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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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681 | 2024-08-07 |
The bounded complexity of DNA computing
1999-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(99)00033-7
PMID:10636031
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法来分析基于DNA的分子计算算法,这些算法通过编码、管操作和提取来抽象地表征 | 定义了基于DNA的算法的复杂性,并展示了新的哈密顿路径算法比Adleman的原始算法效率提高约两倍,以及Max-Clique算法的类似效率提升 | NA | 分析和改进基于DNA的分子计算算法的效率 | 基于DNA的分子计算算法及其复杂性 | 分子计算 | NA | DNA计算 | NA | 分子 | NA |
682 | 2024-08-07 |
Length bounded molecular computing
1999-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(99)00042-8
PMID:10636040
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研究论文 | 本文研究如何在不影响运行时间和体积的情况下,减少DNA计算中已知分子算法(如3-SAT和独立集问题)的DNA链长度 | 提出了一种减少DNA链长度的方法,而不会显著增加算法的运行时间和体积 | NA | 研究DNA计算中DNA链长度的优化 | 3-SAT和独立集问题等NP完全问题的分子算法 | 分子计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA链 | NA |
683 | 2024-08-07 |
Article for analog vector algebra computation
1999-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(99)00044-1
PMID:10636042
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研究论文 | 本文介绍了由DNA链上的化学操作表示的模拟神经网络的概念,这种新型DNA计算具有容错优势,比布尔DNA计算机更能抵抗DNA杂交错误。 | 提出了一种基于DNA化学操作的模拟神经网络,具有容错性,能更好地抵抗DNA杂交错误。 | NA | 探索基于DNA的模拟神经网络的实现及其在计算中的应用。 | DNA化学操作、模拟神经网络、Hopfield联想记忆和Rumelhart等人的前馈神经网络。 | 机器学习 | NA | DNA计算 | 模拟神经网络 | DNA数据 | 可能包含多达10^9个神经元的网络 |
684 | 2024-08-07 |
Ligation errors in DNA computing
1999-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(99)00045-3
PMID:10636043
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研究论文 | 本研究测试了DNA计算中连接过程的可靠性,通过估计错误寡核苷酸连接的错误率 | 探讨了DNA计算中连接错误的依赖性,包括寡核苷酸间错配数量和碱基组合的影响 | NA | 评估DNA计算中连接过程的错误率 | DNA计算中的连接错误 | NA | NA | DNA计算 | NA | 寡核苷酸序列 | NA |
685 | 2024-08-07 |
Surface-based DNA computing operations: DESTROY and READOUT
1999-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(99)00046-5
PMID:10636044
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研究论文 | 本文研究了在基底上固定复杂组合的DNA分子混合物,并通过重复的DNA计算周期对其进行标记和酶修饰(DESTROY),以及通过循环测序和PCR扩增后进行地址阵列杂交来确定计算后DNA序列(READOUT)的方法。 | 本文选择了限制酶进行表面DESTROY操作,并研究了循环测序和PCR扩增后进行地址阵列杂交的READOUT操作。 | NA | 研究基于表面的DNA计算操作,包括DESTROY和READOUT。 | DNA分子及其在表面上的计算操作。 | 生物技术 | NA | DNA计算 | NA | DNA序列 | NA |
686 | 2024-08-07 |
The complexities of DNA computation
1999-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/s0167-7799(99)01312-8
PMID:10203773
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算的复杂性及其在实际应用中的局限性 | 通过创新的编码技术和分子生物学操作,实现了对计算复杂问题的实验性解决 | 技术问题使得DNA计算在解决现实世界问题方面难以与硅基计算竞争 | 研究DNA计算的理论与实际应用之间的桥梁 | DNA计算的编码技术和分子生物学操作 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
687 | 2024-08-07 |
A sticker-based model for DNA computation
1998, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.1998.5.615
PMID:10072080
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研究论文 | 介绍了一种名为贴纸模型的新型分子计算模型,该模型利用DNA链作为物理基质,并通过杂交分离作为核心机制 | 贴纸模型具有无需链延伸和酶的随机存取内存,且材料理论上可重复使用 | 尽管理论上有许多优势,但实际应用中仍面临重大的工程挑战 | 探讨贴纸模型的计算方式并提出实现每种操作的物理方法,以及提出一种特定的机器架构 | 贴纸模型的计算方式及其物理实现方法 | NA | NA | DNA计算 | 贴纸模型 | DNA链 | NA |
688 | 2024-08-07 |
DNA computation: theory, practice, and prospects
1998, Evolutionary computation
IF:4.6Q1
DOI:10.1162/evco.1998.6.3.201
PMID:10021747
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research paper | 本文探讨了DNA计算的理论、实践和前景 | 理论工作表明DNA具有通用计算能力,并描述了使用现有技术解决有趣问题的算法 | 生物实验验证理论结果的缺乏,以及错误率的控制问题 | 评估DNA计算的实际应用潜力并实现解决现实问题的算法 | DNA计算的通用性、算法实现和错误率控制 | NA | NA | DNA | NA | NA | NA |
689 | 2024-08-07 |
Bidirectional sticker systems
1998, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:9697210
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研究论文 | 本文介绍了一种双面贴纸系统,这是作为一种抽象计算模型引入的,旨在模拟Adleman风格的DNA计算和所谓的Watson-Crick互补匹配 | 本文发现了几种类型的贴纸系统与常规语法具有相同的计算能力,其中一个变体代表线性语言,另一个变体被证明能够表示任何递归可枚举语言 | NA | 探索双面贴纸系统的计算能力和其在计算模型中的应用 | 双面贴纸系统的计算能力和语言表示能力 | 计算理论 | NA | NA | NA | NA | NA |
690 | 2024-08-07 |
DNA computing on surfaces: encoding information at the single base level
1998, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.1998.5.269
PMID:9672832
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研究论文 | 评估在单核苷酸水平上编码DNA计算信息的可行性,特别是关于杂交识别的效率和特异性 | 研究了在化学修饰的玻璃和金表面上固定32种不同寡核苷酸阵列的杂交实验,并探讨了提高单核苷酸编码特异性的几种方法 | 在获得单核苷酸杂交特异性的条件下,杂交效率较低,影响了其在DNA计算应用中的实用性 | 评估单核苷酸水平上编码DNA计算信息的可行性及其在实际应用中的限制 | 32种不同寡核苷酸在化学修饰的玻璃和金表面上的杂交行为 | NA | NA | 杂交实验 | NA | 寡核苷酸阵列 | 32种不同寡核苷酸 |
691 | 2024-08-07 |
Demonstration of a word design strategy for DNA computing on surfaces
1997-Dec-01, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/25.23.4748
PMID:9441280
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研究论文 | 本文提出了一种在表面上进行DNA计算的策略,使用由短寡核苷酸(16mers)组成的'DNA单词'集合 | 该策略通过模板和映射方法,设计了具有特定互补性和稳定性的DNA寡核苷酸集合,用于表面上的DNA计算 | NA | 探索在表面上进行DNA计算的新方法 | DNA寡核苷酸的设计及其在表面上的计算应用 | 生物技术 | NA | DNA寡核苷酸设计 | NA | DNA序列 | 108个8mers和多个单词标签集合 |
692 | 2024-08-07 |
DNA computing based on splicing: universality results
1996, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:9390231
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研究论文 | 本文扩展了关于特定变体H系统的计算通用性的最新结果,并证明了基于拼接操作的H系统可以构建通用计算机 | 展示了基于拼接操作的可编程通用DNA计算机的理论可能性,并介绍了测试管系统,其中多个H系统并行工作,为生物(DNA)计算机的发展提供了理论基础 | NA | 证明基于拼接操作的H系统可以构建通用计算机 | 特定变体H系统的计算通用性 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | H系统 | DNA序列 | NA |
693 | 2024-08-07 |
DNA solution of the maximal clique problem
1997-Oct-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.278.5337.446
PMID:9334300
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研究论文 | 本文通过分子生物学技术解决了最大团问题 | 利用DNA计算解决NP完全搜索问题的能力得到了进一步证明 | NA | 解决最大团问题 | 六顶点团集合 | 计算机科学 | NA | 分子生物学技术 | NA | DNA分子 | 一批DNA分子 |
694 | 2024-08-07 |
DNA computing
1997-Feb, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/s0958-1669(97)80164-4
PMID:9013647
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research paper | 本文介绍了DNA计算这一新兴领域的最新进展,该领域结合了计算机科学和分子生物学 | DNA计算是一种新颖的计算方法,利用分子生物学技术解决计算难题 | NA | 探索DNA计算在解决计算难题中的应用 | DNA计算技术及其在计算机科学中的应用 | NA | NA | 分子生物学技术 | NA | NA | NA |
695 | 2024-08-07 |
A special-purpose processor for gene sequence analysis
1993-Apr, Computer applications in the biosciences : CABIOS
DOI:10.1093/bioinformatics/9.2.221
PMID:8481828
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研究论文 | 本文描述了一种专门用于基因序列分析的自定义加速器,该加速器实现了Needleman-Wunsch算法的核苷酸序列比对版本 | 设计了一种新的硬件设备,专门用于支持生物计算,填补了分子生物学家和计算机设计师之间的知识空白 | 序列长度受限于可用内存,当前实现中序列长度的乘积最大为2(22) | 开发一种能够显著提高成本性能比基因序列分析的专用计算机 | 基因序列分析的专用计算机 | 计算机视觉 | NA | TTL和FPGA技术 | NA | 基因序列 | 序列长度的乘积最大为2(22) |
696 | 2024-08-07 |
Modeling the gastric mill central pattern generator of the lobster with a relaxation-oscillator network
1993-Sep, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.1993.70.3.1030
PMID:8229158
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研究论文 | 本文开发了一种简化模型,用于捕捉龙虾胃磨中枢模式发生器(CPG)的主要生物学特征,并介绍了能够再现胃磨神经元多个全局特性的简化神经元模型。 | 引入了一种基于范德波尔弛豫振荡器方程的简化神经元模型,该模型能够通过调整参数表现出负电阻区域,并能模拟多种神经元行为。 | NA | 开发一个简化模型,以捕捉龙虾胃磨中枢模式发生器的主要生物学特征。 | 龙虾胃磨中枢模式发生器及其控制咀嚼运动的机制。 | 神经科学 | NA | 范德波尔弛豫振荡器 | 简化神经元模型 | 神经元行为数据 | NA |
697 | 2024-08-07 |
Simplified user poll and experience report language (SUPER): implementation and application
1994-Feb, Computer applications in the biosciences : CABIOS
DOI:10.1093/bioinformatics/10.1.35
PMID:8193954
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SUPER的方法,用于自动化和定制生物计算服务的用户调查,并结合了多项选择题和基本问题后的分支逻辑 | SUPER方法的创新之处在于自动化和定制用户调查,以及结合多项选择题和分支逻辑 | NA | 开发和应用一种自动化和定制的用户调查方法,以收集生物计算服务用户的反馈 | 生物计算服务的学术用户 | NA | NA | NA | NA | NA | 在瑞士的学术用户中进行了一次调查 |
698 | 2024-08-07 |
DNA storage and duplicate sampling: lessons learnt from testing for Huntington's disease
1993-Dec, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg.30.12.1042-a
PMID:8133504
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
699 | 2024-08-07 |
Simplified user poll and experience report language (SUPER): implementation and application
1994-Apr, Computer applications in the biosciences : CABIOS
DOI:10.1093/bioinformatics/10.2.105
PMID:8019857
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SUPER的方法,用于自动化和定制化生物计算服务的用户调查和体验报告,并在瑞士的学术用户中应用了该方法来调查分子生物学数据库的使用情况 | SUPER方法能够自动化和定制化用户调查,结合多选题和基于基本问题的分支,同时处理答案并提供详细的答案表格 | NA | 开发和应用一种自动化和定制化的用户调查方法,以收集生物计算服务的用户反馈 | 生物计算服务的用户和分子生物学数据库的使用情况 | NA | NA | NA | NA | 文本 | 瑞士的学术用户 |
700 | 2024-08-07 |
A boom in plans for DNA computing
1995-Apr-28, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.7725093
PMID:7725093
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |