生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
A versatile and convenient tool for regulation of DNA strand displacement and post-modification on pre-fabricated DNA nanodevices
2023-01-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac1193
PMID:36537218
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cap的新型调控工具，用于DNA链置换反应的微调及预制DNA纳米器件的后修饰 | Cap工具能够在不改变原始反应序列的情况下，实现对DNA链置换反应速率的微调及可擦除性，并进一步开发了三种高级功能，实现了对预制DNA电路的个性化定制后修饰 | NA | 开发一种新型调控工具，以实现对DNA纳米技术的标准化、包装化设备的个性化后修饰 | DNA链置换反应及预制DNA纳米器件 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换反应 | NA | DNA序列 | NA |
| 222 | 2024-08-07 |
Construction of a scalable DNA computing nano-system for large-scale and complex logical operations
2023-01-30, Nanoscale horizons
IF:8.0Q1
DOI:10.1039/d2nh00525e
PMID:36524605
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研究论文 | 本研究设计了一种基于多功能DNA纳米结构的反应平台，实现了大规模和复杂逻辑运算的可扩展DNA计算系统 | 首次成功进行了连续整数的平方根和立方根计算，并保留了小数点后两位数字 | NA | 解决DNA计算中逻辑电路操作范围的扩展和电路集成与可扩展性的关键问题 | DNA计算系统的可扩展性和复杂逻辑运算能力 | 生物计算 | NA | DNA纳米技术 | NA | 荧光信号 | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
An allosteric DNA switch-mediated catalytic DNA circuit for ratiometric and sensitive nucleic acid detection
2022-12-22, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d2ay01751b
PMID:36504112
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研究论文 | 本文提出了一种基于配体调控DNA开关的催化DNA电路反应策略，用于比率式和敏感的核酸检测 | 该研究创新性地利用了配体调控DNA开关和脚趾介导的链置换反应（TSDR），形成了一个互惠的链置换网络，实现了信号放大和比率式信号响应 | NA | 开发一种新的核酸检测方法，实现高灵敏度和选择性的检测 | 核酸检测 | 生物传感器 | NA | 脚趾介导的链置换反应（TSDR） | DNA电路 | 核酸 | NA |
| 224 | 2024-08-07 |
DNA computing for gastric cancer analysis and functional classification
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1064715
PMID:36506309
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研究论文 | 本文利用DNA链置换机制（DSD）构建了用于癌症分析的DNA计算系统，并通过基因芯片和加权基因共表达网络分析（WGCNA）识别了关键的微小RNA生物标志物。 | 本文创新地使用了DNA链置换机制构建计算系统，实现了无实验室环境的临床意义重大的癌症分析。 | NA | 旨在通过DNA计算系统实现快速准确的癌症诊断。 | 胃癌分析和功能分类的关键生物标志物。 | 数字病理学 | 胃癌 | DNA链置换机制（DSD） | 加权基因共表达网络（WGCNA） | 微小RNA数据和临床特征 | 数据来自癌症基因组图谱（TCGA）数据库 |
| 225 | 2024-08-07 |
Neuronal cultures playing Pong: First steps toward advanced screening and biological computing
2022-12-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2022.11.010
PMID:36480938
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研究论文 | 本文通过在培养的神经元中实现学习-在-盘，向器官智能迈出了重要一步 | 该系统可能补充对认知的分子和细胞机制的研究，并允许在神经发育或神经退行性疾病以及生物计算方面的创新 | NA | 探索神经元培养系统在认知机制研究和生物计算中的应用 | 神经元培养系统 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
Colorimetric aptasensor for the sensitive detection of ochratoxin A based on a triple cascade amplification strategy
2023-Jan-02, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2022.340616
PMID:36442942
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research paper | 本文介绍了一种基于三重级联放大策略的比色适体传感器，用于高灵敏度检测赭曲霉素A。 | 该研究采用了熵驱动DNA电路、催化发夹组装和Mg辅助DNA酶催化三重级联放大策略，显著提高了检测灵敏度和选择性。 | NA | 开发一种灵敏、准确、简单且成本效益高的检测方法，以保障食品安全和质量控制。 | 赭曲霉素A的检测。 | NA | NA | 比色法 | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
Multiple errors correction for position-limited DNA sequences with GC balance and no homopolymer for DNA-based data storage
2023-01-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac484
PMID:36410731
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研究论文 | 本文提出了一种名为DNA-LC的新型编码方案，用于在DNA数据存储中减少和纠正插入、删除和替换错误，该方案能将二进制序列转换为满足GC平衡和游程限制的DNA碱基序列 | DNA-LC编码模式能够检测并纠正多重错误，其错误纠正能力高于针对单链中单个错误纠正的其他方法 | NA | 旨在减少和纠正DNA数据存储中的错误 | DNA序列中的插入、删除和替换错误 | NA | NA | NA | NA | DNA序列 | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
An automated DNA computing platform for rapid etiological diagnostics
2022-11-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ade0453
PMID:36427311
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研究论文 | 开发了一种基于自动化DNA计算的平台，用于快速准确地诊断急性呼吸道感染的病因 | 该平台能够在分子水平上实施经过计算机训练的分类模型，通过七种不同的mRNA表达模式在4小时内准确诊断ARI病因 | NA | 开发一种快速、准确、低成本且自动化的诊断平台，用于急诊部门或即时护理诊所的疾病病因诊断 | 急性呼吸道感染的病因分类 | 数字病理学 | 急性呼吸道感染 | DNA计算 | 分类模型 | mRNA表达模式 | 80个临床样本 |
| 229 | 2024-08-07 |
Calibration-free counting of low molecular copy numbers in single DNA-PAINT localization clusters
2021-Dec-08, Biophysical reports
IF:2.4Q3
DOI:10.1016/j.bpr.2021.100032
PMID:36425461
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研究论文 | 本文介绍了一种名为lbFCS+的扩展概念，能够在单个DNA-PAINT图像中对单个定位簇的分子拷贝数进行绝对计数 | lbFCS+通过精确测量DNA-PAINT成像中荧光标记的寡核苷酸（'成像器'）的局部杂交速率，实现了对单个纳米尺度体积内荧光位点的绝对计数，无需参考校准 | NA | 开发一种无需预先了解染料光物理学或参考校准的分子计数方法 | DNA-PAINT成像中的单个定位簇内的分子拷贝数 | 生物传感 | NA | DNA-PAINT | lbFCS+ | 图像 | 包含多达10个停靠链的定位簇 |
| 230 | 2024-08-07 |
A functional RNA/DNA circuit for one-pot detection of SARS-CoV-2 RNA
2022-Dec-06, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d2cc05251b
PMID:36383079
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研究论文 | 本文提出了一种基于功能性RNA/DNA电路的简单方法，用于检测SARS-CoV-2 RNA | 该方法巧妙地整合了核酸电路技术和CRISPR/cas12a系统，能够在一步骤中实现对目标RNA的飞摩尔级检测 | NA | 开发一种简单有效的方法用于检测SARS-CoV-2 RNA | SARS-CoV-2 RNA | NA | COVID-19 | CRISPR/cas12a系统 | NA | RNA | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Neuromorphic quantum computing
2022-Oct, Physical review. E
DOI:10.1103/PhysRevE.106.045311
PMID:36397478
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研究论文 | 本文展示了神经形态计算可以执行量子操作，通过将尖峰神经元的状态与Ising自旋的两个状态相连接，并从Ising自旋的期望值和相关性构建量子密度矩阵。 | 本文提出了一种超越马尔可夫链的概率计算方法，不基于转换概率，而是通过约束经典概率分布来模拟量子系统的纠缠特性。 | NA | 探索神经形态计算在量子操作中的应用 | 神经形态计算与量子计算的结合 | 量子计算 | NA | 量子计算 | 神经网络 | 量子系统 | 两量子比特系统 |
| 232 | 2024-08-07 |
Levy Equilibrium Optimizer algorithm for the DNA storage code set
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0277139
PMID:36395269
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研究论文 | 本文提出了一种Levy均衡优化器（LEO）算法，用于构建满足组合约束的DNA存储代码集 | 提出的LEO算法在13个基准函数上测试，获得了4个新的全局最优解，并改进了DNA存储代码集的下限 | NA | 研究如何通过优化算法提高DNA存储代码集的性能 | DNA存储代码集及其优化算法 | 生物信息学 | NA | Levy Equilibrium Optimizer (LEO)算法 | NA | DNA序列 | 13个基准函数 |
| 233 | 2024-08-07 |
Improved Bare Bones Particle Swarm Optimization for DNA Sequence Design
2023-Jul, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2022.3220795
PMID:36350858
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研究论文 | 本文提出了一种改进的裸骨粒子群优化算法（IBPSO）用于DNA序列设计 | 使用动态透镜对立学习初始化种群以提高多样性，设计基于信噪比距离的进化策略平衡探索与开发，并引入入侵杂草优化算法与小生境拥挤机制消除低质量解 | 未提及 | 解决DNA序列设计问题，提高DNA编码质量 | DNA序列设计 | 计算生物学 | NA | 粒子群优化算法 | IBPSO | DNA序列 | 未提及 |
| 234 | 2024-08-07 |
FMG: An observable DNA storage coding method based on frequency matrix game graphs
2022-12, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106269
PMID:36356390
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研究论文 | 提出了一种基于频率矩阵游戏图（FMG）的DNA存储编码方法，用于生成满足组合约束的DNA存储编码 | 该方法具有确定性，能清晰解释编码过程，并且编码结果具有可观测特性，优于先前发表的结果 | NA | 开发一种高效且合理的DNA存储编码方法 | DNA存储编码方法及其性能 | 生物信息学 | NA | 频率矩阵游戏图（FMG） | NA | DNA序列 | 当编码长度n=10，汉明距离d=4时，编码集大小比先前结果提高24% |
| 235 | 2024-08-07 |
Applications of Terminal Deoxynucleotidyl Transferase Enzyme in Biotechnology
2023-03-01, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202200510
PMID:36342345
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综述 | 本文综述了终端脱氧核苷酸转移酶（TdT）在生物技术中的独特性质和应用 | TdT酶能够催化模板独立地逐步添加核苷酸到寡核苷酸链上，这一独特性质使其在多种应用中得到显著增加 | NA | 探讨TdT酶作为生物技术工具的独特性质和应用，并展望其在未来的发展 | TdT酶在生物传感、多/寡核苷酸合成、DNA存储、DNA纳米结构合成和适配体开发中的应用 | 生物技术 | NA | 终端脱氧核苷酸转移酶（TdT） | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
Colorimetric aptasensor for fumonisin B1 detection based on the DNA tetrahedra-functionalized magnetic beads and DNA hydrogel-coated bimetallic MOFzyme
2023-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2022.130252
PMID:36327850
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研究论文 | 本文开发了一种基于DNA四面体功能化磁珠和DNA水凝胶包覆的双金属MOFzyme的比色适体传感器，用于检测伏马菌素B1。 | 该传感器通过DNA四面体功能化磁珠捕获伏马菌素B1，并触发DNA水凝胶中的熵驱动DNA电路，释放双金属MOFzyme，产生与伏马菌素B1浓度相关的比色信号。 | NA | 开发一种新型的比色适体传感器，用于定量检测伏马菌素B1，以应对其对公共健康和环境的威胁。 | 伏马菌素B1的检测。 | 环境监测 | NA | 比色法 | NA | 比色信号 | 检测范围为5 × 10至50 ng/mL，检测限为0.38 pg/mL。 |
| 237 | 2024-08-07 |
Microneedle Array Encapsulated with Programmed DNA Hydrogels for Rapidly Sampling and Sensitively Sensing of Specific MicroRNA in Dermal Interstitial Fluid
2022-11-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.2c06261
PMID:36326107
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研究论文 | 本文报道了一种封装有编程DNA水凝胶的微针阵列，用于快速富集和敏感检测皮肤间质液中的特定microRNA | 该技术利用甲基丙烯酸透明质酸（MeHA）与智能DNA电路水凝胶系统（MeHA/DNA），通过级联脚趾介导的DNA位移反应触发荧光放大，实现对低丰度microRNA的敏感检测 | NA | 开发一种用于快速且敏感检测皮肤间质液中microRNA的新技术 | microRNA在皮肤间质液中的检测 | 生物技术 | NA | DNA位移反应 | NA | 荧光信号 | 在5分钟内提取0.97 ± 0.2 mg的皮肤间质液 |
| 238 | 2024-08-07 |
Modularized Enzymatic Tandem Reaction for tsRNA Detection
2022-11-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c04010
PMID:36325814
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RT-NExT的模块化酶级联反应，用于检测tRNA衍生的小RNA（tsRNA），作为乳腺癌早期诊断和预后预测的新生物标志物。 | RT-NExT反应通过模块化设计，能够独立工作或组装，提高了设计的灵活性和检测的准确性。 | NA | 开发一种新的检测方法，用于乳腺癌的早期诊断和预后评估。 | tRNA衍生的小RNA（tsRNA） | NA | 乳腺癌 | NA | NA | RNA | 10 M ts-66或ts-86 |
| 239 | 2024-08-07 |
ADAR regulates APOL1 via A-to-I RNA editing by inhibition of MDA5 activation in a paradoxical biological circuit
2022-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210150119
PMID:36282916
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研究论文 | 研究ADAR通过抑制MDA5激活在生物电路中调控APOL1的机制 | 发现ADAR通过A-to-I RNA编辑调控APOL1表达，影响APOL1相关肾脏疾病的渗透率和严重程度 | NA | 探讨ADAR对APOL1表达的调控机制及其在肾脏疾病中的作用 | ADAR、APOL1、MDA5以及它们在肾脏疾病中的相互作用 | NA | 肾脏疾病 | A-to-I RNA编辑 | NA | RNA | 人类肾组织、足细胞、转基因APOL1小鼠模型 |
| 240 | 2024-08-07 |
Stochastic dynamics of Type-I interferon responses
2022-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1010623
PMID:36269758
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研究论文 | 研究了JAK-STAT信号通路中干扰素α反应诱导的变异性的来源 | 整合时间分辨流式细胞仪数据和JAK-STAT信号通路的随机建模，量化了通路不同步骤的内在变异性 | NA | 探究干扰素α反应诱导的变异性的来源及其对JAK-STAT信号通路的影响 | 干扰素α反应的变异性及其在JAK-STAT信号通路中的作用 | NA | NA | 流式细胞术 | 随机模型 | 时间序列数据 | 未具体说明样本数量 |