生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 758 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-06 |
Detection, molecular typing and phylogenetic analysis of Leishmania isolated from cases of leishmaniasis among Syrian refugees in Lebanon
2016-Jun, Parasite epidemiology and control
IF:2.0Q3
DOI:10.1016/j.parepi.2016.02.002
PMID:29988171
|
研究论文 | 本文研究了从黎巴嫩叙利亚难民中分离出的利什曼原虫的检测、分子分型和系统发育分析 | 首次比较了两种不同的分子方法在黎巴嫩的利什曼原虫检测和识别中的效果 | 未能全面阐明皮肤利什曼病的流行病学情况 | 探讨在黎巴嫩的利什曼病流行情况以及检测方法的有效性 | 39个来自石蜡包埋（FFPE）组织的利什曼原虫分离株 | 数字病理学 | NA | ITS1-PCR RFLP和嵌套ITS1-5.8S rDNA基因扩增 | 邻接法（NJ） | DNA序列 | 39个FFPE样本 |
| 182 | 2024-08-06 |
A programming language for composable DNA circuits
2009-Aug-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2009.0072.focus
PMID:19535415
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于设计和模拟DNA电路的编程语言 | 提出了一种新的编程语言来支持基于链置换的DNA电路的设计与模拟 | 假设链没有任何次级结构，可能限制了模型的适用性 | 旨在促进DNA电路的设计及其自动编译到核苷酸序列 | 各种电路模型及其模拟，包括熵驱动的催化门和化学反应系统 | 数字病理学 | NA | 链置换 | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-06 |
Protocols for dry DNA storage and shipment at room temperature
2013-Sep, Molecular ecology resources
IF:5.5Q1
DOI:10.1111/1755-0998.12134
PMID:23789643
|
研究论文 | 本研究评估了三种干态DNA稳定化系统在常温和56°C下的效果 | 提出了不同的干燥DNA存储和运输方案，为DNA长时间保存提供了新的思路 | 研究时间跨度长达4年，但在常温下存储的DNA质量尚需更多数据支持 | 制定成本效益高、有效的DNA提取物和PCR产品的运输及存储协议 | 对比不同的DNA存储方案对昆虫DNA的保护效果 | 数字病理学 | NA | PCR，选择性测序 | NA | DNA样本 | 96孔板的昆虫DNA样本 |
| 184 | 2024-08-06 |
BioCode: two biologically compatible Algorithms for embedding data in non-coding and coding regions of DNA
2013-Apr-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-14-121
PMID:23570444
|
研究论文 | 本论文提出了两种新颖的DNA数据嵌入算法BioCode，分别在非编码DNA和编码DNA中操作。 | 提出的算法遵循更严格的生物学限制，提高了信息嵌入的生物相容性和稳健性。 | 目前的方法只考虑了基本的生物学约束，未能充分考虑存在的进一步生物学限制。 | 研究旨在开发可以在DNA中嵌入非遗传信息的鲁棒算法。 | 研究对象为DNA数据嵌入算法，特别关注在活体生物基因组中的信息嵌入。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-06 |
Colorimetric and fluorescent independent dual "signal on" biosensor for accurate detection of ochratoxin A based on aptamer-triggered biocatalytic reactions
2024-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.342440
PMID:38499428
|
研究论文 | 本文开发了一种基于适配体触发的双通道“信号开启”生物传感器，用于准确检测赭曲霉毒素A。 | 该生物传感器具有一个识别过程和两个独立的信号输出，提高了对赭曲霉毒素A的检测灵敏度。 | 目前研究仍然面临系统内校正和与“信号关闭”相关的假阳性挑战。 | 本研究的目的是提高对赭曲霉毒素A的检测准确性与可靠性。 | 研究对象为赭曲霉毒素A及其在葡萄汁和白酒中的检测。 | 数字病理学 | NA | 生物催化反应 | NA | 荧光和比色数据 | 研究中涉及的样本包括葡萄汁和白酒 |
| 186 | 2024-08-06 |
RepairNatrix: a Snakemake workflow for processing DNA sequencing data for DNA storage
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad117
PMID:38496344
|
研究论文 | 本文章介绍了一种用于处理DNA存储的DNA测序数据的工作流程RepairNatrix | RepairNatrix通过支持对原始测序数据进行预处理并修复违反约束的序列，增强了数据编码的可恢复性 | 没有提到具体的局限性 | 提高DNA存储系统中原始测序数据处理的效率 | DNA测序数据及其存储 | 数字病理学 | NA | DNA测序 | NA | 测序数据 | 不同数据集的原始读数，数量减少了25-35倍 |
| 187 | 2024-08-06 |
DNA as a universal chemical substrate for computing and data storage
2024-03, Nature reviews. Chemistry
DOI:10.1038/s41570-024-00576-4
PMID:38337008
|
综述 | 本文探讨了DNA在计算和数据存储中的应用，重点关注神经网络和分 compartmentalized DNA 电路。 | 提出了将DNA计算与DNA数据存储集成的观点，并探索了DNA在近记忆计算中的潜力。 | 未提及具体实验数据或案例，主要为理论探讨。 | 研究DNA在新兴信息技术和诊断中的应用潜力。 | 探讨DNA作为计算基材和存储介质的特性及其在神经网络中的应用。 | 数字病理学 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA |
| 188 | 2024-08-06 |
DNA computing the Hamiltonian path problem
1999-Oct-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
PMID:10597033
|
研究论文 | 本文研究了如何影响DNA计算的Hamiltonian路径问题的实验室协议的稳健性 | 探讨了图的特征如何影响DNA计算实验室协议的参数选择 | 未能提供DHP问题在更大规模图形中的应用效果 | 研究DHP问题的DNA计算方法的实验室协议的稳健性 | 涉及使用DNA方法解决的Hamiltonian路径问题 | 数字病理学 | NA | DNA计算 | NA | 图数据 | 8个顶点和14条边的图 |
| 189 | 2024-08-06 |
DNA-QLC: an efficient and reliable image encoding scheme for DNA storage
2024-Mar-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10178-5
PMID:38461245
|
研究论文 | 本研究提出了一种高效可靠的图像编码方案DNA-QLC，用于DNA存储 | 本研究创新地结合了量化的ResNet VAE模型和Levenshtein编码来提高DNA存储的编码密度和错误校正能力 | 虽然DNA-QLC在高错误率下表现良好，但具体的适用范围和扩展性未在此研究中充分探讨 | 提高DNA存储中图像重建的效率和可靠性 | 图像数据的DNA编码和存储 | 数字病理学 | NA | 量化ResNet VAE模型和Levenshtein编码 | NA | 图像 | NA |
| 190 | 2024-08-06 |
Renewable Time-Responsive DNA Circuits
2018-Jul-18, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.201801470
PMID:30022600
|
研究论文 | 本文展示了可再生和时间响应的DNA电路。 | 介绍了可手动恢复至原始状态的可再生DNA电路和时间响应DNA电路，能够在重置后正确计算输出。 | NA | 探讨DNA电路的可再生性和时间响应特性。 | 可再生和异步的DNA电路 | NA | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-06 |
Bubble DNA tweezer: A triple-conformation sensor responsive to concentration-ratios
2024-Mar-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109074
PMID:38361618
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型泡泡DNA镊子，能够基于目标信号比例进行三种不同的构象变化 | 提出了一种新型的泡泡DNA镊子，突破了传统DNA镊子仅能进行二元转变的限制 | NA | 探讨一种新型DNA传感器在复杂环境中的应用 | 泡泡DNA镊子及其对目标DNA/miRNA信号的定量能力 | 生物传感 | NA | DNA链置换 | NA | 信号浓度 | NA |
| 192 | 2024-08-06 |
An open-source, 3D printed inkjet DNA synthesizer
2024-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-53944-x
PMID:38355610
|
研究论文 | 本研究介绍了一种开源的喷墨DNA合成器，提供了易于构建、快速部署和灵活扩展的解决方案 | 开源设计结合3D打印和工业喷墨打印头，实现了低成本的自制合成器，适合学术实验室使用 | 对非专家用户的操作可能存在一定的学习曲线，且实际应用中可能受设备和材料限制 | 提供可靠的合成高密度寡核苷酸的解决方案 | 合成多点寡核苷酸并进行性能验证 | 合成生物学 | NA | 喷墨打印 | NA | 生物数据 | 144个点的寡核苷酸在15×25毫米的硅片上合成 |
| 193 | 2024-08-06 |
An electrochemical biosensor designed with entropy-driven autocatalytic DNA circuits for sensitive detection of ovarian cancer-derived exosomes
2024-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116060
PMID:38278121
|
研究论文 | 本文设计了一种电化学生物传感器，用于灵敏检测卵巢癌来源的外泌体 | 文章中提出了一种基于熵驱动自催化DNA电路的传感器，能够显著提高信号放大能力 | NA | 实现卵巢癌外泌体的灵敏和准确检测 | 卵巢癌细胞来源的外泌体 | 数字病理 | 卵巢癌 | 电化学传感 | 自催化DNA电路 | 电化学信号 | NA |
| 194 | 2024-08-06 |
An approach for state differentiation in nucleic acid circuits: Application to diagnostic DNA computing
2024-Mar-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.342266
PMID:38336407
|
研究论文 | 该研究介绍了一种区分核酸电路中不同状态的创新方法，强调生物学相关状态的选择性标记 | 该方法通过选择性标记生物学重要状态来简化电路设计并降低复杂性 | 研究中未提及具体样本规模和实验条件的限制 | 该研究的目的是开发一种更具成本效益的核酸电路状态区分方法 | 研究对象包括四个DNA逻辑门和两个检测模块，主要用于胎儿性别确定和X连锁遗传病的诊断 | 数字病理学 | NA | DNA计算 | DNA逻辑门 | 生物标志物 | NA |
| 195 | 2024-08-06 |
Molecular circuit for exponentiation based on the domain coding strategy
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1331951
PMID:38323242
|
研究论文 | 本文提出了一种新的DNA域编码方法用于逻辑计算。 | 提出基于领域编码策略的DNA域编码方法，简化分子逻辑电路结构并提高响应速度。 | 未提及具体的实验规模和适用范围，可能对某些应用有限制。 | 研究如何利用域编码策略构建高效的大规模复杂分子电路。 | 构建平方根和指数的分子电路，验证领域编码策略的优越性。 | 分子计算 | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-06 |
Tick extracellular vesicles impair epidermal homeostasis through immune-epithelial networks during hematophagy
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.10.566612
PMID:37986907
|
研究论文 | 这篇文章探讨蜱的细胞外囊泡如何通过免疫上皮网络损害表皮的稳态 | 揭示了蜱细胞外囊泡对组织修复网络的影响，尤其是影响了表皮γδ T细胞频率和功能 | 研究主要集中于三种医学相关蜱，从而可能限制了结果的广泛适用性 | 研究蜱如何通过细胞外囊泡影响皮肤修复和宿主的免疫反应 | 蜱的细胞外囊泡和小鼠模型 | 数字病理学 | 脊椎动物疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、流式细胞术、小鼠遗传学、体内显微镜 | NA | 皮肤样本 | 涉及三种医学相关蜱 |
| 197 | 2024-08-06 |
DNA data storage in electrospun and melt-electrowritten composite nucleic acid-polymer fibers
2024-Feb, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2023.100900
PMID:38234463
|
研究论文 | 本研究介绍了用于数字信息存储的复合核酸-聚合物纤维。 | 提出了一种通过电纺和熔融电写技术相结合的复合纤维用于DNA数据存储，以实现高密度信息存储。 | 尚存在如何确保存储介质的长期稳定性和高效提取的信息问题。 | 开发用于安全存储和检索DNA的介质。 | 复合核酸-聚合物纤维作为数字信息承载体。 | 纳米技术 | NA | 电纺纳米纤维技术，熔融电写技术 | NA | 数字信息，DNA序列 | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
The yin-yang codec for archival DNA storage
2022-Apr, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-022-00235-y
PMID:38177541
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-06 |
Key dependent information confidentiality scheme based on deoxyribonucleic acid (DNA) and circular shifting
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23572
PMID:38192866
|
研究论文 | 本文提出了一种结合DNA序列和四维超混沌映射的信息安全加密方案 | 创新点在于将DNA加密和超混沌技术结合以增强数字信息的安全性 | NA | 旨在设计一种强健安全的颜色图像加密方案 | 提取三种不同的DNA序列以生成加密密钥 | 计算机视觉 | NA | DNA加密、超混沌映射 | NA | 图像 | NA |
| 200 | 2024-08-06 |
CRISPR-Mediated Strand Displacement Logic Circuits with Toehold-Free DNA
2021-May-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.0c00649
PMID:33900064
|
研究论文 | 该文章报道了利用CRISPR-Cas系统设计无踏脚位双链DNA的逻辑电路 | 创新点在于实现了无踏脚位的双链DNA逻辑电路，使用了等温链置换的CRISPR-Cas系统 | 该研究未讨论实现的逻辑电路在实际应用中的可扩展性和稳定性 | 研究DNA计算中的逻辑电路设计和功能扩展 | 研究的对象是基于链置换的DNA逻辑电路 | DNA纳米技术 | NA | CRISPR-Cas系统 | NA | NA | NA |