生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 814 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2024-08-07 |
The use of gold nanoparticle aggregation for DNA computing and logic-based biomolecular detection
2008-Oct-01, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/0957-4484/19/39/395103
PMID:21832585
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研究论文 | 本文介绍了一种基于金纳米颗粒聚集引起颜色变化的快速简单可视化技术，用于展示DNA计算过程的结果，并应用于基于逻辑的生物分子检测。 | 提出了一种新的基于金纳米颗粒聚集的颜色变化可视化技术，用于DNA计算和逻辑控制生物系统的分析。 | NA | 开发一种有效的可视化方法，用于DNA计算和逻辑控制生物系统的分析。 | DNA分子和金纳米颗粒 | 生物分子检测 | NA | 金纳米颗粒聚集 | NA | 颜色变化 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 682 | 2024-08-07 |
Abstractions for DNA circuit design
2012-Mar-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2011.0343
PMID:21775321
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计DNA链置换装置的编程语言，支持不同级别的分子细节分析 | 提出了一种新的编程语言，允许在不同细节级别上分析DNA链置换装置设计，无需修改程序 | 未提及 | 开发一种编程语言，用于设计能够维持精确反应动力学的DNA链置换装置 | DNA链置换装置的设计和分析 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 683 | 2024-08-07 |
Neural network computation with DNA strand displacement cascades
2011-Jul-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature10262
PMID:21776082
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研究论文 | 本文展示了如何利用DNA计算和链置换电路构建分子系统，使其表现出类似大脑的自主行为 | 首次实现了将任意线性阈值电路（一种人工神经网络模型）系统地转化为DNA链置换级联，这些级联可以作为小型神经网络运行 | 目前仅实现了包含四个完全连接的人工神经元的Hopfield联想记忆模型 | 探索分子系统如何模拟大脑的认知功能，如模式识别、决策和环境响应 | DNA链置换级联及其在人工神经网络中的应用 | 生物技术 | NA | DNA计算，链置换电路 | 人工神经网络 | DNA序列 | 四个完全连接的人工神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 684 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Jun, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.38844717
PMID:21770097
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合，通过DNA实现信息的存储和基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据，展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的实际应用 | DNA信息存储和基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 685 | 2024-08-07 |
An unenumerative DNA computing model for vertex coloring problem
2011-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2011.2160996
PMID:21742570
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研究论文 | 本文提出了一种新的非枚举DNA计算模型，用于解决图的顶点着色问题 | 通过排序顶点序列和减少颜色编码数量，有效减少了候选解的枚举，从而避免了解决方案空间的指数爆炸 | NA | 解决DNA计算中由于候选解枚举导致的解决方案空间指数爆炸问题 | 图的顶点着色问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | 非枚举DNA计算模型 | 图 | 12个顶点的图，初始解决方案空间包含283个DNA链 | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2024-08-07 |
[DNA computing]
2011, Postepy biochemii
PMID:21735816
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算作为一种替代传统硅基计算机的可能性，并介绍了其在不同领域的应用前景 | 首次实现了使用DNA寡聚物和DNA连接酶解决哈密顿路径问题，并提出了基于限制酶FokI的分子两态有限自动机模型 | DNA计算的研究仍处于进展中，尚未实现大规模应用 | 探索DNA计算在计算机科学中的突破潜力 | DNA计算的模型和应用 | NA | 癌症 | DNA计算 | 分子两态有限自动机 | DNA寡聚物 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 687 | 2024-08-07 |
A CLIQUE algorithm using DNA computing techniques based on closed-circle DNA sequences
2011-Jul, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2011.03.004
PMID:21511001
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研究论文 | 本文利用闭环DNA序列的DNA计算技术实现CLIQUE算法，用于二维数据的聚类 | 本文提出了一种新的DNA计算应用策略，将聚类过程转化为并行的生物化学反应，并利用闭环DNA序列表示标记单元 | 该策略目前仅适用于二维数据 | 探索DNA计算技术在图论和组合问题中的应用 | CLIQUE算法及二维数据的聚类 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 二维数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2024-08-07 |
An improved colony PCR procedure for genetic screening of Chlorella and related microalgae
2011-Aug, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-011-0596-6
PMID:21431847
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研究论文 | 本文介绍了一种改进的菌落PCR技术，用于绿藻Chlorella及相关微藻的基因筛选 | 使用Chelex-100作为优选的裂解缓冲液，不仅提高了DNA提取、PCR和DNA存储的效率，而且对细胞密度的变化不敏感 | NA | 建立适用于基因工程转化体筛选和天然微藻分离株生物勘探的改进PCR条件 | Chlorella及相关微藻的基因筛选 | NA | NA | PCR | NA | DNA | 涉及多种微藻菌株，包括Chlorella、Chlamydomonas reinhardtii、Dunaliella salina、Nannochloropsis sp.、Coccomyxa sp.和Thalassiosira pseudonana | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Mar, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.3422
PMID:21449321
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合，通过DNA存储信息并进行基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据，展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的潜力及其应用 | DNA计算中的信息存储与基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 | NA | NA | NA | NA |
| 690 | 2024-08-07 |
Assessing a novel room temperature DNA storage medium for forensic biological samples
2012-Jan, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2011.01.008
PMID:21324769
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研究论文 | 评估一种新型室温DNA存储介质SampleMatrix™在法医生物样本中的稳定性和保护效果 | 介绍了一种新型室温DNA存储介质SampleMatrix™，能够在室温下稳定和保护DNA样本，无需冷冻存储 | NA | 评估SampleMatrix™在法医生物样本中的稳定性和保护效果 | 人类基因组DNA样本在不同条件下的存储效果 | NA | NA | 定量PCR，琼脂糖凝胶电泳，多重短串联重复序列（STR）分析 | NA | DNA | 不同量的DNA样本（0.0625-200 ng）在SampleMatrix™中存储1天至1年 | NA | NA | NA | NA |
| 691 | 2024-08-07 |
Companies hope to bring DNA storage in from the cold
2010-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm1010-1056b
PMID:20930728
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 692 | 2024-08-07 |
Evaluation of novel forensic DNA storage methodologies
2011-Nov, Forensic science international. Genetics
DOI:10.1016/j.fsigen.2010.08.007
PMID:20837408
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研究论文 | 本研究评估了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术在法医学中的应用 | 开发了基于脱水生物学的新型室温DNA存储技术，如Gentegra产品 | 该技术似乎依赖于DNA提取方法，磁珠提取的DNA无法安全存储超过6个月 | 比较Gentegra产品与-20°C和Qiasafe存储的DNA数量和质量 | 法医学中DNA的安全存储 | 法医学 | NA | 脱水生物学技术 | NA | DNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2024-08-07 |
DNA word set design based on minimum free energy
2010-Dec, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2010.2069570
PMID:20840907
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研究论文 | 本文开发了一种基于最小自由能（MFE）标准的算法，用于设计DNA短词集 | 该算法直接生成实际的DNA词集，不同于其他学术和统计数字，能够减少错误杂交反应的出现，提高DNA计算的可靠性和规模 | NA | 开发一种新的算法，用于设计基于最小自由能的DNA短词集 | DNA短词集的设计 | 生物分子计算 | NA | 最小自由能（MFE） | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 694 | 2024-08-07 |
Mathematical modeling: bridging the gap between concept and realization in synthetic biology
2010, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2010/541609
PMID:20589069
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review | 本文综述了数学建模在合成生物学中的重要性和方法，包括模型假设、建模框架类型（确定性和随机性）以及参数估计和优化的重要性 | NA | NA | 探讨数学建模在合成生物学中连接概念与实现的作用 | 合成生物学中的数学建模概念、方法及其应用 | synthetic biology | NA | 数学建模 | 确定性模型和随机性模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 695 | 2024-08-07 |
Applying DNA computation to intractable problems in social network analysis
2010-Sep, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2010.05.006
PMID:20566337
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研究论文 | 本文提出基于DNA计算的方法来解决社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 利用DNA计算的高信息密度和大规模并行性来解决传统计算机架构难以处理的NP完全问题 | NA | 探索DNA计算在社交网络分析中的应用，以解决复杂的社会网络问题 | 社交网络分析中的N-团、N-族和N-俱乐部问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 社交网络数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 696 | 2024-08-07 |
DNA computing circuits using libraries of DNAzyme subunits
2010-Jun, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2010.88
PMID:20512129
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研究论文 | 本文报道了一种基于催化核酸（DNAzymes）库的DNA计算平台，用于动态组装通用逻辑门和半加器/半减法器系统 | 首次展示了多层门级联、扇出门和并行逻辑门操作，并能根据输入标记调控反义分子或适配体的表达，作为酶的抑制剂 | NA | 开发适用于生物工程和纳米医学的生物计算系统 | DNA计算电路及其模块化耦合和可扩展性 | 生物工程 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2024-08-07 |
Networks and circuits in cell regulation
2010-Jun-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2010.05.015
PMID:20457126
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研究论文 | 本文研究了酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路，通过广泛的数值模拟分析探讨了网络表示和相应的数学模型 | 提出了一种结合组件连接和功能任务的建模策略，以更好地理解细胞功能的动态过程 | 研究仅限于酵母细胞周期的G1到S阶段，可能不适用于其他生物过程 | 探索细胞调控中的网络和电路模型，以实现对复杂细胞功能动态的更真实描述 | 酵母细胞周期中G1到S阶段的生物电路 | NA | NA | 数值模拟分析 | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2024-08-07 |
Biological computing with diffusion and excitable calcium stores
2004-Jun, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2004.1.147
PMID:20369965
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研究论文 | 研究细胞内信号传递中通过扩散和兴奋性钙储存的几何配置生成完整逻辑门的能力，以及如何利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建生物信号的符合检测器 | 探讨了不同几何配置的兴奋性钙储存生成逻辑门的能力，并描述了利用兴奋性钙诱导的钙释放机制构建符合检测器的方法 | NA | 研究细胞内信号传递中的计算能力 | 细胞内兴奋性钙储存的几何配置及钙诱导的钙释放机制 | 生物计算 | NA | 兴奋性钙诱导的钙释放 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 699 | 2024-08-07 |
A microfluidic DNA computing processor for gene expression analysis and gene drug synthesis
2009-Nov-06, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/1.3259628
PMID:20216967
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研究论文 | 本文描述了一种用于基因表达分析和基因药物合成的微流控DNA计算处理器，该处理器能够执行布尔逻辑操作 | 该处理器通过微流控芯片集成多步生物化学反应，实现了对多个基因表达的同步分析和相应的基因药物合成，具有简单快速的特点 | NA | 开发一种用于基因表达分析和基因药物合成的微流控DNA计算处理器 | 使用与癌症相关的多个基因作为输入分子，通过其表达水平与计算相关DNA链的相互作用进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 微流控技术 | NA | DNA | 多个癌症相关基因 | NA | NA | NA | NA |
| 700 | 2024-08-07 |
Free energy estimation of short DNA duplex hybridizations
2010-Feb-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-11-105
PMID:20181279
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研究论文 | 本文比较了四种已发表的DNA/DNA双链自由能计算方法与基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，并提出了一种改进模型 | 提出了基于三联体相互作用的扩展最近邻模型，该模型在标准和非标准实验条件下都能准确估计完美匹配双链的自由能 | 文章未明确提及具体的局限性 | 比较不同DNA双链自由能计算方法的相似性与差异，并提出改进模型 | 695对短寡核苷酸序列 | 生物信息学 | NA | 最近邻模型 | 最近邻模型 | 序列 | 695对短寡核苷酸序列 | NA | NA | NA | NA |