生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 798 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
|
研究论文 | 介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 将光响应性邻硝基苯基磷酸酯笼状DNA发夹与'静默'反应模块集成，实现光控瞬态DNA电路/网络的动态操作 | NA | 开发光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | DNA反应电路、宪法动态网络(CDN)、凝血酶催化纤维蛋白原凝固过程 | 分子计算 | NA | 光解保护技术、DNA计算 | 计算动力学模型 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算,分子计算 | NA |
| 122 | 2025-10-05 |
Programming and monitoring surface-confined DNA computing
2024-02, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.107080
PMID:38183684
|
综述 | 系统评述表面受限DNA计算的编程与监测方法及其应用 | 首次系统总结不同表面（DNA折纸、纳米颗粒、脂质膜和芯片）对DNA计算的限制效应及其操控方法 | 未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献的归纳分析 | 探讨表面受限DNA计算系统的设计原理、监测技术及应用前景 | 基于表面反应的DNA计算系统 | 分子计算 | NA | DNA计算，表面反应技术 | NA | 分子相互作用数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 相较于溶液体系具有更高的特异性和计算速度 |
| 123 | 2025-10-05 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种基于流式细胞分选技术的DNA数据存储方法，通过封装荧光DNA微粒增强数据稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装技术保护DNA结构完整性 | NA | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 封装荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞分选技术，层层自组装封装，微流控芯片 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高密度DNA负载，长期稳定性，随机读取能力 |
| 124 | 2025-10-05 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 开发了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于活体内microRNA成像和光热治疗 | 通过近红外激光功率调控实现时空选择性microRNA成像和成像引导的按需治疗 | 未明确说明实验样本数量和具体技术参数 | 开发精确癌症诊断和高效治疗的纳米诊疗平台 | microRNA-21和癌细胞 | 生物医学工程 | 癌症 | 熵驱动链置换反应、光热治疗、荧光成像 | DNA纳米平台 | 荧光信号、图像数据 | NA | DNA | DNA链置换编码 | 分子计算 | 时空选择性成像和按需治疗能力 |
| 125 | 2025-10-05 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
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研究论文 | 本研究揭示质子泵抑制剂奥美拉唑对类蛋白质自发放电特性的显著影响及其在非常规计算领域的应用潜力 | 首次发现奥美拉唑可调控类蛋白质的放电特性，并将其与布尔逻辑结合开拓生物计算新范式 | 研究仅聚焦单一药物作用，尚未系统探索其他质子调节剂的影响机制 | 探索药物调控下生物分子系统的计算潜力 | 类蛋白质（proteinoids）与奥美拉唑的相互作用系统 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑分析、电信号记录 | NA | 电生理信号 | NA | 蛋白质 | 布尔编码 | 分子计算, 生物计算 | 通过药物浓度调控实现放电模式的可编程性 |
| 126 | 2025-10-05 |
A practical DNA data storage using an expanded alphabet introducing 5-methylcytosine
2025, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.147
PMID:39906332
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于5-甲基胞嘧啶扩展分子字母表的实用DNA数据存储转码方案R+ | 首次将5-甲基胞嘧啶作为额外分子字母引入DNA数据存储系统，提高了信息密度 | 仅对代表性文件进行了实验验证，样本规模有限 | 开发基于修饰碱基的高密度DNA数据存储系统 | DNA分子作为数据存储介质 | DNA数据存储 | NA | 纳米孔测序 | NA | 数字文件 | 多个1.3∼1.6 kbps DNA片段 | DNA | R+转码方案 | DNA计算 | 数据恢复率：有参考时98.97%，无参考时86.91% |
| 127 | 2025-10-05 |
Integrating Genomics into the Care of People with Palliative Needs: A Global Scoping Review of Policy Recommendations
2023, Public health genomics
IF:1.3Q4
DOI:10.1159/000527963
PMID:36380618
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综述 | 通过范围综述评估将基因组学整合到姑息治疗中的政策建议现状 | 首次系统评估全球姑息治疗与基因组学政策的整合情况，揭示政策空白 | 仅分析政策文件，未评估实际临床实施效果 | 识别将基因组学整合到姑息治疗患者及其家庭护理中的政策建议 | 姑息治疗和基因组学政策文件 | 医疗政策研究 | 姑息治疗 | 基因组学检测 | NA | 政策文档 | 78项政策 | DNA | NA | NA | NA |
| 128 | 2025-10-05 |
Robust multi-read reconstruction from noisy clusters using deep neural network for DNA storage
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.019
PMID:39807110
|
研究论文 | 提出一种基于深度神经网络的鲁棒多读重建方法RobuSeqNet，用于DNA存储系统中的序列重建 | 首次设计专门处理含污染序列噪声簇的神经网络，通过注意力机制和精心设计的网络结构有效应对链断裂、重排和错误聚类等问题 | 仅在三个下一代测序数据集上验证，未测试在其他类型DNA存储数据上的性能 | 提高DNA存储系统中序列重建的准确性和鲁棒性 | DNA存储系统中的序列重建 | 机器学习 | NA | 下一代测序 | 深度神经网络，注意力机制 | DNA测序数据 | 三个下一代测序数据集 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 在含20%污染序列的噪声簇中仍保持96.44%-99.74%的重建成功率 |
| 129 | 2025-10-05 |
Efficient data reconstruction: The bottleneck of large-scale application of DNA storage
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113699
PMID:38517891
|
综述 | 本文回顾DNA存储技术现状，分析数据重建瓶颈对大规模应用的影响 | 从数据重建角度系统分析DNA存储技术瓶颈，提出影响实际应用的关键因素 | 未提出具体解决方案，主要基于现有技术分析 | 探讨DNA存储技术在大规模应用中的数据重建瓶颈问题 | DNA存储技术及其数据重建过程 | 生物信息存储 | NA | DNA合成、DNA测序 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、持久性、重建成本与延迟 |
| 130 | 2025-01-05 |
High-Speed Sequential DNA Computing Using a Solid-State DNA Origami Register
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c01557
PMID:39735316
|
研究论文 | 本文介绍了一种固态DNA折纸寄存器，用于高速顺序DNA计算 | 设计了一种固态DNA折纸寄存器，将输出数据从3D溶液压缩到2D表面，实现了可重写的寄存器，并开发了液态电路和固态寄存器的异质集成架构，显著减少了寄存器介导的信号传输时间 | 之前的DNA折纸寄存器仅支持单次写入操作，信号传输涉及繁琐且耗时的寄存器移动，限制了顺序计算的速度 | 提高顺序DNA计算的速度，并增强DNA分子算法的可视调试和自动执行能力 | DNA折纸寄存器 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 131 | 2024-12-31 |
Stationary DNA Origami Register Drives Fast Sequential DNA Computing
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c02006
PMID:39735317
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 132 | 2025-01-04 |
Harnessing DNA computing and nanopore decoding for practical applications: from informatics to microRNA-targeting diagnostics
2025-Jan-02, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00396e
PMID:39471098
|
教程综述 | 本文综述了DNA计算和纳米孔解码的基础知识、技术和方法，并重点介绍了针对microRNA作为生物标志物的医学诊断中的最新进展 | 将DNA计算与纳米孔解码技术结合，应用于医学诊断，特别是针对microRNA的检测 | 实际应用中仍面临技术和实施挑战 | 探索DNA计算和纳米孔解码在医学诊断中的实际应用 | DNA计算设备和纳米孔解码技术 | 分子计算 | NA | DNA计算、纳米孔技术 | NA | 核酸分子 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 133 | 2024-12-28 |
Exploring the Potential of DNA Computing for Complex Big Data Problems: A Case Study on the Traveling Car Renter Problem
2024-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3396142
PMID:38709614
|
研究论文 | 本文探讨了DNA计算在解决复杂大数据问题中的潜力，特别是针对旅行租车问题（TCRP）的案例研究 | 提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决TCRP问题，展示了DNA计算在并行计算中的潜力 | 研究仅通过模拟实验验证了算法的有效性，未在实际DNA计算环境中进行测试 | 探索DNA计算在解决NP难问题中的应用，特别是针对TCRP问题 | 旅行租车问题（TCRP） | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 134 | 2024-12-28 |
Design of DNA Storage Coding Scheme With LDPC Codes and Interleaving
2024-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3379976
PMID:38512749
|
研究论文 | 本文提出了一种新的DNA存储编码方案，结合了低密度奇偶校验（LDPC）码和交织技术 | 通过使用优化的LDPC码和交织技术，显著减少了完美恢复所需的寡核苷酸读取次数，并开发了一个非均匀二进制对称通道的DNA通道模型 | 未提及具体实验样本数量及实际应用中的潜在限制 | 提高DNA存储的可靠性和解码性能 | DNA存储编码方案 | 机器学习 | NA | LDPC码, 交织技术 | LDPC | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-12-28 |
An Encoding Table Corresponding to ASCII Codes for DNA Data Storage and a New Error Correction Method HMSA
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3356522
PMID:38252580
|
研究论文 | 本文提出了一种与ASCII码对应的DNA数据存储编码表及新的错误校正方法HMSA | 结合ASCII码构建了ASCII-DNA编码表，并提出了新的错误校正方法HMSA，能够校正Reads中的替换、插入和删除错误，以及连续错误 | 未提及具体实验数据或实际应用中的限制 | 标准化DNA编码系统，提高DNA数据存储的编码密度和错误校正能力 | DNA数据存储系统 | 数据存储 | NA | DNA编码、错误校正 | HMSA | 文本、音频、视频 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 136 | 2024-12-28 |
DNA Sequences Under Multiple Guanine-Cytosine (GC) Base Pairs Constraint
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3316431
PMID:37721871
|
研究论文 | 本文提出了一种基于麻雀进化搜索算法（SESA）的DNA序列设计方法，并引入了多重GC碱基对约束以提高DNA序列的质量 | 提出了麻雀进化搜索算法（SESA）和多重GC碱基对约束，显著提高了DNA序列设计的效率和质量 | 未提及具体实验样本量或实际应用场景的验证 | 提高DNA序列设计的效率和质量，以优化DNA计算的结果 | DNA序列 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | 麻雀进化搜索算法（SESA） | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 137 | 2024-12-28 |
A Novel Algorithm for Solving the Prize Collecting Traveling Salesman Problem Based on DNA Computing
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3307458
PMID:37607150
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的新算法，用于解决奖励收集旅行商问题（PCTSP） | 使用Adleman-Lipton模型基于DNA计算解决PCTSP，并通过模拟实验验证了该模型的可行性 | NA | 解决奖励收集旅行商问题（PCTSP）及其他组合优化问题 | 奖励收集旅行商问题（PCTSP）的开放实例 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 138 | 2024-12-28 |
Iterative Soft Decoding Algorithm for DNA Storage Using Quality Score and Redecoding
2024-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3284406
PMID:37294652
|
研究论文 | 本文提出了一种新的迭代软解码算法，用于DNA存储系统中的错误纠正 | 提出了一种基于质量评分和重新解码的迭代软解码算法，提高了错误纠正码的纠正能力和DNA存储系统的鲁棒性 | NA | 提高DNA存储系统中错误纠正码的纠正能力和系统的鲁棒性 | DNA存储系统中的错误纠正 | 生物信息学 | NA | FASTQ文件分析 | 迭代软解码算法 | DNA测序数据 | 三组不同的测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 139 | 2024-12-26 |
Random Sanitization in DNA Information Storage Using CRISPR-Cas12a
2024-Dec-25, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c11380
PMID:39658506
|
研究论文 | 本文提出了一种基于CRISPR-Cas12a的DNA信息存储随机消毒方法（RSDISC），用于实现元数据的安全擦除 | 利用CRISPR-Cas12a的侧链切割（trans-activity）特性，实现了对单链DNA（ssDNA）的选择性消毒，消毒效率高达99.9% | 目前的研究主要集中于存储和读取数据的过程，缺乏全面的元数据安全擦除解决方案 | 开发一种DNA信息存储中的随机消毒方法，以提高元数据的安全性和可管理性 | DNA信息存储中的元数据 | DNA信息存储 | NA | CRISPR-Cas12a | NA | DNA序列 | 28,258个寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 140 | 2024-12-25 |
Harnessing Demethylase-Regulated Catalytic DNA Circuit for In-Situ Investigation of the Regulatory Connection with MicroRNA
2024-Dec-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05225
PMID:39668155
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研究论文 | 本文构建了一种由ALKBH5调节的催化DNA电路，用于在活细胞中进行miRNA的原位成像 | 本文创新性地将N6-甲基腺苷（mA）修饰的I-R3 DNAzyme引入电路组件，通过ALKBH5介导的去甲基化途径恢复其催化活性，实现了miRNA的高特异性和高灵敏度成像 | NA | 研究表观遗传调节因子与miRNA之间的潜在关联 | ALKBH5、miRNA、DNAzyme、催化DNA电路 | 生物分析 | NA | DNAzyme、催化DNA电路 | NA | DNA、miRNA | 活细胞 | NA | NA | NA | NA |