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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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401 | 2024-08-07 |
Minimum Free Energy Coding for DNA Storage
2021-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3056351
PMID:33534710
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研究论文 | 本文探讨了如何通过最小自由能约束和布朗多宇宙优化算法来提高DNA存储系统的编码效率和稳定性 | 提出了基于最小自由能约束的DNA存储编码方法,并使用布朗多宇宙优化算法设计了更优的DNA存储编码集 | NA | 提高DNA存储系统的数据存储效率和降低错误率 | DNA存储系统的编码方法和编码集设计 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | 布朗多宇宙优化算法 | DNA序列 | NA |
402 | 2024-08-07 |
Kinetics of Toehold-Mediated DNA Strand Displacement Depend on FeII4L4 Tetrahedron Concentration
2021-02-10, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.0c04125
PMID:33508195
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研究论文 | 本文研究了通过外部刺激——水溶性FeL四面体笼——调节基于脚手架介导的DNA链置换反应(SDR)动力学的新方法 | 引入水溶性FeL四面体笼作为外部刺激,有效调节了SDR的动力学,而无需改变原有设计 | NA | 探索通过外部刺激精确调节DNA链置换反应动力学的新方法 | 基于脚手架介导的DNA链置换反应及其动力学 | 分子生物学 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | 不同长度的脚手架末端(3-5)的SDR反应 |
403 | 2024-08-07 |
Upconversion Luminescence-Controlled DNA Computation for Spatiotemporally Resolved, Multiplexed Molecular Imaging
2021-02-02, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c04531
PMID:33464832
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研究论文 | 本文报道了一种基于光子纳米电路的概念方法,用于在体外和体内实现高空间精度的DNA分子计算 | 提出了一种新型光子纳米电路,通过近红外光远程激活,实现对DNA计算的时间和空间精确控制 | NA | 开发一种能够在特定时间和地点精确控制DNA计算的新方法 | DNA分子电路及其在生物系统中的信息处理能力 | 分子生物学 | NA | 近红外光激活技术 | NA | NA | NA |
404 | 2024-08-07 |
One-time-pad cipher algorithm based on confusion mapping and DNA storage technology
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0245506
PMID:33471849
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研究论文 | 本文提出了一种基于混淆映射和DNA存储技术的一次性密码本加密算法,旨在解决基于DNA的一次性密码本加密中编码映射计算安全性低和生物实验操作困难的问题 | 该算法通过使用混沌映射、编码映射、混淆编码表和模拟生物操作过程等方法增加密钥空间,并实现了比类似算法更随机的动态加密和解密过程 | NA | 提高基于DNA的一次性密码本加密算法的计算安全性和实际操作可行性 | 基于DNA的一次性密码本加密算法 | NA | NA | DNA存储技术 | NA | 生物信息 | NA |
405 | 2024-08-07 |
Streptavidin-Decorated Algorithmic DNA Lattices Constructed by Substrate-Assisted Growth Method
2018-Oct-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.8b00950
PMID:33450799
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研究论文 | 本文开发了一种通过基质辅助生长方法构建的链霉亲和素修饰的算法DNA晶格,用于高密度信息存储和复杂问题解决 | 引入了基质辅助生长方法和链霉亲和素修饰,提高了算法晶格的覆盖率和可视化效率,同时降低了DNA浓度需求 | NA | 探索DNA计算的高密度信息存储和复杂问题解决 | 算法COPY和XOR晶格的构建及其在分子多路分解电路和计算中的应用 | NA | NA | 基质辅助生长方法 | NA | DNA晶格 | 使用了不同比例的0-和1-位规则DNA片 |
406 | 2024-08-07 |
An amplifying DNA circuit coupled with Mg2+-dependent DNAzyme for bisphenol A detection in milk samples
2021-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2020.128975
PMID:33429296
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研究论文 | 本文设计了一种结合放大DNA电路和Mg2+依赖性DNA酶的BPA生物传感器,用于牛奶样品中双酚A的检测 | 该生物传感器通过BPA-适配体结合激活基于脚趾介导的链置换信号放大DNA电路,形成催化Mg2+依赖性DNA酶,切割双标记底物DNA,产生高荧光响应 | NA | 开发一种新的双酚A检测方法 | 双酚A在牛奶样品中的检测 | 生物传感器 | NA | DNA电路,Mg2+依赖性DNA酶 | NA | 荧光信号 | NA |
407 | 2024-08-07 |
Dual recognition element-controlled logic DNA circuit for COVID-19 detection based on exonuclease III and DNAzyme
2021-Feb-02, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d0cc06799g
PMID:33410447
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研究论文 | 本文利用COVID-19基因组的两段(特异性和同源性)作为两个输入,基于外切酶III和DNA酶构建了一个用于COVID-19检测的AND逻辑门 | 开发了一种基于外切酶III和DNA酶的新型逻辑DNA电路,用于高灵敏度的COVID-19检测 | NA | 开发一种高灵敏度的COVID-19检测方法 | COVID-19病毒的检测 | 生物技术 | COVID-19 | 外切酶III和DNA酶 | 逻辑DNA电路 | 基因组片段 | NA |
408 | 2024-08-07 |
Propelling DNA Computing with Materials' Power: Recent Advancements in Innovative DNA Logic Computing Systems and Smart Bio-Applications
2020-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202001766
PMID:33344121
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综述 | 本文综述了利用多种材料作为构建模块的DNA逻辑计算系统的最新进展及其在智能生物应用中的表现 | 介绍了基于不同“工具箱”材料的先进DNA计算系统,包括典型功能性DNA基序、DNA工具酶、非DNA生物材料、纳米材料或聚合物以及2D/3D DNA纳米结构 | 讨论了当前DNA计算领域的“致命弱点”和挑战,并提出了未来有前景的发展方向 | 总结DNA逻辑计算系统的最新成就,并探讨其在智能生物应用中的潜力 | DNA逻辑计算系统及其在智能分析/诊断、细胞成像/治疗等领域的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
409 | 2024-08-07 |
A DNA algorithm for the job shop scheduling problem based on the Adleman-Lipton model
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242083
PMID:33264317
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研究论文 | 提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决作业车间调度问题 | 开发了一种针对该问题的编码方案,并提出了用于算法的DNA计算操作 | NA | 解决作业车间调度问题 | 作业车间调度问题 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | 58个基准实例 |
410 | 2024-08-07 |
Field-programmable biological circuits and configurable (bio)logic blocks for distributed biological computing
2021-01, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2020.104109
PMID:33221638
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研究论文 | 本文描述了一种可编程生物电路的设计,该电路可以在不进行额外遗传工程的情况下进行配置,并且其配置可以在生物程序执行期间通过引入编程输入来改变 | 本文提出的可编程生物电路设计灵感来源于数字电子中的现场可编程门阵列(FPGA)电路,能够在不进行额外遗传工程的情况下进行配置,并且其配置可以在生物程序执行期间通过引入编程输入来改变 | NA | 研究目的是设计一种无需额外遗传工程即可配置的可编程生物电路 | 可编程生物电路及其基本单元可配置(生物)逻辑块(CBLB) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
411 | 2024-08-07 |
Target-directed enzyme-free dual-amplification DNA circuit for rapid signal amplification
2020-12-21, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d0tb02114h
PMID:33185637
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研究论文 | 本文开发了一种无酶、单步快速信号放大的DNA电路,通过整合目标导向的熵驱动催化(EDC)和杂交链反应(HCR),用于核酸和小分子的分析 | 该电路利用熵驱动,无需酶参与,降低了成本,并通过隐藏的扩增触发器(T)设计避免了副产物的产生,提高了反应速率 | NA | 开发一种新型的无酶DNA电路,用于生物传感和高灵敏度检测 | 核酸和小分子,如血清样本中的ATP | 生物工程 | NA | 杂交链反应(HCR) | NA | DNA | NA |
412 | 2024-08-07 |
Catalytic Amplification of Electrochemical Signal in Homogeneous Solution Using an Entropy-driven DNA Circuit
2021-Mar-10, Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry
IF:1.8Q3
DOI:10.2116/analsci.20SCN04
PMID:33162418
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研究论文 | 本文通过模板引导形成和解离包含β-环糊精的包含复合物,在均相溶液中成功调制了DNA探针上二茂铁的电化学信号,并通过与DNA电路结合放大了电化学响应 | 该系统无需对电极表面的互补DNA进行任何修饰,即可检测200 nM的目标DNA | NA | 研究如何通过DNA电路在均相溶液中放大电化学信号 | DNA探针上的二茂铁电化学信号 | 生物传感器 | NA | 电化学检测 | DNA电路 | 电化学信号 | 200 nM目标DNA |
413 | 2024-08-07 |
An enzyme-free DNA circuit-assisted MoS2 nanosheet enhanced fluorescence assay for label-free DNA detection
2021-Jan-15, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2020.121505
PMID:33167218
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研究论文 | 本文提出了一种基于MoS纳米片和催化发夹组装的荧光策略,用于高灵敏度和选择性的H5N1 DNA无标记检测 | 该方法避免了任何标记,并减少了背景信号,通过改变相应的分子信标,该平台具有检测其他病毒DNA的潜力 | NA | 开发一种高灵敏度和选择性的无标记DNA检测方法 | H5N1 DNA | 生物技术 | NA | 催化发夹组装 | NA | DNA | 检测限为7.5 pM,并在人血清样本中进行了H5N1 DNA的检测 |
414 | 2024-08-07 |
Simple Tripedal DNA Walker Prepared by Target-Triggered Catalytic Hairpin Assembly for Ultrasensitive Electrochemiluminescence Detection of MicroRNA
2020-11-25, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.0c01864
PMID:33170660
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研究论文 | 本文采用无酶目标触发催化发夹组装(CHA)电路合成了一个三足DNA步行器,并通过在DNA轨道功能化电极上行走,构建了一个灵敏的电化学发光DNA纳米机器生物传感器,用于检测miRNA-21。 | 本文创新地使用无酶目标触发催化发夹组装技术,简化了多足DNA步行器的制备过程,并实现了高灵敏度和宽线性范围的miRNA检测。 | NA | 开发一种简单且高效的DNA步行器生物传感器,用于超灵敏检测miRNA。 | miRNA-21的检测 | 生物传感 | NA | 催化发夹组装(CHA) | DNA步行器 | DNA | NA |
415 | 2024-08-07 |
Superparamagnetic Nanostructures Coupled with an Entropy-Driven DNA Circuit for Elegant and Robust Photoelectrochemical Biosensing
2020-11-17, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03580
PMID:33124411
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研究论文 | 本文设计了一种基于熵驱动DNA信号放大与光电流表达分离模式的微小RNA-122光电化学生物传感器 | 采用多链复合结构替代DNA发夹结构,减少信号放大系统每一步的可逆性,并通过独特的熵增加机制提高反应效率和增强热稳定性及强特异性识别能力 | NA | 开发一种高性能的微小RNA监测方法 | 微小RNA-122 | 生物传感 | 癌症诊断 | 光电化学 | NA | DNA | NA |
416 | 2024-08-07 |
Integrating CRISPR-Cas12a with a DNA circuit as a generic sensing platform for amplified detection of microRNA
2020-Jul-28, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d0sc03084h
PMID:33133487
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研究论文 | 本文介绍了一种将CRISPR-Cas12a与DNA电路合理整合的CRISPR-Dx方法,用于敏感且成本效益高的miRNA检测 | 通过设计模块化的催化发夹组装(CHA)电路,将每个目标转换并放大为多个可编程的DNA双链,作为触发器启动CRISPR-Cas12a的切割活性,实现信号的进一步放大 | NA | 开发一种新型的CRISPR-Dx方法,用于提高miRNA生物标志物的检测灵敏度和降低成本 | microRNA(miRNA)生物标志物 | 分子诊断 | NA | CRISPR-Cas12a | DNA电路 | DNA | 不同癌症细胞系和临床血清样本 |
417 | 2024-08-07 |
Construction of a simple and intelligent DNA-based computing system for multiplexing logic operations
2020-12, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2020.09.054
PMID:33035692
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研究论文 | 本文利用氧化石墨烯(GO)实现更复杂的大规模逻辑计算,首次通过GO与多种分类的单链DNA的独特相互作用作为反应平台,实现了6位平方根和9位立方根逻辑电路 | 首次利用GO与多种分类的单链DNA的独特相互作用,实现了大规模逻辑数学运算 | NA | 开发一种简单而高效的生物技术方法,用于高级和大规模逻辑数学运算 | 氧化石墨烯(GO)与单链DNA的相互作用 | 生物技术 | NA | DNA计算技术 | NA | DNA序列 | 多种分类的单链DNA |
418 | 2024-08-07 |
Parallelizing Assignment Problem with DNA Strands
2020-Jan, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/IJB.2020.195413.2547
PMID:32884959
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研究论文 | 本文提出了一种利用DNA计算解决分配问题的并行DNA算法 | 该算法能够在多项式时间内解决NP难问题,且仅需O(n²)初始DNA序列,相比其他方法的nn初始序列更为高效 | NA | 利用DNA计算解决NP难问题 | 分配问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA序列 | NA |
419 | 2024-08-07 |
Aptamer-Mediated Reversible Transactivation of Gene Expression by Light
2020-12-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202009240
PMID:32865316
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研究论文 | 本文介绍了一种基于光敏蛋白PAL与RNA适配体相互作用的CRISPR/dCAS9系统变体,用于光控基因表达激活 | 该平台显著减少了遗传操作所需的编码空间,并提供了一个强大的开启开关,在黑暗中几乎没有残留活性 | NA | 探索和操控具有亚细胞分辨率的细胞过程 | 光控基因表达激活系统 | 生物技术 | NA | CRISPR/dCAS9系统 | NA | NA | NA |
420 | 2024-08-07 |
Long-Term Rewritable Report and Recording of Environmental Stimuli in Engineered Bacterial Populations
2020-09-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00193
PMID:32794765
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研究论文 | 本研究设计了一种基于CRISPR基础编辑器的合成遗传电路,名为CRISPR-istop,用于长期可重写的记录系统,能够将刺激转换为荧光强度的变化和基因组DNA的单碱基突变 | 开发了一种新的CRISPR-istop系统,能够实现刺激的长期报告和记录,并且记录可以手动擦除和重写 | 该系统的功能仍需扩展,且在复杂生物环境中的重写难度限制了其应用 | 设计一种新的合成遗传电路,用于长期可重写的记录环境刺激 | 环境刺激的长期记录和报告 | 合成生物学 | NA | CRISPR基础编辑器 | 合成遗传电路 | 基因组DNA | 两轮连续操作,每轮10次传代,每次传代12小时 |