析解码多状态DNA编码数据 | 未提及具体存储容量限制和错误率数据 | 开发快速、低成本的DNA数据检索技术 | DNA存储系统中的编码数据 | DNA存储技术 | NA | 微流控VLSI平台、熔解曲线分析、DNA识别技术 | NA | DNA编码数据 | NA | DNA | 多状态编码 | DNA计算 | 可扩展平台，支持高度并行数据读取 |
| 217 | 2025-10-05 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
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研究论文 | 开发了一种基于空间控制邻近分裂镊子开关的DNA电路构建策略，用于增强生物分子信号转导 | 利用双链镊子结构的刚性与发夹锁的阻碍效应协同作用，有效减少电路泄漏，并实现多类型靶标检测 | 未明确说明具体实验规模和应用场景的局限性 | 开发高效低泄漏的DNA电路构建方法，实现多功能生物分子信号转导 | 核酸、小分子和蛋白质等生物分子靶标 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应，邻近分裂镊子开关技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可扩展的复杂性，系统兼容性，适用于复杂转导网络构建 |
| 218 | 2025-10-05 |
A generative adversarial network for multiple reads reconstruction in DNA storage
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83806-5
PMID:39738820
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研究论文 | 提出一种基于生成对抗网络的DNA存储多读段重建方法，将多读段转换为噪声图像并通过条件GAN生成共识序列 | 首次将生成对抗网络应用于DNA存储的多读段重建，能够处理第三代测序技术的高错误率数据 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的性能表现 | 解决DNA存储中因合成、PCR和测序过程导致的读段错误问题 | DNA存储系统中的多读段数据 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序，下一代测序 | GAN，条件生成对抗网络 | DNA测序读段，图像表示 | 两个真实数据集 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 可处理高达5.9%错误率的序列，在20%读段污染情况下仍保持鲁棒性 |
| 219 | 2025-10-05 |
Solving Minimum Spanning Tree Problems Based on DNA Chemical Reaction Networks
2025-Mar-18, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA链置换反应网络解决最小生成树问题的新型计算方法 | 首次将DNA链置换反应网络应用于图论中的最小生成树问题求解，创新性地整合了加权、阈值和求和三个反应模块 | 目前仅通过软件模拟验证，尚未进行实际生物实验验证 | 探索DNA计算在解决图论经典问题中的应用潜力 | 图论中的最小生成树问题 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应 | DNA化学反应网络模型 | DNA序列数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算,分子计算 | 通过荧光强度进行阈值筛选，能够处理复杂图论问题 |
| 220 | 2025-10-05 |
Biotechnological tools boost the functional diversity of DNA-based data storage systems
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.02.002
PMID:40027441
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综述 | 本文总结了生物技术工具如何增强DNA数据存储系统的功能多样性 | 系统阐述了基于DNA分子序列特异性、封装和高维结构的生物技术工具如何实现随机访问、搜索和数据操作等新功能 | 使用生化反应会阻碍更精确高效信息存储系统的发展 | 探讨DNA数据存储系统的功能扩展和技术发展 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | 分子生物学、纳米技术 | NA | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、数据密度、访问时间、错误率、耐久性 |