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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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661 | 2024-08-07 |
Photochemical ligation of DNA "words" for DNA computing
2003, Nucleic acids research. Supplement (2001)
DOI:10.1093/nass/3.1.183
PMID:14510441
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研究论文 | 本文展示了含有5-乙烯尿嘧啶((V)U)的寡脱氧核苷酸(ODNs)的光化学DNA计算,通过(V)U介导的可逆DNA光连接实现了多“DNA词”的计算。 | 开发了一种基于(V)U介导的可逆DNA光连接的新MARK和UNMARK操作,用于多词DNA计算。 | NA | 展示光化学DNA计算在解决小规模满足性问题(SAT问题)中的应用。 | 含有5-乙烯尿嘧啶的寡脱氧核苷酸及其在DNA计算中的应用。 | NA | NA | 光化学DNA连接 | NA | DNA序列 | 涉及三个串联的DNA词 |
662 | 2024-08-07 |
DNA library design for molecular computation
2003, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/106652703321825973
PMID:12804092
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研究论文 | 提出了一种用于分子计算的DNA库设计的新方法 | 该方法考虑了DNA链在复杂结构中如发夹、内部环或凸环的杂交能力,并基于热力学数据计算杂交体的稳定性 | NA | 实现DNA分子中二进制信息的编码,并在大量不同分子中实现完美匹配的DNA寡聚体与错配之间的实际区分 | DNA库的设计及其在分子计算中的应用 | 分子生物学 | NA | 分子生物学工具 | 动态规划算法 | DNA序列 | 十二位DNA库 |
663 | 2024-08-07 |
The general form of 0-1 programming problem based on DNA computing
2003-Jun, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(03)00053-4
PMID:12753938
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研究论文 | 本文利用基于表面化学的荧光标记技术,通过将DNA计算应用于编程问题,解决了0-1规划问题的一般形式 | 本文首次尝试将DNA计算应用于0-1规划问题,并提出了一种基于荧光标记技术的新方法 | NA | 解决0-1规划问题的一般形式 | 0-1规划问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
664 | 2024-08-07 |
Measurement of the number of molecules of a single mRNA species in a complex mRNA preparation
2003-Apr-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1006/jtbi.2003.3211
PMID:12713944
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研究论文 | 本文设计了一种方法来计算复杂mRNA制备中单一mRNA种类的分子数量 | 将定量问题转化为定性问题,通过将相同分子种类的单个分子转化为新的不同分子种类并进行放大 | 第二种策略受限于只能处理几百个单个分子 | 解决使用DNA芯片进行杂交实验以确定mRNA表达和浓度(基因表达谱)时数据标准化的未解决问题 | 单一mRNA种类的分子数量 | NA | NA | DNA计算中常用的多聚连接器方法 | NA | mRNA | 第一种方法可处理多达10^6个单个分子,第二种方法可处理几百个单个分子 |
665 | 2024-08-07 |
Directed evolution of a genetic circuit
2002-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.252535999
PMID:12451174
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研究论文 | 本文提出了一种结合理性和进化设计策略来构建遗传调控电路的方法 | 通过定向进化应用于简单遗传电路的基因,展示了非功能电路可以迅速演变为功能电路 | 生物电路工程师在预测简单合成网络的精确行为方面存在困难 | 探索构建遗传调控电路的新策略 | 遗传调控电路及其在活细胞中的应用 | 生物工程 | NA | 定向进化 | NA | 遗传设备库 | 一系列具有不同行为的遗传设备 |
666 | 2024-08-07 |
DNA solution of a graph coloring problem
2002 May-Jun, Journal of chemical information and computer sciences
DOI:10.1021/ci010016o
PMID:12086509
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研究论文 | 本文通过分子生物学技术解决了图着色问题 | 本文首次使用DNA计算解决NP完全问题 | NA | 展示DNA计算解决NP完全问题的能力 | 图着色问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | 图论参数 | NA |
667 | 2024-08-07 |
A Chinese Postman Problem based on DNA computing
2002 Mar-Apr, Journal of chemical information and computer sciences
DOI:10.1021/ci010046r
PMID:11911690
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研究论文 | 本文通过分子生物学技术解决了一个基于DNA计算的中国邮差问题 | 利用DNA计算解决NP完全搜索问题的能力得到了进一步证明 | NA | 探索DNA计算在解决复杂计算问题中的应用 | 中国邮差问题 | NA | NA | 分子生物学技术 | NA | DNA分子 | 一个小图被编码在DNA分子中 |
668 | 2024-08-07 |
Analysis of the frequency response of the saccadic circuit: numerical simulations
2001-Dec, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/s0893-6080(01)00121-6
PMID:11771717
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研究论文 | 本文通过分析扫视运动电路的频率响应,扩展了之前对扫视运动系统阶跃响应的研究 | 提出了对扫视电路频率响应的分析方法,为生物电路的几个方面提供了机制解释,并明确了可行模型的约束条件 | NA | 揭示大脑电路操作的基本机制,特别是运动电路的动态行为 | 扫视运动电路的频率响应 | 神经科学 | NA | 数值模拟 | NA | NA | NA |
669 | 2024-08-07 |
Digital and biological computing in organizations
2002-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(01)00185-x
PMID:11755499
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研究论文 | 本文探讨了生物计算与数字计算在组织中的结合,重点关注生物信息处理基础设施的本质及其如何有效扩展数字计算 | 本文基于Michael Conrad的理论,深入探讨了生物计算与数字计算的结合,特别是在组织中的应用 | NA | 研究生物计算与数字计算在组织中的结合及其应用 | 生物计算与数字计算的结合及其在组织中的应用 | NA | NA | 生物计算 | NA | NA | NA |
670 | 2024-08-07 |
Intelligent DNA chips: logical operation of gene expression profiles on DNA computers
2000, Genome informatics. Workshop on Genome Informatics
PMID:11700585
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研究论文 | 提出了一种新型DNA芯片,能够在DNA计算机上执行基因表达谱的逻辑运算 | 利用DNA编码数字方法,实现了不仅检测基因表达还能找到基因表达逻辑公式的通用DNA芯片 | NA | 开发一种能够在DNA计算机上进行基因表达谱逻辑运算的新型DNA芯片 | 基因表达谱的逻辑运算 | 生物信息学 | NA | DNA编码数字方法 | NA | 基因表达数据 | NA |
671 | 2024-08-07 |
A DNA computing readout operation based on structure-specific cleavage
2001-Nov, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt1101-1053
PMID:11689851
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研究论文 | 本文介绍了一种基于结构特异性切割的表面DNA计算读出策略 | 该策略利用DNA杂交的序列特异性与酶切结构的特异性,实现了对DNA计算产物的高均匀性检测,且过程线性,无需PCR扩增 | NA | 开发一种新的DNA计算读出方法 | 基于结构特异性切割的DNA计算读出策略 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | DNA分子 | 4变量/3可满足性(SAT)问题 |
672 | 2024-08-07 |
On combinatorial DNA word design
2001, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/10665270152530818
PMID:11535173
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研究论文 | 本文研究了设计满足特定组合约束的DNA码字集合的问题,这些码字用于DNA计算或作为化学库中的分子条形码。 | 本文扩展了编码理论的经典结果,提出了DNA码最大尺寸的上界和下界,并给出了构建此类码的方法。 | NA | 研究设计满足特定组合约束的DNA码字集合的方法。 | DNA码字集合的设计。 | 生物信息学 | NA | 动态规划算法 | NA | 文本 | NA |
673 | 2024-08-07 |
Bio-libraries and DNA storage: assessment of patient perception of information
2001, Medicine and law
IF:<0.1Q4
PMID:11495203
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研究论文 | 本研究分析并评估了法国临床医生向患者提供关于DNA存储信息的冲击,以及患者对这些信息的接收和理解程度 | 首次探讨了患者对DNA存储信息的认知和理解程度,以及这对知情同意书有效性的影响 | 样本量较小,且仅限于一个部门的患者,可能影响研究结果的普遍性 | 评估患者对DNA存储信息的认知和理解,以及这对知情同意书有效性的影响 | 患者对遗传学知识、DNA存储和同意书的认知 | NA | NA | NA | NA | 问卷调查 | 170名患者 |
674 | 2024-08-07 |
Fidelity of enzymatic ligation for DNA computing
2000, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/10665270050514963
PMID:11382365
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研究论文 | 本文介绍了一种用于快速定性评估杂交/连接忠实度的便捷检测方法 | 使用随机探针DNA链和限制性酶消化,结合聚合酶链反应(PCR)放大反应产物 | NA | 评估两种DNA连接酶(T4 DNA连接酶和Thermus aquaticus(Taq)DNA连接酶)在不同温度下的连接效率和忠实度 | DNA连接酶的连接效率和忠实度 | NA | NA | 聚合酶链反应(PCR) | NA | DNA | NA |
675 | 2024-08-07 |
Optically programming DNA computing in microflow reactors
2001-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(01)00099-5
PMID:11267740
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research paper | 本文探讨了使用光化学和微系统技术在DNA计算中实现生物化学处理协议的可编程性和集成 | 提出了一个磁性可切换的选择性传输模块(STM),实现了在恒定流下的序列特异性DNA过滤操作;介绍了单稳流STM系统,解决了给定最大尺寸N的最大团问题;提出了通过光化学光刻技术光学编程DNA标记过程的方法 | 实验实现尚未完成,将在其他地方报告 | 研究DNA计算中生物化学处理协议的可编程性和集成 | DNA计算中的生物化学处理协议 | NA | NA | 光化学光刻技术 | 选择性传输模块(STM) | DNA寡核苷酸 | N值可达约100 |
676 | 2024-08-07 |
An improved surface-based method for DNA computation
2001-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/s0303-2647(00)00133-7
PMID:11226621
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研究论文 | 本文分析了Liu等人的表面基DNA计算方法,并提出了一种改进的混合DNA/光学计算方法 | 提出的方法具有低成本、短操作时间、可重复使用的表面和简单的实验步骤等显著优势,并且结合了易于图案化的DNA计算步骤与并行但通常均匀且不易图案化的光学计算步骤 | NA | 改进DNA计算方法的性能和可靠性 | DNA计算方法 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
677 | 2024-08-07 |
End-specific covalent photo-dependent immobilisation of synthetic DNA to paramagnetic beads
2000-Nov-15, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/28.22.e98
PMID:11071952
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研究论文 | 描述了一种新型光依赖共价固定合成DNA寡聚物到氨基包被的顺磁性珠子上的方法 | 使用了异双功能光反应交联化学物质4-硝基苯3-重氮吡咯甲酸盐,将5'氨基修饰的DNA共价固定到硅和聚苯乙烯顺磁性珠子上 | NA | 开发一种光依赖的共价固定合成DNA到顺磁性珠子上的新方法,并探索其在复杂诊断、进化生物技术和DNA计算等领域的应用 | 合成DNA寡聚物和氨基包被的顺磁性珠子 | 生物技术 | NA | 光反应交联化学 | NA | DNA | NA |
678 | 2024-08-07 |
[Development of bioethics. Analysis of practices in 20 hospital departments]
2000-Oct-28, Presse medicale (Paris, France : 1983)
PMID:11098269
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研究论文 | 本文通过问卷调查分析了法国20个医院部门在DNA库的建立和管理以及当前使用的程序限制方面的实践情况 | 本文强调了在日常临床实践和研究中存储和使用DNA所涉及的伦理问题,并提供了关于法国生物伦理法律兴趣和限制的讨论元素 | 本文的局限性在于仅基于问卷调查的结果,可能未能全面反映所有医院部门的具体实践情况 | 旨在分析法国医院部门在DNA库的建立和管理以及当前使用的程序限制方面的实践情况,并促进伦理实践 | 法国20个医院部门的DNA库实践情况 | NA | NA | NA | NA | 文本 | 20个医院部门 |
679 | 2024-08-07 |
Search-and-destroy missions in DNA computing
2000-Oct-01, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/ac0029408
PMID:11028600
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
680 | 2024-08-07 |
Toggles and oscillators: new genetic circuit designs
2000-Jun, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
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研究论文 | 本文报道了使用已知遗传元件从头设计功能性生物电路的两个最新研究 | 设计并构建了遗传触发开关和振荡遗传电路,这些电路在数学模型的辅助下设计 | 模型仅能解释电路的部分特性,未预测到的行为需要进一步研究 | 旨在统一理论与实验在遗传电路研究中的应用 | 遗传触发开关和振荡遗传电路 | NA | NA | NA | 数学模型 | NA | NA |