生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 767 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
DNA-based programmable gate arrays for general-purpose DNA computing
2023-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06484-9
PMID:37704731
|
研究论文 | 本文展示了一种基于DNA的多层可编程门阵列（DPGA）系统，用于开发通用目的的DNA集成电路（DIC） | 首次开发了通用目的的DNA集成电路，并展示了其在大规模并行计算和疾病相关microRNAs分类中的应用 | NA | 探索和开发通用目的的DNA集成电路 | DNA集成电路及其在计算和疾病分类中的应用 | 生物技术 | NA | DNA折纸技术 | DNA集成电路（DIC） | DNA | 30个逻辑门，约500条DNA链 |
| 222 | 2024-08-07 |
Three-input logic gate based on DNA strand displacement reaction
2023-09-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42383-9
PMID:37709846
|
研究论文 | 本文基于DNA链置换反应设计了三种三输入逻辑门，包括三输入OR逻辑门、三输入AND逻辑门和三输入MAJORITY逻辑门 | 利用DNA链置换技术设计并验证了三输入逻辑门，展示了其在DNA计算中的重要应用价值 | NA | 设计并验证基于DNA链置换反应的三输入逻辑门 | 三输入逻辑门的设计与实现 | NA | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA链 | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Weakly mutually uncorrelated codes with maximum run length constraint for DNA storage
2023-10, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107439
PMID:37678135
|
研究论文 | 本文提出了一种结合弱互不相关码与最大游程长度约束的编码设计，用于DNA存储系统中的引物设计 | 首次将弱互不相关码与最大游程长度约束结合，并探索了满足多种约束条件的编码设计 | 未提及 | 解决DNA存储系统中随机访问的引物设计问题 | DNA存储系统中的编码设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-07 |
Parallel molecular computation on digital data stored in DNA
2023-09-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217330120
PMID:37669382
|
研究论文 | 本文通过利用DNA链置换反应，在DNA存储的数据上实现并行的分子计算 | 提出了一种新的方法，通过DNA链置换反应在DNA存储的数据上进行并行分子计算，展示了二进制计数和图灵通用细胞自动机规则110的程序 | NA | 探索在DNA存储的数据上进行并行分子计算的可能性 | DNA存储的数据及其并行分子计算 | 生物信息学 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | 使用了来自M13噬菌体的天然DNA序列，进行了244次不同的链交换 |
| 225 | 2024-08-07 |
Reducing cost in DNA-based data storage by sequence analysis-aided soft information decoding of variable-length reads
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad548
PMID:37669160
|
研究论文 | 本文提出了一种通过序列分析辅助的软信息解码方法，用于降低基于DNA的数据存储的成本，并实现了编码和解码过程。 | 引入了新的聚类和比对方法，以及在序列分析辅助解码过程中使用编辑距离和质量分数，有效提高了解码性能并减少了异常读取。 | NA | 旨在降低基于DNA的数据存储的写入和读取成本。 | 基于DNA的数据存储技术。 | 生物信息学 | NA | 低密度奇偶校验码（LDPC） | NA | DNA序列 | 存储了548.83 KB的图像文件 |
| 226 | 2024-08-07 |
Accelerating DNA computing via freeze-thaw cycling
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aax7983
PMID:37624882
|
研究论文 | 本文提出了一种通过冷冻-解冻循环加速DNA计算的方法 | 利用冷冻-解冻循环和共晶冰相作为介质，显著提高了DNA计算的速度 | NA | 提高DNA计算的速度 | DNA计算的速度提升 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
Material-level countermeasures for securing microfluidic biochips
2023-09-26, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d3lc00335c
PMID:37605818
|
研究论文 | 本文提出了一种针对基于聚二甲基硅氧烷（PDMS）的微流控生物芯片的动态材料级水印方案，并使用机器学习模型检测制造过程中的异常 | 引入了一种新的动态材料级水印技术，以及使用机器学习模型来检测PDMS固化比率异常 | NA | 开发针对微流控生物芯片的材料级防护措施 | 微流控生物芯片及其在生物计算、临床诊断和即时检测中的应用 | NA | NA | 机器学习 | NA | 荧光数据 | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
Integration of DNA-RNA-triplex-based regulation of transcription into molecular logic gates
2023-10, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14721
PMID:37591635
|
研究论文 | 本文通过利用DNA-RNA三链体对转录的增强和抑制作用，在体外构建了基于三链体的分子门：'异或'（XOR）、'异或非'（XNOR）和一个阈值门 | 首次使用DNA-RNA三链体纳米结构开发分子门 | NA | 探索和工程化生物计算组件 | DNA-RNA三链体在基因调控中的作用 | 分子生物学 | NA | NA | NA | RNA | NA |
| 229 | 2024-08-07 |
DUHI: Dynamically updated hash index clustering method for DNA storage
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107244
PMID:37453377
|
研究论文 | 本文提出了一种动态更新哈希索引（DUHI）聚类方法，用于解决DNA存储过程中的高冗余问题 | DUHI聚类方法通过构建动态核心索引集和使用哈希查找，能够减少序列簇内的冗余并提高序列的重建率 | NA | 解决DNA序列聚类后的高冗余问题，提高数据读取的准确性 | DNA存储过程中的数据冗余和读取准确性 | 生物信息学 | NA | 哈希索引 | 聚类方法 | DNA序列 | NA |
| 230 | 2024-08-07 |
Magnetic Bead Spherical Nucleic Acid Microstructure for Reliable DNA Preservation and Repeated DNA Reading
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00221
PMID:37470286
|
研究论文 | 本文报道了一种磁珠球形核酸（MB-SNA）复合微结构的构建及其作为成本效益高的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | MB-SNA具有高密度双链DNA外壳，实现了高容量存储，并通过加速老化测试证明了其在极端条件下的长期保存能力 | NA | 开发一种新的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | 磁珠球形核酸复合微结构 | 生物技术 | NA | PCR-磁分离 | NA | DNA | 每个MB-SNA存储一条双链DNA数据片段 |
| 231 | 2024-08-07 |
An Aptamer-Functionalized DNA Circuit to Establish an Artificial Interaction between T Cells and Cancer Cells
2023-09-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307656
PMID:37423897
|
research paper | 本研究开发了一种适体功能化的DNA电路，用于调节T细胞与癌细胞之间的相互作用 | 该DNA电路由识别-触发和聚集-激活模块组成，能够在识别目标癌细胞后，释放触发链诱导T细胞表面免疫受体的聚集，从而增强T细胞活性，有效消除癌细胞 | NA | 探索非遗传策略以控制细胞间相互作用网络，特别是在基于T细胞的癌症免疫治疗中 | T细胞与癌细胞的相互作用 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Programmable Molecular Signal Transmission Architecture and Reactant Regeneration Strategy Driven by EXO λ for DNA Circuits
2023-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00168
PMID:37405388
|
研究论文 | 本文展示了一种新型可编程的核酸外切酶辅助信号传输架构，并提出了一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，用于构建DNA电路，以减少信号在级联和分流过程中的衰减。 | 本文提出了一种新型的可编程核酸外切酶辅助信号传输架构和一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，这些方法能够减少DNA电路中信号的衰减，提高分子计算系统的可靠性。 | NA | 提高分子计算系统的可靠性和扩展DNA电路的规模。 | DNA电路中的信号传输和反应物再生策略。 | 分子计算 | NA | 核酸外切酶辅助信号传输 | NA | DNA序列 | 四节点DNA电路 |
| 233 | 2024-08-07 |
A Smart Deoxyribozyme-Programmable Catalytic DNA Circuit for High-Contrast MicroRNA Imaging
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307418
PMID:37379042
|
研究论文 | 本文介绍了一种智能脱氧核酶可编程催化DNA电路，用于高对比度microRNA成像 | 提出了一种内源性激活的DNAzyme策略，与催化DNA电路结合，实现了在活细胞中选择性和高效的microRNA成像 | NA | 实现活细胞中microRNA的选择性成像 | microRNA成像 | 生物技术 | NA | 催化DNA电路 | DNAzyme | NA | NA |
| 234 | 2024-08-07 |
A Cationic Copolymer Enhances Responsiveness and Robustness of DNA Circuits
2023-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202304091
PMID:37340578
|
研究论文 | 本研究探讨了一系列阳离子共聚物对DNA催化发夹组装（一种代表性的脚跟介导的DNA电路）的影响 | 使用聚（赖氨酸）-接枝-葡聚糖共聚物显著提高了反应速率，并通过静电相互作用增强了DNA电路的鲁棒性 | NA | 研究阳离子共聚物对脚跟介导的DNA电路操作速率和鲁棒性的影响 | 阳离子共聚物对DNA催化发夹组装的影响 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 一系列阳离子共聚物 |
| 235 | 2024-08-07 |
Entropy-driven DNA circuit with two-stage strand displacement for elegant and robust detection of miRNA let-7a
2023-Aug-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2023.341392
PMID:37290851
|
研究论文 | 本研究设计了一种基于外切酶Ⅲ辅助的两阶段链置换反应（SDR）的稳定miRNA-let-7a荧光生物传感器 | 采用了一种熵驱动的SDR，包含三链结构的底物，减少了目标循环过程的可逆性，并设计了两阶段链置换系统，提高了检测灵敏度和范围 | NA | 推动miRNA在癌症诊断传感系统中的研究 | miRNA-let-7a | 生物传感器 | 癌症 | 外切酶Ⅲ辅助链置换反应 | NA | 荧光信号 | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
N/S-Co-doped carbon dot-based FRET ratiometric fluorescence aptasensing platform modulated with entropy-driven DNA amplifier for ochratoxin A detection
2023-Aug, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04778-5
PMID:37306781
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于氮硫共掺杂碳点（N/S-CD）的FRET比率荧光适体传感策略，结合熵驱动的DNA放大器，用于灵敏和准确检测赭曲霉素A（OTA） | 该策略通过熵驱动的DNA电路和Cu放大器的协同放大，显著提高了检测性能 | NA | 开发一种新型的高灵敏度和准确度的赭曲霉素A检测方法 | 赭曲霉素A的检测 | 生物传感技术 | 食品污染 | FRET比率荧光适体传感技术 | NA | 荧光信号 | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
A Robust and Efficient DNA Storage Architecture Based on Modulation Encoding and Decoding
2023-06-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.3c00629
PMID:37289182
|
研究论文 | 本文提出了一种基于调制编码和解码的DNA存储架构，以解决合成DNA数据存储中的随机插入-删除-替换（IDS）错误问题 | 利用通信领域的调制技术，将二进制数据调制成具有相同AT/GC模式的DNA序列，便于检测噪声读取中的插入和删除错误 | 该方法的逻辑密度相对较低，为1.0比特/nt | 提高DNA存储的可靠性和效率 | 合成DNA数据存储中的IDS错误 | NA | NA | 调制编码和解码 | NA | DNA序列 | 实验包括模拟数据集和真实数据集 |
| 238 | 2024-08-07 |
Programming DNA Circuits for Controlled Immunostimulation through CpG Oligodeoxynucleotide Delivery
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09359
PMID:37267596
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于递送具有药理免疫刺激功能的CpG寡脱氧核苷酸（CpG ODNs）的DNA电路 | 通过编程DNA电路控制CpG ODN的释放，实现了急性且强效的免疫刺激，与无控制的CpG ODN释放系统相比，具有更快的响应 | NA | 探索DNA电路在控制DNA链药理活性方面的潜力，用于受控药物递送 | DNA电路的设计、DNA双链浓度、T7核酸外切酶浓度对电路动力学和时间行为的影响 | 生物技术 | NA | CpG寡脱氧核苷酸递送 | NA | DNA | 使用了HEK工程细胞系和J774A.1巨噬细胞进行体外激活实验 |
| 239 | 2024-08-07 |
Accelerating Cell-Free Biosensors by Entropy-Driven Assembly of Transcription Templates
2023-06-13, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c01090
PMID:37261725
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过熵驱动组装转录模板的方法来加速无细胞转录过程，以提高无细胞生物传感器的效率和选择性。 | 提出了一种新的熵驱动组装转录模板的方法，作为动态放大模块，显著加速了无细胞转录系统，且不受多种酶的干扰。 | NA | 旨在提高无细胞生物传感器的生产效率和应用范围。 | 无细胞转录系统及其在生物生产、环境监测和疾病诊断中的应用。 | 生物技术 | 传染病 | 无细胞生物合成 | NA | RNA | NA |
| 240 | 2024-08-07 |
Control of Reversible Formation and Dispersion of the Three Enzyme Networks Integrating DNA Computing
2023-06-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00924
PMID:37253150
|
研究论文 | 本研究报告了通过三叉分支DNA结构单元组装的三酶复合网络的形成和分散，并展示了这种网络在控制酶级联反应活性和乳腺癌生物标志物的检测中的应用 | 首次实现了通过单链DNA、RNA和酶实现三酶复合网络的可逆形成和分散，并将其集成到DNA计算中，为生物或环境传感提供了一个新的平台 | NA | 探索通过DNA纳米技术实现酶级联反应的高效控制和生物标志物的检测 | 三酶复合网络的形成和分散机制及其在生物标志物检测中的应用 | 生物技术 | 乳腺癌 | DNA纳米技术 | NA | DNA、RNA | NA |