生物计算机与DNA存储相关文章

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当前共找到 714 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
301 2024-08-07
Design of Constraint Coding Sets for Archive DNA Storage
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种新的海洋捕食者算法(QRSS-MPA),用于增加约束编码集的下界,以提高DNA存储的准确性 提出了新的海洋捕食者算法(QRSS-MPA),增加了约束编码集的下界,提高了DNA存储的准确性 NA 提高DNA存储的准确性和可靠性 约束编码集的设计和优化 生物信息学 NA DNA存储技术 海洋捕食者算法(QRSS-MPA) DNA序列 NA
302 2024-08-07
Real-Time Investigation of Intracellular Polynucleotide Kinase Using a Cascaded Amplification Circuit
2021-11-23, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文开发了一种通过整合催化DNA组装和杂交链反应电路的级联DNA放大电路,实现了通过Förster共振能量转移(FRET)原理准确评估细胞内多核苷酸激酶(PNK)活性 提出了一个创新的级联DNA放大电路,通过λ核酸酶特异性消化5'-磷酸DNA和高信号增益的级联电路,实现了对PNK活性的敏感分析 NA 开发一种新的方法来实时监测和评估细胞内多核苷酸激酶的活性 细胞内多核苷酸激酶的活性 生物技术 NA Förster共振能量转移(FRET) NA DNA 在HeLa细胞中进行了广泛探索
303 2024-08-07
Rational design of allosterically regulated toehold mediated strand displacement circuits for sensitive and on-site detection of small molecule metabolites
2021-Nov-22, The Analyst
研究论文 本文开发了一种基于别构转录因子(aTF)调控的脚手架介导的链置换(TMSD)电路的生物传感器,用于非侵入性唾液样本中尿酸(UA)的检测 通过理性设计双通道TMSD电路,克服了天然HucR低配体亲和力的影响,提高了输出信号的富集和生物传感器的灵敏度 NA 开发快速、去中心化的小分子检测方法,满足日常健康监测和快速诊断的需求 尿酸(UA)的检测 生物传感器 NA 脚手架介导的链置换(TMSD)电路 NA 唾液样本 NA
304 2024-08-07
An Efficient Method for DNA Purification-Free PCR from Plant Tissue
2021-Nov, Current protocols
研究论文 本文介绍了一种无需DNA纯化的高通量PCR方法,用于从植物组织中扩增基因组DNA片段 该方法无需DNA纯化或特殊样品存储设备,使用商业化或自制的DNA存储卡,直接从植物组织中进行PCR扩增 NA 开发一种低成本、高通量的PCR方法,使植物DNA分子诊断技术更易于在资源有限的条件下进行 至少包括拟南芥、番茄、大豆、马铃薯、棉花和稻在内的十一种植物 分子生物学 NA PCR NA DNA 至少十一种植物物种
305 2024-08-07
CRISPR-Powered DNA Computing and Digital Display
2021-11-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文报道了一种基于CRISPR技术的DNA计算和数字显示系统,该系统通过编程的DNA目标作为输入,并通过ON/OFF荧光信号表示TRUE/FALSE输出 该系统能够建立输入与输出之间的一对一关系,实现多级DNA逻辑计算,并通过预CRISPR反应选择性维持或抑制CRISPR反应性来扩展输入大小 NA 开发一种新型的CRISPR驱动的DNA计算和数字显示系统 CRISPR技术在DNA计算和分子编程中的应用 生物技术 NA CRISPR技术 NA DNA NA
306 2024-08-07
DNA storage: research landscape and future prospects
2020-Jun, National science review IF:16.3Q1
综述 本文综述了DNA存储的基本理论、研究历史和技术挑战,并从定量角度评估了DNA作为新型数据存储介质的前景 DNA作为一种稳定、资源和能源高效且可持续的数据存储解决方案 NA 探讨DNA存储的研究现状及未来前景 DNA存储的理论、历史和技术挑战 NA NA NA NA NA NA
307 2024-08-07
Enhancing Physical and Thermodynamic Properties of DNA Storage Sets With End-Constraint
2022-04, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3
research paper 本文提出了一种新的方法来设计高质量的DNA存储集,通过引入随机开关和双权重后代策略在双策略黑寡妇优化算法(DBWO)中,提高了算法的探索和利用能力,并应用于设计DNA存储集,同时提出了末端约束以改善序列的稳定性。 本文创新地引入了随机开关和双权重后代策略在DBWO算法中,提高了算法的性能,并提出了末端约束方法来增强DNA存储集的物理和热力学性质。 NA 提高DNA存储集的质量和稳定性 DNA存储集的设计和优化 生物信息学 NA 双策略黑寡妇优化算法(DBWO) DBWO DNA序列 26个基准函数
308 2024-08-07
Scaling up DNA digital data storage by efficiently predicting DNA hybridisation using deep learning
2021-10-15, Scientific reports IF:3.8Q1
research paper 本文通过深度学习方法有效预测DNA杂交过程,以扩大DNA数字数据存储的应用 首次全面研究机器学习方法在预测DNA杂交任务中的应用,并引入了一个包含超过250万个数据点的模拟杂交数据集 NA 控制和预测DNA杂交过程,以推动混合分子-电子计算的未来发展 DNA杂交过程及其在DNA数字数据存储和计算中的应用 machine learning NA deep learning NA DNA序列数据 超过250万个数据点
309 2024-08-07
A Loser-Take-All DNA Circuit
2021-11-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文介绍了一种新型DNA电路——失败者全取电路,该电路通过DNA链置换实现,能够在输入中选择最小模拟值的信号 引入了一种新的DNA电路类型——失败者全取电路,与传统的赢家全取电路互补,能够识别基于最小相似性的分子模式 NA 开发一种新型的DNA电路,用于分子模式识别任务 DNA电路的设计和性能 NA NA DNA链置换 NA NA 成功演示了一个包含九种独特输入组合的三输入失败者全取电路
310 2024-08-07
Stochastic Hazard Analysis of Genetic Circuits in iBioSim and STAMINA
2021-10-15, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本文通过使用STAMINA工具对三种已知具有故障行为的遗传电路实现进行随机分析,预测故障倾向,并通过与iBioSim中的随机模拟结果对比验证了STAMINA的有效性 本文展示了随机验证在遗传设计中的应用,帮助设计者评估设计选择和输入限制,以实现所需的运行可靠性 NA 研究如何通过随机分析预测遗传电路中的故障倾向,并提高电路的运行可靠性 三种已知具有故障行为的遗传电路实现 合成生物学 NA 随机验证 NA 遗传电路数据 三种遗传电路实现
311 2024-08-07
Integrated Iontronic Circuits Based on Single Nanochannels
2021-Oct-13, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本文介绍了一种基于并行单个聚二甲基硅氧烷(PDMS)纳米通道的离子电子电路的发明,用于实现有效的电子信号操控 该电路能够作为双极结型晶体管或离子整流器,通过不对称地装饰带电聚电解质在纳米通道上来调控离子传输 NA 开发新型离子电子集成电路,以改进生物计算和传感技术 离子电子电路及其在生物计算和传感中的应用 NA NA 离子电子技术 离子电子电路 NA NA
312 2024-08-07
Modular DNA Circuits for Point-of-Care Colorimetric Assay of Infectious Pathogens
2021-10-19, Analytical chemistry IF:6.7Q1
研究论文 本文介绍了一种基于核酸等温扩增技术和DNA酶介导比色读出的模块化DNA电路,用于即时检测多种传染性病原体 该研究设计了一种固定模块和灵活模块组成的模块化DNA电路,能够同时检测多种遗传目标,并通过尿素处理和磁分离实现固定模块的重复使用 NA 开发一种准确、特异且经济的检测方法,用于同时检测多种传染性病原体,以提高人类健康和安全 传染性病原体的检测 生物技术 传染性疾病 核酸等温扩增技术 DNA电路 遗传目标 NA
313 2024-08-07
In Situ Programmable DNA Circuit-Promoted Electrochemical Characterization of Stemlike Phenotype in Breast Cancer
2021-10-06, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1
研究论文 本文报道了一种电化学表型方法,用于表征乳腺癌中的干细胞样表型,提供了一种低成本且稳健的选择,替代昂贵且依赖经验的流式细胞术。 设计了一种原位可编程DNA电路,使用捕获探针引入DNA组装的触发点和效应探针加速背景信号的移除,提高了电化学表型方法的灵敏度和准确性。 NA 开发一种新的电化学表型方法,用于表征乳腺癌中的干细胞样表型。 乳腺癌干细胞样表型。 数字病理学 乳腺癌 电化学表型方法 NA 细胞 涉及乳腺癌细胞和小鼠乳腺癌异种移植瘤模型。
314 2024-08-07
A Hierarchical Error Correction Strategy for Text DNA Storage
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文提出了一种用于文本DNA存储的分层错误纠正策略 该策略通过设计针对常见字符的鲁棒代码,逐步纠正DNA读取中的错误,并能处理多个插入或删除错误 NA 旨在解决DNA序列中的错误复杂性,以促进其在大量数据存储中的应用 DNA存储中的错误纠正方法 生物信息学 NA NA NA 文本 NA
315 2024-08-07
Solving the Family Traveling Salesperson Problem in the Adleman-Lipton Model Based on DNA Computing
2022-01, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3
研究论文 本文提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决家庭旅行商问题(FTSP) 利用DNA计算的强大并行能力,相较于传统计算机在处理NP完全问题上具有无可比拟的优势 NA 探索DNA计算在解决复杂NP完全问题中的应用 家庭旅行商问题(FTSP) 计算机科学 NA DNA计算 Adleman-Lipton模型 DNA分子 一些基准实例
316 2024-08-07
DNA Logic Circuits for Multiple Tumor Cells Identification Using Intracellular MicroRNA Molecular Bispecific Recognition
2021-11, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本文介绍了一种基于细胞内双特异性微小RNA识别的DNA逻辑电路,用于多种肿瘤细胞亚型的识别 开发了一种集成多个识别和报告模块的DNA电路,通过三维逻辑门纳米六面体框架实现三种细胞亚型的同时识别 NA 旨在开发一种新方法,通过细胞内微小RNA的双特异性识别来区分多种肿瘤细胞亚型 肿瘤细胞亚型 生物技术 肿瘤 DNA逻辑电路 NA 微小RNA NA
317 2024-08-07
NOREC4DNA: using near-optimal rateless erasure codes for DNA storage
2021-Aug-17, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 介绍NOREC4DNA软件框架,用于使用、测试、比较和改进近最优无速率擦除码(NORECs)在DNA存储系统中的应用 提出NOREC4DNA框架,使用近最优无速率擦除码,如Raptor和Online码,相较于之前的LT码,在DNA存储系统中实现显著改进 NA 探索和优化用于DNA存储的近最优无速率擦除码 DNA存储系统中的近最优无速率擦除码 生物信息学 NA 近最优无速率擦除码 NA DNA序列 NA
318 2024-08-07
Securing Bio-Cyber Interface for the Internet of Bio-Nano Things using Particle Swarm Optimization and Artificial Neural Networks based parameter profiling
2021-09, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本文提出了一种使用粒子群优化(PSO)和人工神经网络(ANN)进行参数分析的框架,以提高生物纳米物联网(IoBNT)的安全性 本文创新性地使用PSO算法优化ANN,以检测IoBNT传输中的异常活动,并提高了98.9%的准确性 NA 研究如何提高生物纳米物联网的安全性,特别是在医疗应用中的安全性 生物纳米物联网(IoBNT)及其生物网络接口(Bio Cyber Interface)的安全性 计算机视觉 NA 粒子群优化(PSO),人工神经网络(ANN) 人工神经网络(ANN) 模拟数据 NA
319 2024-08-07
A Cascaded DNA Circuit in Bead Arrays for Quantitative Single-Cell MicroRNA Analysis
2021-08-24, Analytical chemistry IF:6.7Q1
research paper 本文构建了一种级联DNA电路,通过催化发夹组装和杂交链反应,在珠阵列平台上实现单细胞微RNA的定量分析 提出了一个结合催化发夹组装和杂交链反应的级联DNA电路,用于在珠阵列平台上进行微RNA的信号放大和定量分析 NA 开发一种高灵敏度和高特异性的方法,用于单细胞微RNA的定量分析 单细胞微RNA NA cancer 催化发夹组装和杂交链反应 NA microRNA 单个癌细胞
320 2024-08-07
HD-Code: End-to-End High Density Code for DNA Storage
2021-10, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3
研究论文 本文提出了一种端到端的高密度DNA编码算法(称为HD-code),用于DNA存储 该算法通过充分利用原始多媒体数据的统计特性和考虑DNA碱基的生物学约束,实现了更高的逻辑存储密度,并提高了数据存储的灵活性和一致性 NA 探索和优化DNA作为信息存储媒介的方法 DNA存储技术及其编码算法 生物信息学 NA DNA编码 NA 多媒体数据 NA
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