生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-06 |
DNA Bloom Filter enables anti-contamination and file version control for DNA-based data storage
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae125
PMID:38555478
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研究论文 | 本文提出利用Bloom Filter在DNA存储中实现抗污染和文件版本控制 | 创新地应用了Bloom Filter作为一种空间高效的概率数据结构来实现DNA存储中的抗错误功能 | 未具体说明其他可能的限制 | 探讨如何提高DNA存储的准确性并降低存储成本 | 原始正确的DNA序列和相应的数据结构 | 数字病理学 | NA | DNA存储 | Bloom Filter | DNA序列 | 实验结果未具体说明样本数量 |
| 122 | 2024-08-06 |
High-density information storage and random access scheme using synthetic DNA
2021-Jul, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-021-02882-w
PMID:34194912
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研究论文 | 本文提出了一种基于合成DNA的高密度信息存储和随机访问方案 | 提出了一种基于码本的DNA映射方法和基于编码内容的随机访问方法，该方案提升了信息存储密度 | 合成DNA的高成本和低随机访问效率仍然是主要缺点 | 研究下一代存储技术中的DNA存储方案 | 针对合成DNA的存储密度和随机访问效率进行研究 | 计算机视觉 | NA | NA | 卷积神经网络 | NA | 实验中与现有DNA信息存储方法进行比较 |
| 123 | 2024-08-06 |
DNA nanotechnology provides an avenue for the construction of programmable dynamic molecular systems
2021, Biophysics and physicobiology
IF:1.6Q4
DOI:10.2142/biophysico.bppb-v18.013
PMID:34123692
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综述 | 文章概述了基于DNA的自组装系统的最新研究，并强调其动态特性 | 探讨了利用DNA纳米技术构建可编程动态分子系统的前沿进展 | 未明确指出具体的实验数据和实例 | 研究基于DNA的自组装系统在生物工程中的应用 | 人工设计的DNA自组装系统 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 124 | 2024-08-06 |
Low cost DNA data storage using photolithographic synthesis and advanced information reconstruction and error correction
2020-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-19148-3
PMID:33093494
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研究论文 | 本文展示了一种利用光引导合成的低成本DNA数据存储系统 | 创新点在于提出了一种成本更低、潜在速度更快的高误差合成技术，并开发了一套编码和重建信息的算法管道 | 所使用的高误差合成技术在速度优化时会导致较高的序列错误率 | 研究DNA作为一种长期存储介质的潜力，并改善当前DNA数据存储系统的成本和速度问题 | 研究对象为DNA数据存储系统及其信息编码和重建过程 | 数字病理学 | NA | 光引导合成 | NA | 文件数据 | 1个文件（包含莫扎特的乐谱） |
| 125 | 2024-08-06 |
An Encoding Table Corresponding to ASCII Codes for DNA Data Storage and a New Error Correction Method HMSA
2024-Apr, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3356522
PMID:38252580
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研究论文 | 本研究提出了一种符合ASCII码的DNA编码表及新的错误校正方法HMSA | 结合ASCII编码建立DNA编码表，同时提出一种新的HMSA错误校正方法，有效纠正各种序列错误 | 文中未详细讨论不同编码方案下HMSA方法的局限性 | 规范DNA编码系统，提高字符表示和传输的一致性 | 纯文本、音频和视频信息的DNA编码 | 数字遗传学 | NA | DNA存储 | NA | 文本、音频、视频 | 150nt序列 |
| 126 | 2024-08-06 |
DNA Sequences Under Multiple Guanine-Cytosine (GC) Base Pairs Constraint
2024-Apr, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3316431
PMID:37721871
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研究论文 | 本文提出了一种新的DNA序列设计方法，旨在提高DNA计算的效率和准确性 | 提出了一种新的鸟类进化搜索算法（SESA）及多重GC约束，以提升DNA序列的质量和稳定性 | 未提及具体的局限性 | 提高DNA序列设计的效率和质量 | DNA计算中的序列设计 | 计算机视觉 | NA | 鸟类进化搜索算法（SESA） | NA | NA | 使用NUPACK进行模拟实验的结果 |
| 127 | 2024-08-06 |
A Novel Algorithm for Solving the Prize Collecting Traveling Salesman Problem Based on DNA Computing
2024-Apr, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3307458
PMID:37607150
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研究论文 | 该文章提出了一种基于DNA计算的算法来解决奖金收集旅行商问题。 | 创新点在于首次将Adleman-Lipton模型应用于奖金收集旅行商问题，并通过模拟实验展示了模型的可行性。 | 该研究主要集中在特定的奖金收集旅行商问题实例，未涉及更广泛的应用场景。 | 研究旨在探索DNA计算在组合优化问题中的应用潜力。 | 研究对象为奖金收集旅行商问题的开放实例。 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | 模拟数据 | 多个奖金收集旅行商问题的开放实例 |
| 128 | 2024-08-06 |
Sequence-to-function deep learning frameworks for engineered riboregulators
2020-10-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-020-18676-2
PMID:33028819
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研究论文 | 本文介绍了用于优化和重新设计脚趾开关的新型深度学习框架。 | 提出了Sequence-based Toehold Optimization and Redesign Model (STORM)和Nucleic-Acid Speech (NuSpeak)两种独特且协同的深度学习架构，优化脚趾开关的功能。 | 对设计规则的理解仍然有限，可能影响深度学习模型的应用范围。 | 研究新的生物电路组件设计方法，特别是脚趾开关的优化。 | 本文的研究对象是可编程的核酸传感器——脚趾开关。 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 卷积神经网络 | NA | 使用稀疏训练数据进行实验验证 |
| 129 | 2024-08-06 |
Image Encryption Based on Pixel-Level Diffusion with Dynamic Filtering and DNA-Level Permutation with 3D Latin Cubes
2019-Mar-24, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e21030319
PMID:33267033
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研究论文 | 本文提出了一种结合超混沌系统、像素级动态滤波和DNA计算的新型图像加密方法DFDLC | 创新点在于将5D超混沌系统与动态滤波和DNA计算结合到图像加密过程中 | NA | 研究图像安全中的图像加密技术 | 对公共测试图像进行加密实验 | 计算机视觉 | NA | DNA计算 | 超混沌系统 | 图像 | 大量公共测试图像 |
| 130 | 2024-08-06 |
Noise control for molecular computing
2018-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2018.0199
PMID:29997258
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研究论文 | 本文提出了一种用于分子计算的噪声控制方法。 | 开发了一种算法，通过结构性修改反应网络，引入可控的状态依赖噪声，同时保留确定性动力学。 | 尚未提及具体的实验验证或应用范围，可能限制实际应用的推广。 | 旨在通过控制系统内部噪声，促进生化网络在随机水平上的设计。 | 针对生化反应网络的设计与优化。 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 反应网络数据 | 未指定样本数量 |
| 131 | 2024-08-06 |
Isothermal Reciprocal Catalytic DNA Circuit for Sensitive Analysis of Kanamycin
2024-Mar-27, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c00261
PMID:38470333
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研究论文 | 本文提出了一种用于敏感分析氟康唑的等温互促催化DNA电路 | 本文开发了一种稳健的互促催化DNA电路，实现了高效的信号放大和细菌抗生素检测 | 当前方法对设计复杂度和信号增益的限制尚未完全解决 | 开发一种高效的抗生素检测方法 | 该研究对象为氟康唑在缓冲液及食品样本中的检测 | 数字病理学 | NA | DNA扩增电路 | NA | 样本分析 | 包括牛奶、蜂蜜和鱼的食品样本 |
| 132 | 2024-08-06 |
Recurrent architecture for adaptive regulation of learning in the insect brain
2020-04, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-020-0607-9
PMID:32203499
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研究论文 | 本研究提供了果蝇幼虫学习中心的多巴胺能神经元的突触分辨率连通组图 | 探索了多巴胺能神经元活动的调控机制，并发现了与不同记忆系统相关的反馈神经元群体 | 研究主要集中在果蝇幼虫的神经回路，可能无法直接推广到其他物种 | 揭示驱动学习的多巴胺能神经元的上游电路 | 研究果蝇幼虫中多巴胺能神经元的电路连接和功能 | 数字病理学 | NA | 电路建模 | NA | 突触连接组 | 果蝇幼虫的学习中心神经元群体 |
| 133 | 2024-08-06 |
An Intelligent Optimization Algorithm for Constructing a DNA Storage Code: NOL-HHO
2020-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21062191
PMID:32235762
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研究论文 | 本文提出了一种改进的哈里斯猎鹰优化算法NOL-HHO，用于构建DNA存储编码 | 引入了非线性控制参数策略和随机反向学习策略以增强算法性能 | 未提及具体的局限性 | 提升DNA存储编码的下界，以促进DNA存储技术的发展 | 23个广泛使用的基准函数 | 计算机视觉 | NA | NA | 哈里斯猎鹰优化算法 | NA | 23个基准函数 |
| 134 | 2024-08-06 |
Detection, molecular typing and phylogenetic analysis of Leishmania isolated from cases of leishmaniasis among Syrian refugees in Lebanon
2016-Jun, Parasite epidemiology and control
IF:2.0Q3
DOI:10.1016/j.parepi.2016.02.002
PMID:29988171
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研究论文 | 本文研究了从黎巴嫩叙利亚难民中分离出的利什曼原虫的检测、分子分型和系统发育分析 | 首次比较了两种不同的分子方法在黎巴嫩的利什曼原虫检测和识别中的效果 | 未能全面阐明皮肤利什曼病的流行病学情况 | 探讨在黎巴嫩的利什曼病流行情况以及检测方法的有效性 | 39个来自石蜡包埋（FFPE）组织的利什曼原虫分离株 | 数字病理学 | NA | ITS1-PCR RFLP和嵌套ITS1-5.8S rDNA基因扩增 | 邻接法（NJ） | DNA序列 | 39个FFPE样本 |
| 135 | 2024-08-06 |
A programming language for composable DNA circuits
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0072.focus
PMID:19535415
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计和模拟DNA电路的编程语言 | 提出了一种新的编程语言来支持基于链置换的DNA电路的设计与模拟 | 假设链没有任何次级结构，可能限制了模型的适用性 | 旨在促进DNA电路的设计及其自动编译到核苷酸序列 | 各种电路模型及其模拟，包括熵驱动的催化门和化学反应系统 | 数字病理学 | NA | 链置换 | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-08-06 |
Protocols for dry DNA storage and shipment at room temperature
2013-Sep, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.12134
PMID:23789643
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研究论文 | 本研究评估了三种干态DNA稳定化系统在常温和56°C下的效果 | 提出了不同的干燥DNA存储和运输方案，为DNA长时间保存提供了新的思路 | 研究时间跨度长达4年，但在常温下存储的DNA质量尚需更多数据支持 | 制定成本效益高、有效的DNA提取物和PCR产品的运输及存储协议 | 对比不同的DNA存储方案对昆虫DNA的保护效果 | 数字病理学 | NA | PCR，选择性测序 | NA | DNA样本 | 96孔板的昆虫DNA样本 |
| 137 | 2024-08-06 |
BioCode: two biologically compatible Algorithms for embedding data in non-coding and coding regions of DNA
2013-Apr-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-14-121
PMID:23570444
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研究论文 | 本论文提出了两种新颖的DNA数据嵌入算法BioCode，分别在非编码DNA和编码DNA中操作。 | 提出的算法遵循更严格的生物学限制，提高了信息嵌入的生物相容性和稳健性。 | 目前的方法只考虑了基本的生物学约束，未能充分考虑存在的进一步生物学限制。 | 研究旨在开发可以在DNA中嵌入非遗传信息的鲁棒算法。 | 研究对象为DNA数据嵌入算法，特别关注在活体生物基因组中的信息嵌入。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-08-06 |
Colorimetric and fluorescent independent dual "signal on" biosensor for accurate detection of ochratoxin A based on aptamer-triggered biocatalytic reactions
2024-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.342440
PMID:38499428
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研究论文 | 本文开发了一种基于适配体触发的双通道“信号开启”生物传感器，用于准确检测赭曲霉毒素A。 | 该生物传感器具有一个识别过程和两个独立的信号输出，提高了对赭曲霉毒素A的检测灵敏度。 | 目前研究仍然面临系统内校正和与“信号关闭”相关的假阳性挑战。 | 本研究的目的是提高对赭曲霉毒素A的检测准确性与可靠性。 | 研究对象为赭曲霉毒素A及其在葡萄汁和白酒中的检测。 | 数字病理学 | NA | 生物催化反应 | NA | 荧光和比色数据 | 研究中涉及的样本包括葡萄汁和白酒 |
| 139 | 2024-08-06 |
RepairNatrix: a Snakemake workflow for processing DNA sequencing data for DNA storage
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad117
PMID:38496344
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研究论文 | 本文章介绍了一种用于处理DNA存储的DNA测序数据的工作流程RepairNatrix | RepairNatrix通过支持对原始测序数据进行预处理并修复违反约束的序列，增强了数据编码的可恢复性 | 没有提到具体的局限性 | 提高DNA存储系统中原始测序数据处理的效率 | DNA测序数据及其存储 | 数字病理学 | NA | DNA测序 | NA | 测序数据 | 不同数据集的原始读数，数量减少了25-35倍 |
| 140 | 2024-08-06 |
DNA as a universal chemical substrate for computing and data storage
2024-03, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-024-00576-4
PMID:38337008
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综述 | 本文探讨了DNA在计算和数据存储中的应用，重点关注神经网络和分 compartmentalized DNA 电路。 | 提出了将DNA计算与DNA数据存储集成的观点，并探索了DNA在近记忆计算中的潜力。 | 未提及具体实验数据或案例，主要为理论探讨。 | 研究DNA在新兴信息技术和诊断中的应用潜力。 | 探讨DNA作为计算基材和存储介质的特性及其在神经网络中的应用。 | 数字病理学 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA |