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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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301 | 2024-08-07 |
Adaptive coding for DNA storage with high storage density and low coverage
2022-07-04, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-022-00233-w
PMID:35788589
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研究论文 | 本文提出了一种自适应编码的DNA存储系统,通过使用不同的编码方案和自适应生成编码约束阈值的方法,优化系统性能,实现了高存储密度和低读取覆盖率。 | 本文提出的自适应编码方法能够有效提高DNA存储的空间利用率,降低读取覆盖率,并优化系统各环节的运行效率。 | NA | 探索和优化DNA作为存储介质的应用,提高其存储密度和读取效率。 | DNA存储系统及其自适应编码方法。 | 生物信息学 | NA | DNA存储 | 自适应编码算法 | 图像、视频、PDF文件 | 698 KB的数据 |
302 | 2024-08-07 |
A Chimeric Conjugate of Antibody and Programmable DNA Nanoassembly Smartly Activates T Cells for Precise Cancer Cell Targeting
2022-09-05, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202205902
PMID:35751134
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研究论文 | 本文报道了一种智能分子平台,通过设计一种融合抗体和可编程DNA纳米装配的杂交偶联物,实现对肿瘤细胞的精确T细胞激活 | 通过集成多种适配体抗原识别于动态DNA电路中,实现了对肿瘤细胞上三重抗原的组合识别,并通过高阶逻辑操作实现选择性T细胞激活 | NA | 开发一种新型的合成免疫疗法策略,用于精确激活T细胞以对抗肿瘤细胞 | T细胞和肿瘤细胞 | 生物技术 | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
303 | 2024-08-07 |
Evaluating commercial thermoplastic materials in fused deposition modeling 3D printing for their compatibility with DNA storage and analysis by quantitative polymerase chain reaction
2022-07-14, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d2ay00772j
PMID:35766132
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研究论文 | 本研究评估了六种常见热塑性材料在熔融沉积成型(FDM)3D打印中的DNA存储和定量聚合酶链反应(qPCR)分析的兼容性 | 研究了不同热塑性材料及其颜色对DNA吸附的影响,并探索了通过调整3D打印层高来减少DNA吸附的方法 | 研究仅限于六种常见热塑性材料,未涵盖所有可能的3D打印材料 | 旨在表征FDM打印线材与核酸存储的兼容性,特别是通过qPCR进行分析 | 六种常见热塑性材料(PLA、尼龙、ABS、CPE、PC和PP)及其对DNA吸附的影响 | NA | NA | 熔融沉积成型(FDM)3D打印,定量聚合酶链反应(qPCR) | NA | DNA | 六种热塑性材料,包括两种不同长度的DNA片段(98碱基对和830碱基对) |
304 | 2024-08-07 |
Exponential Function Computation Based on DNA Strand Displacement Circuits
2022-06, IEEE transactions on biomedical circuits and systems
IF:3.8Q2
DOI:10.1109/TBCAS.2022.3184760
PMID:35727777
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研究论文 | 本文通过DNA链置换反应构建了加法、减法、乘法、除法、n次方和1/n次方门,并利用这六个DNA模拟计算门建立了指数函数的化学反应网络,进而构建了集成DNA链置换电路,实现指数函数多项式的计算。 | 本文创新地利用DNA链置换反应构建了多种计算门,并成功建立了指数函数的化学反应网络,实现了指数函数多项式的计算。 | NA | 研究如何利用DNA电路进行生物计算,特别是指数函数的计算。 | DNA链置换反应及其在生物计算中的应用。 | 生物计算 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | NA |
305 | 2024-08-07 |
Graph Computation Using Algorithmic Self-Assembly of DNA Molecules
2022-07-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.2c00120
PMID:35703038
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研究论文 | 本文提出了一种利用DNA折纸作为代理的并行计算方法,用于解决三色问题 | 该方法在计算算法上与现有的DNA计算方法完全不同,具有计算复杂度低和结果检测优势 | NA | 探索利用DNA分子进行图计算的新方法 | DNA折纸和三色问题 | 生物计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | DNA分子 | 约50 nm直径的DNA折纸 |
306 | 2024-08-07 |
Research Progress in Construction and Application of Enzyme-Based DNA Logic Gates
2023-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3181615
PMID:35679378
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综述 | 本文综述了基于酶的DNA逻辑门在信息处理领域的研究进展及其应用 | 探讨了利用高效的切割酶和聚合酶以及核酶构建DNA逻辑门的新方法 | NA | 旨在探讨基于酶的DNA逻辑门在信息、生物医学、化学和计算机领域的应用及未来发展 | 研究对象包括蛋白质酶、切割酶、聚合酶和核酶等 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | DNA逻辑门 | DNA分子 | NA |
307 | 2024-08-07 |
Design considerations for advancing data storage with synthetic DNA for long-term archiving
2022-Jun, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2022.100306
PMID:35677811
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研究论文 | 本文总结了使用合成DNA作为存储介质时采用的一般流程和技术,并分享了可持续工程设计考虑因素 | 本文探讨了如何通过可持续设计来开发一个高效且稳健的基于合成DNA的长期存档存储系统 | NA | 探讨如何通过设计考虑因素来提高基于合成DNA的长期数据存储系统的效率和可靠性 | 合成DNA作为长期数据存储介质的设计和应用 | NA | NA | 合成DNA | NA | 数字信息 | NA |
308 | 2024-08-07 |
A rational design of a cascaded DNA circuit for nanoparticle assembly and its application in the discrimination of single-base changes
2022-06-22, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d2tb00155a
PMID:35621087
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研究论文 | 本文设计了一种基于脚手架介导的链置换反应的可编程DNA组装电路,用于纳米颗粒的自组装,并应用于单碱基变化的鉴别 | 通过合理设计由两个回收环组成的级联电路,实现了纳米颗粒作为传感元件的自主反应预启动,有效减少了实际组装时间和信号泄露 | 目前研究中,纳米颗粒与寡核苷酸的修饰工作繁琐,组装时间长,电路泄露问题限制了其进一步和可扩展的应用 | 设计新型DNA电路,优化纳米颗粒组装过程,提高其在诊断应用中的效率和可靠性 | 纳米颗粒的自组装及其在单碱基变化鉴别中的应用 | 动态DNA纳米技术 | NA | 脚手架介导的链置换反应 | NA | NA | NA |
309 | 2024-08-07 |
Replication Compartments-The Great Survival Strategy for Epstein-Barr Virus Lytic Replication
2022-Apr-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms10050896
PMID:35630341
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综述 | 本文综述了Epstein-Barr病毒(EBV)裂解复制过程中复制隔室(RCs)的作用及其对病毒生存的重要意义 | NA | NA | 探讨复制隔室在EBV生存中的作用 | Epstein-Barr病毒的复制隔室及其功能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
310 | 2024-08-07 |
Quality Assessment of Cryopreserved Human Biological Samples from the Biobank of Barretos Cancer Hospital
2023-Feb, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2021.0131
PMID:35613409
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研究论文 | 本研究评估了Barretos癌症医院生物样本库中保存长达9年的冷冻保存样本的完整性和质量 | 研究了不同存储时间和温度对冷冻保存样本核酸完整性的影响,特别是RNA的完整性 | NA | 了解时间和温度对冷冻保存样本质量的影响 | 冷冻保存的肿瘤组织和外周血单个核细胞样本 | 数字病理学 | NA | RNA完整性评估(RIN)和DNA完整性评估(DIN) | NA | 生物样本 | 447个样本,包括肿瘤组织和外周血单个核细胞 |
311 | 2024-08-07 |
DeSP: a systematic DNA storage error simulation pipeline
2022-May-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-022-04723-w
PMID:35581548
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeSP的系统性DNA存储错误模拟管道,用于模拟DNA存储过程中的错误并优化编码冗余 | DeSP能够模拟DNA存储各阶段的错误,并系统性地指导编码冗余的优化 | NA | 解决DNA数据存储中处理通道引入的噪声和优化错误纠正码冗余与信息存储密度之间的平衡问题 | DNA存储过程中的错误模拟和冗余优化 | 生物信息学 | NA | DNA存储错误模拟 | NA | DNA序列 | NA |
312 | 2024-08-07 |
Forensic DNA profiling in the southern border provinces of Thailand: Ethical and regulatory issues
2022-Jul, Forensic science international
IF:2.2Q1
DOI:10.1016/j.forsciint.2022.111322
PMID:35533636
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研究论文 | 本文探讨了泰国南部边境省份法医DNA分析的使用及其伦理和监管问题 | NA | NA | 分析法医DNA分析在刑事调查中的应用及其相关的法律、伦理和社会问题 | 法医DNA分析技术及其在泰国南部边境省份的应用 | NA | NA | DNA分析 | NA | DNA样本 | NA |
313 | 2024-08-07 |
Fuel-Powered DNA Nanomachines for Biosensing and Cancer Therapy
2022-05, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202200098
PMID:35535792
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综述 | 本文综述了燃料驱动的DNA纳米机器的设计机制及其在生物成像和癌症治疗中的最新研究进展 | 燃料驱动的DNA纳米机器具有优异的细胞穿透性和生物相容性,能够在活体系统中执行各种特定任务,如生物标志物成像、DNA计算和癌症治疗 | NA | 探讨燃料驱动的DNA纳米机器的设计及其在生物分析和癌症治疗中的应用 | 燃料驱动的DNA纳米机器及其在生物成像和癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
314 | 2024-08-07 |
Site-specific functionalization with amino, guanidinium, and imidazolyl groups enabling the activation of 10-23 DNAzyme
2020-May-14, RSC advances
IF:3.9Q2
DOI:10.1039/d0ra02226h
PMID:35518333
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研究论文 | 本文研究了通过特定位置的功能化修饰,包括氨基、胍基和咪唑基团,来激活10-23 DNAzyme的方法 | 提出了一种基于腺嘌呤碱基的化学激活方法,通过引入氨基、胍基和咪唑基团到催化核心,实现更高效的DNAzyme | NA | 探索10-23 DNAzyme的更高效催化方法 | 10-23 DNAzyme的催化性能 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
315 | 2024-08-07 |
Modular Assembly of a Concatenated DNA Circuit for In Vivo Amplified Aptasensing
2022-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202200983
PMID:35460185
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研究论文 | 本文设计了一种基于多层非酶催化DNA电路的适体传感系统,用于在活体小鼠中进行生物活性分子的原位成像 | 该系统通过组装高分子量和高信号增益的分支DNA共聚物,基于雪崩模拟的杂交链反应(HCRs),实现了高灵敏度、准确性和适应性的体内成像 | NA | 开发一种高灵敏度和准确性的体内适体传感系统,用于生物活性分子的精确分析和成像 | 生物活性分子在活体小鼠中的成像 | 分子成像 | NA | 杂交链反应(HCRs) | NA | NA | 活体小鼠 |
316 | 2024-08-07 |
Construction of Multiple Logic Circuits Based on Allosteric DNAzymes
2022-03-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12040495
PMID:35454084
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研究论文 | 本文提出了一种基于别构DNAzymes构建多逻辑电路的策略,通过控制DNAzymes保守域的二级结构来调节其活性,实现了基本逻辑门及其级联电路,并引入了一种具有一票否决功能的三输入DNA投票器。 | 本文通过控制DNAzymes的二级结构,避免了四通结的产生,并实现了基本逻辑门及其级联电路,同时通过别构二级结构实现了三输入DNA投票器的一票否决功能,提高了系统的可扩展性。 | NA | 开发一个基于简单机制的具有复杂逻辑功能的系统,并在同一系统中实现基本逻辑门及其级联电路。 | DNA计算中的复杂和稳定逻辑操作的实现。 | DNA计算 | NA | DNAzymes | NA | NA | NA |
317 | 2024-08-07 |
One-step isothermal amplification strategy for microRNA specific and ultrasensitive detection based on nicking-assisted entropy-driven DNA circuit triggered exponential amplification reaction
2022-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2022.339706
PMID:35361424
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研究论文 | 本文介绍了一种基于切口辅助熵驱动DNA电路触发指数放大反应(NAED-EXPAR)的一步等温放大策略,用于超灵敏和特异性检测microRNA(miRNA)。 | 首次采用NAED-EXPAR方法,通过切口辅助熵驱动DNA电路特异性识别目标miRNA,实现高效的信号放大,其放大效率优于单一的EXPAR方法。 | NA | 开发一种新的等温放大策略,用于超灵敏和特异性检测miRNA,以支持早期癌症诊断。 | microRNA(miRNA)的特异性和超灵敏检测。 | 生物技术 | 胰腺癌 | 切口辅助熵驱动DNA电路触发指数放大反应(NAED-EXPAR) | NA | DNA | NA |
318 | 2024-08-07 |
Single-Molecule Resettable DNA Computing via Magnetic Tweezers
2022-04-13, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.2c00183
PMID:35357200
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研究论文 | 本文通过磁力镊子控制拉伸力,实现了基于单分子DNA的计算 | 开发了一种实时、无标记、力控制的单分子DNA计算系统,通过磁力镊子实现对DNA扩展信号的实时追踪,并实现了可控动力学的TMSD反应 | NA | 探索分子计算的新方法 | 单分子DNA计算 | 生物传感 | NA | 磁力镊子 | NA | DNA | 单分子 |
319 | 2024-08-07 |
Monte Carlo simulations of nanodosimetry and radiolytic species production for monoenergetic proton and electron beams: Benchmarking of GEANT4-DNA and LPCHEM codes
2022-May, Medical physics
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/mp.15609
PMID:35318686
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研究论文 | 本研究通过蒙特卡罗模拟方法,对比了Geant4-DNA和LPCHEM两种代码在单能质子和电子束下的纳米剂量学和辐射分解产物生成方面的性能 | 首次全面对比了两种蒙特卡罗轨迹结构代码的物理、物理化学和化学模型,并对水辐射分解模拟的影响进行了广泛分析 | NA | 旨在对比两种蒙特卡罗轨迹结构代码Geant4-DNA和LPCHEM,评估它们在辐射治疗中估计离子生物效应的效用 | 单能质子束(10 MeV)和电子束(1 MeV)的特定能量谱以及辐射分解产物生成 | 计算机模拟 | NA | 蒙特卡罗轨迹结构模拟 | Geant4-DNA和LPCHEM | 能量谱和化学产率 | 1000个初级粒子 |
320 | 2024-08-07 |
A high-integrated DNA biocomputing platform for MicroRNA sensing in living cells
2022-Jul-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2022.114183
PMID:35303538
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research paper | 本研究开发了一种配备适配体的高集成DNA生物计算平台(HIDBP-A),具有双重识别功能,可实现癌细胞靶向 | 通过将所有计算元件集成到同一DNA四面体中,利用局部高浓度计算元件的限制效应,大幅提高了逻辑计算速度和效率 | NA | 开发一种新型的DNA生物计算平台,用于疾病诊断和逻辑控制的治疗 | 癌细胞中的微RNAs | 生物技术 | 癌症 | DNA逻辑计算 | DNA四面体 | DNA | NA |