生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 778 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
Participant characteristics that influence consent for genetic research in a population-based survey: the Baltimore epidemiologic catchment area follow-up
2008, Community genetics
DOI:10.1159/000113880
PMID:18376114
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研究论文 | 本研究旨在探讨社会人口统计和健康特征对参与纵向社区调查者捐赠DNA样本及同意测试和长期存储该样本意愿的影响 | 研究揭示了影响捐赠生物样本意愿与同意遗传测试或存储样本意愿的不同因素 | NA | 调查社会人口统计和健康特征对捐赠DNA样本及同意测试和长期存储意愿的影响 | 参与纵向社区调查的1,071名参与者 | NA | NA | NA | NA | NA | 1,071名参与者中，83%同意捐赠生物样本 |
| 682 | 2024-08-07 |
OptCircuit: an optimization based method for computational design of genetic circuits
2008-Mar-03, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-2-24
PMID:18315885
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研究论文 | 本文介绍了OptCircuit，一种基于优化的框架，用于自动识别满足特定功能的遗传电路组件及其连接方式 | OptCircuit框架能够自动识别电路组件及其连接方式，以实现所需功能，并且能够设计出超越传统数字逻辑设计原则的电路配置 | 目前遗传电路元素间的相互作用使用确定性常微分方程建模，未来可能需要考虑更复杂的随机模拟 | 开发一种基于优化的方法，用于计算设计遗传电路 | 遗传电路的设计及其组件的优化选择 | 生物工程 | NA | 优化方法 | 常微分方程 | 文本 | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
Spontaneous deadlock breaking on amoeba-based neurocomputer
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.08.004
PMID:17889990
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研究论文 | 本文研究了基于变形虫的神经计算机如何自发地打破死锁情况 | 利用变形虫细胞膜的自发振荡产生多种时空模式来解决死锁问题 | NA | 探索生物计算范式与人工计算范式的本质差异 | 基于变形虫的神经计算机及其在死锁情况下的表现 | 计算机视觉 | NA | 光学反馈控制 | 循环神经网络 | 细胞信息处理 | 单个光敏变形虫细胞 |
| 684 | 2024-08-07 |
An evolutionary Monte Carlo algorithm for predicting DNA hybridization
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.07.005
PMID:17897776
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research paper | 本文提出了一种基于群体的蒙特卡罗算法，用于模拟反应DNA分子的微观模型，以预测DNA杂交反应。 | 该算法使用DNA分子的两个基本热力学量：结合的DNA链的结合能和未结合链的熵，来模拟微观模型。 | NA | 开发一种新的算法来预测DNA杂交反应，并验证其在逻辑推理问题中的应用。 | DNA杂交反应及其在DNA计算、DNA纳米组装和DNA生物芯片等技术中的应用。 | NA | NA | 蒙特卡罗算法 | NA | NA | NA |
| 685 | 2024-08-07 |
Solving the SAT problem using a DNA computing algorithm based on ligase chain reaction
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.08.006
PMID:17904730
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研究论文 | 本文展示了一种基于连接酶链反应的DNA计算算法，用于解决SAT问题 | 该算法通过逐步生成部分满足SAT公式的解决方案，并利用连接酶链反应进行错误修剪，显著减少了所需的DNA链数量，提高了空间效率和容错性 | NA | 开发一种新的DNA计算算法，以解决复杂的SAT问题 | SAT问题 | NA | NA | 连接酶链反应 (LCR) | NA | DNA链 | 当n=50时，最大所需的DNA链数量为2(0.48n) |
| 686 | 2024-08-07 |
Enzymatic ligation assisted by nucleases: simultaneous ligation and digestion promote the ordered assembly of DNA
2007, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2007.325
PMID:17853876
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研究论文 | 本文介绍了一种酶联辅助核酸酶技术（ELAN），用于在单管中大规模制备特定DNA分子的有序组装 | ELAN方法通过明智选择限制酶位点并结合同时进行的消化和连接反应，将非目标产物转化为底物，从而产生单一产物 | NA | 开发一种高效的方法用于DNA分子的有序组装 | DNA分子的有序组装 | 分子克隆 | NA | 酶联辅助核酸酶技术（ELAN） | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 |
| 687 | 2024-08-07 |
DNA approach to solve clustering problem based on a mutual order
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.06.002
PMID:17669585
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的聚类技术，旨在处理大规模数据集、未知数量的聚类以及数据的异质性问题 | 本文创新性地将DNA计算应用于聚类问题，通过DNA计算机制实现聚类技术的核心组件 | NA | 提出一种基于DNA计算的聚类技术 | 大规模数据集、未知数量的聚类以及数据的异质性 | 机器学习 | NA | DNA计算 | NA | 高维数据 | NA |
| 688 | 2024-08-07 |
Physarum machines: encapsulating reaction-diffusion to compute spanning tree
2007-Dec, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-007-0276-5
PMID:17603779
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研究论文 | 本文介绍了一种使用Physarum polycephalum的plasmodium作为计算基质的生物计算设备——Physarum机器，并展示了其在构建生成树方面的应用 | 本文通过在反应扩散系统中封装具有少数‘生长点’的膜，解决了反应扩散计算机无法独立构建某些邻近图的问题 | NA | 探索和验证Physarum机器在计算生成树方面的可行性 | Physarum polycephalum的plasmodium和反应扩散系统 | 生物计算 | NA | 反应扩散计算 | NA | 生物模式 | NA |
| 689 | 2024-08-07 |
Modeling molecular computing systems by an artificial chemistry - its expressive power and application
2007, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl.2007.13.3.223
PMID:17567243
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研究论文 | 本文探讨了使用人工化学模型来模拟分子计算系统的可能性，并展示了其在分子计算建模中的应用 | 提出了一种基于字符串模式匹配和重组的人工化学模型，并证明了其在计算上的通用性 | NA | 探索人工化学在模拟分子计算系统中的应用 | 分子计算系统 | NA | NA | 人工化学 | 人工化学模型 | NA | NA |
| 690 | 2024-08-07 |
Directed assembly of DNA molecules via simultaneous ligation and digestion
2007-Jan, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/000112283
PMID:17269489
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research paper | 本文介绍了一种通过同时连接和消化DNA分子的定向组装技术 | 提出了一种名为ELAN的新策略，通过酶辅助核酸酶将非目标连接产物转化为底物，显著提高了目标产物的产量 | NA | 开发一种高产量的DNA连接技术，以支持从标准分子克隆到生物物理学和DNA计算等多种下游应用 | DNA分子的定向组装 | NA | NA | ELAN (enzymatic ligation assisted by nucleases) | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 |
| 691 | 2024-08-07 |
Estimating the sequence complexity of a random oligonucleotide population by using in vitro thermal melting and Cot analyses
2005-Sep, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2005.06.003
PMID:17292083
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研究论文 | 本研究开发了一种非线性动力学模型，用于估计大型未知多核苷酸群体的序列复杂性，并通过体外重退火实验和热熔实验进行实验验证 | 开发了一种新的非线性动力学模型，用于估计随机寡核苷酸群体的序列复杂性 | NA | 实现随机寡核苷酸在DNA计算和纳米尺度自组装应用中的潜力 | 随机生成的20碱基对寡核苷酸群体的序列复杂性 | 生物医学 | NA | 体外重退火实验和热熔实验 | 非线性动力学模型 | 寡核苷酸序列 | 随机生成的20碱基对寡核苷酸群体 |
| 692 | 2024-08-07 |
Differential dependence on DNA ligase of type II restriction enzymes: a practical way toward ligase-free DNA automaton
2007-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.082
PMID:17196173
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research paper | 本文研究了不同类型的II型限制酶对DNA连接酶的依赖性，并探讨了无连接酶DNA自动机的实际应用 | 发现使用FokI等IIS型限制酶作为硬件时，DNA计算效率可能与DNA连接酶无关 | NA | 探讨无连接酶DNA自动机的可行性及其在基因组网络规模中处理基因关系的潜力 | 比较FokI与HgaI、BsmFI、BbsI和BseMII五种酶在自动机反应中对T4 DNA连接酶的依赖性差异 | 生物计算 | NA | DNA计算 | DNA自动机 | DNA分子 | 涉及五种不同的酶 |
| 693 | 2024-08-07 |
Solving satisfiability problems using a novel microarray-based DNA computer
2007 Jul-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.08.009
PMID:17029765
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进的贴纸模型和先进MEMS微阵列技术的算法，用于解决SAT问题 | 该方法通过分步构建解决方案，每一步满足一个子句，最终解决整个布尔公式，无需耗时的样本准备程序和精细的样本应用设备 | NA | 解决SAT问题 | DNA计算机算法 | 生物计算 | NA | MEMS微阵列技术 | 贴纸模型 | DNA序列 | NA |
| 694 | 2024-08-07 |
DNA computing of solutions to knapsack problems
2007-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.06.001
PMID:16860927
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研究论文 | 本文研究了使用DNA计算解决背包问题的方法，通过分子生物技术在巨大的分子库中进行并行搜索 | 本文展示了如何通过体内翻译DNA库为蛋白质来扩展计算，结合DNA和蛋白质实现多准则优化 | NA | 研究使用DNA计算解决优化问题的方法 | 背包问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 695 | 2024-08-07 |
Hybridization-ligation versus parallel overlap assembly: an experimental comparison of initial pool generation for direct-proportional length-based DNA computing
2006-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/tnb.2006.875043
PMID:16805106
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研究论文 | 本文比较了两种用于直接比例长度基DNA计算（DPLB-DNAC）的初始池生成方法：杂交连接和并行重叠组装（POA），并发现POA在种群大小、生成时间、材料使用和效率方面优于杂交连接方法。 | 首次实验比较了DPLB-DNAC中两种初始池生成方法的性能，并证实了POA方法的优势。 | NA | 评估和比较用于解决加权图问题的DPLB-DNAC的初始池生成方法。 | DPLB-DNAC的初始池生成方法，特别是杂交连接和并行重叠组装（POA）。 | DNA计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 696 | 2024-08-07 |
A logical alternative for biological computing
2006-May-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/441025c
PMID:16672949
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2024-08-07 |
Design and evaluation of single-stranded DNA carrier molecules for DNA-directed assembly
2006-Jun, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2006.10507090
PMID:16615811
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研究论文 | 本文报道了单链DNA载体分子的计算机设计和体外评估，用于指导DNA定向组装。 | 开发了一种新的单链DNA载体分子设计方法，用于高效定向DNA组装。 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内或实际应用场景。 | 探索和优化基于DNA的纳米技术中的分子识别和组装方法。 | 单链DNA载体分子及其在DNA定向组装中的应用。 | DNA微阵列技术 | NA | DNA微阵列杂交技术 | NA | DNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 698 | 2024-08-07 |
Towards computing with proteins
2006-Apr-01, Proteins
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/prot.20886
PMID:16435369
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研究论文 | 探讨蛋白质作为计算设备解决复杂计算问题的可能性 | 提出利用蛋白质网络的精确选择性和特异性设计生物系统，实现任何逻辑电路的并行异步计算 | NA | 研究蛋白质作为计算设备在医学应用中的可行性 | 蛋白质分子及其在逻辑电路中的应用 | 生物计算 | NA | 磷酸化和外切酶反应 | 逻辑门 | 蛋白质 | NA |
| 699 | 2024-08-07 |
Scalability of the surface-based DNA algorithm for 3-SAT
2006-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.12.002
PMID:16423447
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研究论文 | 本文研究了基于表面的DNA算法在解决3-SAT问题时的可扩展性，并建立了一个错误模型来分析“标记”和“破坏”操作的不完全性 | 提出了一个错误模型来分析DNA计算中“标记”和“破坏”操作的不完全性，并证明了无论这些操作的速率多大，总存在可满足的3-SAT实例导致计算结果错误 | 该方法只能解决最多N个变量的3-SAT问题，其中N受限于“标记”率和“非破坏”率的特定公式 | 探讨基于表面的DNA算法在解决3-SAT问题时的错误率和可扩展性 | 基于表面的DNA算法在3-SAT问题中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 700 | 2024-08-07 |
Genetic predisposition to cancer: the consequences of a delayed diagnosis of Gorlin syndrome
2005-Dec, Clinical oncology (Royal College of Radiologists (Great Britain))
DOI:10.1016/j.clon.2005.07.014
PMID:16372493
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病例报告 | 本文报告了一例Gorlin综合征的延迟诊断情况，并提出了多个重要问题 | NA | NA | 探讨Gorlin综合征延迟诊断的后果及其对遗传性癌症易感性的影响 | Gorlin综合征患者及其遗传易感性 | NA | 癌症 | DNA存储 | NA | NA | 单个病例 |