生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 807 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
High-Risk Sequence Prediction Model in DNA Storage: The LQSF Method
2025-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3424576
PMID:38976468
|
研究论文 | 提出了一种基于深度学习的DNA存储高风险序列预测方法LQSF | 首次将深度学习模型应用于DNA存储的序列质量预测，实现了编码阶段的主动序列过滤 | NA | 改进DNA存储技术中的错误校正方法 | DNA存储序列 | 机器学习 | NA | 深度学习，Illumina测序 | AlexNet, VGG16, VGG19 | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
DNA attachment to polymeric, soft and quantum materials: mechanisms and applications
2025-Aug-20, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc03552j
PMID:40777751
|
综述 | 综述DNA在聚合物、软材料和量子材料上的附着机制及其在生物医学、分析和环境领域的应用 | 系统总结了DNA在多种无金属材料上的吸附机制，并探讨了刺激响应系统在DNA可控吸附与释放中的应用 | 未涉及金属材料体系，主要聚焦于无金属材料的研究现状 | 探讨DNA与不同材料表面的相互作用机制及其功能化应用 | 聚多巴胺(PDA)、水凝胶、微塑料、纤维素晶体、纳米金刚石和碳量子点等材料 | 材料科学 | NA | DNA寡核苷酸附着技术 | NA | 实验数据 | NA | DNA | NA | NA | 高密度DNA存储 |
| 23 | 2025-10-05 |
Inverted Molecular Beacons as Reaction-Based Hybridization Probes for Small-Molecule Activation by Nucleic Acid Inputs
2025-Aug-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.5c00333
PMID:40662663
|
研究论文 | 开发了一种新型发夹结构核酸报告探针，通过模板诱导的邻近反应激活小分子荧光团 | 采用单分子发夹结构设计，仅需未修饰的核酸输入即可激活小分子，简化了上游电路设计 | 未明确说明该方法的检测灵敏度限制和可能存在的非特异性激活问题 | 扩展DNA计算的应用范围，实现以化学反应为最终输出的报告系统 | 核酸杂交探针和小分子荧光激活系统 | 分子计算 | NA | 分子信标技术，逆电子需求Diels-Alder反应 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | 核酸杂交编码 | DNA计算，分子计算 | NA |
| 24 | 2025-10-05 |
Signal Propagation in Surface-Confined DNA Circuits with Rigidified DNA Origami
2025-Sep-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10818
PMID:40856430
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研究论文 | 本研究利用刚性化DNA折纸平台实现表面受限DNA电路中的高保真信号传播 | 采用刚性化双层单轴DNA折纸平台抑制结构波动，显著减少信号泄漏并提高开关比 | 未明确说明实验规模和应用场景的具体限制 | 开发可靠的表面受限DNA计算平台 | DNA折纸结构和表面受限分子电路 | 分子计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 分子编码 | DNA计算,分子计算 | 纳米级精确定位能力，高保真信号传播特性 |
| 25 | 2025-10-05 |
Photothermal sensing via DNAzyme catalysis for MicroRNA detection at the point-of-care
2025-Nov-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117832
PMID:40743891
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研究论文 | 开发了一种基于DNAzyme催化的光热传感平台，用于即时检测MicroRNA | 利用非酶等温扩增和变构DNAzyme构建可开关光热平台，将miRNA信号转化为可视温度输出 | 未明确说明检测灵敏度的具体数值范围和实际临床验证规模 | 开发简单、低成本、高灵敏度的MicroRNA即时检测方法 | MicroRNA分子 | 生物传感 | NA | DNAzyme催化、光热传感、等温扩增 | NA | 温度信号、比色信号 | 在复杂生物体液中测试，但未明确具体样本数量 | DNA | NA | 分子计算 | 适用于资源匮乏地区，具有便携性和简单操作特性 |
| 26 | 2025-10-05 |
Nanopore-Based Single-Molecule Logic Unit (sMOLU)
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202501560
PMID:40462731
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研究论文 | 开发了一种基于纳米孔的单分子逻辑单元(sMOLU)，利用α-溶血素纳米孔在脂质双分子层中实现DNA基AND逻辑门 | 首次将单分子DNA计算与纳米孔技术结合，在脂质膜上实现三链DNA连接体固定的纳米孔逻辑门系统 | 未提及系统的大规模集成能力和实际应用场景的验证 | 推进纳米尺度计算系统的发展，整合DNA计算和纳米孔技术实现精确分子分析 | 单分子逻辑单元(sMOLU)、α-溶血素纳米孔、三链DNA连接体、巨型单层囊泡(GUVs) | 分子计算 | NA | 纳米孔技术、DNA计算、荧光测量、电生理测量 | AND逻辑门 | 分子信号 | NA | DNA | 逻辑门编码 | DNA计算, 分子计算 | 单分子水平操作精度 |
| 27 | 2025-10-05 |
Light-Triggered Phase Separation for Enhanced DNA Computing
2025-Aug, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500074
PMID:40464587
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研究论文 | 本文介绍了一种利用光触发相分离增强DNA计算速度的新方法 | 首次将光控相分离技术应用于DNA计算系统，通过形成无膜共凝聚微滴提高DNA分子局部浓度，显著加速计算速度 | 未提及该方法在更复杂计算场景下的适用性限制 | 开发高效DNA计算方法以推动生物传感和临床诊断领域发展 | DNA计算系统，包括基本链置换反应和复杂神经元计算 | 分子计算 | NA | 光触发相分离技术 | DNA计算电路 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算 | 计算速度提升：基本链置换反应约4.3倍，复杂神经元计算约3倍 |
| 28 | 2025-10-05 |
A Four-Year Retrospective Study of Amniocentesis in a Tertiary Care Center in South India-Lessons Learnt
2025, Journal of pregnancy
IF:3.2Q1
DOI:10.1155/jp/9983529
PMID:40894389
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研究论文 | 回顾性分析印度南部三级医疗中心四年间羊膜穿刺术的适应症、操作方法和妊娠结局 | 在高端超声、无创产前筛查和染色体微阵列技术时代重新评估羊膜穿刺术的临床价值 | 单中心回顾性研究，样本量有限（321例） | 重新评估羊膜穿刺术的适应症、操作流程和遗传检测方法 | 接受羊膜穿刺术的孕妇及其妊娠结局 | 临床医学 | 产前诊断 | 染色体微阵列，全外显子测序，DNA存储 | NA | 临床数据 | 321例接受羊膜穿刺术的患者 | DNA | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
Highly Ordered DNA Framework Interface Enables Efficient Enzymatic Oligonucleotide Synthesis
2025-Sep-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505868
PMID:40899643
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于三维DNA框架的纳米界面，用于实现高效的酶促寡核苷酸合成 | 利用高度有序的四面体DNA纳米结构作为支架，为引物提供有序直立取向和合理间距，显著提高酶可及性 | 未明确说明该方法在更长DNA链合成中的性能表现和适用范围 | 开发更高效准确的DNA合成方法，为DNA信息存储和遗传研究奠定基础 | 酶促寡核苷酸合成过程 | DNA计算 | NA | 酶促寡核苷酸合成，DNA纳米技术 | NA | DNA序列，文本信息 | 5个给定模式序列，1个60核苷酸DNA片段 | DNA | NA | DNA计算 | 步进产率96.82%，准确检索15字节文本信息 |
| 30 | 2025-10-05 |
Self-replicating DNA circuit for high-fidelity in situ imaging of T4 polynucleotide kinase activity in living cells
2025-Nov-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117841
PMID:40753825
|
研究论文 | 开发了一种自复制DNA电路用于活细胞中T4多核苷酸激酶活性的高保真原位成像 | 设计了包含信号转导和信号放大双功能模块的自复制DNA电路，通过自复制杂交链式反应实现局部信号富集 | 未明确说明检测灵敏度下限和在实际生物样本中的验证效果 | 开发高灵敏度、高空间分辨率的活细胞内PNK活性监测方法 | T4多核苷酸激酶活性 | 分子诊断 | NA | 自复制DNA电路，杂交链式反应，λ-外切酶消化 | NA | 荧光成像数据 | NA | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 高分子量组装体有限扩散性，局部信号富集能力 |
| 31 | 2025-10-05 |
Ultrasensitive Nanofluidic Detection of 17β-Estradiol in Natural Water by DNA Circuit-Mediated Hyperbranched DNA Nanowire Dual-Signal Amplification
2025-Sep-02, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c07179
PMID:40825210
|
研究论文 | 开发了一种集成DNA电路和超支化DNA纳米线的纳米流体生物传感器，用于超灵敏检测自然水体中的17β-雌二醇 | 结合熵驱动DNA电路和超支化DNA纳米线双重信号放大策略，通过界面电荷工程实现飞摩尔级检测灵敏度 | 未明确说明传感器在复杂环境基质中的长期稳定性及大规模应用可行性 | 开发高灵敏度、可现场应用的雌激素污染物检测平台 | 自然水体中的17β-雌二醇污染物 | 生物传感器 | 内分泌干扰相关疾病 | 纳米流体技术, DNA电路, 超支化DNA组装 | NA | 电化学信号 | 黄河、黑虎泉、千湖及养殖池塘等实际水样 | DNA | 核酸碱基编码 | 分子计算, DNA计算 | 检测范围1fM-100pM（5个数量级），检测限0.39fM |
| 32 | 2025-10-05 |
Preservation and Encryption in DNA Digital Data Storage
2022-09, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202200183
PMID:35856827
|
综述 | 本文综述DNA数字数据存储的工作流程，重点介绍存储步骤和加密方法 | 系统阐述DNA作为分子数字存储介质的优势，并重点分析不同信息存储形式下的加密方法 | 未提供具体实验数据或量化分析，主要基于现有研究进行总结 | 探讨DNA数字数据存储的技术发展和加密方法 | DNA数字数据存储系统 | 分子计算 | NA | DNA合成技术、DNA测序技术 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高存储密度、可复制性、长可恢复寿命 |
| 33 | 2025-10-05 |
Enhanced sensitivity in PCSK9 detection using binding-induced DNA walker-triggered Argonaute protein-based DNA circuit
2025-Jul-23, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-025-07380-x
PMID:40696233
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研究论文 | 开发了一种基于结合诱导DNA步行器触发Argonaute蛋白DNA电路的新型PCSK9检测方法 | 结合了结合诱导DNA步行器的特异性识别能力和TtAgo DNA电路的高灵敏度，实现了超低检测限 | 未提及长期稳定性和大规模临床应用验证 | 开发高灵敏度PCSK9检测方法用于临床诊断 | PCSK9蛋白 | 生物传感 | 心血管疾病 | DNA walker, Argonaute蛋白DNA电路, 生物传感 | NA | 生物分子检测信号 | 血清样本 | DNA | NA | 分子计算, DNA计算 | 检测限2.5 fg/mL, 15天后信号保持率93.1% |
| 34 | 2025-10-05 |
Dna-storalator: a computational simulator for DNA data storage
2025-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06222-0
PMID:40760650
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研究论文 | 开发了一个名为DNA-Storalator的跨平台软件工具，用于模拟DNA数据存储中的生物和计算过程 | 提供了一个完整的DNA数据存储模拟器，能够模拟合成、PCR和测序等昂贵且复杂的生物过程，并集成编码和算法组件 | 基于简化的数字视角进行模拟，可能无法完全反映真实生物过程的复杂性 | 为DNA数据存储系统开发算法和编码解决方案 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | DNA合成、PCR、测序技术 | 聚类算法、重构算法 | DNA序列数据 | NA | DNA | 错误校正码 | DNA计算 | 支持自定义错误率和扩增过程控制，能够分析新数据集并建立错误模型 |
| 35 | 2025-10-05 |
Direct high-throughput deconvolution of non-canonical bases via nanopore sequencing and bootstrapped learning
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62347-z
PMID:40739090
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研究论文 | 通过纳米孔测序和自举学习方法实现非经典碱基的高通量直接解卷积 | 首次展示利用纳米孔测序技术对含非经典碱基的异源核酸进行高通量测序，并开发了基于自举学习和数据增强的通用性AI模型 | 需要合成高纯度(>90%)的寡核苷酸池进行模型训练，可能受限于特定测序平台(MinION系统) | 开发能够高通量测序和解码非经典碱基的方法 | 含非经典碱基的异源核酸和合成寡核苷酸 | 生物信息学 | NA | 纳米孔测序，自举学习，数据增强 | AI模型 | 测序信号数据 | 1,024种含非经典碱基的寡核苷酸，>2.3×10^5 reads/流动池 | DNA, XNA | 非经典碱基编码 | 分子计算 | 高通量测序能力(>2.3×10^5 reads/流动池)，高准确度(>80%)和高特异性(99%) |
| 36 | 2025-10-05 |
N/S-Co-doped carbon dot-based FRET ratiometric fluorescence aptasensing platform modulated with entropy-driven DNA amplifier for ochratoxin A detection
2023-Aug, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04778-5
PMID:37306781
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研究论文 | 开发了一种基于氮硫共掺杂碳点的FRET比率荧光适配体传感平台，结合熵驱动DNA放大器用于赭曲霉毒素A的高灵敏检测 | 首次将N/S共掺杂碳点与熵驱动DNA放大器结合，通过协同放大效应显著提升检测性能 | 未明确说明在实际复杂食品基质中的抗干扰能力和长期稳定性 | 建立高灵敏、准确的赭曲霉毒素A检测方法 | 赭曲霉毒素A(OTA)毒素分子 | 生物传感 | NA | FRET比率荧光检测, 熵驱动DNA扩增, 适配体传感 | NA | 荧光信号 | 实际样品检测(与LC-MS方法对比验证) | DNA | NA | 分子计算 | 检测限达0.006 pg/mL，可实现现场可视化筛查 |
| 37 | 2025-10-05 |
DNA Arithmetic With Error Correction
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3189833
PMID:35816540
|
研究论文 | 提出一种基于冗余余数系统的DNA计算系统，具备错误检测与校正能力 | 首次将贴纸模型引入基于RRNS的DNA算术运算 | 未明确说明具体错误率数值和实验验证规模 | 开发具有容错特性的DNA计算系统 | DNA计算系统的算术运算方法 | DNA计算 | NA | DNA计算技术 | 贴纸模型 | DNA序列 | NA | DNA | 冗余余数系统 | DNA计算 | 支持大数运算，通过余数系统将大数分解为小数处理 |
| 38 | 2025-10-05 |
Research Progress in Construction and Application of Enzyme-Based DNA Logic Gates
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3181615
PMID:35679378
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综述 | 本文综述了酶基DNA逻辑门的构建方法与应用进展 | 重点探讨了具有高效率和特异性的切口酶、聚合酶以及核酶在构建DNA逻辑门中的最新应用机制 | NA | 探讨DNA计算中酶基逻辑门的构建技术与应用前景 | DNA逻辑门、蛋白质酶（切口酶、聚合酶）、核酶 | 分子计算 | NA | DNA计算、酶催化 | DNA逻辑门 | 分子数据 | NA | DNA | 分子逻辑编码 | DNA计算, 分子计算 | 并行计算能力、低能耗、高性能存储能力 |
| 39 | 2025-10-05 |
Family of Mutually Uncorrelated Codes for DNA Storage Address Design
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3530470
PMID:40030887
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研究论文 | 本文提出基于k-弱互不相关码的DNA存储地址序列设计方法，以提高DNA存储的访问效率 | 结合0-m-ruling编码方案与k-WMU码，使地址序列避免产生茎长3-9的二级结构，并扩展具有纠错功能的k-WMU码 | NA | 设计高质量的DNA存储随机访问地址序列以提高访问效率 | DNA存储地址序列 | DNA存储 | NA | DNA存储技术 | k-弱互不相关码(k-WMU)，0-m-ruling编码方案 | DNA序列数据 | NA | DNA | k-弱互不相关码，0-m-ruling编码 | DNA计算 | 存储密度，访问效率，错误率，最小自由能(MFE)，熔解温度(TM)，平均解码成功率(ADSR) |
| 40 | 2025-10-05 |
Effective IDS Error Correction Algorithms for DNA Storage Channels With Multiple Output Sequences
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3558853
PMID:40198284
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研究论文 | 本文研究DNA存储中针对多输出序列IDS错误的纠错算法 | 提出分段渐进匹配算法和两种解码方案，显著降低比特错误率 | 未提及实际DNA合成和测序实验验证 | 提高DNA数据存储系统的可靠性和解码性能 | DNA存储通道中的IDS错误 | 数据存储 | NA | DNA数据存储技术 | 隐马尔可夫模型, LDPC码 | DNA序列数据 | NA | DNA | 标记码, 嵌入式标记码, 低密度奇偶校验码 | DNA计算 | 线性复杂度扩展, 比特错误率降低21.72%~99.75% |