生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Design of Constraint Coding Sets for Archive DNA Storage
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3127271
PMID:34762590
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研究论文 | 本文提出了一种新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），用于增加约束编码集的下界，以提高DNA存储的准确性 | 提出了新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），增加了约束编码集的下界，提高了DNA存储的准确性 | NA | 提高DNA存储的准确性和可靠性 | 约束编码集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | DNA存储技术 | 海洋捕食者算法（QRSS-MPA） | DNA序列 | NA |
| 302 | 2024-08-07 |
Real-Time Investigation of Intracellular Polynucleotide Kinase Using a Cascaded Amplification Circuit
2021-11-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04033
PMID:34748706
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研究论文 | 本文开发了一种通过整合催化DNA组装和杂交链反应电路的级联DNA放大电路，实现了通过Förster共振能量转移（FRET）原理准确评估细胞内多核苷酸激酶（PNK）活性 | 提出了一个创新的级联DNA放大电路，通过λ核酸酶特异性消化5'-磷酸DNA和高信号增益的级联电路，实现了对PNK活性的敏感分析 | NA | 开发一种新的方法来实时监测和评估细胞内多核苷酸激酶的活性 | 细胞内多核苷酸激酶的活性 | 生物技术 | NA | Förster共振能量转移（FRET） | NA | DNA | 在HeLa细胞中进行了广泛探索 |
| 303 | 2024-08-07 |
Rational design of allosterically regulated toehold mediated strand displacement circuits for sensitive and on-site detection of small molecule metabolites
2021-Nov-22, The Analyst
DOI:10.1039/d1an01488a
PMID:34734587
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研究论文 | 本文开发了一种基于别构转录因子（aTF）调控的脚手架介导的链置换（TMSD）电路的生物传感器，用于非侵入性唾液样本中尿酸（UA）的检测 | 通过理性设计双通道TMSD电路，克服了天然HucR低配体亲和力的影响，提高了输出信号的富集和生物传感器的灵敏度 | NA | 开发快速、去中心化的小分子检测方法，满足日常健康监测和快速诊断的需求 | 尿酸（UA）的检测 | 生物传感器 | NA | 脚手架介导的链置换（TMSD）电路 | NA | 唾液样本 | NA |
| 304 | 2024-08-07 |
An Efficient Method for DNA Purification-Free PCR from Plant Tissue
2021-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.289
PMID:34748285
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研究论文 | 本文介绍了一种无需DNA纯化的高通量PCR方法，用于从植物组织中扩增基因组DNA片段 | 该方法无需DNA纯化或特殊样品存储设备，使用商业化或自制的DNA存储卡，直接从植物组织中进行PCR扩增 | NA | 开发一种低成本、高通量的PCR方法，使植物DNA分子诊断技术更易于在资源有限的条件下进行 | 至少包括拟南芥、番茄、大豆、马铃薯、棉花和稻在内的十一种植物 | 分子生物学 | NA | PCR | NA | DNA | 至少十一种植物物种 |
| 305 | 2024-08-07 |
CRISPR-Powered DNA Computing and Digital Display
2021-11-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00431
PMID:34704742
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研究论文 | 本文报道了一种基于CRISPR技术的DNA计算和数字显示系统，该系统通过编程的DNA目标作为输入，并通过ON/OFF荧光信号表示TRUE/FALSE输出 | 该系统能够建立输入与输出之间的一对一关系，实现多级DNA逻辑计算，并通过预CRISPR反应选择性维持或抑制CRISPR反应性来扩展输入大小 | NA | 开发一种新型的CRISPR驱动的DNA计算和数字显示系统 | CRISPR技术在DNA计算和分子编程中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR技术 | NA | DNA | NA |
| 306 | 2024-08-07 |
DNA storage: research landscape and future prospects
2020-Jun, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa007
PMID:34692128
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综述 | 本文综述了DNA存储的基本理论、研究历史和技术挑战，并从定量角度评估了DNA作为新型数据存储介质的前景 | DNA作为一种稳定、资源和能源高效且可持续的数据存储解决方案 | NA | 探讨DNA存储的研究现状及未来前景 | DNA存储的理论、历史和技术挑战 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-07 |
Enhancing Physical and Thermodynamic Properties of DNA Storage Sets With End-Constraint
2022-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3121278
PMID:34662278
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research paper | 本文提出了一种新的方法来设计高质量的DNA存储集，通过引入随机开关和双权重后代策略在双策略黑寡妇优化算法（DBWO）中，提高了算法的探索和利用能力，并应用于设计DNA存储集，同时提出了末端约束以改善序列的稳定性。 | 本文创新地引入了随机开关和双权重后代策略在DBWO算法中，提高了算法的性能，并提出了末端约束方法来增强DNA存储集的物理和热力学性质。 | NA | 提高DNA存储集的质量和稳定性 | DNA存储集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | 双策略黑寡妇优化算法（DBWO） | DBWO | DNA序列 | 26个基准函数 |
| 308 | 2024-08-07 |
Scaling up DNA digital data storage by efficiently predicting DNA hybridisation using deep learning
2021-10-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97238-y
PMID:34654863
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research paper | 本文通过深度学习方法有效预测DNA杂交过程，以扩大DNA数字数据存储的应用 | 首次全面研究机器学习方法在预测DNA杂交任务中的应用，并引入了一个包含超过250万个数据点的模拟杂交数据集 | NA | 控制和预测DNA杂交过程，以推动混合分子-电子计算的未来发展 | DNA杂交过程及其在DNA数字数据存储和计算中的应用 | machine learning | NA | deep learning | NA | DNA序列数据 | 超过250万个数据点 |
| 309 | 2024-08-07 |
A Loser-Take-All DNA Circuit
2021-11-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00318
PMID:34623152
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研究论文 | 本文介绍了一种新型DNA电路——失败者全取电路，该电路通过DNA链置换实现，能够在输入中选择最小模拟值的信号 | 引入了一种新的DNA电路类型——失败者全取电路，与传统的赢家全取电路互补，能够识别基于最小相似性的分子模式 | NA | 开发一种新型的DNA电路，用于分子模式识别任务 | DNA电路的设计和性能 | NA | NA | DNA链置换 | NA | NA | 成功演示了一个包含九种独特输入组合的三输入失败者全取电路 |
| 310 | 2024-08-07 |
Stochastic Hazard Analysis of Genetic Circuits in iBioSim and STAMINA
2021-10-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00159
PMID:34606710
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研究论文 | 本文通过使用STAMINA工具对三种已知具有故障行为的遗传电路实现进行随机分析，预测故障倾向，并通过与iBioSim中的随机模拟结果对比验证了STAMINA的有效性 | 本文展示了随机验证在遗传设计中的应用，帮助设计者评估设计选择和输入限制，以实现所需的运行可靠性 | NA | 研究如何通过随机分析预测遗传电路中的故障倾向，并提高电路的运行可靠性 | 三种已知具有故障行为的遗传电路实现 | 合成生物学 | NA | 随机验证 | NA | 遗传电路数据 | 三种遗传电路实现 |
| 311 | 2024-08-07 |
Integrated Iontronic Circuits Based on Single Nanochannels
2021-Oct-13, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c12324
PMID:34585930
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研究论文 | 本文介绍了一种基于并行单个聚二甲基硅氧烷（PDMS）纳米通道的离子电子电路的发明，用于实现有效的电子信号操控 | 该电路能够作为双极结型晶体管或离子整流器，通过不对称地装饰带电聚电解质在纳米通道上来调控离子传输 | NA | 开发新型离子电子集成电路，以改进生物计算和传感技术 | 离子电子电路及其在生物计算和传感中的应用 | NA | NA | 离子电子技术 | 离子电子电路 | NA | NA |
| 312 | 2024-08-07 |
Modular DNA Circuits for Point-of-Care Colorimetric Assay of Infectious Pathogens
2021-10-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02597
PMID:34506117
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研究论文 | 本文介绍了一种基于核酸等温扩增技术和DNA酶介导比色读出的模块化DNA电路，用于即时检测多种传染性病原体 | 该研究设计了一种固定模块和灵活模块组成的模块化DNA电路，能够同时检测多种遗传目标，并通过尿素处理和磁分离实现固定模块的重复使用 | NA | 开发一种准确、特异且经济的检测方法，用于同时检测多种传染性病原体，以提高人类健康和安全 | 传染性病原体的检测 | 生物技术 | 传染性疾病 | 核酸等温扩增技术 | DNA电路 | 遗传目标 | NA |
| 313 | 2024-08-07 |
In Situ Programmable DNA Circuit-Promoted Electrochemical Characterization of Stemlike Phenotype in Breast Cancer
2021-10-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06436
PMID:34495654
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研究论文 | 本文报道了一种电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型，提供了一种低成本且稳健的选择，替代昂贵且依赖经验的流式细胞术。 | 设计了一种原位可编程DNA电路，使用捕获探针引入DNA组装的触发点和效应探针加速背景信号的移除，提高了电化学表型方法的灵敏度和准确性。 | NA | 开发一种新的电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型。 | 乳腺癌干细胞样表型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 电化学表型方法 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和小鼠乳腺癌异种移植瘤模型。 |
| 314 | 2024-08-07 |
A Hierarchical Error Correction Strategy for Text DNA Storage
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00476-x
PMID:34463928
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研究论文 | 本文提出了一种用于文本DNA存储的分层错误纠正策略 | 该策略通过设计针对常见字符的鲁棒代码，逐步纠正DNA读取中的错误，并能处理多个插入或删除错误 | NA | 旨在解决DNA序列中的错误复杂性，以促进其在大量数据存储中的应用 | DNA存储中的错误纠正方法 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 315 | 2024-08-07 |
Solving the Family Traveling Salesperson Problem in the Adleman-Lipton Model Based on DNA Computing
2022-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3109067
PMID:34460379
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研究论文 | 本文提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决家庭旅行商问题（FTSP） | 利用DNA计算的强大并行能力，相较于传统计算机在处理NP完全问题上具有无可比拟的优势 | NA | 探索DNA计算在解决复杂NP完全问题中的应用 | 家庭旅行商问题（FTSP） | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | DNA分子 | 一些基准实例 |
| 316 | 2024-08-07 |
DNA Logic Circuits for Multiple Tumor Cells Identification Using Intracellular MicroRNA Molecular Bispecific Recognition
2021-11, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202101130
PMID:34486246
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研究论文 | 本文介绍了一种基于细胞内双特异性微小RNA识别的DNA逻辑电路，用于多种肿瘤细胞亚型的识别 | 开发了一种集成多个识别和报告模块的DNA电路，通过三维逻辑门纳米六面体框架实现三种细胞亚型的同时识别 | NA | 旨在开发一种新方法，通过细胞内微小RNA的双特异性识别来区分多种肿瘤细胞亚型 | 肿瘤细胞亚型 | 生物技术 | 肿瘤 | DNA逻辑电路 | NA | 微小RNA | NA |
| 317 | 2024-08-07 |
NOREC4DNA: using near-optimal rateless erasure codes for DNA storage
2021-Aug-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04318-x
PMID:34404355
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研究论文 | 介绍NOREC4DNA软件框架，用于使用、测试、比较和改进近最优无速率擦除码（NORECs）在DNA存储系统中的应用 | 提出NOREC4DNA框架，使用近最优无速率擦除码，如Raptor和Online码，相较于之前的LT码，在DNA存储系统中实现显著改进 | NA | 探索和优化用于DNA存储的近最优无速率擦除码 | DNA存储系统中的近最优无速率擦除码 | 生物信息学 | NA | 近最优无速率擦除码 | NA | DNA序列 | NA |
| 318 | 2024-08-07 |
Securing Bio-Cyber Interface for the Internet of Bio-Nano Things using Particle Swarm Optimization and Artificial Neural Networks based parameter profiling
2021-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2021.104707
PMID:34375900
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研究论文 | 本文提出了一种使用粒子群优化（PSO）和人工神经网络（ANN）进行参数分析的框架，以提高生物纳米物联网（IoBNT）的安全性 | 本文创新性地使用PSO算法优化ANN，以检测IoBNT传输中的异常活动，并提高了98.9%的准确性 | NA | 研究如何提高生物纳米物联网的安全性，特别是在医疗应用中的安全性 | 生物纳米物联网（IoBNT）及其生物网络接口（Bio Cyber Interface）的安全性 | 计算机视觉 | NA | 粒子群优化（PSO），人工神经网络（ANN） | 人工神经网络（ANN） | 模拟数据 | NA |
| 319 | 2024-08-07 |
A Cascaded DNA Circuit in Bead Arrays for Quantitative Single-Cell MicroRNA Analysis
2021-08-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02388
PMID:34375096
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research paper | 本文构建了一种级联DNA电路，通过催化发夹组装和杂交链反应，在珠阵列平台上实现单细胞微RNA的定量分析 | 提出了一个结合催化发夹组装和杂交链反应的级联DNA电路，用于在珠阵列平台上进行微RNA的信号放大和定量分析 | NA | 开发一种高灵敏度和高特异性的方法，用于单细胞微RNA的定量分析 | 单细胞微RNA | NA | cancer | 催化发夹组装和杂交链反应 | NA | microRNA | 单个癌细胞 |
| 320 | 2024-08-07 |
HD-Code: End-to-End High Density Code for DNA Storage
2021-10, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3102122
PMID:34343096
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研究论文 | 本文提出了一种端到端的高密度DNA编码算法（称为HD-code），用于DNA存储 | 该算法通过充分利用原始多媒体数据的统计特性和考虑DNA碱基的生物学约束，实现了更高的逻辑存储密度，并提高了数据存储的灵活性和一致性 | NA | 探索和优化DNA作为信息存储媒介的方法 | DNA存储技术及其编码算法 | 生物信息学 | NA | DNA编码 | NA | 多媒体数据 | NA |