生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 805 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Padlock probe-mediated qRT-PCR for DNA computing answer determination
2011-Jun, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-010-9227-8
PMID:21691417
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研究论文 | 开发基于Padlock探针的qRT-PCR方法用于DNA计算中旅行商问题最优解的序列定量检测 | 首次将Padlock探针介导的qRT-PCR技术应用于DNA计算领域，实现多组短DNA序列的同时高效定量 | 未明确说明该方法在更复杂计算问题中的扩展性及最大并行检测目标数 | 建立DNA计算中答案判定的高效定量检测方法 | 10聚体DNA序列 | DNA计算 | NA | Padlock探针,qRT-PCR,酶连接 | NA | DNA序列数据 | 三组目标序列的验证实验 | DNA | 序列特异性杂交 | DNA计算 | 线性检测范围0.2 pg-20 ng，扩增效率98.7%，支持多重检测 |
| 82 | 2025-10-05 |
Kinetics of DNA and RNA Hybridization in Serum and Serum-SDS
2010-Sep-01, IEEE transactions on nanotechnology
IF:2.1Q3
DOI:10.1109/TNANO.2010.2053380
PMID:20967137
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA的交叉催化网络，用于放大血清中与癌症相关的特定miRNA | 利用DNA计算技术构建核酸化学网络，无需PCR即可实现miRNA的扩增检测 | 目前仅报告了初步进展，DNA网络的子组件测试和初步模拟结果 | 开发基于DNA纳米技术的癌症早期检测方法 | 血清中的microRNA（miRNA）生物标志物 | DNA计算 | 癌症 | DNA纳米技术，DNA计算，核酸杂交 | DNA-based cross-catalytic network | 生物分子数据 | NA | DNA, RNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 能够检测血液中低丰度的miRNA分子 |
| 83 | 2025-10-05 |
SELF-RECOGNITION OF DNA FROM LIFE PROCESSES TO DNA COMPUTATION
2007-Apr, Biophysical reviews and letters
DOI:10.1142/S1793048007000490
PMID:20640192
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研究论文 | 探讨DNA结构如何编码生命过程及其在自下而上纳米技术和DNA计算中的应用 | 利用DNA的自识别和自组装特性开发纳米技术，并基于DNA链的大规模并行性和沃森-克里克互补性实现计算技术微型化 | NA | 研究DNA结构对生命过程的编码机制及其在纳米技术和计算领域的应用潜力 | DNA分子及其核苷酸组成（腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤） | DNA计算 | NA | DNA纳米技术 | NA | 分子结构数据 | NA | DNA | 沃森-克里克互补性编码 | DNA计算 | 利用DNA链的大规模并行性实现高性能计算 |
| 84 | 2025-10-05 |
Robustness from flexibility in the fungal circadian clock
2010-Jun-24, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-88
PMID:20576110
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研究论文 | 通过数学模型研究真菌生物钟电路中灵活性与鲁棒性的关系 | 揭示了生物钟电路中互锁反馈环结构通过增加灵活性来提升鲁棒性的新机制 | 研究基于数学模型和真菌Neurospora crassa，在其他生物系统中的普适性需要验证 | 探索生物电路中灵活性与鲁棒性的相互关系 | 真菌Neurospora crassa的生物钟电路及其分生孢子形成调控 | 系统生物学 | NA | 数学建模、计算机模拟、敏感性分析 | 转录翻译反馈模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2025-10-05 |
DNA Media Storage
2007-Sep, International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications : [proceedings]. International Conference on Bio-inspired Computing, Theories and Applications
PMID:20622994
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研究论文 | 提出一种使用DNA作为文件存储介质的新方法，通过多序列比对和智能启发式算法实现低错误率的内容恢复 | 将DNA应用于数据存储领域，结合多序列比对和智能启发式算法来确定最可能的文件内容 | 发现时间限制、资源需求高和序列不匹配等问题尚未完全解决 | 探索DNA作为数据存储介质的可行性 | DNA存储技术 | DNA计算 | NA | 多序列比对、智能启发式算法 | NA | 文件数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 最小化错误率 |
| 86 | 2025-10-05 |
Neural Network Circuits for Bionic Associative Memory and Temporal Order Memory Based on DNA Strand Displacement
2025-05, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3425060
PMID:39012737
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研究论文 | 基于DNA链置换反应构建了仿生联想记忆和时间顺序记忆的神经网络电路 | 首次在DNA分子水平实现巴甫洛夫联想记忆，并开发了具有时间顺序记忆能力的DNA电路 | 仅通过软件仿真验证电路可靠性，尚未进行实际生物实验验证 | 利用DNA链置换技术开发生物计算和神经网络的新型实现方法 | DNA分子电路和仿生记忆系统 | 分子计算 | NA | DNA链置换(DSD) | 神经网络电路 | 分子信号 | NA | DNA | DNA链置换编码 | DNA计算,分子计算 | 通过模块化设计支持构建更复杂的DNA仿生电路和智能电路 |
| 87 | 2025-10-05 |
The role of predictive modelling in rationally re-engineering biological systems
2009-04, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/nrmicro2107
PMID:19252506
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综述 | 本文综述了系统生物学与合成生物学的融合框架，探讨通过预测性建模重新设计生物系统的潜力 | 提出整合系统生物学与合成生物学的框架，为大规模生物电路重新工程化提供系统级优化方法 | 未提供具体实验验证，主要基于理论框架和前景展望 | 探讨预测性建模在生物系统重新工程化中的作用 | 生物系统、生物电路、细胞组成部件 | 合成生物学 | NA | 基因组合成与移植技术 | 预测性建模 | NA | NA | DNA | NA | 分子计算, 细胞计算 | 大规模生物电路重新工程化的系统级优化能力 |
| 88 | 2025-10-05 |
Participant characteristics that influence consent for genetic research in a population-based survey: the Baltimore epidemiologic catchment area follow-up
2008, Community genetics
DOI:10.1159/000113880
PMID:18376114
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研究论文 | 本研究探讨了基于人群调查中影响参与者同意基因研究的社会人口学和健康特征 | 揭示了影响生物样本捐赠、基因检测和长期存储意愿的不同因素模式 | 样本仅来自巴尔的摩流行病学集水区随访研究，可能限制结果的普适性 | 调查影响参与者同意基因研究的社会人口学和健康特征 | 纵向社区调查的参与者 | 流行病学 | 多种疾病 | 基因检测 | 逻辑回归分析 | 调查数据、生物样本 | 1071名2004/5年受访者中的83%同意捐赠生物样本 | DNA | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-10-05 |
DP-ID: Interleaving and Denoising to Improve the Quality of DNA Storage Image
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00671-6
PMID:39578306
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研究论文 | 提出一种名为DP-ID的新型DNA存储编码解码方法，用于提高图像存储的信息密度和重建质量 | 通过动态规划算法压缩图像、DNA序列交织和椒盐噪声中值滤波，有效应对插入删除错误，在高错误率下仍能重建高质量图像 | 未明确说明方法对特定类型图像的适用性限制 | 提高DNA存储中图像存储的信息密度和重建质量 | 数字图像 | DNA存储 | NA | 动态规划算法、中值滤波、DNA测序 | NA | 图像 | NA | DNA | 二进制编码、DNA碱基映射 | DNA计算 | 5倍测序深度下重建高质量图像，显著降低DNA存储成本 |
| 90 | 2025-10-05 |
Engineering DNA circuit powered by entropy integrated into robust and elegant photoelectrochemical and photothermal dual-mode biosensing
2025-Jun, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-025-05848-6
PMID:40131437
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研究论文 | 开发了一种基于熵驱动DNA电路的光电化学和光热双模式生物传感器，用于检测microRNA-221 | 优化设计的熵驱动DNA电路使输出DNA产量翻倍并显著提高传感器灵敏度，同时采用电沉积制备的ZnO纳米棒光电信标提高了稳定性和可控性 | NA | 开发具有自我验证检测结果能力的双信号模式生物传感器 | microRNA-221 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、光热检测、DNA电路 | NA | 光电信号、温度信号 | NA | DNA | 碱基配对 | DNA计算 | 检测范围：1.0 fmol/L-50.0 pmol/L（光电模式）和5.0×10 fmol/L-5.0 nmol/L（光热模式） |
| 91 | 2025-10-05 |
Highly sensitive detection of the tetracycline resistance gene tetA in water supply systems with an autocatalytic deoxyribonucleic acid-based cascade circuit
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138226
PMID:40220386
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研究论文 | 开发了一种基于杂交链式反应和脱氧核酶的等温无酶级联放大系统，用于水环境中四环素抗性基因的高灵敏度检测 | 结合杂交链式反应与脱氧核酶设计自催化反馈回路，实现指数级信号放大，无需PCR和酶参与 | 未明确说明检测系统的稳定性和长期使用性能 | 开发高效、低成本、稳定的水环境中抗生素抗性基因现场检测方法 | 水供应系统中的四环素抗性基因tetA | 生物传感 | 抗生素耐药性 | 杂交链式反应(HCR)、脱氧核酶、荧光检测 | DNA级联电路 | 荧光信号 | 实际水样 | DNA | NA | 分子计算 | 检测限低至4.6 pM，与ddPCR检测结果高度相关(R=0.997) |
| 92 | 2025-10-05 |
Localized DNA Logic Circuit Equipped with Cascade Amplifiers for Precise Identification of Cancer Cells
2025-Mar-25, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00247
PMID:40091166
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研究论文 | 开发了一种配备级联放大器的局部DNA逻辑电路，用于精确识别癌细胞 | 通过将Y形AND门电路模块和三个发夹放大器模块集成到DNA四面体中，构建了具有级联放大功能的局部DNA电路 | NA | 提高癌细胞检测的精确性和灵敏度 | 癌细胞和健康细胞 | 分子计算 | 癌症 | DNA逻辑电路，荧光检测 | Y形AND门逻辑电路 | 荧光信号 | NA | DNA | DNA链置换 | DNA计算，分子计算 | 检测灵敏度：miR-21为82.5 pM，FEN1为0.015 U/mL；信号放大倍数：与无放大器电路相比提高15.5倍，与非局部电路相比灵敏度提高5.2倍 |
| 93 | 2025-10-05 |
Pragmatic soft-decision data readout of encoded large DNA
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf102
PMID:40091194
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研究论文 | 提出一种实用的软决策数据读出方法，用于编码大DNA的数据读取，实现无需组装序列重构和错误校正 | 通过水印嵌入和软决策前向-后向算法，实现无需读段组装、插入缺失错误校正和超低覆盖度数据读取 | 方法仅在质粒规模(~51kb)验证，大规模实际应用效果需进一步验证 | 开发高效可靠的DNA存储数据读取方法 | 编码大DNA片段的数据读取 | DNA存储 | NA | 纳米孔测序，软决策算法，水印嵌入技术 | 前向-后向算法 | DNA序列数据 | 两个环形质粒(~51kb)，大规模数据集模拟 | DNA | 水印编码，错误校正编码 | 分子计算，DNA计算 | 在1-4×覆盖度下实现无错误恢复，支持多种错误率条件下的大规模数据集 |
| 94 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas12a-Assisted DNA Circuit for Nonmicroscopic Detection of Cell Surface Receptor Clustering
2025-02-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.4c02770
PMID:39924908
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-Cas12a的DNA电路，用于无显微镜检测细胞表面受体聚集 | 首次将Cas12a与DNA电路结合用于非显微镜检测细胞表面受体聚集，基于邻近原理将蛋白质相互作用转化为DNA条形码 | 存在泄漏反应需要最小化，目前只能进行半定量检测 | 开发不依赖显微镜的细胞表面蛋白质相互作用检测方法 | 人类乳腺癌细胞系中的HER2同源二聚体和与HER1、HER3的异源二聚体 | 分子诊断 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas12a, DNA电路技术 | NA | 分子信号 | 人类乳腺癌细胞系模型 | DNA | DNA条形码 | 分子计算, DNA计算 | 适用于快速筛选诊断应用和药物发现 |
| 95 | 2025-10-05 |
Highly Reusable Enzyme-Driven DNA Logic Circuits
2025-03-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c15176
PMID:40035235
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研究论文 | 提出一种利用核酸外切酶III实现酶驱动DNA逻辑电路高度重用的方法 | 通过选择性消化双链DNA同时保留门链，使电路高度恢复到无废链的初始状态 | 未明确说明在更复杂电路中的重用性能极限 | 解决酶驱动DNA逻辑电路缺乏重用能力的问题 | 酶驱动DNA逻辑电路 | 分子计算 | NA | 核酸外切酶III消化 | DNA逻辑电路 | 分子数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算 | 在相对复杂电路中实现4次转换输入重用，平方根DNA电路中实现3次多重重用 |
| 96 | 2025-10-05 |
Molecular Circuit-Controlled Nanoparticle Folders for Programmable DNA Information Access
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c13882
PMID:39945285
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研究论文 | 提出了一种通过DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现可编程DNA信息访问的新策略 | 首次利用DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现动态可编程的DNA数据访问操作，突破了传统PCR和DNA杂交方法的局限 | 未明确说明系统的存储容量和错误率等性能指标 | 开发可编程的DNA数据访问方法以提高分子数据读取效率 | DNA存储系统中的信息访问机制 | 分子计算 | NA | DNAzyme电路，纳米粒子文件夹技术 | 逻辑电路模型（YES、AND、OR） | DNA分子数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 展示了多操作模式扩展能力，但未提供具体存储容量指标 |
| 97 | 2025-10-05 |
Ultrafast and Accurate DNA Storage and Reading Integrated System Via Microfluidic Magnetic Beads Polymerase Chain Reaction
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c17817
PMID:39946680
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研究论文 | 开发了一种基于微流控磁珠PCR的集成系统，用于实现快速准确的DNA存储与读取 | 提出名为MMBP的自制微流控PCR和DNA磁珠技术，将随机访问时间缩短至10分钟，提高读取精度和灵敏度 | 未明确说明系统存储容量和错误率的具体数据 | 解决DNA存储中快速准确数据检索的挑战 | DNA存储系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控PCR、DNA磁珠技术、DNA电化学合成 | NA | 数字信息编码的DNA序列 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 随机访问时间10分钟，较低测序深度，成本降低 |
| 98 | 2025-10-05 |
Integrating lanthanide coordination polymer ratiometric fluorescence biosensors with a concatenated DNA circuit for locus-specific N6-methyladenosine quantification
2025-Mar-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06742h
PMID:39992289
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研究论文 | 开发了一种整合镧系配位聚合物比率荧光生物传感器与级联DNA电路的检测方法，用于准确定量分析癌症细胞和组织中位点特异性的N6-甲基腺嘌呤 | 首次将镧系配位聚合物比率荧光传感与点击化学驱动的级联DNA电路相结合，实现位点特异性m6A的高精度检测 | NA | 开发高灵敏度和准确性的位点特异性m6A定量检测技术 | 癌症细胞和组织中的N6-甲基腺嘌呤修饰 | 生物传感 | 癌症 | 比率荧光生物传感, 级联DNA电路, 点击化学 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 99 | 2025-10-05 |
Engineered Living Memory Microspheroid-Based Archival File System for Random Accessible In Vivo DNA Storage
2025-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202415358
PMID:39981833
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研究论文 | 提出一种基于工程化活记忆微球体的DNA存储系统，实现体内DNA数据的随机存取 | 首次将质粒功能与DNA数据以键值对格式结合，通过微流控技术快速封装细菌并实现基于荧光表达的文件检索 | 仅演示了2种文件类型的检索，系统容量和实际应用规模尚未验证 | 开发高效随机存取的DNA数据存储系统以满足EB-YB级数据存储需求 | DNA数据存储材料和检索系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控技术、冻干保存、荧光分选 | NA | DNA数据、图像文件 | 每种文件类型至少10个副本，使用N个光学通道 | DNA | 键值对格式 | DNA计算, 分子计算 | 支持EB-YB级数据库，室温存储，5分钟封装时间 |
| 100 | 2025-10-05 |
FEN1-assisted DNA logic amplifier circuit for fast and compact DNA computing
2024-Apr-23, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc00203b
PMID:38577866
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研究论文 | 本研究开发了基于FEN1酶催化信号放大的DNA逻辑放大器电路，用于实现快速紧凑的DNA计算 | 利用FEN1催化的信号放大反应构建DNA逻辑门，输入链浓度低于1 nM，比其他DNA逻辑电路低100倍以上 | NA | 开发快速紧凑的DNA计算方法 | DNA逻辑放大器电路 | 分子计算 | NA | FEN1酶催化信号放大 | DNA逻辑门（AND-OR、OR-AND、FAN-IN、FAN-OUT、4位平方根电路） | DNA链 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 输入浓度低于1 nM，快速紧凑的计算能力 |