生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-11-06 |
mRNA-Initiated, Three-Dimensional DNA Amplifier Able to Function inside Living Cells
2018-01-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.7b09789
PMID:29211455
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研究论文 | 本文报道了一种基于mRNA启动的三维DNA放大器（EDTD），能够在活细胞内响应特定mRNA目标进行操作 | 开发了一种新的三维DNA放大器（EDTD），通过分子工程设计，具有增强的生物稳定性和细胞摄取效率，能够在活细胞内进行信号放大 | NA | 解决DNA机器在活细胞内操作的挑战，提供一种新的分子工具用于细胞内生物标志物的检测 | 三维DNA放大器（EDTD）及其在活细胞内的应用 | DNA纳米技术 | NA | DNA分子工程 | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-10-30 |
Exploring nanoparticle dynamics in binary chemical reactions within magnetized porous media: a computational analysis
2024-Oct-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76757-4
PMID:39462113
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研究论文 | 研究了在磁化多孔介质中二元化学反应中的纳米颗粒动力学，并使用人工神经网络进行计算分析 | 结合反向传播人工神经网络和Levenberg-Marquardt算法评估混合纳米流体中的传热 | NA | 探讨人工神经网络在处理复杂非线性数学问题中的应用 | MgO + GO/EG混合纳米流体在指数拉伸表面的稳态混合对流流动 | 计算流体动力学 | NA | 人工神经网络 | 反向传播人工神经网络 | 数值数据 | 训练集70%，测试集15%，验证集15% |
| 23 | 2024-10-29 |
Converting an allocentric goal into an egocentric steering signal
2024-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-07006-3
PMID:38326612
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研究论文 | 研究果蝇中枢复合体中的神经回路，探讨其如何将世界中心的航向和目标角度转换为身体中心的转向信号 | 首次描述了果蝇大脑中FC2神经元与目标角度的相关性，并提出了一个模型解释如何通过神经回路将世界中心的航向和目标角度转换为身体中心的转向信号 | 研究仅限于果蝇，尚未在其他物种中验证该神经回路的普遍性 | 探讨神经回路如何将世界中心的航向和目标角度转换为身体中心的转向信号，以指导导航行为 | 果蝇中枢复合体中的EPG、FC2和PFL3神经元 | 神经科学 | NA | 光遗传学 | NA | 神经活动数据 | 果蝇样本 |
| 24 | 2024-10-21 |
Reconstruction algorithms for DNA-storage systems
2024-01-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-51730-3
PMID:38263421
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研究论文 | 本文提出了一种用于DNA存储系统的重建算法，旨在通过动态规划方法最小化原始字符串与算法估计之间的编辑距离 | 本文提出了几种新的DNA重建算法，这些算法在全局范围内处理整个序列，并使用动态规划算法进行解码，无需对输入和迹的数量进行限制，并且在高错误概率下表现良好 | NA | 开发一种能够最小化DNA存储系统中原始字符串与算法估计之间编辑距离的重建算法 | DNA存储系统中的字符串重建问题 | 计算机科学 | NA | 动态规划算法 | NA | 字符串 | NA |
| 25 | 2024-10-19 |
Advancements in DNA computing: exploring DNA logic systems and their biomedical applications
2024-Oct-17, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d4tb00936c
PMID:39282799
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综述 | 本文综述了DNA计算逻辑系统的最新进展及其在生物医学领域的应用 | 介绍了基于功能DNA序列、纳米材料和三维DNA纳米结构的新型DNA逻辑系统，并总结了推动DNA计算的材料创新 | 讨论了DNA计算发展中存在的挑战和未来研究方向 | 总结DNA计算逻辑系统的最新进展及其在生物医学领域的应用 | DNA逻辑系统及其在细胞成像、临床诊断和疾病治疗中的应用 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-10-18 |
An Effective DNA-Based File Storage System for Practical Archiving and Retrieval of Medical MRI Data
2024-Oct, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202301585
PMID:38807543
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA的文件存储系统，用于实际存档和检索医学MRI数据 | 本文的创新点包括一种新的分段策略来解决旋转编码中的数据丢失问题，一种基于规则的四进制转码方法以满足生物约束并确保可靠映射，以及一种索引技术以简化随机搜索和访问 | NA | 开发一种有效的基于DNA的医学数据存储系统，以解决长期、高密度数据存档的需求 | 医学MRI数据 | 计算生物学 | NA | DNA存储 | NA | MRI数据 | NA |
| 27 | 2024-10-13 |
Processing DNA Storage through Programmable Assembly in a Droplet-Based Fluidics System
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303197
PMID:37755129
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研究论文 | 本文开发了一种在液滴控制流体系统中使用接头连接进行主动DNA数据编辑的方法 | 首次在液滴控制流体系统中实现了DNA数据的可编程组装和处理 | NA | 开发一种在DNA池中主动处理和编辑DNA数据的方法 | 合成短序列DNA池中的DNA数据处理 | 生物信息学 | NA | 接头连接 | NA | DNA序列 | 八个90 bps DNA池和八个270 bps DNA池 |
| 28 | 2024-10-09 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-Oct-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种利用流式细胞术分选技术对编码数据的荧光DNA微粒进行分选和随机访问的方法，并通过层层自组装形成封装的荧光DNA微粒，以提高DNA数据存储的稳定性和序列完整性 | 本研究创新性地利用流式细胞术分选技术实现了DNA数据存储中的随机访问，并通过封装技术提高了DNA微粒在恶劣条件下的结构和序列完整性 | NA | 研究如何保护和检索DNA存储过程中的数据，提高DNA数据存储的稳定性和随机可读性 | 荧光DNA微粒及其在DNA数据存储中的应用 | NA | NA | 流式细胞术分选技术 | NA | DNA | NA |
| 29 | 2024-10-09 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-Oct-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 本文介绍了一种基于钛碳化物的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于体内微小RNA成像和光热治疗 | 提出了一种光热激活的熵驱动链置换反应模块，结合光热转换模块，实现了时空控制的微小RNA-21体内成像和成像引导的光热治疗 | NA | 开发一种精确的癌症诊断和高效治疗的新型纳米治疗平台 | 微小RNA-21的体内成像和光热治疗 | 生物医学诊断与治疗 | NA | 光热转换技术 | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-10-09 |
DNA circuit-based immunoassay for ultrasensitive protein pattern classification
2024-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/d4an00728j
PMID:39206940
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA电路的免疫分析法i-PUMA，用于超灵敏蛋白质模式分类 | i-PUMA结合了ELISA协议的便利性和DNA/酶电路的计算能力，实现了对IL12、IL4和IFNγ细胞因子的超灵敏检测，并能创建2输入感知器类分类器 | NA | 开发一种超灵敏的免疫分析法，用于多标记样本分类 | IL12、IL4和IFNγ细胞因子 | 生物技术 | NA | DNA纳米技术 | 感知器类分类器 | 蛋白质 | NA |
| 31 | 2024-10-05 |
Efficient and low-complexity variable-to-variable length coding for DNA storage
2024-Oct-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05943-y
PMID:39354338
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研究论文 | 本文提出了一种高效的DNA存储系统中的变长编码方法，解决了同聚物和GC含量约束问题 | 引入了一种新的编码技术，能够在满足同聚物和GC含量约束的同时，保持线性复杂度并接近最优编码率 | NA | 解决DNA存储中的编码问题，提高编码效率和复杂度 | DNA存储系统中的数据编码 | NA | NA | 变长编码 | NA | DNA序列 | 随机生成的数据和现有文件 |
| 32 | 2024-09-30 |
Levy Sooty Tern Optimization Algorithm Builds DNA Storage Coding Sets for Random Access
2024-Sep-11, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e26090778
PMID:39330111
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研究论文 | 本文提出了一种基于Levy Sooty Tern优化算法的DNA存储编码集构建方法，以实现高效的随机访问DNA存储系统 | 引入Levy飞行操作改进Sooty Tern优化算法，提出Levy Sooty Tern优化算法，并利用该算法构建满足组合约束的DNA存储编码集 | 未提及具体限制 | 解决DNA存储中的低存储密度、高延迟和存储过程中的错误问题 | DNA存储编码集的构建 | 生物信息学 | NA | Levy Sooty Tern优化算法 | Levy Sooty Tern优化算法 | DNA序列 | 13个基准测试函数 |
| 33 | 2024-09-30 |
A biological circuit to anticipate trend
2024-Sep, Evolution letters
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/evlett/qrae027
PMID:39328288
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研究论文 | 本文介绍了一种简单的生物电路，用于预测环境变化的趋势 | 本文提出的生物电路通过计算短期和长期指数移动平均值的差异来测量动量，从而预测未来趋势，这一方法具有简单性和普遍性 | 本文未详细讨论该生物电路在实际生物系统中的应用和验证 | 研究如何通过生物电路预测环境变化的趋势 | 生物电路的设计和其在趋势预测中的应用 | NA | NA | 指数移动平均 | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-09-28 |
Scalable DNA recognition circuits based on DNA strand displacement
2024-Sep-24, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d4na00379a
PMID:39323422
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研究论文 | 本文提出并实现了一种基于DNA链置换技术的分子识别电路，能够实现识别和求和功能，并构建了分子比较器 | 利用DNA链置换技术开发了一种可扩展的分子识别电路，并集成了交叉抑制模块以构建分子比较器 | NA | 开发基于DNA链置换技术的分子识别电路，并探索其在智能分子电路或生物传感器中的应用 | DNA分子识别电路及其在分子计算中的应用 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-09-28 |
Towards Chinese text and DNA shift encoding scheme based on biomass plasmid storage
2023, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2023.1276934
PMID:37900965
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研究论文 | 本文提出了一种基于生物量质粒存储的中文文本和DNA移位编码方案 | 设计了一种新的中文汉字编码表，具有极高的信息存储密度，并开发了一种低算法复杂度的DNA移位编码方案，能够编码任何长度的DNA链，包括过长的同聚物 | NA | 解决现有电磁存储介质的缺点，如信息密度低、维护能耗高和存储时间短 | 中文文本和DNA的编码与存储 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | NA | 文本和DNA序列 | 744bp的双链质粒 |
| 36 | 2024-09-28 |
DNA circuits driven by conformational changes in DNAzyme recognition arms
2020-Feb-18, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra00115e
PMID:35492184
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研究论文 | 本文提出了一种通过Mg驱动的E6型DNAzyme识别臂构象变化来调节DNA电路的策略 | 该策略改变了DNAzyme信号传输的单一模式，扩展了E6型DNAzyme的功能，并节省了分子尺度上的信号传输时间 | NA | 提高DNAzyme驱动的逻辑单元的效率 | DNAzyme识别臂的构象变化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-09-26 |
Rewireable Building Blocks for Enzyme-Powered DNA Computing Networks
2024-Sep-25, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c07221
PMID:39255470
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研究论文 | 本文探讨了通过酶驱动的DNA计算网络的可重构构建模块，以提高DNA神经网络的可扩展性 | 提出了三种策略来解决当前DNA神经网络架构的局限性，包括酶促合成高纯度神经元、基于网络位置的空间神经元集群模式以及在通用单链DNA骨架上编码神经元连接 | 当前DNA神经网络架构需要大量核酸来模拟单个神经元，导致组装时间长、背景信号高和组件间串扰 | 提高DNA神经网络的可扩展性，以实现便携式诊断、紧凑数据存储和芯片实验室的自主决策 | DNA神经网络的可重构构建模块和自动化操作的微流控设备 | 生物信息学 | NA | 酶促合成 | DNA神经网络 | DNA | NA |
| 38 | 2024-09-26 |
DBTRG: De Bruijn Trim rotation graph encoding for reliable DNA storage
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.09.004
PMID:37736298
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研究论文 | 本文提出了一种基于De Bruijn Trim Rotation Graph (DBTRG)的DNA存储编码方案 | 通过动态二进制序列与原始二进制序列的XOR操作，将k-mers划分为De Bruijn Trim图，并根据重叠关系压缩存储信息，确保碱基平衡和多样性，减少不期望的motif，提高DNA存储和数据恢复的稳定性 | NA | 解决现有DNA存储编码方案在局部和全局稳定性以及读写准确性方面的不足 | DNA存储编码方案 | NA | NA | DNA存储编码 | De Bruijn Trim Rotation Graph (DBTRG) | 图像 | 510 KB图像 |
| 39 | 2024-09-20 |
Advanced DNA Amplification for Efficient Data Storage
2024-Sep-18, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c12102
PMID:39254000
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研究论文 | 本文探讨了DNA扩增技术在数据存储中的应用及其面临的挑战 | 本文提出了优化DNA存储协议以提高可扩展性和鲁棒性的方法，并探讨了酶促过程和新扩增方法的进展 | 本文未详细讨论具体的优化方法和新技术 | 研究如何利用先进的DNA扩增策略提高数据存储的效率和可行性 | DNA扩增技术及其在数据存储中的应用 | 生物技术 | NA | 聚合酶链反应（PCR）、等温扩增 | NA | DNA | NA |
| 40 | 2024-09-20 |
Bacteriophage λ exonuclease and a 5'-phosphorylated DNA guide allow PAM-independent targeting of double-stranded nucleic acids
2024-Sep-18, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02388-9
PMID:39294394
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研究论文 | 本文研究了噬菌体λ核酸外切酶（λExo）与5'-磷酸化DNA引导序列结合，实现对双链核酸的无PAM依赖性靶向识别 | 本文发现λExo酶的活性，并展示了5'-磷酸化单链DNA（pDNA）与双链DNA和DNA-RNA杂交体的互补区域结合，无需PAM样基序，显著扩展了靶向序列的范围 | NA | 探索新的双链核酸序列特异性识别方法，减少脱靶效应 | 噬菌体λ核酸外切酶、5'-磷酸化单链DNA、双链DNA和DNA-RNA杂交体 | 分子诊断学 | NA | 单分子荧光共振能量转移分析 | NA | DNA | NA |