生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 757 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Modularized Enzymatic Tandem Reaction for tsRNA Detection
2022-11-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c04010
PMID:36325814
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RT-NExT的模块化酶级联反应，用于检测tRNA衍生的小RNA（tsRNA），作为乳腺癌早期诊断和预后预测的新生物标志物。 | RT-NExT反应通过模块化设计，能够独立工作或组装，提高了设计的灵活性和检测的准确性。 | NA | 开发一种新的检测方法，用于乳腺癌的早期诊断和预后评估。 | tRNA衍生的小RNA（tsRNA） | NA | 乳腺癌 | NA | NA | RNA | 10 M ts-66或ts-86 |
| 282 | 2024-08-07 |
ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit
2022-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210150119
PMID:36282916
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研究论文 | 研究ADAR通过抑制MDA5激活在生物电路中调控APOL1的机制 | 发现ADAR通过A-to-I RNA编辑调控APOL1表达，影响APOL1相关肾脏疾病的渗透率和严重程度 | NA | 探讨ADAR对APOL1表达的调控机制及其在肾脏疾病中的作用 | ADAR、APOL1、MDA5以及它们在肾脏疾病中的相互作用 | NA | 肾脏疾病 | A-to-I RNA编辑 | NA | RNA | 人类肾组织、足细胞、转基因APOL1小鼠模型 |
| 283 | 2024-08-07 |
Stochastic dynamics of Type-I interferon responses
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010623
PMID:36269758
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研究论文 | 研究了JAK-STAT信号通路中干扰素α反应诱导的变异性的来源 | 整合时间分辨流式细胞仪数据和JAK-STAT信号通路的随机建模，量化了通路不同步骤的内在变异性 | NA | 探究干扰素α反应诱导的变异性的来源及其对JAK-STAT信号通路的影响 | 干扰素α反应的变异性及其在JAK-STAT信号通路中的作用 | NA | NA | 流式细胞术 | 随机模型 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 284 | 2024-08-07 |
Provenance of life: Chemical autonomous agents surviving through associative learning
2022-Sep, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.034401
PMID:36266823
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研究论文 | 本文展示了一种自主化学代理通过关联学习适应环境特征的基准研究 | 首次证明简单的非生物耗散结构也能展示关联学习能力 | NA | 探索简单的非生物耗散结构是否能展示关联学习 | 自主化学代理的关联学习能力 | 系统化学 | NA | 反应扩散模型 | Gray-Scott模型 | 化学物种 | NA |
| 285 | 2024-08-07 |
pyDockDNA: A new web server for energy-based protein-DNA docking and scoring
2022, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2022.988996
PMID:36275623
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研究论文 | 介绍了一个名为pyDockDNA的网络服务器，用于基于能量的蛋白质-DNA对接和评分 | pyDockDNA服务器能够以合理的预测成功率模拟蛋白质-DNA复合物，并引入了新的能量基参数和外部约束的可能性 | NA | 开发一种新的计算方法来模拟蛋白质-DNA复合物的结构 | 蛋白质和DNA的相互作用 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 结构数据 | 使用标准蛋白质-DNA复合物结构数据集进行基准测试 |
| 286 | 2024-08-07 |
Sensitive fluorescence biosensor for SARS-CoV-2 nucleocapsid protein detection in cold-chain food products based on DNA circuit and g-CNQDs@Zn-MOF
2022-Nov-01, Lebensmittel-Wissenschaft + [i.e. und] Technologie. Food science + technology. Science + technologie alimentaire
DOI:10.1016/j.lwt.2022.114032
PMID:36186577
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研究论文 | 本文报道了一种基于DNA电路和g-CNQDs@Zn-MOF的荧光生物传感器，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | 该荧光生物传感器具有极高的灵敏度，检测限为1.0 pg/mL，且不与其他N蛋白发生显著交叉反应 | NA | 开发一种快速且灵敏的检测方法，用于检测冷链食品中的SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | SARS-CoV-2核衣壳蛋白 | 生物传感器 | COVID-19 | 荧光检测 | NA | 蛋白质 | 实际冷链食品样本 |
| 287 | 2024-08-07 |
Integrated Microfluidic DNA Storage Platform with Automated Sample Handling and Physical Data Partitioning
2022-09-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c02667
PMID:36106626
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研究论文 | 本文介绍了一种集成微流控DNA存储平台，该平台通过微阀网络架构实现数据编码寡核苷酸样本的自动存储和检索 | 该平台采用可单独寻址的隔室，提供了一种与分子级随机访问实现正交的数据分区策略，每个分区相当于4×2 mm区域内的9.5 TB数据 | NA | 研究目的是开发一种集成和自动化的微流控平台，用于DNA存储 | 研究对象是用于数据存储的微流控DNA平台及其与DNA存储工作流程的兼容性 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | DNA | 每个分区相当于9.5 TB数据 |
| 288 | 2024-08-07 |
Nanocellulose Composites as Smart Devices With Chassis, Light-Directed DNA Storage, Engineered Electronic Properties, and Chip Integration
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.869111
PMID:36105598
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研究论文 | 研究评估了将纳米纤维素复合材料转化为信息存储或处理设备的四种方法 | 纳米纤维素复合材料通过光控酶、半导体特性及电子能力实现信息存储与处理，并展示了其在智能设备和生物医学应用中的潜力 | NA | 探索纳米纤维素复合材料在智能设备和信息处理中的应用 | 纳米纤维素复合材料及其在信息存储和处理中的应用 | NA | NA | 纳米技术 | NA | NA | NA |
| 289 | 2024-08-07 |
Identification of DNA-binding proteins via Multi-view LSSVM with independence criterion
2022-11, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2022.08.015
PMID:36087888
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研究论文 | 本文提出了一种基于序列信息的机器学习算法，用于识别DNA结合蛋白，该方法结合了多视角最小二乘支持向量机与希尔伯特-施密特独立性准则 | 该方法采用六种特征集作为多视角输入，并通过引入希尔伯特-施密特独立性准则作为正则项，减少了视角间的依赖性，探索了多视角的互补信息 | NA | 设计一种高效准确的工具来识别DNA结合蛋白 | DNA结合蛋白 | 机器学习 | NA | NA | LSSVM | 序列信息 | 训练集PDB1075，独立测试集PDB186和PDB2272 |
| 290 | 2024-08-07 |
A Parallel DNA Algorithm for Solving the Quota Traveling Salesman Problem Based on Biocomputing Model
2022, Computational intelligence and neuroscience
DOI:10.1155/2022/1450756
PMID:36093485
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研究论文 | 本文开发了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决配额旅行商问题(QTSP) | 提出了一种具有多项式时间复杂度的算法来解决QTSP，相较于指数计算复杂度的算法，随着问题规模的增加，其优势更加明显 | NA | 解决配额旅行商问题(QTSP) | 配额旅行商问题(QTSP) | 生物计算 | NA | DNA算法 | Adleman-Lipton模型 | NA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
Pattern Recognition of microRNA Expression in Body Fluids Using Nanopore Decoding at Subfemtomolar Concentrations
2022-Aug-22, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.2c00117
PMID:36032536
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研究论文 | 本文描述了一种使用纳米孔基DNA计算技术检测微小RNA（miRNA）表达模式的方法 | 提出的系统能够在无标记的情况下检测BDC患者血浆中的miRNA表达模式，并且能够在亚飞摩尔浓度下检测dgDNA-miRNA复合物，这是对先前报道的检测限的显著改进 | NA | 开发一种简单策略用于miRNA模式识别，以实现早期癌症诊断 | 五种在胆管癌（BDC）中过度表达的miRNA | 数字病理学 | 胆管癌 | 纳米孔分析 | NA | DNA | BDC患者的血浆样本 |
| 292 | 2024-08-07 |
A nanopore interface for higher bandwidth DNA computing
2022-08-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32526-3
PMID:35987925
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研究论文 | 本文介绍了一种利用纳米孔传感器阵列技术进行DNA计算的高带宽接口，无需测序即可实现实时动力学测量。 | 提出了一种可多路复用的无测序读出方法，通过纳米孔传感器阵列技术直接检测编码输出链，提高了DNA链置换电路的输出带宽。 | NA | 开发一种新的方法来提高DNA计算中DNA链置换电路的输出带宽。 | DNA链置换电路的输出检测方法。 | 生物技术 | NA | 纳米孔传感器阵列技术 | NA | DNA | NA |
| 293 | 2024-08-07 |
Clover: tree structure-based efficient DNA clustering for DNA-based data storage
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac336
PMID:35975958
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研究论文 | 本文提出了一种名为Clover的高效DNA聚类方法，用于基于DNA的数据存储，具有线性计算复杂度和低内存需求 | Clover通过使用树结构进行区间特定检索，避免了计算Levenshtein距离，从而提高了效率 | NA | 旨在解决DNA存储中DNA序列聚类的效率问题 | DNA序列的聚类 | 生物信息学 | NA | DNA聚类算法 | 树结构 | DNA序列 | 10亿DNA数据 |
| 294 | 2024-08-07 |
Hidden Addressing Encoding for DNA Storage
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.916615
PMID:35928958
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研究论文 | 本文提出了一种用于DNA存储的隐藏寻址编码方案，通过改进的喷泉编码方案实现隐藏地址，并验证了其性能。 | 提出的隐藏寻址编码方案能够减少物理冗余，提高碱基利用率，并确保DNA存储在测序和解码过程中的正确率。 | NA | 旨在改进DNA存储技术，减少数据转换为短DNA序列时的物理冗余。 | DNA存储编码方案的性能和效率。 | 生物信息学 | NA | 喷泉编码 | NA | DNA序列 | 10.1 MB文件 |
| 295 | 2024-08-07 |
DNA circuits compatible encoder and demultiplexer based on a single biomolecular platform with DNA strands as outputs
2022-08-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac650
PMID:35904810
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研究论文 | 本文构建了一系列基于单一生物分子平台的多个逻辑电路，执行非算术和算术功能，包括4-to-2编码器、1-to-2解复用器、1-to-4解复用器和多输入OR门 | 首次实现了基于DNA的编码器，其输出为DNA链，可真正应用于DNA电路，使DNA电路能在非二进制生物环境中应用 | NA | 开发基于单一生物分子平台的高级分子逻辑电路 | 基于DNA的编码器和解复用器 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA链 | NA |
| 296 | 2024-08-07 |
DNA Arithmetic With Error Correction
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3189833
PMID:35816540
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研究论文 | 本文提出了一种基于冗余剩余数系统（RRNS）的DNA计算系统，该系统具有优雅的容错特性 | 首次将贴纸模型引入基于RRNS的DNA算术中 | NA | 解决DNA大规模制造中的高错误率问题 | DNA计算系统及其在非硅基计算机设计中的应用 | NA | NA | 冗余剩余数系统（RRNS） | NA | DNA | NA |
| 297 | 2024-08-07 |
Correction to: DeSP: a systematic DNA storage error simulation pipeline
2022-Jul-12, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04813-9
PMID:35820794
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
On-Site Non-enzymatic Orthogonal Activation of a Catalytic DNA Circuit for Self-Reinforced In Vivo MicroRNA Imaging
2022-11-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202206529
PMID:35775154
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research paper | 本文开发了一种高效的非酶促电路激活策略，用于实现正交控制的催化DNA电路，以实现高保真的体内微RNA成像 | 提出了一种非酶促的正交激活方法，用于在活细胞内现场激活催化DNA电路，实现高保真的微RNA成像 | NA | 开发一种新的方法用于体内微RNA成像，以提高临床诊断和预后的准确性 | 微RNA的体内成像 | 生物技术 | NA | 催化DNA电路 | NA | DNA | NA |
| 299 | 2024-08-07 |
An Autocatalytic DNA Circuit Based on Hybridization Chain Assembly for Intracellular Imaging of Polynucleotide Kinase
2022-Jul-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.2c08523
PMID:35786848
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研究论文 | 本文提出了一种基于杂交链反应的自催化DNA电路，用于细胞内多核苷酸激酶的成像 | 通过精心整合杂交链反应和催化DNA组装，实现了高效的正反馈放大 | NA | 开发高效的人工DNA电路，用于分析低丰度生物标志物 | 多核苷酸激酶及其在细胞内的活性 | 生物化学 | NA | 杂交链反应（HCA）和催化DNA组装（CDA） | 自催化杂交系统（AHS） | DNA | NA |
| 300 | 2024-08-07 |
Massively Parallel DNA Computing Based on Domino DNA Strand Displacement Logic Gates
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00270
PMID:35771957
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研究论文 | 本文利用DNA链置换技术构建了一种基于多米诺DNA链置换逻辑门的并行DNA计算系统 | 本文提出了一种新的多输入AND门计算系统，取代了传统的多级级联操作，显著降低了系统构建成本并提高了系统的稳定性和鲁棒性 | NA | 建立基于生物分子的可寻址逻辑门，为构建生物计算机奠定基础 | DNA计算中的多输入AND操作 | 生物计算 | NA | DNA链置换技术 | 多输入AND门 | NA | NA |