生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 758 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
Magnetic Bead Spherical Nucleic Acid Microstructure for Reliable DNA Preservation and Repeated DNA Reading
2023-08-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00221
PMID:37470286
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研究论文 | 本文报道了一种磁珠球形核酸（MB-SNA）复合微结构的构建及其作为成本效益高的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | MB-SNA具有高密度双链DNA外壳，实现了高容量存储，并通过加速老化测试证明了其在极端条件下的长期保存能力 | NA | 开发一种新的平台用于可靠的DNA保存和重复读取 | 磁珠球形核酸复合微结构 | 生物技术 | NA | PCR-磁分离 | NA | DNA | 每个MB-SNA存储一条双链DNA数据片段 |
| 222 | 2024-08-07 |
An Aptamer-Functionalized DNA Circuit to Establish an Artificial Interaction between T Cells and Cancer Cells
2023-09-25, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307656
PMID:37423897
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research paper | 本研究开发了一种适体功能化的DNA电路，用于调节T细胞与癌细胞之间的相互作用 | 该DNA电路由识别-触发和聚集-激活模块组成，能够在识别目标癌细胞后，释放触发链诱导T细胞表面免疫受体的聚集，从而增强T细胞活性，有效消除癌细胞 | NA | 探索非遗传策略以控制细胞间相互作用网络，特别是在基于T细胞的癌症免疫治疗中 | T细胞与癌细胞的相互作用 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Programmable Molecular Signal Transmission Architecture and Reactant Regeneration Strategy Driven by EXO λ for DNA Circuits
2023-07-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00168
PMID:37405388
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研究论文 | 本文展示了一种新型可编程的核酸外切酶辅助信号传输架构，并提出了一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，用于构建DNA电路，以减少信号在级联和分流过程中的衰减。 | 本文提出了一种新型的可编程核酸外切酶辅助信号传输架构和一种简单的核酸外切酶驱动的反应物再生策略，这些方法能够减少DNA电路中信号的衰减，提高分子计算系统的可靠性。 | NA | 提高分子计算系统的可靠性和扩展DNA电路的规模。 | DNA电路中的信号传输和反应物再生策略。 | 分子计算 | NA | 核酸外切酶辅助信号传输 | NA | DNA序列 | 四节点DNA电路 |
| 224 | 2024-08-07 |
A Smart Deoxyribozyme-Programmable Catalytic DNA Circuit for High-Contrast MicroRNA Imaging
2023-08-14, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202307418
PMID:37379042
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研究论文 | 本文介绍了一种智能脱氧核酶可编程催化DNA电路，用于高对比度microRNA成像 | 提出了一种内源性激活的DNAzyme策略，与催化DNA电路结合，实现了在活细胞中选择性和高效的microRNA成像 | NA | 实现活细胞中microRNA的选择性成像 | microRNA成像 | 生物技术 | NA | 催化DNA电路 | DNAzyme | NA | NA |
| 225 | 2024-08-07 |
A Cationic Copolymer Enhances Responsiveness and Robustness of DNA Circuits
2023-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202304091
PMID:37340578
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研究论文 | 本研究探讨了一系列阳离子共聚物对DNA催化发夹组装（一种代表性的脚跟介导的DNA电路）的影响 | 使用聚（赖氨酸）-接枝-葡聚糖共聚物显著提高了反应速率，并通过静电相互作用增强了DNA电路的鲁棒性 | NA | 研究阳离子共聚物对脚跟介导的DNA电路操作速率和鲁棒性的影响 | 阳离子共聚物对DNA催化发夹组装的影响 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 一系列阳离子共聚物 |
| 226 | 2024-08-07 |
Entropy-driven DNA circuit with two-stage strand displacement for elegant and robust detection of miRNA let-7a
2023-Aug-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2023.341392
PMID:37290851
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研究论文 | 本研究设计了一种基于外切酶Ⅲ辅助的两阶段链置换反应（SDR）的稳定miRNA-let-7a荧光生物传感器 | 采用了一种熵驱动的SDR，包含三链结构的底物，减少了目标循环过程的可逆性，并设计了两阶段链置换系统，提高了检测灵敏度和范围 | NA | 推动miRNA在癌症诊断传感系统中的研究 | miRNA-let-7a | 生物传感器 | 癌症 | 外切酶Ⅲ辅助链置换反应 | NA | 荧光信号 | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
N/S-Co-doped carbon dot-based FRET ratiometric fluorescence aptasensing platform modulated with entropy-driven DNA amplifier for ochratoxin A detection
2023-Aug, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-023-04778-5
PMID:37306781
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研究论文 | 本研究提出了一种基于氮硫共掺杂碳点（N/S-CD）的FRET比率荧光适体传感策略，结合熵驱动的DNA放大器，用于灵敏和准确检测赭曲霉素A（OTA） | 该策略通过熵驱动的DNA电路和Cu放大器的协同放大，显著提高了检测性能 | NA | 开发一种新型的高灵敏度和准确度的赭曲霉素A检测方法 | 赭曲霉素A的检测 | 生物传感技术 | 食品污染 | FRET比率荧光适体传感技术 | NA | 荧光信号 | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
A Robust and Efficient DNA Storage Architecture Based on Modulation Encoding and Decoding
2023-06-26, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.3c00629
PMID:37289182
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研究论文 | 本文提出了一种基于调制编码和解码的DNA存储架构，以解决合成DNA数据存储中的随机插入-删除-替换（IDS）错误问题 | 利用通信领域的调制技术，将二进制数据调制成具有相同AT/GC模式的DNA序列，便于检测噪声读取中的插入和删除错误 | 该方法的逻辑密度相对较低，为1.0比特/nt | 提高DNA存储的可靠性和效率 | 合成DNA数据存储中的IDS错误 | NA | NA | 调制编码和解码 | NA | DNA序列 | 实验包括模拟数据集和真实数据集 |
| 229 | 2024-08-07 |
Programming DNA Circuits for Controlled Immunostimulation through CpG Oligodeoxynucleotide Delivery
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c09359
PMID:37267596
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研究论文 | 本文介绍了一种用于递送具有药理免疫刺激功能的CpG寡脱氧核苷酸（CpG ODNs）的DNA电路 | 通过编程DNA电路控制CpG ODN的释放，实现了急性且强效的免疫刺激，与无控制的CpG ODN释放系统相比，具有更快的响应 | NA | 探索DNA电路在控制DNA链药理活性方面的潜力，用于受控药物递送 | DNA电路的设计、DNA双链浓度、T7核酸外切酶浓度对电路动力学和时间行为的影响 | 生物技术 | NA | CpG寡脱氧核苷酸递送 | NA | DNA | 使用了HEK工程细胞系和J774A.1巨噬细胞进行体外激活实验 |
| 230 | 2024-08-07 |
Accelerating Cell-Free Biosensors by Entropy-Driven Assembly of Transcription Templates
2023-06-13, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c01090
PMID:37261725
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研究论文 | 本文介绍了一种通过熵驱动组装转录模板的方法来加速无细胞转录过程，以提高无细胞生物传感器的效率和选择性。 | 提出了一种新的熵驱动组装转录模板的方法，作为动态放大模块，显著加速了无细胞转录系统，且不受多种酶的干扰。 | NA | 旨在提高无细胞生物传感器的生产效率和应用范围。 | 无细胞转录系统及其在生物生产、环境监测和疾病诊断中的应用。 | 生物技术 | 传染病 | 无细胞生物合成 | NA | RNA | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Control of Reversible Formation and Dispersion of the Three Enzyme Networks Integrating DNA Computing
2023-06-27, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00924
PMID:37253150
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研究论文 | 本研究报告了通过三叉分支DNA结构单元组装的三酶复合网络的形成和分散，并展示了这种网络在控制酶级联反应活性和乳腺癌生物标志物的检测中的应用 | 首次实现了通过单链DNA、RNA和酶实现三酶复合网络的可逆形成和分散，并将其集成到DNA计算中，为生物或环境传感提供了一个新的平台 | NA | 探索通过DNA纳米技术实现酶级联反应的高效控制和生物标志物的检测 | 三酶复合网络的形成和分散机制及其在生物标志物检测中的应用 | 生物技术 | 乳腺癌 | DNA纳米技术 | NA | DNA、RNA | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Chemiluminescence resonance energy transfer-based multistage nucleic acid amplification circuits for MiRNA detection with low background
2023-Jun-12, The Analyst
DOI:10.1039/d3an00594a
PMID:37195805
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研究论文 | 本文构建了一种基于化学发光共振能量转移（CRET）的多级核酸扩增电路，用于低背景下的miRNA检测和细胞成像。 | 通过巧妙的可编程催化发夹组装（CHA）、杂交链反应（HCR）和DNAzyme的使用，实现了目标触发下供体和受体之间距离的精确调控，从而增强了化学发光信号。 | NA | 开发一种高灵敏度、低背景的miRNA检测方法，并实现细胞内miRNA的成像。 | miRNA的检测和细胞内成像。 | 生物传感技术 | NA | 化学发光共振能量转移（CRET） | DNA电路 | 化学发光信号 | NA |
| 233 | 2024-08-07 |
Study on DNA Storage Encoding Based IAOA under Innovation Constraints
2023-Apr-18, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45040233
PMID:37185757
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研究论文 | 本文提出了一种基于双匹配和错误配对约束的方法，以提高DNA编码集的质量，从而减少存储过程中DNA序列的不稳定性导致的错误 | 引入了随机扰动基本函数和双重自适应加权策略，改进了算术优化算法（IAOA），并在DNA编码设计中应用了新的约束条件 | NA | 解决传统存储介质无法满足当前数据存储需求的问题，利用DNA的高存储容量和持久性优势 | DNA存储中的编码质量和稳定性 | 生物信息学 | NA | DNA存储技术 | 算术优化算法（IAOA） | DNA序列 | 13个基准函数 |
| 234 | 2024-08-07 |
PRO-Simat: Protein network simulation and design tool
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.04.023
PMID:37181657
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研究论文 | PRO-Simat是一个用于分析蛋白质相互作用网络、动态变化及路径工程的模拟工具 | 集成了Jimena框架进行动态网络模拟，快速有效地模拟布尔遗传调控网络，并提供深入的蛋白质相互作用类型、强度、持续时间和路径的分析 | NA | 开发一个用于蛋白质网络模拟和设计的工具 | 蛋白质相互作用网络及其动态变化和路径工程 | 生物信息学 | NA | 网络模拟 | 布尔遗传调控网络 | 蛋白质相互作用数据 | 超过800万蛋白质相互作用数据，涵盖32种模型生物及人类蛋白质组 |
| 235 | 2024-08-07 |
DNA storage in thermoresponsive microcapsules for repeated random multiplexed data access
2023-08, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-023-01377-4
PMID:37142708
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研究论文 | 本文报道了一种基于热响应性微胶囊的DNA存储系统，该系统能够实现多次随机并行数据访问 | 提出了一种基于热限制的聚合酶链反应技术，使得DNA文件能够在分隔的微胶囊中进行多次随机并行访问 | NA | 开发一种可扩展的DNA存储系统，实现多次随机并行数据访问 | 热响应性微胶囊中的DNA存储技术 | 生物技术 | NA | 聚合酶链反应（PCR） | NA | DNA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
An image cryptography method by highly error-prone DNA storage channel
2023, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2023.1173763
PMID:37152655
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研究论文 | 本文提出了一种基于调制存储架构的图像加密方法，利用不可预测的调制信号在高度错误倾向的DNA存储通道中加密图像 | 本文的创新点在于利用DNA存储通道的不可预测性进行图像加密，提高了数据安全性 | NA | 研究如何在DNA存储系统中实现数据安全 | 图像加密方法 | 计算机视觉 | NA | DNA存储 | NA | 图像 | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
DNA Origami: Recent Progress and Applications
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3028-0_1
PMID:37166708
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review | 本章探讨了DNA折纸的基本概念及其多种类型 | 展示了过去15年中结构DNA纳米技术取得的进展，强调了DNA折纸在构建2D和3D复杂结构方面的能力 | NA | 探讨DNA折纸的进展及其在不同领域的应用潜力 | DNA折纸及其在生物计算、纳米机器人和DNA步行器等领域的应用 | NA | NA | DNA折纸 | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-07 |
Rational Design of Cascade DNA System for Signal Amplification
2023-05-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00433
PMID:37129512
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研究论文 | 本文提出了一种基于“分裂-重建”和“保护-释放”策略的级联DNA系统设计方法，用于信号放大 | 本文提出的策略使得级联系统不再依赖于严格的1:1:1摩尔比，从而避免了系统泄漏问题，并增强了信号放大能力 | NA | 开发不依赖于严格摩尔比的级联DNA系统，以实现更有效的信号放大 | 级联DNA系统及其在信号放大中的应用 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | DNA序列 | NA |
| 239 | 2024-08-07 |
Content-based filter queries on DNA data storage systems
2023-04-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-34160-5
PMID:37120614
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research paper | 本文介绍了首个支持在DNA存储上进行内容基于过滤查询的编码方法 | 提出了首个支持在DNA存储上进行内容基于过滤查询的编码方法 | 当前DNA存储系统由于生物化学限制，对DNA存储设备的随机访问支持有限 | 开发一种新的DNA编码方法，以支持在DNA存储系统上的内容基于过滤查询 | DNA数据存储系统的编码和解码方法 | NA | NA | DNA编码 | NA | DNA数据 | 数百万可直接访问的数据对象 |
| 240 | 2024-08-07 |
Optimizing mycobacteria molecular diagnostics: No decontamination! Human DNA depletion? Greener storage at 4 °C!
2023, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2023.1104752
PMID:37113238
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研究论文 | 本文研究了优化分枝杆菌分子诊断的方法，包括不使用去污染、减少人类DNA和在4°C下更环保的存储方法。 | 本文首次展示了在分子诊断中不使用去污染和人类DNA减少的方法，并发现样本可以在4°C下存储而不会显著影响检测结果。 | 本文的实验设置可能不适用于所有类型的样本，特别是那些分枝杆菌载量极低的样本。 | 优化分枝杆菌分子诊断的前处理和提取步骤，以提高检测效率和准确性。 | 分枝杆菌DNA的提取效率和存储方法。 | 分子诊断 | 结核病 | 下一代测序（NGS） | NA | DNA | 五个常用设备从相同样本中提取的DNA |