生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Neural Network Circuits for Bionic Associative Memory and Temporal Order Memory Based on DNA Strand Displacement
2024-Jul-16, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3425060
PMID:39012737
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研究论文 | 该文章构建了基于DNA链置换的仿生关联记忆和时间顺序记忆电路 | 通过DNA链置换反应实现了DNA分子层面的Pavlovian关联记忆，拓展了生物计算的发展和神经网络的应用场景 | NA | 探讨在DNA分子层面实现关联记忆和时间顺序记忆的可能性 | DNA链置换反应构建的各种记忆电路 | 计算机视觉 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
Erasable and Field Programmable DNA Circuits Based on Configurable Logic Blocks
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400011
PMID:38698560
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研究论文 | 该文章提出了一种基于可配置逻辑块的可擦除现场可编程DNA电路 | 该电路通过使用操作控制信号的夹子链条实现了可擦除和现场可编程的功能，能高效实现多种逻辑操作 | 目前仅展示了基本的与二进制计算相关的操作，可能缺乏其他复杂电路的示范 | 研究和开发一种新的可编程DNA电路，提高其在实际应用中的可行性 | 本研究对象是基于可配置逻辑块的DNA电路 | 数字病理学 | NA | DNA电路设计 | 可配置逻辑块 | NA | NA |
| 83 | 2024-08-05 |
High-Risk Sequence Prediction Model in DNA Storage: The LQSF Method
2024-Jul-08, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3424576
PMID:38976468
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研究论文 | 本文介绍了一种利用深度学习模型预测高风险序列的LQSF方法，以改善传统DNA存储技术中的错误修正问题 | LQSF方法通过主动过滤低质量序列，在编码阶段引入了积极的序列过滤，这是对传统方法的重大改进 | 未提及具体的限制因素 | 改善DNA存储技术中的错误修正，提高存储效率 | 高风险序列的预测与低质量序列的过滤 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 神经网络 | 序列数据 | 在多个数据集上进行了广泛的训练和测试，具体样本数量未提供 |
| 84 | 2024-08-05 |
An Exo III-powered closed-loop DNA circuit architecture for biosensing/imaging
2024-06-14, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-024-06476-0
PMID:38877347
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研究论文 | 本研究提出了一种Exo III驱动的闭环DNA电路架构，用于生物传感和成像 | 提出了一种新的Exo III驱动闭环DNA电路架构，集成了四个高效的AND逻辑门，提高了电路的操作效率与应用范围 | NA | 本研究旨在提高DNA逻辑电路的操作效率并扩展其应用领域 | 利用设计好的ECDC架构在体外智能确定miR-21 | 数字病理学 | 癌症 | DNA电路 | AND逻辑门 | NA | NA |
| 85 | 2024-08-05 |
DetSpace: a web server for engineering detectable pathways for bio-based chemical production
2024-Jul-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae287
PMID:38634809
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研究论文 | DetSpace是一个网络服务器，用于设计可检测的生物电路以促进生物基化学品的生产 | 提供了一种系统的方法来设计对特定目标化合物浓度响应的遗传电路 | 当前的生产效率在标度化过程中仍然面临挑战，如滴度、速率和产量 | 旨在提高生物基化学品的生产效率 | 研究生物电路的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 生物传感器 | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-06 |
Exploring the Potential of DNA Computing for Complex Big Data Problems: A Case Study on the Traveling Car Renter Problem
2024-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3396142
PMID:38709614
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算在复杂大数据问题中的潜力，以旅行租车问题为例 | 采用基于Adleman-Lipton模型的DNA算法解决旅行租车问题，展现了DNA计算在处理NP难题中的独特优势 | 对该算法的性能依赖于模拟实验和特定实例的计算，可能不能普遍适用于所有情况 | 研究DNA计算在复杂问题中的应用潜力，尤其是在旅行租车问题中的应用 | 旅行租车问题（TCRP），作为旅行销售员问题的变种 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | 模拟数据 | 多个旅行租车问题实例 |
| 87 | 2024-08-06 |
Design of DNA Storage Coding Scheme With LDPC Codes and Interleaving
2024-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3379976
PMID:38512749
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研究论文 | 本文提出了一种新的DNA存储编码方案，使用低密度奇偶校验(平衡LDPC)编码和交织技术 | 该方法通过差分进化优化的交错LDPC编码确保了DNA存储的可靠性，并通过交织技术处理非均匀误差特征 | 本文未提及具体的限制 | 研究DNA存储系统中的编码方案以提高数据恢复性能 | 主要关注低密度奇偶校验代码和交织技术在DNA存储中的应用 | NA | NA | 低密度奇偶校验编码，交织技术 | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-06 |
Leveraging Concentration Imbalance-Driven DNA Circuit as an Operational Amplifier to Enhance the Sensitivity of Hepatitis B Virus DNA Detection with Hybridization-Responsive DNA-Templated Silver Nanoclusters
2024-Jun-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.4c00291
PMID:38938798
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研究论文 | 本研究提出了一种通过浓度不平衡驱动的DNA电路来增强HBV DNA检测灵敏度的新方法 | 采用浓度不平衡驱动的DNA电路作为操作放大器，结合响应杂交的DNA模板银纳米簇，提升了检测灵敏度 | NA | 开发灵敏且可靠的HBV DNA检测方法 | HBV感染及其相关疾病的分子诊断 | 数字病理学 | 肝炎 | DNA模板银纳米簇 | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-06 |
Efficient DNA Coding Algorithm for Polymerase Chain Reaction Amplification Information Retrieval
2024-Jun-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126449
PMID:38928155
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研究论文 | 提出了一种高效的编码算法以优化PCR扩增信息检索 | 该算法通过可变长度扫描和修剪优化建设代码表，最大化存储密度并满足生物学约束 | 实验结果的具体适用范围及情况下的表现未详细说明 | 改善PCR扩增过程中的非特异性配对问题 | 重点研究PCR扩增中的编码算法及其对DNA序列的影响 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-06 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
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研究论文 | 本文开发了一种基于空间控制分离夹具的开关，用于增强DNA电路构建和多功能转导 | 该平台通过空间控制分离夹具开关有效减少电路泄漏，设计简单、灵活且兼容性强 | 目前未提及具体实验验证的局限性 | 研究旨在构建复杂的核酸电路并提高信号转导性能 | 使用空间控制的分离夹具开关进行多种目标间的逻辑操作 | 数字病理学 | NA | DNA链置换反应 | 分离夹具开关 | NA | NA |
| 91 | 2024-08-06 |
DNA Reaction System That Acquires Classical Conditioning
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00459
PMID:38279958
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研究论文 | 该论文提出了一种基本的DNA反应系统设计，该设计能够获得经典条件作用。 | 创新点在于构建了一种基于五种DNA链位移反应和两种降解反应的DNA反应系统，能够通过输入历史动态地获得或失去功能。 | 设计中可能存在挑战，尤其是在利用生化反应动态特性来实现记忆和学习能力方面。 | 研究旨在设计具有记忆和学习能力的DNA反应系统。 | 研究对象是基于DNA化学反应的经典条件作用学习任务。 | 生物化学反应网络 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA |
| 92 | 2024-08-06 |
DNA Logic Gates for Small Molecule Activation Circuits in Cells
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00474
PMID:38306634
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研究论文 | 本文报告了一种基于DNA的激活荧光报告器及其与DNA链位移电路的集成 | 提出了一种应用逆电子需求Diels-Alder反应的可激活荧光报告器，使其在哺乳动物细胞中更为有效且不受电路降解影响 | 未提及具体的局限性 | 研究可编程DNA电路在细胞内的应用 | 旨在设计和实现与特定DNA输入模式响应的DNA电路 | 数字病理学 | NA | 逆电子需求Diels-Alder反应 | NA | 荧光数据 | 细胞内的DNA逻辑电路，复杂性各异的多个实例 |
| 93 | 2024-08-06 |
Emergent digital bio-computation through spatial diffusion and engineered bacteria
2024-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49264-3
PMID:38851790
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研究论文 | 本研究展示了使用空间模式设计细菌计算机以处理信息的工作 | 提出了一种新方法，通过空间扩散和工程化细菌实现数字逻辑和复杂功能的组合 | NA | 探索生物计算在生物工程、生物材料和生物传感中的应用 | 细菌计算和模块化细菌群落 | 生物计算 | NA | 空间模式设计 | 模块化细菌群落 | 实验数据 | NA |
| 94 | 2024-08-06 |
First characterization of a biphasic, switch-like DNA amplification
2018-Apr-16, The Analyst
DOI:10.1039/c8an00130h
PMID:29577124
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研究论文 | 我们报告了首个具有开关特性的DNA扩增化学反应，该反应表现出双相特征 | 首次提出了双相开关式DNA扩增机制，并展示了其反应途径和热力学原理 | 缺乏关于不具回文序列时的反应机制的深入探讨 | 研究一种新的DNA扩增反应以提高产品产量 | 使用具有回文结构的DNA模板和引物进行的DNA扩增反应 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 化学反应数据 | 提供了一定量的反应类型和路径分析，但具体样本量未明确 |
| 95 | 2024-08-06 |
Two-layer cascaded catalytic hairpin assemblies based on locked nucleic acids for one-step and highly sensitive ctDNA detection
2024-Jun-06, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d4ay00611a
PMID:38774994
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研究论文 | 本研究提出了一种基于锁核酸的两层级联催化发夹组装用于高灵敏度ctDNA检测 | 引入了两层级联LNA辅助CCC电路，解决了单阶段系统的放大效率限制和信号泄漏问题 | NA | 开发一种高灵敏度、一体化的ctDNA检测方法 | 循环肿瘤DNA(ctDNA) | 数字病理学 | NA | 催化发夹组装 (CHA) | NA | NA | 已成功实施于临床样本分析 |
| 96 | 2024-08-06 |
A molecular assessment of the practical potential of DNA-based computation
2023-06, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2023.102940
PMID:37058876
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研究论文 | 本文评估了DNA计算的实际潜力与应用 | 探讨了自1990年代以来DNA计算系统的演变及其新兴应用 | 本文未提及具体的实验数据或案例研究 | 重新评估DNA计算系统的潜力和应用 | DNA计算系统及其应用 | 计算机视觉 | NA | DNA计算 | 合成电路 | NA | NA |
| 97 | 2024-08-06 |
Construction of an exogenously and endogenously Co-activated DNA logic amplifier for highly reliable intracellular MicroRNA imaging
2024-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116409
PMID:38795495
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研究论文 | 本文介绍了一种双重激活策略的DNA逻辑放大器，用于癌细胞内miRNA的高效监测。 | 本研究创新性地结合了外部光和内部ATP的双重激活方法，从而实现了对DNA逻辑电路在特定时间和位置的控制。 | 本文并未提供现实临床应用的相关数据或长时间观察结果，限制了其转化潜力。 | 研究旨在开发稳定的DNA逻辑放大器，以提高癌细胞内miRNA成像的可靠性。 | 研究对象主要为癌细胞中的miRNA。 | 数字病理学 | 癌症 | DNA逻辑电路 | CHA模块 | 图像 | NA |
| 98 | 2024-08-06 |
High-throughput DNA synthesis for data storage
2024-May-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00469d
PMID:38498347
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综述 | 本文概述了高通量DNA合成在数据存储中的应用 | 讨论了不同合成方法的技术特征和最新进展，特别关注硅芯片微阵列合成和新型酶促DNA合成 | 未提及具体的实验数据和实证研究 | 探讨DNA作为数据存储介质的潜力及其合成技术的发展 | 涉及高通量DNA合成技术及其在数据存储中的应用 | 数字病理学 | NA | 高通量DNA合成 | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-06 |
Arbitrary Digital DNA Computing: A Programmable Molecular Perceptron Driven by Lambda Exonuclease for Lighting up Concatenated Circuits
2024-May-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c03486
PMID:38688864
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研究论文 | 本文提出了一种基于Lambda外核酶的可编程分子感知器，用于设计数字DNA电路 | 提出了一种新的分子感知器，通过调整权重和偏差参数来实现任意逻辑运算，增强了分子电路的多样性 | 未提及关于实际应用或实验环境的限制 | 研究可编程分子电路的设计理念，以推动生物医学研究的发展 | 研究分子电路及其逻辑运算能力 | 分子数字计算 | NA | Lambda外核酶 | 分子感知器 | 实验数据 | 未具体说明样本数量 |
| 100 | 2024-08-06 |
Bridging the Two Worlds: A Universal Interface between Enzymatic and DNA Computing Systems
2015-May-26, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201411148
PMID:25864379
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研究论文 | 本文开发了一种通用接口，连接了酶计算和DNA计算系统 | 提出了一种能够实现不兼容的核酸和酶计算系统之间通信的接口 | NA | 探索如何将酶计算系统与DNA计算系统结合以提升功能 | 酶计算系统和DNA计算系统 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |