生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 767 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Pattern Recognition of microRNA Expression in Body Fluids Using Nanopore Decoding at Subfemtomolar Concentrations
2022-Aug-22, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.2c00117
PMID:36032536
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研究论文 | 本文描述了一种使用纳米孔基DNA计算技术检测微小RNA（miRNA）表达模式的方法 | 提出的系统能够在无标记的情况下检测BDC患者血浆中的miRNA表达模式，并且能够在亚飞摩尔浓度下检测dgDNA-miRNA复合物，这是对先前报道的检测限的显著改进 | NA | 开发一种简单策略用于miRNA模式识别，以实现早期癌症诊断 | 五种在胆管癌（BDC）中过度表达的miRNA | 数字病理学 | 胆管癌 | 纳米孔分析 | NA | DNA | BDC患者的血浆样本 |
| 302 | 2024-08-07 |
A nanopore interface for higher bandwidth DNA computing
2022-08-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32526-3
PMID:35987925
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研究论文 | 本文介绍了一种利用纳米孔传感器阵列技术进行DNA计算的高带宽接口，无需测序即可实现实时动力学测量。 | 提出了一种可多路复用的无测序读出方法，通过纳米孔传感器阵列技术直接检测编码输出链，提高了DNA链置换电路的输出带宽。 | NA | 开发一种新的方法来提高DNA计算中DNA链置换电路的输出带宽。 | DNA链置换电路的输出检测方法。 | 生物技术 | NA | 纳米孔传感器阵列技术 | NA | DNA | NA |
| 303 | 2024-08-07 |
Clover: tree structure-based efficient DNA clustering for DNA-based data storage
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac336
PMID:35975958
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研究论文 | 本文提出了一种名为Clover的高效DNA聚类方法，用于基于DNA的数据存储，具有线性计算复杂度和低内存需求 | Clover通过使用树结构进行区间特定检索，避免了计算Levenshtein距离，从而提高了效率 | NA | 旨在解决DNA存储中DNA序列聚类的效率问题 | DNA序列的聚类 | 生物信息学 | NA | DNA聚类算法 | 树结构 | DNA序列 | 10亿DNA数据 |
| 304 | 2024-08-07 |
Hidden Addressing Encoding for DNA Storage
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916615
PMID:35928958
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研究论文 | 本文提出了一种用于DNA存储的隐藏寻址编码方案，通过改进的喷泉编码方案实现隐藏地址，并验证了其性能。 | 提出的隐藏寻址编码方案能够减少物理冗余，提高碱基利用率，并确保DNA存储在测序和解码过程中的正确率。 | NA | 旨在改进DNA存储技术，减少数据转换为短DNA序列时的物理冗余。 | DNA存储编码方案的性能和效率。 | 生物信息学 | NA | 喷泉编码 | NA | DNA序列 | 10.1 MB文件 |
| 305 | 2024-08-07 |
DNA circuits compatible encoder and demultiplexer based on a single biomolecular platform with DNA strands as outputs
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac650
PMID:35904810
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研究论文 | 本文构建了一系列基于单一生物分子平台的多个逻辑电路，执行非算术和算术功能，包括4-to-2编码器、1-to-2解复用器、1-to-4解复用器和多输入OR门 | 首次实现了基于DNA的编码器，其输出为DNA链，可真正应用于DNA电路，使DNA电路能在非二进制生物环境中应用 | NA | 开发基于单一生物分子平台的高级分子逻辑电路 | 基于DNA的编码器和解复用器 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA链 | NA |
| 306 | 2024-08-07 |
DNA Arithmetic With Error Correction
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3189833
PMID:35816540
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研究论文 | 本文提出了一种基于冗余剩余数系统（RRNS）的DNA计算系统，该系统具有优雅的容错特性 | 首次将贴纸模型引入基于RRNS的DNA算术中 | NA | 解决DNA大规模制造中的高错误率问题 | DNA计算系统及其在非硅基计算机设计中的应用 | NA | NA | 冗余剩余数系统（RRNS） | NA | DNA | NA |
| 307 | 2024-08-07 |
Correction to: DeSP: a systematic DNA storage error simulation pipeline
2022-Jul-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04813-9
PMID:35820794
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-07 |
On-Site Non-enzymatic Orthogonal Activation of a Catalytic DNA Circuit for Self-Reinforced In Vivo MicroRNA Imaging
2022-11-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202206529
PMID:35775154
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research paper | 本文开发了一种高效的非酶促电路激活策略，用于实现正交控制的催化DNA电路，以实现高保真的体内微RNA成像 | 提出了一种非酶促的正交激活方法，用于在活细胞内现场激活催化DNA电路，实现高保真的微RNA成像 | NA | 开发一种新的方法用于体内微RNA成像，以提高临床诊断和预后的准确性 | 微RNA的体内成像 | 生物技术 | NA | 催化DNA电路 | NA | DNA | NA |
| 309 | 2024-08-07 |
An Autocatalytic DNA Circuit Based on Hybridization Chain Assembly for Intracellular Imaging of Polynucleotide Kinase
2022-Jul-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.2c08523
PMID:35786848
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研究论文 | 本文提出了一种基于杂交链反应的自催化DNA电路，用于细胞内多核苷酸激酶的成像 | 通过精心整合杂交链反应和催化DNA组装，实现了高效的正反馈放大 | NA | 开发高效的人工DNA电路，用于分析低丰度生物标志物 | 多核苷酸激酶及其在细胞内的活性 | 生物化学 | NA | 杂交链反应（HCA）和催化DNA组装（CDA） | 自催化杂交系统（AHS） | DNA | NA |
| 310 | 2024-08-07 |
Massively Parallel DNA Computing Based on Domino DNA Strand Displacement Logic Gates
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00270
PMID:35771957
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研究论文 | 本文利用DNA链置换技术构建了一种基于多米诺DNA链置换逻辑门的并行DNA计算系统 | 本文提出了一种新的多输入AND门计算系统，取代了传统的多级级联操作，显著降低了系统构建成本并提高了系统的稳定性和鲁棒性 | NA | 建立基于生物分子的可寻址逻辑门，为构建生物计算机奠定基础 | DNA计算中的多输入AND操作 | 生物计算 | NA | DNA链置换技术 | 多输入AND门 | NA | NA |
| 311 | 2024-08-07 |
Adaptive coding for DNA storage with high storage density and low coverage
2022-07-04, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00233-w
PMID:35788589
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研究论文 | 本文提出了一种自适应编码的DNA存储系统，通过使用不同的编码方案和自适应生成编码约束阈值的方法，优化系统性能，实现了高存储密度和低读取覆盖率。 | 本文提出的自适应编码方法能够有效提高DNA存储的空间利用率，降低读取覆盖率，并优化系统各环节的运行效率。 | NA | 探索和优化DNA作为存储介质的应用，提高其存储密度和读取效率。 | DNA存储系统及其自适应编码方法。 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | 自适应编码算法 | 图像、视频、PDF文件 | 698 KB的数据 |
| 312 | 2024-08-07 |
A Chimeric Conjugate of Antibody and Programmable DNA Nanoassembly Smartly Activates T Cells for Precise Cancer Cell Targeting
2022-09-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202205902
PMID:35751134
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研究论文 | 本文报道了一种智能分子平台，通过设计一种融合抗体和可编程DNA纳米装配的杂交偶联物，实现对肿瘤细胞的精确T细胞激活 | 通过集成多种适配体抗原识别于动态DNA电路中，实现了对肿瘤细胞上三重抗原的组合识别，并通过高阶逻辑操作实现选择性T细胞激活 | NA | 开发一种新型的合成免疫疗法策略，用于精确激活T细胞以对抗肿瘤细胞 | T细胞和肿瘤细胞 | 生物技术 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-07 |
Evaluating commercial thermoplastic materials in fused deposition modeling 3D printing for their compatibility with DNA storage and analysis by quantitative polymerase chain reaction
2022-07-14, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d2ay00772j
PMID:35766132
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研究论文 | 本研究评估了六种常见热塑性材料在熔融沉积成型（FDM）3D打印中的DNA存储和定量聚合酶链反应（qPCR）分析的兼容性 | 研究了不同热塑性材料及其颜色对DNA吸附的影响，并探索了通过调整3D打印层高来减少DNA吸附的方法 | 研究仅限于六种常见热塑性材料，未涵盖所有可能的3D打印材料 | 旨在表征FDM打印线材与核酸存储的兼容性，特别是通过qPCR进行分析 | 六种常见热塑性材料（PLA、尼龙、ABS、CPE、PC和PP）及其对DNA吸附的影响 | NA | NA | 熔融沉积成型（FDM）3D打印，定量聚合酶链反应（qPCR） | NA | DNA | 六种热塑性材料，包括两种不同长度的DNA片段（98碱基对和830碱基对） |
| 314 | 2024-08-07 |
Exponential Function Computation Based on DNA Strand Displacement Circuits
2022-06, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2022.3184760
PMID:35727777
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研究论文 | 本文通过DNA链置换反应构建了加法、减法、乘法、除法、n次方和1/n次方门，并利用这六个DNA模拟计算门建立了指数函数的化学反应网络，进而构建了集成DNA链置换电路，实现指数函数多项式的计算。 | 本文创新地利用DNA链置换反应构建了多种计算门，并成功建立了指数函数的化学反应网络，实现了指数函数多项式的计算。 | NA | 研究如何利用DNA电路进行生物计算，特别是指数函数的计算。 | DNA链置换反应及其在生物计算中的应用。 | 生物计算 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | NA |
| 315 | 2024-08-07 |
Graph Computation Using Algorithmic Self-Assembly of DNA Molecules
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00120
PMID:35703038
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研究论文 | 本文提出了一种利用DNA折纸作为代理的并行计算方法，用于解决三色问题 | 该方法在计算算法上与现有的DNA计算方法完全不同，具有计算复杂度低和结果检测优势 | NA | 探索利用DNA分子进行图计算的新方法 | DNA折纸和三色问题 | 生物计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | DNA分子 | 约50 nm直径的DNA折纸 |
| 316 | 2024-08-07 |
Research Progress in Construction and Application of Enzyme-Based DNA Logic Gates
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3181615
PMID:35679378
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综述 | 本文综述了基于酶的DNA逻辑门在信息处理领域的研究进展及其应用 | 探讨了利用高效的切割酶和聚合酶以及核酶构建DNA逻辑门的新方法 | NA | 旨在探讨基于酶的DNA逻辑门在信息、生物医学、化学和计算机领域的应用及未来发展 | 研究对象包括蛋白质酶、切割酶、聚合酶和核酶等 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | DNA逻辑门 | DNA分子 | NA |
| 317 | 2024-08-07 |
Design considerations for advancing data storage with synthetic DNA for long-term archiving
2022-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100306
PMID:35677811
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研究论文 | 本文总结了使用合成DNA作为存储介质时采用的一般流程和技术，并分享了可持续工程设计考虑因素 | 本文探讨了如何通过可持续设计来开发一个高效且稳健的基于合成DNA的长期存档存储系统 | NA | 探讨如何通过设计考虑因素来提高基于合成DNA的长期数据存储系统的效率和可靠性 | 合成DNA作为长期数据存储介质的设计和应用 | NA | NA | 合成DNA | NA | 数字信息 | NA |
| 318 | 2024-08-07 |
A rational design of a cascaded DNA circuit for nanoparticle assembly and its application in the discrimination of single-base changes
2022-06-22, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d2tb00155a
PMID:35621087
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研究论文 | 本文设计了一种基于脚手架介导的链置换反应的可编程DNA组装电路，用于纳米颗粒的自组装，并应用于单碱基变化的鉴别 | 通过合理设计由两个回收环组成的级联电路，实现了纳米颗粒作为传感元件的自主反应预启动，有效减少了实际组装时间和信号泄露 | 目前研究中，纳米颗粒与寡核苷酸的修饰工作繁琐，组装时间长，电路泄露问题限制了其进一步和可扩展的应用 | 设计新型DNA电路，优化纳米颗粒组装过程，提高其在诊断应用中的效率和可靠性 | 纳米颗粒的自组装及其在单碱基变化鉴别中的应用 | 动态DNA纳米技术 | NA | 脚手架介导的链置换反应 | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-07 |
Replication Compartments-The Great Survival Strategy for Epstein-Barr Virus Lytic Replication
2022-Apr-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10050896
PMID:35630341
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综述 | 本文综述了Epstein-Barr病毒（EBV）裂解复制过程中复制隔室（RCs）的作用及其对病毒生存的重要意义 | NA | NA | 探讨复制隔室在EBV生存中的作用 | Epstein-Barr病毒的复制隔室及其功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-07 |
Quality Assessment of Cryopreserved Human Biological Samples from the Biobank of Barretos Cancer Hospital
2023-Feb, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2021.0131
PMID:35613409
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研究论文 | 本研究评估了Barretos癌症医院生物样本库中保存长达9年的冷冻保存样本的完整性和质量 | 研究了不同存储时间和温度对冷冻保存样本核酸完整性的影响，特别是RNA的完整性 | NA | 了解时间和温度对冷冻保存样本质量的影响 | 冷冻保存的肿瘤组织和外周血单个核细胞样本 | 数字病理学 | NA | RNA完整性评估（RIN）和DNA完整性评估（DIN） | NA | 生物样本 | 447个样本，包括肿瘤组织和外周血单个核细胞 |