生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['DNA storage', 'DNA computing', 'DNA circuit', 'biological computing', 'biological circuit']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 874 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-10 |
Ionic liquid-based aqueous biphasic system as an alternative tool for enhanced bacterial DNA extraction
2024-09-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343045
PMID:39155099
|
研究论文 | 开发基于离子液体的水性双相系统用于增强细菌DNA提取 | 首次优化基于铵基离子液体的水性双相系统用于DNA提取，引入生物相容性阴离子以降低毒性，并与传统方法效果相当且更经济环保 | DNA回收率和ABS的可重复使用性仍有改进空间 | 开发一种经济环保的DNA提取替代方法，利用离子液体-水性双相系统进行DNA纯化 | 鲑鱼精子DNA和细菌质粒DNA | 分子生物学 | NA | DNA提取 | NA | NA | 细菌样本（具体数量未提及） | DNA | NA | NA | NA |
| 22 | 2026-07-07 |
DNA Bloom Filter enables anti-contamination and file version control for DNA-based data storage
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae125
PMID:38555478
|
研究论文 | 将布隆过滤器应用于DNA存储，实现抗污染和文件版本控制功能 | 首次将空间高效的概率数据结构布隆过滤器应用于DNA存储，实现抗错误/抗污染功能，并利用计数布隆过滤器实现文件版本控制，降低修改DNA文件时的合成成本 | NA | 开发一种高效方法，在DNA存储中实现抗污染和文件版本控制，同时保持高存储密度和低计算复杂度 | DNA存储中的序列数据 | 机器学习 | NA | DNA合成与测序 | 布隆过滤器、计数布隆过滤器 | DNA序列 | NA | DNA | 阴阳编解码系统 | DNA计算 | 存储密度、计算复杂度、错误过滤效率 |
| 23 | 2026-07-07 |
Highly sensitive and portable mRNA detection platform for early cancer detection
2021-Sep-26, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01039-4
PMID:34565398
|
研究论文 | 提出一种新型两步扩增方法CHAGE，用于早期胰腺癌检测中的mRNA高灵敏便携检测 | 结合催化发夹自组装策略与金增强即时检测技术，实现无设备、快速、可视化的mRNA检测，检测限低至100 fM | 未提及 | 开发便携、灵敏的mRNA检测平台用于早期癌症诊断 | 胰腺癌相关生物标志物GPC1 mRNA及细胞外囊泡 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 催化发夹自组装、金增强即时检测、侧流层析 | NA | 图像（检测条带显色结果） | 未明确提及样本数量 | DNA | NA | DNA计算 | 检测限100 fM，检测时间2小时内，操作温度37°C |
| 24 | 2026-07-07 |
Structural DNA nanotechnology: state of the art and future perspective
2014-Aug-13, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja505101a
PMID:25029570
|
评论 | 本综述全面回顾了结构DNA纳米技术领域的最新进展与未来展望，涵盖设计原理、组装方法及多种应用方向 | 系统整合了DNA作为可编程分子构建模块在设计规则与组装方法上的创新，并展望了在遗传编程和分子设计中的机遇 | 文章未涉及具体实验数据或定量性能比较，对某些应用方向的挑战仅做概括性描述 | 阐述结构DNA纳米技术的研究现状、挑战与未来发展机会 | DNA纳米结构及其设计原则、组装技术与应用领域 | 纳米技术 | 未指定 | 结构DNA纳米技术 | 未指定 | 未指定 | 未指定 | DNA | 沃森-克里克碱基配对编码 | DNA计算 | 未指定 |
| 25 | 2026-07-05 |
A multiple-encrypted DNA device for secure communication
2026-Jul-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aef9101
PMID:42397898
|
研究论文 | 开发了一种集成多种加密算法的DNA多层加密装置，用于安全通信 | 首次在单个DNA折纸通信工作流中整合多个加密协议，利用DNA纳米结构的可寻址性创建纳米摩尔斯电码空间模式，并通过构象门控验证实现隐身通信 | 目前仅实现了短消息的传输，实际应用中可能面临大规模数据处理的效率问题 | 实现基于DNA纳米结构的多层加密安全通信 | DNA纳米折纸结构、加密算法、摩尔斯电码模式 | DNA计算 | NA | DNA折纸术 | NA | 文本 | NA | DNA | 纳米摩尔斯电码编码 | DNA计算 | NA |
| 26 | 2026-07-04 |
What does a consent conversation for whole genome sequencing look like in the NHS Genomic Medicine Service? An observational study
2025-04, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01749-x
PMID:39592828
|
研究论文 | 该研究通过录音分析NHS基因组医学服务中全基因组测序的知情同意对话，揭示其内容、结构及不足 | 首次通过录音观察真实临床环境中的全基因组测序同意对话，系统分析对话内容缺失和家长参与度不足问题 | 样本量较小且集中于儿童罕见病领域，可能无法推广至成人或其他疾病场景 | 探索英国NHS基因组医学服务中全基因组测序同意对话的实际操作模式与改进方向 | 26次医疗专业人员与儿童罕见病患者家长的同意咨询对话 | 自然语言处理 | 罕见病（儿童） | 全基因组测序 | NA | 音频数据 | 26次同意咨询对话（涉及7个NHS信托机构） | DNA | NA | NA | NA |
| 27 | 2026-07-04 |
Robust multi-read reconstruction from noisy clusters using deep neural network for DNA storage
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.019
PMID:39807110
|
研究论文 | 提出RobuSeqNet神经网络，用于从含噪声的DNA存储序列簇中稳健重建多读段 | 通过注意力机制和精心设计的网络结构，RobuSeqNet能够处理包含断裂、重排和错误聚类等污染的序列簇，在高达20%污染的情况下仍保持高成功率 | 未提及在更长序列或更复杂存储条件下的性能表现 | 解决DNA存储系统中因错误和污染导致的序列重建挑战 | DNA存储系统中的多读段序列簇 | 机器学习 | NA | 下一代测序 | 神经网络 | 序列数据 | 三个代表性下一代测序数据集 | DNA | NA | NA | 序列重建成功率（%），在三个数据集上分别为99.88%、99.82%和97.68%（无污染）及99.74%、99.58%和96.44%（含20%污染） |
| 28 | 2026-06-29 |
Entropy-drive DNA circuit coupled with no-promoter rolling circle transcription to synthesize fluorescent gold nanoclusters for label-free detection of breast cancer biomarkers
2026-Feb-21, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-026-07921-y
PMID:41721123
|
研究论文 | 开发了一种结合熵驱动DNA电路和无启动子滚环转录的级联放大策略，用于无标记检测乳腺癌生物标志物miRNA-21 | 设计了自折叠成哑铃结构的单链DNA探针，同时作为EDC产物和转录模板，防止序列交叉并消除启动子依赖性，并结合荧光金纳米簇实现高灵敏检测 | 未明确讨论该方法在临床应用中的潜在干扰或长期稳定性 | 实现高灵敏、特异性且无标记的miRNA检测，用于癌症诊断 | miRNA-21作为乳腺癌生物标志物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 滚环转录、荧光金纳米簇合成 | NA | NA | 复杂生物样本中的总RNA提取物，用于区分癌细胞与正常细胞 | RNA, DNA | NA | NA | 检测限9.6 pM，单碱基错配特异性 |
| 29 | 2026-06-28 |
Bio-inspired approaches to in vivo DNA data storage systems
2026-Jun-26, Materials horizons
IF:12.2Q1
DOI:10.1039/d6mh00728g
PMID:42359515
|
综述 | 系统概述了受生物启发的体内DNA数据存储系统，聚焦于基于合成信息和记忆的数字记录两种核心策略 | 提出将活细胞作为存储和处理单元，通过模拟遗传记忆和刺激响应行为构建自适应自主存储架构，并综述了功能性整合如动态数据更新、加密和逻辑运算 | 当前面临存储密度、编辑效率和细胞稳定性方面的挑战 | 系统总结体内DNA数据存储的发展，并展望下一代DNA存储平台 | 基于细胞的DNA数据存储系统 | 自然语言处理 | NA | DNA编码、细胞自我复制、实时DNA写入 | NA | NA | NA | DNA | DNA编码 | 分子计算 | 存储密度（TB级）、数据持久性、编辑效率、细胞稳定性 |
| 30 | 2026-06-26 |
Microelectrode Arrays Technology for Brain-on-a-Chip Applications
2026-May-23, Biosensors
DOI:10.3390/bios16060305
PMID:42345861
|
综述 | 系统综述用于脑-芯片系统的微电极阵列技术 | 全面评估了平面和3D柔性微电极阵列技术，强调从被动平面电极到高密度有源CMOS和TFT基阵列的转变，以及内源性整合和外源性包裹策略 | 未来技术发展需解决可扩展性瓶颈、长期稳定性等问题，并整合人工智能 | 回顾和展望微电极阵列在脑-芯片应用中的技术要求和发展方向 | 微电极阵列技术用于脑-芯片（BOC）系统 | 数字病理学 | NA | 微电极阵列、CMOS、TFT、微流控、光电子、电化学传感器 | NA | 电生理数据 | NA | NA | NA | 生物计算 | 可扩展性瓶颈、长期稳定性、数据密度、访问时间、错误率、耐久性 |
| 31 | 2026-06-26 |
On-Demand Regulation of Catalytic DNA Circuits Using Phosphorylated Charge Reversal Peptides
2025-06-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425113
PMID:40249733
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于磷酸化电荷反转肽的催化DNA电路调控系统，实现了对微小RNA的精准活体成像 | 首次利用磷酸化电荷反转肽实现催化DNA电路的可控递送和细胞内释放，通过内源性调控减少非特异性信号泄漏 | 未详细讨论该系统的长期稳定性和体内递送效率的定量评估 | 建立安全高效的催化DNA电路体内递送系统，用于疾病诊断 | 催化DNA电路和酶响应肽（ERP） | 分子计算 | 肿瘤 | DNA电路，磷酸化调控 | NA | NA | NA | DNA | NA | DNA计算 | NA |
| 32 | 2026-06-26 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-06-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
|
研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路，实现原细胞与活细胞社区中自调节的双向通信 | 提出了一个包含识别、激活和反馈模块的DNA电路，使原细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号实现自我调节的细胞间通信，并具备可再生能力，允许原细胞与多个靶标活细胞连续交互 | 未提及具体局限性，但可能涉及电路的稳定性、可扩展性或体内应用挑战 | 开发合成生物学工具，通过自调节信号传输调控原细胞与活细胞间的动态通信，以编程细胞行为 | 原细胞（非生物模拟细胞）与活细胞组成的社区 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA | DNA | DNA电路（识别、激活、反馈模块） | 分子计算, DNA计算 | NA |
| 33 | 2026-06-20 |
Modeling DNA storage retrieval reliability via sequencing coverage depth
2026-May-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag303
PMID:42319256
|
研究论文 | 通过测序覆盖深度建模DNA存储检索可靠性 | 开发了非均匀覆盖深度分析框架，利用对数正态分布建模聚合酶链反应和测序数据的信道非均匀性，并提出了两种互补理论（优惠券收集问题和关键分位数理论）来估计检索可靠性 | 未提及具体局限性 | 量化测序覆盖深度对DNA存储检索可靠性和测序效率的影响 | DNA存储系统中的聚合酶链反应和测序数据信道 | 数字病理学 | NA | 聚合酶链反应、测序 | 对数正态分布模型 | 测序数据 | NA | DNA | NA | 分子计算 | 存储容量、测序覆盖深度、检索可靠性、测序效率 |
| 34 | 2026-06-19 |
Rewireable Building Blocks for Enzyme-Powered DNA Computing Networks
2024-09-25, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c07221
PMID:39255470
|
研究论文 | 提出一种基于酶驱动的DNA计算网络的可重连模块化构建方法，提升神经网络的可扩展性 | 通过酶促合成高纯度神经元、空间模式化神经元簇以及通用单链DNA骨架编码连接性三种策略，解决DNA神经网络扩展中组装时间长、背景信号高和串扰问题 | 未提供具体性能指标如误差率、可扩展性的量化基准，以及长期稳定性和实际应用验证 | 提升基于DNA的神经网络的可扩展性，实现便携式计算能力 | 基于酶驱动DNA计算网络的可重连模块化神经元 | 分子计算, 神经网络 | NA | 酶促合成, 微流控 | 神经网络（级联、扇入和扇出电路） | 生物分子信号 | NA | DNA | 单链DNA编码, 空间模式化编码 | DNA计算 | 扩展性由模块化设计、合成简便性和与各种神经网络架构兼容性实现，未提供具体指标 |
| 35 | 2026-06-19 |
Spatially Localized Entropy-Driven Evolution of Nucleic Acid-Based Constitutional Dynamic Networks for Intracellular Imaging and Spatiotemporal Programmable Gene Therapy
2024-07-31, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c03651
PMID:39012486
|
研究论文 | 该研究引入了一种基于核酸、空间定位的熵驱动构象动态网络（CDN），用于细胞内成像和时空可编程的基因治疗 | 创新点在于利用熵驱动过程实现CDN的高通量演化，并设计了一种空间定位的DNA电路，该电路由DNA四面体核心和四个连接臂组成，能够在miRNA引物的作用下实现动态重配置，从而实现双基因协同沉默 | 未明确阐述，但从方法复杂性看，可能面临在体内递送效率及靶细胞特异性方面的挑战 | 开发一种用于癌细胞靶向基因治疗的编程性、空间定位的DNA电路 | 癌细胞（特别是乳腺癌细胞）和荷瘤小鼠 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DNA四面体纳米结构、siRNA、miRNA引物、DNAzyme | 不在报道范围内 | 不在报道范围内 | 不在报道范围内（提及荷瘤小鼠但未给出具体数量） | DNA | 碱基编码 | DNA计算 | NA |
| 36 | 2026-06-16 |
Programmable Chimeric Antigen Receptor T Cell Circuits With DNA Computing for Precision Tumor Therapy
2026-06-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.9420497
PMID:42051201
|
研究论文 | 开发了一种DNA逻辑CAR系统，通过DNA计算实现可编程靶向和精确消融肿瘤 | 首次利用HaloTag作为细胞外结构域进行DNA偶联，通过DNA逻辑计算控制肿瘤靶向适配体组装，实现通用和组合抗原识别 | 未提及长期安全性、体内稳定性和潜在免疫原性 | 开发可编程的CAR-T细胞电路用于精准肿瘤治疗 | 嵌合抗原受体T细胞（CAR-T细胞） | 数字病理学 | 肿瘤 | DNA计算 | DNA逻辑门（AND、OR、INHIBIT） | NA | 小鼠模型 | DNA | 布尔逻辑编码 | DNA计算 | NA |
| 37 | 2026-06-11 |
High-Fidelity Data Retrieval from Synthetic DNA Pools via Machine Learning Model
2026-May, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202509522
PMID:41797673
|
研究论文 | 通过机器学习模型实现从合成DNA池中高保真检索数据 | 利用机器学习模型学习核苷酸序列识别特异性，超越了传统热力学杂交原理，实现了高达292倍的信噪比提升 | 未明确说明 | 解决DNA数据存储中从复杂DNA混合物中选择性检索特定数据的高保真问题 | 合成DNA池中的锁序列和互补钥匙序列 | 机器学习 | NA | 等温DNA存储、机器学习模型训练 | 机器学习模型（未具体说明） | 合成DNA序列数据 | 12,000个不同的8核苷酸锁序列 | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量高、信息密度大、长期稳定性、信噪比提升292倍 |
| 38 | 2026-06-10 |
The DNA-Based Disease Diagnosis Model With Strand Displacement Reaction
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3671276
PMID:41790822
|
研究论文 | 利用链置换反应构建基于DNA的疾病诊断模型，实现靶miRNA表达水平的直接识别与疾病状态并行分类 | 提出基于DNA链置换反应的支持向量机模型，将加权求和、减法、信号恢复和报告四个功能模块集成于DNA分子层面，实现高精度并行疾病诊断 | 未提及模型的长期稳定性、可扩展性及临床样本验证的局限性 | 开发一种基于DNA计算的疾病诊断模型，利用miRNA作为生物标志物实现精准分类 | miRNA表达水平及三种疾病状态（囊性/黏液性/浆液性肿瘤、胶质瘤、透明细胞癌） | 机器学习 | 囊性/黏液性/浆液性肿瘤、胶质瘤、透明细胞癌 | 链置换反应 | 支持向量机 | 基因表达数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 诊断准确率：CMSN 98.54%，胶质瘤 99.46%，CCC 97.81% |
| 39 | 2026-06-08 |
CRISPR/Cas12a platform activated by a protospacer adjacent motif-engineered DNA circuit for specific target sensing
2026-Feb-19, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d5ay02079d
PMID:41648912
|
研究论文 | 开发了一种由原型间隔序列邻近基序（PAM）工程化DNA电路激活的CRISPR/Cas12a平台，用于特异性目标传感 | 提出一种两阶段信号放大机制，通过PAM工程化DNA电路激活CRISPR/Cas12a，实现对非核酸靶标的高灵敏度检测，检测限低至亚飞摩尔级别 | 未明确说明局限性，可能包括对多种靶标的通用性需进一步验证 | 建立一种通用的传感平台，用于检测包括核酸、酶和小分子在内的多种靶标，推动分子诊断、食品安全评估和环境监测的发展 | 循环肿瘤DNA（ctDNA）、尿嘧啶-DNA糖苷酶（UDG）和啶虫脒（ACE） | 分子诊断 | 肺癌（通过ctDNA推断） | PAM工程化DNA电路，CRISPR/Cas12a系统 | NA | 靶标浓度数据 | 实际样本用于定量检测（具体数量未提及） | DNA | NA | 分子计算 | 检测限：ctDNA为0.023 fM，UDG为0.00004 U/mL，ACE为0.12 fM |
| 40 | 2026-06-07 |
Highly Secure In Vivo DNA Data Storage Driven by Genomic Dynamics
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514565
PMID:41588883
|
研究论文 | 提出一种利用基因组动态特性的体内DNA数据存储安全范式 | 整合计算与生物系统，通过基因调控网络或完整基因组构建动态编码表，密钥空间扩大超过100个数量级 | 未明确讨论大规模实际部署时的性能瓶颈或通用性限制 | 实现高安全性的体内DNA数据存储 | 数字文件在微生物系统中的加密、存储与解密 | 计算机科学 | 不适用 | DNA编码、计算与计算操作 | 不适用 | 数字文件 | 100代复制后的数据恢复测试 | DNA | 动态编码表 | DNA计算 | 信息密度、密钥空间大小、数据恢复率（100代复制后100%恢复） |