生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2024-08-07 |
The surface-based approach for DNA computation is unreliable for SAT
2005-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.05.007
PMID:16024166
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研究论文 | 本文探讨了基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的不可靠性，并提出需要增加验证步骤来确保计算结果的准确性 | 本文首次揭示了基于表面的DNA计算方法在某些情况下可能导致所有剩余的DNA链都错误地表示问题实例，从而证明该方法的不可靠性 | 本文指出基于表面的DNA计算方法在某些情况下可能导致所有剩余的DNA链都错误地表示问题实例，而没有进行有效的验证步骤 | 验证基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的可靠性 | 基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的可靠性 | NA | NA | DNA计算 | NA | DNA链 | 四变量四子句的3-SAT实例 |
| 642 | 2024-08-07 |
Markov chains: computing limit existence and approximations with DNA
2005-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.05.003
PMID:15982800
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研究论文 | 本文提出了两种算法用于在马尔可夫链上进行计算，并使用DNA计算来估计极限 | 本文通过DNA计算实现了马尔可夫链极限的计算和估计 | NA | 研究如何使用DNA计算来处理马尔可夫链的极限问题 | 马尔可夫链的极限存在性和近似计算 | NA | NA | DNA computing | NA | DNA strands | NA |
| 643 | 2024-08-07 |
A DNA solution of SAT problem by a modified sticker model
2005-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.01.001
PMID:15917122
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研究论文 | 本文通过修改贴纸模型设计了一种不需要初始数据池的SAT问题DNA计算算法 | 提出了一种不依赖初始数据池的SAT问题求解算法，通过逐步构建解决方案序列来满足每个子句，最终解决整个布尔公式 | 该算法在问题规模扩大时可能仍面临数据池大小增长的挑战 | 设计一种适用于大规模SAT问题的DNA计算算法 | SAT问题及其DNA计算方法 | NA | NA | DNA计算 | 贴纸模型 | DNA序列 | 数据池大小从一种分子增长到解决方案分配的数量 |
| 644 | 2024-08-07 |
DNA shuttling between plasmid vectors and a genome vector: systematic conversion and preservation of DNA libraries using the Bacillus subtilis genome (BGM) vector
2005-Jun-24, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2005.04.041
PMID:15913652
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研究论文 | 本文介绍了一种新构建的Bacillus subtilis genome (BGM)载体，能够有效地整合来自细菌人工染色体(BAC)载体的DNA，并展示了如何将BAC库转换为BGM库，以及DNA在BGM中的稳定保存 | 新构建的BGM载体能够高效整合来自BAC载体的DNA，并实现了DNA在B. subtilis中的稳定保存和长期低成本的存储与运输 | NA | 研究如何通过结合BAC和BGM载体系统来处理和保存大型DNA片段 | BAC和BGM载体系统，以及来自拟南芥线粒体DNA的BAC库 | NA | NA | NA | NA | DNA | 18个独立的拟南芥线粒体DNA克隆 |
| 645 | 2024-08-07 |
Design of nucleic acid sequences for DNA computing based on a thermodynamic approach
2005, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gki235
PMID:15701762
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研究论文 | 开发了一种基于最小自由能（DeltaG (min)）的算法，用于设计具有均匀熔解温度的多条核酸序列，这些序列与其互补序列之间不发生非特异性杂交 | 该算法的创新之处在于使用贪心搜索计算DeltaG (min)，有效排除不合适的序列，从而大幅减少计算时间 | NA | 设计适用于DNA计算的核酸序列 | 核酸序列及其在计算、工程应用和纳米制造中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | 126条序列 |
| 646 | 2024-08-07 |
Collaborative design for automated DNA storage that allows for rapid, accurate, large-scale studies
2004-Dec, Assay and drug development technologies
IF:1.6Q3
DOI:10.1089/adt.2004.2.683
PMID:15674026
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研究论文 | 本文介绍了Genomics Collaborative公司如何自动化其DNA处理、存储和检索的方法 | 本文首次展示了商业实体如何通过其大型全球样本库在工业规模上支持遗传研究 | NA | 支持药物发现的持续需求，制定样本存储和收集的战略方向 | DNA样本的自动化处理、存储和检索 | 基因组学 | NA | 自动化DNA处理 | NA | DNA样本 | 大型全球样本库中的大量人类样本 |
| 647 | 2024-08-07 |
Solving traveling salesman problems with DNA molecules encoding numerical values
2004-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2004.06.005
PMID:15555757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA热力学性质的DNA编码方法和偏向分子算法，用于解决旅行商问题 | 该方法利用DNA的热力学性质进行有效的局部搜索，扩展了DNA计算在解决数值优化问题上的能力 | NA | 探索DNA计算在解决数值优化问题上的应用 | 旅行商问题 | 生物信息学 | NA | 温度梯度聚合酶链反应和温度梯度凝胶电泳 | NA | DNA | NA |
| 648 | 2024-08-07 |
A new DNA computing model for the NAND gate based on induced hairpin formation
2004-Nov, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2004.04.005
PMID:15527948
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研究论文 | 本文提出了一种基于诱导发夹形成的DNA计算模型，用于实现NAND逻辑门 | 利用序列特异性结合的小分子配体诱导发夹形成，提供了控制发夹形成的灵活性，并保持了高度的特异性杂交敏感性 | NA | 开发一种新的DNA计算模型，用于实现逻辑NAND门 | DNA分子的发夹结构及其在逻辑门中的应用 | 生物技术 | NA | 诱导发夹形成 | 理论模型 | NA | NA |
| 649 | 2024-08-07 |
Strong coupling of nonlinear electronic and biological oscillators: reaching the "amplitude death" regime
2004-Oct-08, Physical review letters
IF:8.1Q1
DOI:10.1103/PhysRevLett.93.158102
PMID:15524944
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研究论文 | 研究了电子和生物电路之间的相互作用，使用自发振荡的橄榄核神经元作为单细胞生物元素，通过改变振荡器之间的耦合强度，观察到一系列由模型计算预测的行为，包括可逆的低能量耗散“幅度死亡”状态。 | 首次实现了非线性电子和生物振荡器之间的强耦合，并观察到“幅度死亡”状态。 | 仅限于单细胞生物元素的实验，未涉及更复杂的生物系统。 | 探索电子和生物振荡器之间的相互作用及其对系统行为的影响。 | 电子振荡器和自发振荡的橄榄核神经元。 | NA | NA | NA | NA | NA | 一对振荡器 |
| 650 | 2024-08-07 |
DNA computing using single-molecule hybridization detection
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh817
PMID:15388798
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研究论文 | 本文探讨了使用单分子杂交检测技术进行DNA计算的方法 | 结合DNA计算与单分子检测，实现了计算的小型化并显著减少了所需的DNA量 | 目前实现的并行度远低于使用的DNA分子数量 | 旨在利用核酸进行计算，解决需要大量搜索空间的优化问题 | DNA计算的并行性和单分子检测技术 | NA | NA | 荧光交叉相关光谱学 | NA | DNA分子 | 使用了单个DNA分子进行检测 |
| 651 | 2024-08-07 |
DNA display I. Sequence-encoded routing of DNA populations
2004-Jul, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.0020173
PMID:15221027
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研究论文 | 本文介绍了一种用于DNA路由基因的模块化设计，以及由寡核苷酸和商业化色谱树脂制成的路由机械，用于将纳摩尔量的DNA基于序列分配到物理上不同的子池中。 | 提出了一种新的模块化设计方法和路由机械，用于DNA序列编码的路由，提高了DNA编程化学合成的效率。 | 文章未明确提及具体的局限性。 | 旨在开发实用的实验工具，以实现DNA导向的有机合成和DNA计算中的DNA路由技术。 | 研究对象包括DNA路由基因的设计和路由机械的构建。 | 生物技术 | NA | DNA路由技术 | NA | DNA序列 | 纳摩尔量的DNA |
| 652 | 2024-08-07 |
Demonstration of a universal surface DNA computer
2004, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkh635
PMID:15181177
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研究论文 | 本文展示了能够模拟布尔逻辑电路的表面DNA计算机 | 首次展示了表面DNA计算机能够模拟布尔逻辑电路，并通过DNA操作实现了NOR和OR门的构建 | NA | 验证表面DNA计算机模拟布尔逻辑电路的能力 | 表面DNA计算机及其在布尔逻辑电路中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 表面DNA计算机 | DNA | NA |
| 653 | 2024-08-07 |
Microarray-based in vitro evaluation of DNA oligomer libraries designed in silico
2004-Mar-19, Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/cphc.200300978
PMID:15067873
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研究论文 | 本文报道了基于微阵列的体外评估，针对在计算机设计用于超分子自组装应用的两个DNA寡核苷酸序列库 | 首次将理论预测的序列基序特性与实际性能进行比较，并展示了微阵列方法在快速评估其他DNA序列库中的应用潜力 | NA | 比较理论预测的序列基序特性与实际性能 | 两个DNA寡核苷酸序列库 | 生物技术 | NA | 微阵列技术 | NA | DNA序列 | 两个DNA寡核苷酸序列库 |
| 654 | 2024-08-07 |
Animal-free production of ccc-supercoiled plasmids for research and clinical applications
2004-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.511
PMID:14978750
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研究论文 | 本文开发了一种大规模制造工艺，用于生产不含动物源性物质的ccc超螺旋质粒DNA，并使用毛细管凝胶电泳（CGE）进行质量控制和稳定性评估 | 首次实现了符合良好制造规范（GMP）的制药级质粒生产，并首次在DNA存储实验中评估了不同质粒形式的物理稳定性 | NA | 开发一种新的大规模制造工艺，用于生产高质量的ccc超螺旋质粒DNA，适用于研究和临床应用 | ccc超螺旋质粒DNA的生产工艺及其质量控制 | NA | NA | 毛细管凝胶电泳（CGE） | NA | DNA | NA |
| 655 | 2024-08-07 |
Controlled assembly of dendrimer-like DNA
2004-Jan, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/nmat1045
PMID:14704783
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research paper | 本文展示了从Y形DNA（Y-DNA）控制组装成树枝状DNA（DL-DNA）的过程 | 首次展示了从Y形DNA控制组装成树枝状DNA的过程，并证明了其稳定性和几乎单分散的特性 | NA | 探索DNA作为通用材料而非仅限于遗传材料的潜力 | 树枝状DNA（DL-DNA）的合成与控制组装 | DNA nanotechnology | NA | NA | NA | NA | NA |
| 656 | 2024-08-07 |
Hairpin formation in DNA computation presents limits for large NP-complete problems
2003-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00145-x
PMID:14643488
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算中发夹结构的形成对解决大型NP完全问题的限制 | NA | 本文指出当前DNA计算范式无法解决大型NP完全问题，因为发夹结构的稳定性限制了问题规模 | 研究DNA计算中发夹结构的稳定性及其对解决NP完全问题规模的影响 | 发夹结构的稳定性和其在DNA计算中的概率 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 657 | 2024-08-07 |
Solving the 3-SAT problem based on DNA computing
2003 Nov-Dec, Journal of chemical information and computer sciences
DOI:10.1021/ci034113o
PMID:14632435
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的新算法来解决3-SAT问题，该算法基于Sakamoto等人提出的文字串策略，并通过仿真结果展示了计算过程中产生的最大文字串数量大幅减少，且文字串长度也最多从m减少到n。 | 本文提出的新算法基于Sakamoto等人的文字串策略，有效减少了计算过程中产生的最大文字串数量和长度。 | NA | 解决3-SAT问题 | 3-SAT问题 | 计算理论 | NA | DNA计算 | NA | 文字串 | NA |
| 658 | 2024-08-07 |
[Progress in molecular biology study of DNA computer]
2003-Sep, Yi chuan xue bao = Acta genetica Sinica
PMID:14577383
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研究论文 | 本文介绍了DNA计算机的基本原理、应用及其与基因组研究的重要关系 | DNA计算机具有大规模并行计算能力和潜在的巨大数据存储容量，被视为计算领域的革命性进展 | NA | 探讨DNA计算机的研究进展及其在分子生物学和计算科学中的应用 | DNA计算机及其相关技术 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 659 | 2024-08-07 |
A multi-investigator/institutional DNA bank for AIDS-related human genetic studies: AACTG Protocol A5128
2003 Sep-Oct, HIV clinical trials
DOI:10.1310/MUQC-QXBC-8118-BPM5
PMID:14583845
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研究论文 | 本文介绍了AACTG协议A5128，一个多调查者/机构用于艾滋病相关人类遗传研究的DNA库的开发和实施 | 该研究通过建立一个多学科团队，解决了DNA库在保密性、伦理和监管问题上的挑战，并允许未来分析基因型-表型关系 | NA | 旨在通过分析HIV感染者中的等位基因变异与临床结果之间的关系，以促进人类基因组学知识的应用 | HIV感染者的DNA样本及其临床数据 | 人类遗传学 | 艾滋病 | DNA提取 | NA | DNA | 已招募4,247名参与者，其中82%为男性，56%为白人，26%为非裔美国人，15%为西班牙裔，代表324个不同AACTG研究和子研究的11,424个案例 |
| 660 | 2024-08-07 |
Beyond input-output computings: error-driven emergence with parallel non-distributed slime mold computer
2003-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00085-6
PMID:14563567
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研究论文 | 本文提出了一种可实现的生物计算实验方案，以激发复杂系统的涌现特性，使用真正的黏菌Physarum polycephalum作为黏菌计算机 | 文章通过修改基本细胞自动机来解决并行计算中的全局同步问题，并讨论了通过不提供所有可能结果或明确解决方案寻求来解决问题的可能性 | NA | 探索从错误中衍生的涌现现象在新型计算和计算机新用途中的关键重要性 | 真正的黏菌Physarum polycephalum及其在计算中的应用 | 计算机科学 | NA | 基本细胞自动机 | NA | NA | 单个黏菌个体 |