生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 767 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-07 |
Evaluation of novel forensic DNA storage methodologies
2011-Nov, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2010.08.007
PMID:20837408
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研究论文 | 本研究评估了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术在法医学中的应用 | 开发了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术，如Gentegra产品 | 该技术似乎依赖于DNA提取方法，磁珠提取的DNA无法安全存储超过6个月 | 比较Gentegra产品与-20°C和Qiasafe存储的DNA数量和质量 | 法医学中DNA的安全存储 | 法医学 | NA | 脱水生物学技术 | NA | DNA | 未具体说明样本数量 |
| 642 | 2024-08-07 |
DNA word set design based on minimum free energy
2010-Dec, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2010.2069570
PMID:20840907
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研究论文 | 本文开发了一种基于最小自由能（MFE）标准的算法，用于设计DNA短词集 | 该算法直接生成实际的DNA词集，不同于其他学术和统计数字，能够减少错误杂交反应的出现，提高DNA计算的可靠性和规模 | NA | 开发一种新的算法，用于设计基于最小自由能的DNA短词集 | DNA短词集的设计 | 生物分子计算 | NA | 最小自由能（MFE） | NA | DNA序列 | NA |
| 643 | 2024-08-07 |
SELF-RECOGNITION OF DNA FROM LIFE PROCESSES TO DNA COMPUTATION
2007-Apr, Biophysical reviews and letters
DOI:10.1142/S1793048007000490
PMID:20640192
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研究论文 | 本文探讨了DNA结构如何编码生命过程，并利用其微小尺寸、自我识别和自组装机制进行自下而上的纳米技术 | 利用DNA的并行性和沃森-克里克互补性进行DNA计算，以实现现有计算技术的小型化 | NA | 研究DNA结构如何编码生命过程，并探索其在纳米技术中的应用 | DNA的结构及其在生命过程和纳米技术中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 644 | 2024-08-07 |
Robustness from flexibility in the fungal circadian clock
2010-Jun-24, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-4-88
PMID:20576110
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研究论文 | 本文通过数学模型研究了真菌Neurospora crassa的菌丝形成电路中，中央负反馈回路与正反馈回路相互锁定结构对时钟灵活性和鲁棒性的影响 | 本文首次展示了生物电路中更大的灵活性可以提高鲁棒性，并引入了适用于更广泛细胞振荡器的新颖敏感性分析技术 | NA | 研究生物电路结构如何赋予系统级特性如鲁棒性 | 真菌Neurospora crassa的菌丝形成电路 | NA | NA | 数学模型 | 转录-翻译反馈模型 | NA | NA |
| 645 | 2024-08-07 |
Mathematical modeling: bridging the gap between concept and realization in synthetic biology
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/541609
PMID:20589069
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review | 本文综述了数学建模在合成生物学中的重要性和方法，包括模型假设、建模框架类型（确定性和随机性）以及参数估计和优化的重要性 | NA | NA | 探讨数学建模在合成生物学中连接概念与实现的作用 | 合成生物学中的数学建模概念、方法及其应用 | synthetic biology | NA | 数学建模 | 确定性模型和随机性模型 | NA | NA |
| 646 | 2024-08-07 |
Applying DNA computation to intractable problems in social network analysis
2010-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2010.05.006
PMID:20566337
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研究论文 | 本文提出基于DNA计算的方法来解决社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 利用DNA计算的高信息密度和大规模并行性来解决传统计算机架构难以处理的NP完全问题 | NA | 探索DNA计算在社交网络分析中的应用，以解决复杂的社会网络问题 | 社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 社交网络数据 | NA |
| 647 | 2024-08-07 |
DNA computing circuits using libraries of DNAzyme subunits
2010-Jun, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2010.88
PMID:20512129
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研究论文 | 本文报道了一种基于催化核酸（DNAzymes）库的DNA计算平台，用于动态组装通用逻辑门和半加器/半减法器系统 | 首次展示了多层门级联、扇出门和并行逻辑门操作，并能根据输入标记调控反义分子或适配体的表达，作为酶的抑制剂 | NA | 开发适用于生物工程和纳米医学的生物计算系统 | DNA计算电路及其模块化耦合和可扩展性 | 生物工程 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 648 | 2024-08-07 |
Networks and circuits in cell regulation
2010-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2010.05.015
PMID:20457126
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研究论文 | 本文研究了酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路，通过广泛的数值模拟分析探讨了网络表示和相应的数学模型 | 提出了一种结合组件连接和功能任务的建模策略，以更好地理解细胞功能的动态过程 | 研究仅限于酵母细胞周期的G1到S阶段，可能不适用于其他生物过程 | 探索细胞调控中的网络和电路模型，以实现对复杂细胞功能动态的更真实描述 | 酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路 | NA | NA | 数值模拟分析 | 数学模型 | NA | NA |
| 649 | 2024-08-07 |
Biological computing with diffusion and excitable calcium stores
2004-Jun, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2004.1.147
PMID:20369965
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研究论文 | 研究细胞内信号传递中通过扩散和兴奋性钙储存的几何配置生成完整逻辑门的能力，以及如何利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建生物信号的符合检测器 | 探讨了不同几何配置的兴奋性钙储存生成逻辑门的能力，并描述了利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建符合检测器的方法 | NA | 研究细胞内信号传递中的计算能力 | 细胞内兴奋性钙储存的几何配置及钙诱导的钙释放机制 | 生物计算 | NA | 兴奋性钙诱导的钙释放 | NA | NA | NA |
| 650 | 2024-08-07 |
A microfluidic DNA computing processor for gene expression analysis and gene drug synthesis
2009-Nov-06, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/1.3259628
PMID:20216967
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研究论文 | 本文描述了一种用于基因表达分析和基因药物合成的微流控DNA计算处理器，该处理器能够执行布尔逻辑操作 | 该处理器通过微流控芯片集成多步生物化学反应，实现了对多个基因表达的同步分析和相应的基因药物合成，具有简单快速的特点 | NA | 开发一种用于基因表达分析和基因药物合成的微流控DNA计算处理器 | 使用与癌症相关的多个基因作为输入分子，通过其表达水平与计算相关DNA链的相互作用进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 微流控技术 | NA | DNA | 多个癌症相关基因 |
| 651 | 2024-08-07 |
Free energy estimation of short DNA duplex hybridizations
2010-Feb-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-11-105
PMID:20181279
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研究论文 | 本文比较了四种已发表的DNA/DNA双链自由能计算方法与基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，并提出了一种改进模型 | 提出了基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，该模型在标准和非标准实验条件下都能准确估计完美匹配双链的自由能 | 文章未明确提及具体的局限性 | 比较不同DNA双链自由能计算方法的相似性与差异，并提出改进模型 | 695对短寡核苷酸序列 | 生物信息学 | NA | 最近邻模型 | 最近邻模型 | 序列 | 695对短寡核苷酸序列 |
| 652 | 2024-08-07 |
Nanoinformatics and DNA-based computing: catalyzing nanomedicine
2010-May, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1203/PDR.0b013e3181d6245e
PMID:20118825
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综述 | 本文综述了纳米信息学和基于DNA的计算在纳米医学和再生医学中的应用，分析了其科学基础、当前研究和项目、预期应用及可能出现的问题 | 纳米信息学和基于DNA的计算为纳米医学和再生医学提供了新的催化剂，可能彻底改变生物医学中的信息建模和处理方式 | 纳米医学在成本效益研究、临床试验、毒性测试、药物递送方法和新个性化疗法的实施方面仍面临挑战 | 探讨纳米信息学和基于DNA的计算如何促进纳米医学的发展，并分析其潜在的应用和问题 | 纳米信息学和基于DNA的计算在纳米医学和再生医学中的应用 | 纳米医学 | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
| 653 | 2024-08-07 |
Algorithm for thermodynamically based prediction of DNA/DNA cross-hybridisation
2010, International journal of bioinformatics research and applications
DOI:10.1504/IJBRA.2010.031294
PMID:20110211
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研究论文 | 本文介绍了一种基于热力学模型的算法HYBGRAPH，用于预测DNA/DNA交叉杂交的二级结构 | 开发了一种新的算法HYBGRAPH，用于预测DNA/DNA交叉杂交复合物的二级结构 | NA | 设计DNA链以优化生物应用中的杂交能量 | DNA/DNA交叉杂交的二级结构 | 生物信息学 | NA | 热力学模型 | 动态规划 | DNA序列 | NA |
| 654 | 2024-08-07 |
Forecast calls for clouds over biological computing
2010-Jan, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm0110-6a
PMID:20057394
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2024-08-07 |
Solving the fully-connected 15-city TSP using probabilistic DNA computing
2009-Mar, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1039/b821735c
PMID:20023738
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研究论文 | 本文展示了如何使用合理的DNA量、更高的效率和准确性以及一种新的读出方法来执行计算，成功解决了具有15个顶点和210条边的最大DNA计算问题 | 本文提出了一种新的读出方法，提高了DNA计算的效率和准确性 | NA | 展示如何克服DNA计算的技术限制，实现更高效和准确的计算 | 完全连接的15城市旅行商问题（TSP） | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | 15个顶点和210条边的问题 |
| 656 | 2024-08-07 |
Green technologies for room temperature nucleic acid storage
2010, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
PMID:19801719
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研究论文 | 本研究评估了两种新型技术在室温下存储DNA的完整性和质量，并与-20°C冷冻存储进行了比较 | 介绍了两种新型核酸稳定技术，能够在室温下以成本效益高、环境友好的方式存储DNA和RNA | NA | 评估新型核酸稳定技术在室温下存储DNA和RNA的效果 | DNA和RNA的存储完整性和质量 | NA | NA | PCR, DNA测序, SNP微阵列, 定量逆转录PCR | NA | 核酸 | 具体样本数量未提及 |
| 657 | 2024-08-07 |
A splicing model-based DNA-computing approach on microfluidic chip
2009-Oct, Electrophoresis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/elps.200900323
PMID:19798677
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研究论文 | 本文提出了一种基于微流控芯片的拼接模型DNA计算方法 | 首次在微流控芯片上实现了基于拼接模型的DNA计算，并应用有限自动机进行等腰三角形的模式识别 | NA | 开发一种高效、可控且易于集成的DNA计算方法，为未来构建完整的生物分子计算机铺平道路 | 基于DNA生物化学反应的计算形式，特别是拼接计算模型 | 生物计算 | NA | DNA消化、连接、分离和检测 | 有限自动机 | DNA | 两个输入符号(a, b)和三个状态(S0, S1, S2) |
| 658 | 2024-08-07 |
CANADA: designing nucleic acid sequences for nanobiotechnology applications
2010-Feb, Journal of computational chemistry
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jcc.21353
PMID:19530109
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研究论文 | 本文介绍了CANADA软件包，用于设计满足特定和高效杂交要求的核酸序列，适用于DNA计算和基于DNA的纳米技术应用 | CANADA软件包提供了设计、分析和处理核酸序列的工具，这些工具对于DNA计算和纳米技术应用至关重要 | NA | 开发用于设计核酸序列的软件工具，以支持DNA计算和纳米技术应用 | 核酸序列的设计和优化 | NA | NA | NA | NA | 序列数据 | NA |
| 659 | 2024-08-07 |
Network inference by combining biologically motivated regulatory constraints with penalized regression
2009-Mar, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/j.1749-6632.2008.03751.x
PMID:19348637
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研究论文 | 本文通过结合生物学启发的调控约束与惩罚回归，扩展并测试了惩罚回归方案，以重建生物分子网络 | 提出了一个新的扩展方法，即在重建网络中加入生物约束，要求出链具有相同的调控符号 | 线性模型不足以涵盖大多数复杂行为，主要适用于接近稳态的系统 | 改进生物分子网络的重建性能 | 生物分子网络的重建算法 | 计算系统生物学 | NA | 惩罚回归 | 线性模型 | mRNA或蛋白质丰度测量 | 数据来自模拟和真实qPCR测量 |
| 660 | 2024-08-07 |
A review of prenatally detected femoral abnormalities
2009-Jul, Clinical dysmorphology
IF:0.4Q4
DOI:10.1097/MCD.0b013e32832443b1
PMID:19339877
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综述 | 本文综述了在产前检测到的股骨异常的管理和结果 | 提出了多学科团队方法，包括胎儿医学、遗传学、儿科放射学和病理学，以促进准确的诊断和适当的咨询 | 在分娩前很难达到正确的诊断，且家庭对不确定性的程度感到困难 | 评估产前检测到股骨异常的胎儿在三级护理胎儿医学单位的管理和结果 | 产前检测到股骨异常的胎儿及其家庭 | NA | NA | NA | NA | NA | 41例病例 |