生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 767 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
An automated DNA computing platform for rapid etiological diagnostics
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade0453
PMID:36427311
|
研究论文 | 开发了一种基于自动化DNA计算的平台，用于快速准确地诊断急性呼吸道感染的病因 | 该平台能够在分子水平上实施经过计算机训练的分类模型，通过七种不同的mRNA表达模式在4小时内准确诊断ARI病因 | NA | 开发一种快速、准确、低成本且自动化的诊断平台，用于急诊部门或即时护理诊所的疾病病因诊断 | 急性呼吸道感染的病因分类 | 数字病理学 | 急性呼吸道感染 | DNA计算 | 分类模型 | mRNA表达模式 | 80个临床样本 |
| 282 | 2024-08-07 |
Calibration-free counting of low molecular copy numbers in single DNA-PAINT localization clusters
2021-Dec-08, Biophysical reports
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.bpr.2021.100032
PMID:36425461
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为lbFCS+的扩展概念，能够在单个DNA-PAINT图像中对单个定位簇的分子拷贝数进行绝对计数 | lbFCS+通过精确测量DNA-PAINT成像中荧光标记的寡核苷酸（'成像器'）的局部杂交速率，实现了对单个纳米尺度体积内荧光位点的绝对计数，无需参考校准 | NA | 开发一种无需预先了解染料光物理学或参考校准的分子计数方法 | DNA-PAINT成像中的单个定位簇内的分子拷贝数 | 生物传感 | NA | DNA-PAINT | lbFCS+ | 图像 | 包含多达10个停靠链的定位簇 |
| 283 | 2024-08-07 |
A functional RNA/DNA circuit for one-pot detection of SARS-CoV-2 RNA
2022-Dec-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d2cc05251b
PMID:36383079
|
研究论文 | 本文提出了一种基于功能性RNA/DNA电路的简单方法，用于检测SARS-CoV-2 RNA | 该方法巧妙地整合了核酸电路技术和CRISPR/cas12a系统，能够在一步骤中实现对目标RNA的飞摩尔级检测 | NA | 开发一种简单有效的方法用于检测SARS-CoV-2 RNA | SARS-CoV-2 RNA | NA | COVID-19 | CRISPR/cas12a系统 | NA | RNA | NA |
| 284 | 2024-08-07 |
Neuromorphic quantum computing
2022-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.045311
PMID:36397478
|
研究论文 | 本文展示了神经形态计算可以执行量子操作，通过将尖峰神经元的状态与Ising自旋的两个状态相连接，并从Ising自旋的期望值和相关性构建量子密度矩阵。 | 本文提出了一种超越马尔可夫链的概率计算方法，不基于转换概率，而是通过约束经典概率分布来模拟量子系统的纠缠特性。 | NA | 探索神经形态计算在量子操作中的应用 | 神经形态计算与量子计算的结合 | 量子计算 | NA | 量子计算 | 神经网络 | 量子系统 | 两量子比特系统 |
| 285 | 2024-08-07 |
Levy Equilibrium Optimizer algorithm for the DNA storage code set
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277139
PMID:36395269
|
研究论文 | 本文提出了一种Levy均衡优化器（LEO）算法，用于构建满足组合约束的DNA存储代码集 | 提出的LEO算法在13个基准函数上测试，获得了4个新的全局最优解，并改进了DNA存储代码集的下限 | NA | 研究如何通过优化算法提高DNA存储代码集的性能 | DNA存储代码集及其优化算法 | 生物信息学 | NA | Levy Equilibrium Optimizer (LEO)算法 | NA | DNA序列 | 13个基准函数 |
| 286 | 2024-08-07 |
Improved Bare Bones Particle Swarm Optimization for DNA Sequence Design
2023-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3220795
PMID:36350858
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的裸骨粒子群优化算法（IBPSO）用于DNA序列设计 | 使用动态透镜对立学习初始化种群以提高多样性，设计基于信噪比距离的进化策略平衡探索与开发，并引入入侵杂草优化算法与小生境拥挤机制消除低质量解 | 未提及 | 解决DNA序列设计问题，提高DNA编码质量 | DNA序列设计 | 计算生物学 | NA | 粒子群优化算法 | IBPSO | DNA序列 | 未提及 |
| 287 | 2024-08-07 |
FMG: An observable DNA storage coding method based on frequency matrix game graphs
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106269
PMID:36356390
|
研究论文 | 提出了一种基于频率矩阵游戏图（FMG）的DNA存储编码方法，用于生成满足组合约束的DNA存储编码 | 该方法具有确定性，能清晰解释编码过程，并且编码结果具有可观测特性，优于先前发表的结果 | NA | 开发一种高效且合理的DNA存储编码方法 | DNA存储编码方法及其性能 | 生物信息学 | NA | 频率矩阵游戏图（FMG） | NA | DNA序列 | 当编码长度n=10，汉明距离d=4时，编码集大小比先前结果提高24% |
| 288 | 2024-08-07 |
Applications of Terminal Deoxynucleotidyl Transferase Enzyme in Biotechnology
2023-03-01, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202200510
PMID:36342345
|
综述 | 本文综述了终端脱氧核苷酸转移酶（TdT）在生物技术中的独特性质和应用 | TdT酶能够催化模板独立地逐步添加核苷酸到寡核苷酸链上，这一独特性质使其在多种应用中得到显著增加 | NA | 探讨TdT酶作为生物技术工具的独特性质和应用，并展望其在未来的发展 | TdT酶在生物传感、多/寡核苷酸合成、DNA存储、DNA纳米结构合成和适配体开发中的应用 | 生物技术 | NA | 终端脱氧核苷酸转移酶（TdT） | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-07 |
Colorimetric aptasensor for fumonisin B1 detection based on the DNA tetrahedra-functionalized magnetic beads and DNA hydrogel-coated bimetallic MOFzyme
2023-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2022.130252
PMID:36327850
|
研究论文 | 本文开发了一种基于DNA四面体功能化磁珠和DNA水凝胶包覆的双金属MOFzyme的比色适体传感器，用于检测伏马菌素B1。 | 该传感器通过DNA四面体功能化磁珠捕获伏马菌素B1，并触发DNA水凝胶中的熵驱动DNA电路，释放双金属MOFzyme，产生与伏马菌素B1浓度相关的比色信号。 | NA | 开发一种新型的比色适体传感器，用于定量检测伏马菌素B1，以应对其对公共健康和环境的威胁。 | 伏马菌素B1的检测。 | 环境监测 | NA | 比色法 | NA | 比色信号 | 检测范围为5 × 10至50 ng/mL，检测限为0.38 pg/mL。 |
| 290 | 2024-08-07 |
Microneedle Array Encapsulated with Programmed DNA Hydrogels for Rapidly Sampling and Sensitively Sensing of Specific MicroRNA in Dermal Interstitial Fluid
2022-11-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.2c06261
PMID:36326107
|
研究论文 | 本文报道了一种封装有编程DNA水凝胶的微针阵列，用于快速富集和敏感检测皮肤间质液中的特定microRNA | 该技术利用甲基丙烯酸透明质酸（MeHA）与智能DNA电路水凝胶系统（MeHA/DNA），通过级联脚趾介导的DNA位移反应触发荧光放大，实现对低丰度microRNA的敏感检测 | NA | 开发一种用于快速且敏感检测皮肤间质液中microRNA的新技术 | microRNA在皮肤间质液中的检测 | 生物技术 | NA | DNA位移反应 | NA | 荧光信号 | 在5分钟内提取0.97 ± 0.2 mg的皮肤间质液 |
| 291 | 2024-08-07 |
Modularized Enzymatic Tandem Reaction for tsRNA Detection
2022-11-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c04010
PMID:36325814
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RT-NExT的模块化酶级联反应，用于检测tRNA衍生的小RNA（tsRNA），作为乳腺癌早期诊断和预后预测的新生物标志物。 | RT-NExT反应通过模块化设计，能够独立工作或组装，提高了设计的灵活性和检测的准确性。 | NA | 开发一种新的检测方法，用于乳腺癌的早期诊断和预后评估。 | tRNA衍生的小RNA（tsRNA） | NA | 乳腺癌 | NA | NA | RNA | 10 M ts-66或ts-86 |
| 292 | 2024-08-07 |
ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit
2022-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210150119
PMID:36282916
|
研究论文 | 研究ADAR通过抑制MDA5激活在生物电路中调控APOL1的机制 | 发现ADAR通过A-to-I RNA编辑调控APOL1表达，影响APOL1相关肾脏疾病的渗透率和严重程度 | NA | 探讨ADAR对APOL1表达的调控机制及其在肾脏疾病中的作用 | ADAR、APOL1、MDA5以及它们在肾脏疾病中的相互作用 | NA | 肾脏疾病 | A-to-I RNA编辑 | NA | RNA | 人类肾组织、足细胞、转基因APOL1小鼠模型 |
| 293 | 2024-08-07 |
Stochastic dynamics of Type-I interferon responses
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010623
PMID:36269758
|
研究论文 | 研究了JAK-STAT信号通路中干扰素α反应诱导的变异性的来源 | 整合时间分辨流式细胞仪数据和JAK-STAT信号通路的随机建模，量化了通路不同步骤的内在变异性 | NA | 探究干扰素α反应诱导的变异性的来源及其对JAK-STAT信号通路的影响 | 干扰素α反应的变异性及其在JAK-STAT信号通路中的作用 | NA | NA | 流式细胞术 | 随机模型 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 294 | 2024-08-07 |
Provenance of life: Chemical autonomous agents surviving through associative learning
2022-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.034401
PMID:36266823
|
研究论文 | 本文展示了一种自主化学代理通过关联学习适应环境特征的基准研究 | 首次证明简单的非生物耗散结构也能展示关联学习能力 | NA | 探索简单的非生物耗散结构是否能展示关联学习 | 自主化学代理的关联学习能力 | 系统化学 | NA | 反应扩散模型 | Gray-Scott模型 | 化学物种 | NA |
| 295 | 2024-08-07 |
pyDockDNA: A new web server for energy-based protein-DNA docking and scoring
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.988996
PMID:36275623
|
研究论文 | 介绍了一个名为pyDockDNA的网络服务器，用于基于能量的蛋白质-DNA对接和评分 | pyDockDNA服务器能够以合理的预测成功率模拟蛋白质-DNA复合物，并引入了新的能量基参数和外部约束的可能性 | NA | 开发一种新的计算方法来模拟蛋白质-DNA复合物的结构 | 蛋白质和DNA的相互作用 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 结构数据 | 使用标准蛋白质-DNA复合物结构数据集进行基准测试 |
| 296 | 2024-08-07 |
Sensitive fluorescence biosensor for SARS-CoV-2 nucleocapsid protein detection in cold-chain food products based on DNA circuit and g-CNQDs@Zn-MOF
2022-Nov-01, Lebensmittel-Wissenschaft + [i.e. und] Technologie. Food science + technology. Science + technologie alimentaire
DOI:10.1016/j.lwt.2022.114032
PMID:36186577
|
研究论文 | 本文报道了一种基于DNA电路和g-CNQDs@Zn-MOF的荧光生物传感器，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | 该荧光生物传感器具有极高的灵敏度，检测限为1.0 pg/mL，且不与其他N蛋白发生显著交叉反应 | NA | 开发一种快速且灵敏的检测方法，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | 生物传感器 | COVID-19 | 荧光检测 | NA | 蛋白质 | 实际冷链食品样本 |
| 297 | 2024-08-07 |
Integrated Microfluidic DNA Storage Platform with Automated Sample Handling and Physical Data Partitioning
2022-09-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c02667
PMID:36106626
|
研究论文 | 本文介绍了一种集成微流控DNA存储平台，该平台通过微阀网络架构实现数据编码寡核苷酸样本的自动存储和检索 | 该平台采用可单独寻址的隔室，提供了一种与分子级随机访问实现正交的数据分区策略，每个分区相当于4×2 mm区域内的9.5 TB数据 | NA | 研究目的是开发一种集成和自动化的微流控平台，用于DNA存储 | 研究对象是用于数据存储的微流控DNA平台及其与DNA存储工作流程的兼容性 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | DNA | 每个分区相当于9.5 TB数据 |
| 298 | 2024-08-07 |
Nanocellulose Composites as Smart Devices With Chassis, Light-Directed DNA Storage, Engineered Electronic Properties, and Chip Integration
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.869111
PMID:36105598
|
研究论文 | 研究评估了将纳米纤维素复合材料转化为信息存储或处理设备的四种方法 | 纳米纤维素复合材料通过光控酶、半导体特性及电子能力实现信息存储与处理，并展示了其在智能设备和生物医学应用中的潜力 | NA | 探索纳米纤维素复合材料在智能设备和信息处理中的应用 | 纳米纤维素复合材料及其在信息存储和处理中的应用 | NA | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
| 299 | 2024-08-07 |
Identification of DNA-binding proteins via Multi-view LSSVM with independence criterion
2022-11, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2022.08.015
PMID:36087888
|
研究论文 | 本文提出了一种基于序列信息的机器学习算法，用于识别DNA结合蛋白，该方法结合了多视角最小二乘支持向量机与希尔伯特-施密特独立性准则 | 该方法采用六种特征集作为多视角输入，并通过引入希尔伯特-施密特独立性准则作为正则项，减少了视角间的依赖性，探索了多视角的互补信息 | NA | 设计一种高效准确的工具来识别DNA结合蛋白 | DNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | NA | LSSVM | 序列信息 | 训练集PDB1075，独立测试集PDB186和PDB2272 |
| 300 | 2024-08-07 |
A Parallel DNA Algorithm for Solving the Quota Traveling Salesman Problem Based on Biocomputing Model
2022, Computational intelligence and neuroscience
DOI:10.1155/2022/1450756
PMID:36093485
|
研究论文 | 本文开发了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决配额旅行商问题(QTSP) | 提出了一种具有多项式时间复杂度的算法来解决QTSP，相较于指数计算复杂度的算法，随着问题规模的增加，其优势更加明显 | NA | 解决配额旅行商问题(QTSP) | 配额旅行商问题(QTSP) | 生物计算 | NA | DNA算法 | Adleman-Lipton模型 | NA | NA |