生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 767 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
Differential dependence on DNA ligase of type II restriction enzymes: a practical way toward ligase-free DNA automaton
2007-Feb-16, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2006.12.082
PMID:17196173
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research paper | 本文研究了不同类型的II型限制酶对DNA连接酶的依赖性，并探讨了无连接酶DNA自动机的实际应用 | 发现使用FokI等IIS型限制酶作为硬件时，DNA计算效率可能与DNA连接酶无关 | NA | 探讨无连接酶DNA自动机的可行性及其在基因组网络规模中处理基因关系的潜力 | 比较FokI与HgaI、BsmFI、BbsI和BseMII五种酶在自动机反应中对T4 DNA连接酶的依赖性差异 | 生物计算 | NA | DNA计算 | DNA自动机 | DNA分子 | 涉及五种不同的酶 |
| 682 | 2024-08-07 |
Solving satisfiability problems using a novel microarray-based DNA computer
2007 Jul-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.08.009
PMID:17029765
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研究论文 | 本文提出了一种基于改进的贴纸模型和先进MEMS微阵列技术的算法，用于解决SAT问题 | 该方法通过分步构建解决方案，每一步满足一个子句，最终解决整个布尔公式，无需耗时的样本准备程序和精细的样本应用设备 | NA | 解决SAT问题 | DNA计算机算法 | 生物计算 | NA | MEMS微阵列技术 | 贴纸模型 | DNA序列 | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
DNA computing of solutions to knapsack problems
2007-Mar, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2006.06.001
PMID:16860927
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研究论文 | 本文研究了使用DNA计算解决背包问题的方法，通过分子生物技术在巨大的分子库中进行并行搜索 | 本文展示了如何通过体内翻译DNA库为蛋白质来扩展计算，结合DNA和蛋白质实现多准则优化 | NA | 研究使用DNA计算解决优化问题的方法 | 背包问题 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 684 | 2024-08-07 |
Hybridization-ligation versus parallel overlap assembly: an experimental comparison of initial pool generation for direct-proportional length-based DNA computing
2006-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/tnb.2006.875043
PMID:16805106
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研究论文 | 本文比较了两种用于直接比例长度基DNA计算（DPLB-DNAC）的初始池生成方法：杂交连接和并行重叠组装（POA），并发现POA在种群大小、生成时间、材料使用和效率方面优于杂交连接方法。 | 首次实验比较了DPLB-DNAC中两种初始池生成方法的性能，并证实了POA方法的优势。 | NA | 评估和比较用于解决加权图问题的DPLB-DNAC的初始池生成方法。 | DPLB-DNAC的初始池生成方法，特别是杂交连接和并行重叠组装（POA）。 | DNA计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 685 | 2024-08-07 |
A logical alternative for biological computing
2006-May-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/441025c
PMID:16672949
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2024-08-07 |
Design and evaluation of single-stranded DNA carrier molecules for DNA-directed assembly
2006-Jun, Journal of biomolecular structure & dynamics
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/07391102.2006.10507090
PMID:16615811
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研究论文 | 本文报道了单链DNA载体分子的计算机设计和体外评估，用于指导DNA定向组装。 | 开发了一种新的单链DNA载体分子设计方法，用于高效定向DNA组装。 | 研究仅限于体外实验，未涉及体内或实际应用场景。 | 探索和优化基于DNA的纳米技术中的分子识别和组装方法。 | 单链DNA载体分子及其在DNA定向组装中的应用。 | DNA微阵列技术 | NA | DNA微阵列杂交技术 | NA | DNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 687 | 2024-08-07 |
Towards computing with proteins
2006-Apr-01, Proteins
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/prot.20886
PMID:16435369
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研究论文 | 探讨蛋白质作为计算设备解决复杂计算问题的可能性 | 提出利用蛋白质网络的精确选择性和特异性设计生物系统，实现任何逻辑电路的并行异步计算 | NA | 研究蛋白质作为计算设备在医学应用中的可行性 | 蛋白质分子及其在逻辑电路中的应用 | 生物计算 | NA | 磷酸化和外切酶反应 | 逻辑门 | 蛋白质 | NA |
| 688 | 2024-08-07 |
Scalability of the surface-based DNA algorithm for 3-SAT
2006-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.12.002
PMID:16423447
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研究论文 | 本文研究了基于表面的DNA算法在解决3-SAT问题时的可扩展性，并建立了一个错误模型来分析“标记”和“破坏”操作的不完全性 | 提出了一个错误模型来分析DNA计算中“标记”和“破坏”操作的不完全性，并证明了无论这些操作的速率多大，总存在可满足的3-SAT实例导致计算结果错误 | 该方法只能解决最多N个变量的3-SAT问题，其中N受限于“标记”率和“非破坏”率的特定公式 | 探讨基于表面的DNA算法在解决3-SAT问题时的错误率和可扩展性 | 基于表面的DNA算法在3-SAT问题中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 689 | 2024-08-07 |
Genetic predisposition to cancer: the consequences of a delayed diagnosis of Gorlin syndrome
2005-Dec, Clinical oncology (Royal College of Radiologists (Great Britain))
DOI:10.1016/j.clon.2005.07.014
PMID:16372493
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病例报告 | 本文报告了一例Gorlin综合征的延迟诊断情况，并提出了多个重要问题 | NA | NA | 探讨Gorlin综合征延迟诊断的后果及其对遗传性癌症易感性的影响 | Gorlin综合征患者及其遗传易感性 | NA | 癌症 | DNA存储 | NA | NA | 单个病例 |
| 690 | 2024-08-07 |
A thermodynamic approach to designing structure-free combinatorial DNA word sets
2005, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gki812
PMID:16284197
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研究论文 | 本文提出了一种利用现有热力学模型预测双链稳定性和二级结构的算法，用于生成非相互作用的DNA序列集。 | 采用DNA 'word'结构，允许将给定长度的单个DNA 'words'（如12mer和16mer）串联成更长的序列，从而从单个单词的组合中组装出非常大的非相互作用DNA链集。 | NA | 开发一种算法，用于生成非相互作用的DNA序列集，并验证其在DNA计算问题中的应用。 | DNA序列集及其在DNA计算问题中的应用。 | 生物信息学 | NA | 热力学模型 | NA | DNA序列 | 包括12mer、16mer等不同长度的DNA序列集 |
| 691 | 2024-08-07 |
An integrated microfluidic processor for single nucleotide polymorphism-based DNA computing
2005-Oct, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/b505840f
PMID:16175257
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研究论文 | 开发了一种集成微流控处理器，利用单核苷酸多态性（SNPs）作为二进制位进行分子计算 | 该处理器通过微流控技术实现了改进的捕获动力学、转移效率和单碱基特异性，适用于更大规模的DNA计算 | NA | 开发一种基于SNPs的集成微流控处理器，用于分子计算 | 集成微流控处理器、SNPs、DNA计算 | NA | NA | 微流控技术 | NA | DNA | 十六个捕获室中的磁珠 |
| 692 | 2024-08-07 |
Comment on "The general form of 0-1 programming problem based on DNA computing, by Yin ZhiXiang et al."
2005-Nov, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.07.001
PMID:16139949
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2024-08-07 |
Filter paper for preservation, storage, and distribution of insect and pathogen DNA samples
2005-Jul, Journal of medical entomology
IF:2.1Q1
DOI:10.1093/jmedent/42.4.709
PMID:16119565
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研究论文 | 本研究评估了一种基于滤纸的简单方法，用于存储和保存昆虫DNA，使用聚合酶链反应（PCR）进行验证。 | 提出了一种简单且经济的滤纸方法，用于存储、保存和分发用于PCR分析的DNA样本。 | NA | 评估滤纸方法在昆虫和病原体DNA样本存储和保存中的有效性。 | 家蝇（Musca domestica L.）和携带的弯曲杆菌（Campylobacter spp.）的DNA样本。 | 分子诊断 | NA | 聚合酶链反应（PCR） | NA | DNA | 50只已知携带弯曲杆菌的家蝇 |
| 694 | 2024-08-07 |
The surface-based approach for DNA computation is unreliable for SAT
2005-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.05.007
PMID:16024166
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研究论文 | 本文探讨了基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的不可靠性，并提出需要增加验证步骤来确保计算结果的准确性 | 本文首次揭示了基于表面的DNA计算方法在某些情况下可能导致所有剩余的DNA链都错误地表示问题实例，从而证明该方法的不可靠性 | 本文指出基于表面的DNA计算方法在某些情况下可能导致所有剩余的DNA链都错误地表示问题实例，而没有进行有效的验证步骤 | 验证基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的可靠性 | 基于表面的DNA计算方法在解决SAT问题时的可靠性 | NA | NA | DNA计算 | NA | DNA链 | 四变量四子句的3-SAT实例 |
| 695 | 2024-08-07 |
Markov chains: computing limit existence and approximations with DNA
2005-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.05.003
PMID:15982800
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研究论文 | 本文提出了两种算法用于在马尔可夫链上进行计算，并使用DNA计算来估计极限 | 本文通过DNA计算实现了马尔可夫链极限的计算和估计 | NA | 研究如何使用DNA计算来处理马尔可夫链的极限问题 | 马尔可夫链的极限存在性和近似计算 | NA | NA | DNA computing | NA | DNA strands | NA |
| 696 | 2024-08-07 |
A DNA solution of SAT problem by a modified sticker model
2005-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2005.01.001
PMID:15917122
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研究论文 | 本文通过修改贴纸模型设计了一种不需要初始数据池的SAT问题DNA计算算法 | 提出了一种不依赖初始数据池的SAT问题求解算法，通过逐步构建解决方案序列来满足每个子句，最终解决整个布尔公式 | 该算法在问题规模扩大时可能仍面临数据池大小增长的挑战 | 设计一种适用于大规模SAT问题的DNA计算算法 | SAT问题及其DNA计算方法 | NA | NA | DNA计算 | 贴纸模型 | DNA序列 | 数据池大小从一种分子增长到解决方案分配的数量 |
| 697 | 2024-08-07 |
DNA shuttling between plasmid vectors and a genome vector: systematic conversion and preservation of DNA libraries using the Bacillus subtilis genome (BGM) vector
2005-Jun-24, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2005.04.041
PMID:15913652
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研究论文 | 本文介绍了一种新构建的Bacillus subtilis genome (BGM)载体，能够有效地整合来自细菌人工染色体(BAC)载体的DNA，并展示了如何将BAC库转换为BGM库，以及DNA在BGM中的稳定保存 | 新构建的BGM载体能够高效整合来自BAC载体的DNA，并实现了DNA在B. subtilis中的稳定保存和长期低成本的存储与运输 | NA | 研究如何通过结合BAC和BGM载体系统来处理和保存大型DNA片段 | BAC和BGM载体系统，以及来自拟南芥线粒体DNA的BAC库 | NA | NA | NA | NA | DNA | 18个独立的拟南芥线粒体DNA克隆 |
| 698 | 2024-08-07 |
Design of nucleic acid sequences for DNA computing based on a thermodynamic approach
2005, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gki235
PMID:15701762
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研究论文 | 开发了一种基于最小自由能（DeltaG (min)）的算法，用于设计具有均匀熔解温度的多条核酸序列，这些序列与其互补序列之间不发生非特异性杂交 | 该算法的创新之处在于使用贪心搜索计算DeltaG (min)，有效排除不合适的序列，从而大幅减少计算时间 | NA | 设计适用于DNA计算的核酸序列 | 核酸序列及其在计算、工程应用和纳米制造中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | 126条序列 |
| 699 | 2024-08-07 |
Collaborative design for automated DNA storage that allows for rapid, accurate, large-scale studies
2004-Dec, Assay and drug development technologies
IF:1.6Q3
DOI:10.1089/adt.2004.2.683
PMID:15674026
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研究论文 | 本文介绍了Genomics Collaborative公司如何自动化其DNA处理、存储和检索的方法 | 本文首次展示了商业实体如何通过其大型全球样本库在工业规模上支持遗传研究 | NA | 支持药物发现的持续需求，制定样本存储和收集的战略方向 | DNA样本的自动化处理、存储和检索 | 基因组学 | NA | 自动化DNA处理 | NA | DNA样本 | 大型全球样本库中的大量人类样本 |
| 700 | 2024-08-07 |
Solving traveling salesman problems with DNA molecules encoding numerical values
2004-Dec, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2004.06.005
PMID:15555757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA热力学性质的DNA编码方法和偏向分子算法，用于解决旅行商问题 | 该方法利用DNA的热力学性质进行有效的局部搜索，扩展了DNA计算在解决数值优化问题上的能力 | NA | 探索DNA计算在解决数值优化问题上的应用 | 旅行商问题 | 生物信息学 | NA | 温度梯度聚合酶链反应和温度梯度凝胶电泳 | NA | DNA | NA |