生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['DNA storage', 'DNA computing', 'DNA circuit', 'biological computing', 'biological circuit']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 797 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
DP-ID: Interleaving and Denoising to Improve the Quality of DNA Storage Image
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00671-6
PMID:39578306
|
研究论文 | 提出一种名为DP-ID的新型DNA存储编码解码方法，用于提高图像存储的信息密度和重建质量 | 通过动态规划算法压缩图像、DNA序列交织和椒盐噪声中值滤波，有效应对插入删除错误，在高错误率下仍能重建高质量图像 | 未明确说明方法对特定类型图像的适用性限制 | 提高DNA存储中图像存储的信息密度和重建质量 | 数字图像 | DNA存储 | NA | 动态规划算法、中值滤波、DNA测序 | NA | 图像 | NA | DNA | 二进制编码、DNA碱基映射 | DNA计算 | 5倍测序深度下重建高质量图像，显著降低DNA存储成本 |
| 82 | 2025-10-05 |
Engineering DNA circuit powered by entropy integrated into robust and elegant photoelectrochemical and photothermal dual-mode biosensing
2025-Jun, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-025-05848-6
PMID:40131437
|
研究论文 | 开发了一种基于熵驱动DNA电路的光电化学和光热双模式生物传感器，用于检测microRNA-221 | 优化设计的熵驱动DNA电路使输出DNA产量翻倍并显著提高传感器灵敏度，同时采用电沉积制备的ZnO纳米棒光电信标提高了稳定性和可控性 | NA | 开发具有自我验证检测结果能力的双信号模式生物传感器 | microRNA-221 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、光热检测、DNA电路 | NA | 光电信号、温度信号 | NA | DNA | 碱基配对 | DNA计算 | 检测范围：1.0 fmol/L-50.0 pmol/L（光电模式）和5.0×10 fmol/L-5.0 nmol/L（光热模式） |
| 83 | 2025-10-05 |
Highly sensitive detection of the tetracycline resistance gene tetA in water supply systems with an autocatalytic deoxyribonucleic acid-based cascade circuit
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138226
PMID:40220386
|
研究论文 | 开发了一种基于杂交链式反应和脱氧核酶的等温无酶级联放大系统，用于水环境中四环素抗性基因的高灵敏度检测 | 结合杂交链式反应与脱氧核酶设计自催化反馈回路，实现指数级信号放大，无需PCR和酶参与 | 未明确说明检测系统的稳定性和长期使用性能 | 开发高效、低成本、稳定的水环境中抗生素抗性基因现场检测方法 | 水供应系统中的四环素抗性基因tetA | 生物传感 | 抗生素耐药性 | 杂交链式反应(HCR)、脱氧核酶、荧光检测 | DNA级联电路 | 荧光信号 | 实际水样 | DNA | NA | 分子计算 | 检测限低至4.6 pM，与ddPCR检测结果高度相关(R=0.997) |
| 84 | 2025-10-05 |
Localized DNA Logic Circuit Equipped with Cascade Amplifiers for Precise Identification of Cancer Cells
2025-Mar-25, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00247
PMID:40091166
|
研究论文 | 开发了一种配备级联放大器的局部DNA逻辑电路，用于精确识别癌细胞 | 通过将Y形AND门电路模块和三个发夹放大器模块集成到DNA四面体中，构建了具有级联放大功能的局部DNA电路 | NA | 提高癌细胞检测的精确性和灵敏度 | 癌细胞和健康细胞 | 分子计算 | 癌症 | DNA逻辑电路，荧光检测 | Y形AND门逻辑电路 | 荧光信号 | NA | DNA | DNA链置换 | DNA计算，分子计算 | 检测灵敏度：miR-21为82.5 pM，FEN1为0.015 U/mL；信号放大倍数：与无放大器电路相比提高15.5倍，与非局部电路相比灵敏度提高5.2倍 |
| 85 | 2025-10-05 |
Pragmatic soft-decision data readout of encoded large DNA
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf102
PMID:40091194
|
研究论文 | 提出一种实用的软决策数据读出方法，用于编码大DNA的数据读取，实现无需组装序列重构和错误校正 | 通过水印嵌入和软决策前向-后向算法，实现无需读段组装、插入缺失错误校正和超低覆盖度数据读取 | 方法仅在质粒规模(~51kb)验证，大规模实际应用效果需进一步验证 | 开发高效可靠的DNA存储数据读取方法 | 编码大DNA片段的数据读取 | DNA存储 | NA | 纳米孔测序，软决策算法，水印嵌入技术 | 前向-后向算法 | DNA序列数据 | 两个环形质粒(~51kb)，大规模数据集模拟 | DNA | 水印编码，错误校正编码 | 分子计算，DNA计算 | 在1-4×覆盖度下实现无错误恢复，支持多种错误率条件下的大规模数据集 |
| 86 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas12a-Assisted DNA Circuit for Nonmicroscopic Detection of Cell Surface Receptor Clustering
2025-02-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.4c02770
PMID:39924908
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR-Cas12a的DNA电路，用于无显微镜检测细胞表面受体聚集 | 首次将Cas12a与DNA电路结合用于非显微镜检测细胞表面受体聚集，基于邻近原理将蛋白质相互作用转化为DNA条形码 | 存在泄漏反应需要最小化，目前只能进行半定量检测 | 开发不依赖显微镜的细胞表面蛋白质相互作用检测方法 | 人类乳腺癌细胞系中的HER2同源二聚体和与HER1、HER3的异源二聚体 | 分子诊断 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas12a, DNA电路技术 | NA | 分子信号 | 人类乳腺癌细胞系模型 | DNA | DNA条形码 | 分子计算, DNA计算 | 适用于快速筛选诊断应用和药物发现 |
| 87 | 2025-10-05 |
Highly Reusable Enzyme-Driven DNA Logic Circuits
2025-03-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c15176
PMID:40035235
|
研究论文 | 提出一种利用核酸外切酶III实现酶驱动DNA逻辑电路高度重用的方法 | 通过选择性消化双链DNA同时保留门链，使电路高度恢复到无废链的初始状态 | 未明确说明在更复杂电路中的重用性能极限 | 解决酶驱动DNA逻辑电路缺乏重用能力的问题 | 酶驱动DNA逻辑电路 | 分子计算 | NA | 核酸外切酶III消化 | DNA逻辑电路 | 分子数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算 | 在相对复杂电路中实现4次转换输入重用，平方根DNA电路中实现3次多重重用 |
| 88 | 2025-10-05 |
Molecular Circuit-Controlled Nanoparticle Folders for Programmable DNA Information Access
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c13882
PMID:39945285
|
研究论文 | 提出了一种通过DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现可编程DNA信息访问的新策略 | 首次利用DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现动态可编程的DNA数据访问操作，突破了传统PCR和DNA杂交方法的局限 | 未明确说明系统的存储容量和错误率等性能指标 | 开发可编程的DNA数据访问方法以提高分子数据读取效率 | DNA存储系统中的信息访问机制 | 分子计算 | NA | DNAzyme电路，纳米粒子文件夹技术 | 逻辑电路模型（YES、AND、OR） | DNA分子数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 展示了多操作模式扩展能力，但未提供具体存储容量指标 |
| 89 | 2025-10-05 |
Ultrafast and Accurate DNA Storage and Reading Integrated System Via Microfluidic Magnetic Beads Polymerase Chain Reaction
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c17817
PMID:39946680
|
研究论文 | 开发了一种基于微流控磁珠PCR的集成系统，用于实现快速准确的DNA存储与读取 | 提出名为MMBP的自制微流控PCR和DNA磁珠技术，将随机访问时间缩短至10分钟，提高读取精度和灵敏度 | 未明确说明系统存储容量和错误率的具体数据 | 解决DNA存储中快速准确数据检索的挑战 | DNA存储系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控PCR、DNA磁珠技术、DNA电化学合成 | NA | 数字信息编码的DNA序列 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 随机访问时间10分钟，较低测序深度，成本降低 |
| 90 | 2025-10-05 |
Integrating lanthanide coordination polymer ratiometric fluorescence biosensors with a concatenated DNA circuit for locus-specific N6-methyladenosine quantification
2025-Mar-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06742h
PMID:39992289
|
研究论文 | 开发了一种整合镧系配位聚合物比率荧光生物传感器与级联DNA电路的检测方法，用于准确定量分析癌症细胞和组织中位点特异性的N6-甲基腺嘌呤 | 首次将镧系配位聚合物比率荧光传感与点击化学驱动的级联DNA电路相结合，实现位点特异性m6A的高精度检测 | NA | 开发高灵敏度和准确性的位点特异性m6A定量检测技术 | 癌症细胞和组织中的N6-甲基腺嘌呤修饰 | 生物传感 | 癌症 | 比率荧光生物传感, 级联DNA电路, 点击化学 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 91 | 2025-10-05 |
Engineered Living Memory Microspheroid-Based Archival File System for Random Accessible In Vivo DNA Storage
2025-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202415358
PMID:39981833
|
研究论文 | 提出一种基于工程化活记忆微球体的DNA存储系统，实现体内DNA数据的随机存取 | 首次将质粒功能与DNA数据以键值对格式结合，通过微流控技术快速封装细菌并实现基于荧光表达的文件检索 | 仅演示了2种文件类型的检索，系统容量和实际应用规模尚未验证 | 开发高效随机存取的DNA数据存储系统以满足EB-YB级数据存储需求 | DNA数据存储材料和检索系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控技术、冻干保存、荧光分选 | NA | DNA数据、图像文件 | 每种文件类型至少10个副本，使用N个光学通道 | DNA | 键值对格式 | DNA计算, 分子计算 | 支持EB-YB级数据库，室温存储，5分钟封装时间 |
| 92 | 2025-10-05 |
FEN1-assisted DNA logic amplifier circuit for fast and compact DNA computing
2024-Apr-23, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc00203b
PMID:38577866
|
研究论文 | 本研究开发了基于FEN1酶催化信号放大的DNA逻辑放大器电路，用于实现快速紧凑的DNA计算 | 利用FEN1催化的信号放大反应构建DNA逻辑门，输入链浓度低于1 nM，比其他DNA逻辑电路低100倍以上 | NA | 开发快速紧凑的DNA计算方法 | DNA逻辑放大器电路 | 分子计算 | NA | FEN1酶催化信号放大 | DNA逻辑门（AND-OR、OR-AND、FAN-IN、FAN-OUT、4位平方根电路） | DNA链 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 输入浓度低于1 nM，快速紧凑的计算能力 |
| 93 | 2025-10-05 |
Performance of cellulose-based card for direct genetic testing of spinal muscular atrophy
2025-Feb-14, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00938-2
PMID:39953527
|
研究论文 | 开发了一种基于纤维素的卡片作为脊髓性肌萎缩症基因检测的替代滤纸 | 首次开发纤维素基卡片作为FTA卡或Guthrie卡的替代品，用于脊髓性肌萎缩症的基因检测 | 研究主要针对印度尼西亚等发展中国家，未与其他类型滤纸进行广泛比较 | 开发适用于脊髓性肌萎缩症基因检测的廉价替代滤纸 | 脊髓性肌萎缩症（SMA）患者和携带者 | 医学遗传学 | 脊髓性肌萎缩症 | 直接PCR-RFLP, 多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | NA | 基因检测数据 | 未明确说明具体样本数量 | DNA | NA | NA | 存储稳定性达3个月，检测结果与标准方法完全匹配 |
| 94 | 2025-10-05 |
Integrating an entropy-driven DNA circuit with a tetrahedral scaffold as a generic in situ electrochemical biosensor for amplified detection of microRNAs
2025-Feb-24, The Analyst
DOI:10.1039/d4an01528b
PMID:39925032
|
研究论文 | 开发了一种集成熵驱动DNA电路与四面体支架的通用电化学生物传感器，用于高灵敏度检测microRNAs | 将四面体DNA纳米结构同时用作电极表面的支架和熵驱动DNA电路的底物，实现了接近均相液相反应性能的界面反应 | 未明确说明生物样本的具体数量和类型，实验验证范围有限 | 开发高灵敏度、高特异性的microRNA检测方法用于早期癌症诊断 | 致癌相关microRNAs（如miR-96） | 生物传感器 | 癌症 | 熵驱动DNA电路，四面体DNA纳米结构，电化学检测，qRT-PCR | NA | 电化学信号，生物分子数据 | B[a]PDE暴露细胞的生物样本 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 检测限74 aM，动态范围100 aM至100 pM |
| 95 | 2025-10-05 |
Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues
2025-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117198
PMID:39893948
|
研究论文 | 构建分层DNA电路用于临床组织中位点特异性m6A-MALAT1的单分子分析 | 首次构建分层DNA电路实现单分子水平m6A-MALAT1检测，结合VMC10-DNAzyme的高特异性识别和单分子检测的超高信噪比 | 未明确说明方法在复杂临床样本中的普适性验证 | 开发高灵敏度和特异性的位点特异性m6A RNA修饰检测方法 | 临床组织样本中的m6A-MALAT1 RNA修饰 | 分子诊断 | 乳腺癌 | 分层DNA电路，VMC10-DNAzyme，单分子检测 | NA | 分子检测信号 | 多种癌细胞系及乳腺癌患者与健康个体样本 | DNA | NA | 分子计算 | 检测灵敏度1.8 aM，动态范围7个数量级，可区分0.001% m6A-MALAT1 |
| 96 | 2025-10-05 |
pH-Controlled DNA Switching Circuits with Multi-State Responsiveness for Logic Computation and Control
2025-Mar-20, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404541
PMID:39876816
|
研究论文 | 提出一种pH控制的多状态DNA开关电路构建策略，实现通过三链体构象转换的动态调控 | 利用三链体独特的pH响应特性构建多状态DNA开关电路，实现三种状态间的动态调控和对杂交链式反应的逻辑计算控制 | 未明确说明电路在复杂环境中的稳定性和实际生物应用中的具体限制 | 开发动态DNA电路构建策略，实现化学反应网络的智能响应和动态调控 | DNA开关电路、三链体结构、杂交链式反应(HCR) | 分子计算 | NA | DNA计算、三链体构象转换、toehold介导的链置换反应 | DNA开关电路 | 分子信号 | NA | DNA | 三链体构象编码 | DNA计算,分子计算 | 适用于大规模化学反应网络和DNA纳米结构自组装的动态调控 |
| 97 | 2025-10-05 |
A Multi-Input Molecular Classifier Based on Digital DNA Strand Displacement for Disease Diagnostics
2025-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202413198
PMID:39891016
|
研究论文 | 开发了一种基于数字DNA链置换的分子计算方法，用于疾病诊断中的生物标志物分类 | 提出数字DNA链置换（DDSD）方法，通过DNA聚合酶延伸和链释放实现目标识别和价态操作，显著减少寡核苷酸使用数量 | 未明确说明临床样本的具体数量和类型，潜在泄漏风险虽已减少但仍存在 | 开发高效的分子计算系统用于疾病诊断和生物标志物检测 | 临床血液样本中的细菌和病毒感染生物标志物 | 分子计算 | 细菌和病毒感染 | DNA链置换，DNA聚合酶延伸 | 二元分类器，多类分类器 | 分子信号 | 临床血液样本（具体数量未明确） | DNA | 价态编码 | DNA计算，分子计算 | 可同时计算14个价态，最大价态25，通过级联DDSD和多路连接DDSD实现扩展 |
| 98 | 2025-10-05 |
Turning waste into wealth: Enzyme-activated DNA sensor based on reactant recycle for spatially selective imaging microRNA toward target cells
2025-Feb-01, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343557
PMID:39800513
|
研究论文 | 开发了一种基于APE1激活反应物循环的DNA传感器，用于在目标细胞中进行空间选择性microRNA成像 | 首次开发APE1激活的反应物循环催化DNA电路；实现细胞和动物体内高空间选择性的miRNA成像；提高体外和体内成像的信背比；提供自动通用的方法区分癌细胞与正常细胞中的miRNA | 需要消耗燃料DNA；依赖脂质体克服核酸递送的生物屏障 | 开发高效选择性成像癌细胞中microRNA的DNA传感器 | 癌细胞中的microRNA | 生物传感器 | 癌症 | 催化DNA电路，链置换反应，脂质体递送 | DNA传感器 | 荧光成像数据 | 细胞和动物实验 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 提高肿瘤与正常组织的对比度，降低脱瘤信号 |
| 99 | 2025-10-05 |
Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway
2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.117109
PMID:39756268
|
研究论文 | 提出一种基于谷胱甘肽激活的DNA电路，通过连续响应机制实现microRNA的高保真成像及相关调控通路的原位解析 | 通过将二硫键整合到预封闭核酸探针中，有效控制电路信号泄漏，实现时空选择性microRNA成像 | 未明确说明该系统的检测灵敏度极限和在实际生物样本中的验证范围 | 开发高保真生物分子成像技术，探索生物分子相互作用网络 | microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH）的相互作用 | 分子计算 | 癌症 | DNA电路技术，非酶催化信号放大 | 催化DNA电路 | 分子成像数据 | 多种癌细胞类型 | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可实现不同生物分子相互作用的稳健分析和探索 |
| 100 | 2025-10-05 |
Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification
2025-Jan-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c18752
PMID:39760699
|
研究论文 | 开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，通过两步DNA电路放大实现啶虫脒的高灵敏检测 | 结合能量转移机制、两步DNA电路放大（熵驱动DNA循环和DNA步行器）和双模式传感策略，实现了超灵敏的农药检测 | 未明确说明实际样品检测的复杂基质干扰问题 | 开发高灵敏度和准确度的啶虫脒检测方法以保障食品安全 | 农药啶虫脒 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、电化学发光检测、DNA电路放大、核酸适配体识别 | NA | 化学传感信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | 检测范围0至1×10 M，检测限20.2 fM（PEC模式）和17.5 fM（ECL模式） |