生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 767 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-07 |
Enzyme-Free Autocatalysis-Driven Feedback DNA Circuits for Amplified Aptasensing of Living Cells
2022-Feb-02, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c22767
PMID:35044153
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研究论文 | 本文设计了一种无酶自催化驱动的反馈DNA电路，用于在活细胞中放大检测腺苷三磷酸（ATP）和凝血酶，显著提高了检测的灵敏度 | 该研究采用了一种无酶自催化驱动的反馈DNA电路，结合了HCR电路和DNAzyme生物催化，实现了信号的指数级增益和持续自我再生或复制 | NA | 开发一种高灵敏度和高特异性的aptasensor，用于活细胞内的分子成像 | 腺苷三磷酸（ATP）和凝血酶 | 生物技术 | NA | DNAzyme生物催化 | HCR电路 | DNA | NA |
| 342 | 2024-08-07 |
Using entropy-driven amplifier circuit response to build nonlinear model under the influence of Lévy jump
2022-Jan-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04331-0
PMID:35057730
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research paper | 本文研究了基于熵驱动放大器（EDA）电路响应的带有Lévy跳跃的非线性动态系统模型 | 建立了基于EDA电路响应的非线性生化反应系统模型，并考虑了扰动因素对系统的影响，构建了带有Lévy跳跃的非线性生化反应系统 | NA | 研究非线性动态系统模型在Lévy跳跃影响下的行为 | 基于熵驱动放大器（EDA）电路响应的非线性生化反应系统 | bioinformatics | NA | NA | 非线性动态系统模型 | NA | NA |
| 343 | 2024-08-07 |
Synthetic Perturbations in IL6 Biological Circuit Induces Dynamical Cellular Response
2021-Dec-26, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules27010124
PMID:35011356
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研究论文 | 研究通过合成生物学方法设计基于肽的免疫调节电路，以靶向SOCS1活性，从而在利什曼原虫感染早期恢复促炎细胞因子表达，改变免疫反应从Th2型向Th1型转变 | 利用合成生物学方法设计新的免疫调节电路，靶向SOCS1活性，以改变利什曼原虫感染早期的免疫反应类型 | NA | 探索合成生物学在利什曼原虫感染早期免疫反应中的应用，特别是通过SOCS1/SOCS3免疫轴改变免疫反应类型 | 利什曼原虫感染中的巨噬细胞和免疫反应 | 生物学 | 利什曼病 | 合成生物学 | 数学模型 | 生物信号 | NA |
| 344 | 2024-08-07 |
The diagnostic utility of exome-based carrier screening in families with a positive family history
2022-04, American journal of medical genetics. Part A
DOI:10.1002/ajmg.a.62633
PMID:34997808
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研究论文 | 本研究描述了在有阳性家族史的14个家庭中，使用全外显子组基于表型的携带者分析的诊断效用 | 首次描述了最年轻的PPP1R21基因可能致病变异纯合子的患者，目前无症状 | 由于样本不足和表型信息不完整，仅能进行初步诊断 | 评估全外显子组携带者筛查在有阳性家族史家庭中的诊断价值 | 有阳性家族史的家庭 | NA | NA | 全外显子测序 | NA | 基因组数据 | 14个家庭 |
| 345 | 2024-08-07 |
Sensitive Logic Nanodevices with Strong Response for Weak Inputs
2022-03-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202115561
PMID:34989066
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research paper | 本文提出了一种“弱输入强输出”策略，通过结合输入诱导的可逆DNA计算平台与基于杂交链反应的信号放大器，构建了敏感逻辑纳米器件 | 通过合理设计计算元件序列，避免输入信号与信号放大器之间的串扰，新形成的逻辑纳米器件对弱输入信号具有良好的敏感性，即使在计算元件浓度较低的情况下也能执行多种逻辑操作 | NA | 开发对弱输入信号具有强响应的敏感逻辑纳米器件 | 逻辑纳米器件的敏感性和计算能力 | NA | NA | DNA计算平台，杂交链反应 | NA | DNA序列 | NA |
| 346 | 2024-08-07 |
NoAS-DS: Neural optimal architecture search for detection of diverse DNA signals
2022-Mar, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2021.12.009
PMID:34979461
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研究论文 | 本文提出了一种名为NoAS-DS的神经网络架构搜索方法，专门用于序列分类任务的架构搜索，并应用于预测结合位点的任务 | NoAS-DS结合了卷积层和LSTM层，实现了自动架构构建，提高了TFBS和RBP数据集上的准确性 | NA | 开发一种适用于序列分类任务的神经网络架构搜索方法，并应用于DNA结合位点预测 | DNA序列分类任务和结合位点预测 | 机器学习 | NA | 神经架构搜索（NAS） | CNN和LSTM | 序列数据 | TFBS和RBP数据集 |
| 347 | 2024-08-07 |
A test strip electrochemical disposable by 3D MXA/AuNPs DNA-circuit for the detection of miRNAs
2022-01-06, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-021-05150-z
PMID:34989879
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研究论文 | 本研究介绍了一种新型TiCTx（MXene）气凝胶（MXA）复合金纳米粒子（AuNPs）修饰的一次性碳纤维纸（CFP）电极，用于无标记和高灵敏度检测miRNA-155 | 开发了一种新型的3D MXA/AuNPs DNA电路测试条，具有优异的界面和宽动态范围 | NA | 研究微小RNA的生物学功能、分子诊断、疾病治疗和靶向药物治疗 | 微小RNA-155的检测 | 生物医学工程 | NA | 3D MXA/AuNPs DNA电路 | NA | 生物样本 | 8个临床样本 |
| 348 | 2024-08-07 |
Bioorthogonal regulation of DNA circuits for smart intracellular microRNA imaging
2021-Dec-08, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d1sc05214d
PMID:35003602
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研究论文 | 本文介绍了一种基于内源性DNA修复酶的预筛选策略，开发了一种顺序且特定于现场激活的催化DNA电路，用于实现高抗干扰能力的癌细胞选择性microRNA成像。 | 引入了前所未有的内源性DNA修复酶驱动的预筛选策略，提高了催化DNA电路的抗干扰能力。 | NA | 开发一种新的催化DNA电路，用于高可靠性的细胞内生物标志物检测。 | 癌细胞内的microRNA。 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA | NA |
| 349 | 2024-08-07 |
A Quaternary Code Correcting a Burst of at Most Two Deletion or Insertion Errors in DNA Storage
2021-Nov-27, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e23121592
PMID:34945898
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research paper | 本文提出了一种适用于DNA存储的四进制码设计，用于纠正最多两个连续的删除或插入错误 | 提出了新的四进制码设计，并证明了其能纠正最多两个连续的删除或插入错误 | NA | 解决DNA存储中的错误纠正问题 | DNA存储中的错误纠正码设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-07 |
Fractal construction of constrained code words for DNA storage systems
2022-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1209
PMID:34908135
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研究论文 | 本文提出了一种基于混沌游戏表示法的新方法，用于生成符合用户定义约束（如GC含量、同聚物和不良基序）的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | 本文的创新点在于采用混沌游戏表示法生成满足特定约束的DNA编码词，以提高DNA存储系统的可靠性。 | NA | 研究如何利用DNA作为存储介质，生成满足特定约束的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | DNA编码词及其在DNA存储系统中的应用。 | 计算机科学 | NA | 混沌游戏表示法 | NA | DNA序列 | NA |
| 351 | 2024-08-07 |
Enzyme Method-Based Microfluidic Chip for the Rapid Detection of Copper Ions
2021-Nov-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi12111380
PMID:34832792
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research paper | 本文报道了一种基于酶法的微流控芯片，用于快速检测海水中的铜离子 | 该芯片采用铜离子抑制辣根过氧化物酶（HRP）活性的方法，实现了对铜离子的快速检测，并具有裸眼和分光光度计两种检测模式 | NA | 开发一种快速检测海水铜污染的方法 | 海水中的铜离子 | NA | NA | 微流控技术 | NA | 溶液 | 使用了三个真实海水样本 |
| 352 | 2024-08-07 |
Development of Synthetic DNA Circuit and Networks for Molecular Information Processing
2021-Nov-04, Nanomaterials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/nano11112955
PMID:34835719
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综述 | 本文总结了近年来合成DNA电路及其在分子信息处理中的应用和研究进展 | 合成DNA电路通过其可编程设计和模块化特性，能够放大微弱信号并建立可编程的级联系统，适用于生物传感检测 | NA | 探讨合成DNA电路的机制和应用，为建立更先进的人工基因调控系统和智能分子传感工具提供基础 | 合成DNA电路及其在基因网络调控和分子信息处理中的应用 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-07 |
Scaling DNA data storage with nanoscale electrode wells
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi6714
PMID:34818035
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research paper | 本文开发了一种纳米级DNA存储写入器，旨在提高DNA数据存储的写入密度 | 首次开发了纳米级DNA存储写入器，预计将DNA写入密度提高到25 × 10序列每平方厘米，比现有DNA合成阵列提高了三个数量级 | NA | 提高DNA数据存储的写入密度和容量 | DNA数据存储技术 | NA | NA | DNA合成技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 354 | 2024-08-07 |
Design of Constraint Coding Sets for Archive DNA Storage
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3127271
PMID:34762590
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研究论文 | 本文提出了一种新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），用于增加约束编码集的下界，以提高DNA存储的准确性 | 提出了新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），增加了约束编码集的下界，提高了DNA存储的准确性 | NA | 提高DNA存储的准确性和可靠性 | 约束编码集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | DNA存储技术 | 海洋捕食者算法（QRSS-MPA） | DNA序列 | NA |
| 355 | 2024-08-07 |
Real-Time Investigation of Intracellular Polynucleotide Kinase Using a Cascaded Amplification Circuit
2021-11-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04033
PMID:34748706
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研究论文 | 本文开发了一种通过整合催化DNA组装和杂交链反应电路的级联DNA放大电路，实现了通过Förster共振能量转移（FRET）原理准确评估细胞内多核苷酸激酶（PNK）活性 | 提出了一个创新的级联DNA放大电路，通过λ核酸酶特异性消化5'-磷酸DNA和高信号增益的级联电路，实现了对PNK活性的敏感分析 | NA | 开发一种新的方法来实时监测和评估细胞内多核苷酸激酶的活性 | 细胞内多核苷酸激酶的活性 | 生物技术 | NA | Förster共振能量转移（FRET） | NA | DNA | 在HeLa细胞中进行了广泛探索 |
| 356 | 2024-08-07 |
Rational design of allosterically regulated toehold mediated strand displacement circuits for sensitive and on-site detection of small molecule metabolites
2021-Nov-22, The Analyst
DOI:10.1039/d1an01488a
PMID:34734587
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研究论文 | 本文开发了一种基于别构转录因子（aTF）调控的脚手架介导的链置换（TMSD）电路的生物传感器，用于非侵入性唾液样本中尿酸（UA）的检测 | 通过理性设计双通道TMSD电路，克服了天然HucR低配体亲和力的影响，提高了输出信号的富集和生物传感器的灵敏度 | NA | 开发快速、去中心化的小分子检测方法，满足日常健康监测和快速诊断的需求 | 尿酸（UA）的检测 | 生物传感器 | NA | 脚手架介导的链置换（TMSD）电路 | NA | 唾液样本 | NA |
| 357 | 2024-08-07 |
An Efficient Method for DNA Purification-Free PCR from Plant Tissue
2021-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.289
PMID:34748285
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研究论文 | 本文介绍了一种无需DNA纯化的高通量PCR方法，用于从植物组织中扩增基因组DNA片段 | 该方法无需DNA纯化或特殊样品存储设备，使用商业化或自制的DNA存储卡，直接从植物组织中进行PCR扩增 | NA | 开发一种低成本、高通量的PCR方法，使植物DNA分子诊断技术更易于在资源有限的条件下进行 | 至少包括拟南芥、番茄、大豆、马铃薯、棉花和稻在内的十一种植物 | 分子生物学 | NA | PCR | NA | DNA | 至少十一种植物物种 |
| 358 | 2024-08-07 |
CRISPR-Powered DNA Computing and Digital Display
2021-11-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00431
PMID:34704742
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研究论文 | 本文报道了一种基于CRISPR技术的DNA计算和数字显示系统，该系统通过编程的DNA目标作为输入，并通过ON/OFF荧光信号表示TRUE/FALSE输出 | 该系统能够建立输入与输出之间的一对一关系，实现多级DNA逻辑计算，并通过预CRISPR反应选择性维持或抑制CRISPR反应性来扩展输入大小 | NA | 开发一种新型的CRISPR驱动的DNA计算和数字显示系统 | CRISPR技术在DNA计算和分子编程中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR技术 | NA | DNA | NA |
| 359 | 2024-08-07 |
DNA storage: research landscape and future prospects
2020-Jun, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa007
PMID:34692128
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综述 | 本文综述了DNA存储的基本理论、研究历史和技术挑战，并从定量角度评估了DNA作为新型数据存储介质的前景 | DNA作为一种稳定、资源和能源高效且可持续的数据存储解决方案 | NA | 探讨DNA存储的研究现状及未来前景 | DNA存储的理论、历史和技术挑战 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-07 |
Enhancing Physical and Thermodynamic Properties of DNA Storage Sets With End-Constraint
2022-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3121278
PMID:34662278
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research paper | 本文提出了一种新的方法来设计高质量的DNA存储集，通过引入随机开关和双权重后代策略在双策略黑寡妇优化算法（DBWO）中，提高了算法的探索和利用能力，并应用于设计DNA存储集，同时提出了末端约束以改善序列的稳定性。 | 本文创新地引入了随机开关和双权重后代策略在DBWO算法中，提高了算法的性能，并提出了末端约束方法来增强DNA存储集的物理和热力学性质。 | NA | 提高DNA存储集的质量和稳定性 | DNA存储集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | 双策略黑寡妇优化算法（DBWO） | DBWO | DNA序列 | 26个基准函数 |