生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 875 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-05 |
Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway
2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.117109
PMID:39756268
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研究论文 | 提出一种基于谷胱甘肽激活的DNA电路，通过连续响应机制实现microRNA的高保真成像及相关调控通路的原位解析 | 通过将二硫键整合到预封闭核酸探针中，有效控制电路信号泄漏，实现时空选择性microRNA成像 | 未明确说明该系统的检测灵敏度极限和在实际生物样本中的验证范围 | 开发高保真生物分子成像技术，探索生物分子相互作用网络 | microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH）的相互作用 | 分子计算 | 癌症 | DNA电路技术，非酶催化信号放大 | 催化DNA电路 | 分子成像数据 | 多种癌细胞类型 | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可实现不同生物分子相互作用的稳健分析和探索 |
| 202 | 2025-10-05 |
Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification
2025-Jan-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c18752
PMID:39760699
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研究论文 | 开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，通过两步DNA电路放大实现啶虫脒的高灵敏检测 | 结合能量转移机制、两步DNA电路放大（熵驱动DNA循环和DNA步行器）和双模式传感策略，实现了超灵敏的农药检测 | 未明确说明实际样品检测的复杂基质干扰问题 | 开发高灵敏度和准确度的啶虫脒检测方法以保障食品安全 | 农药啶虫脒 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、电化学发光检测、DNA电路放大、核酸适配体识别 | NA | 化学传感信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | 检测范围0至1×10 M，检测限20.2 fM（PEC模式）和17.5 fM（ECL模式） |
| 203 | 2025-10-05 |
miR-Cabiner: A Universal microRNA Sensing Platform Based on Self-Stacking Cascaded Bicyclic DNA Circuit-Mediated CRISPR/Cas12a
2025-Jan-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05370
PMID:39704707
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研究论文 | 开发基于自堆叠级联双环DNA电路介导CRISPR/Cas12a的通用microRNA检测平台miR-Cabiner | 将催化发夹组装和杂交链式反应整合为统一电路并级联至CRISPR/Cas12a系统，实现高反应速率和通用性 | 未明确说明检测限的具体数值和实际临床应用验证规模 | 开发高灵敏度通用型microRNA检测平台用于临床诊断 | 与乳腺癌诊断、分期和预后相关的microRNA（miR-130a、miR-10b、miR-21、miR-1285） | 分子诊断 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas12a、催化发夹组装、杂交链式反应、DNA电路 | NA | 核酸序列 | 四种microRNA面板分析 | DNA | NA | 分子计算 | 检测灵敏度达fM级别 |
| 204 | 2025-10-05 |
Instruction-responsive programmable assemblies with DNA origami block pieces
2025-Jan-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1193
PMID:39698832
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研究论文 | 本研究开发了具有八个可编程边缘的DNA折纸构建块，可通过指令集组装成特定二维阵列 | 设计了标准化的DNA折纸构建块和指令系统，实现了确定性和非确定性组装，并能执行布尔逻辑计算 | 未明确说明系统在更复杂结构组装中的效率和错误率 | 开发可编程的有限尺度DNA自组装系统 | DNA折纸构建块及其组装结构 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子结构数据 | NA | DNA | 二进制编码 | DNA计算,分子计算 | 双单元系统可生成48种不同DNA阵列，支持复杂二维结构组装 |
| 205 | 2025-10-05 |
Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics
2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202416004
PMID:39606901
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的集成化DNA数据存储系统，实现从合成到测序的完整流程 | 采用200纳米磁珠和数字微流控技术构建紧凑型DNA存储管道，结合三酶级联反应和重复焦磷酸测序，显著提升存储速度至49分钟/字节 | 概念验证仅存储8字节数据，样本规模较小 | 开发高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统 | DNA数据存储系统 | 分子计算 | NA | 数字微流控、焦磷酸测序、磷酰胺化学合成 | NA | 数字数据 | 8字节数据 | DNA | 霍夫曼编码, 里德-所罗门纠错码 | DNA计算 | 存储速度49分钟/字节，核苷酸准确率超过95% |
| 206 | 2025-10-05 |
Adaptive Arithmetic Coding-Based Encoding Method Toward High-Density DNA Storage
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0697
PMID:39544175
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研究论文 | 提出一种基于自适应算术编码的高密度DNA存储编码方法 | 将自适应算术编码应用于DNA存储，通过三阶段编码流程（压缩、纠错、映射）提高存储密度和数据完整性 | 仅通过仿真实验验证，未在实际生物环境中测试 | 开发高密度、高可靠性的DNA数据存储编码方法 | 文本、图片和音频等多种格式的数字文件 | DNA存储 | NA | 自适应算术编码(AAC)、预测部分匹配(PPM)、八进制汉明码 | NA | 文本、图像、音频 | 多种格式文件的编码验证 | DNA | 自适应算术编码, 八进制汉明码, 3-2码映射 | DNA计算 | 平均编码密度达每个核苷酸3.25个碱基，GC含量稳定在50%，同聚物长度不超过2 |
| 207 | 2025-10-05 |
Cost-Effective DNA Storage System with DNA Movable Type
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411354
PMID:39555674
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研究论文 | 提出了一种受活字印刷启发的DNA可移动类型存储系统，用于实现经济高效的大数据存储 | 引入DNA可移动类型概念，通过预制的DNA片段重复使用，避免每次存储都需要从头合成完整DNA序列 | 仅测试了43.7KB数据，尚未验证更大规模数据的存储能力 | 开发成本效益高的DNA数据存储系统 | 数字数据文件（文本、图像、音频、视频） | DNA存储技术 | NA | DNA合成、酶连接组装、喷墨打印技术 | NA | 多格式数据（文本、图像、音频、视频） | 43.7KB数据文件，使用350个DNA可移动类型 | DNA | 特定有效载荷、地址和校验和数据编码 | DNA计算 | 存储成本$122/MB，每个DNA可移动类型可重复使用10000次 |
| 208 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
|
综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径，整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |
| 209 | 2025-10-05 |
Programmable Primer Switching for Regulating Enzymatic DNA Circuits
2024-02-13, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.3c12000
PMID:38286819
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研究论文 | 提出一种通过引入可切换导线实现酶促DNA电路可编程调控的引物切换调控方法 | 开发了引物切换调控机制，无需重构基础电路框架即可通过添加切换导线实现复杂功能 | 未明确说明实验规模和数据量限制 | 开发更灵活便捷的酶促DNA电路调控方法 | 酶促DNA电路和引物调控机制 | DNA计算 | NA | DNA链置换反应(SDRs) | NA | 分子电路数据 | NA | DNA | NA | DNA计算,分子计算 | 支持级联、扇入/扇出、双轨、前馈和反馈等复杂电路功能 |
| 210 | 2025-10-05 |
Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform
2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309867
PMID:38048539
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控超大规模集成平台实现DNA存储数据快速读取的方法 | 结合微流控VLSI平台实现高度并行化DNA数据读取，并通过片上熔解曲线分析解码多状态DNA编码数据 | 未提及具体存储容量限制和错误率数据 | 开发快速、低成本的DNA数据检索技术 | DNA存储系统中的编码数据 | DNA存储技术 | NA | 微流控VLSI平台、熔解曲线分析、DNA识别技术 | NA | DNA编码数据 | NA | DNA | 多状态编码 | DNA计算 | 可扩展平台，支持高度并行数据读取 |
| 211 | 2025-10-05 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
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研究论文 | 开发了一种基于空间控制邻近分裂镊子开关的DNA电路构建策略，用于增强生物分子信号转导 | 利用双链镊子结构的刚性与发夹锁的阻碍效应协同作用，有效减少电路泄漏，并实现多类型靶标检测 | 未明确说明具体实验规模和应用场景的局限性 | 开发高效低泄漏的DNA电路构建方法，实现多功能生物分子信号转导 | 核酸、小分子和蛋白质等生物分子靶标 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应，邻近分裂镊子开关技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可扩展的复杂性，系统兼容性，适用于复杂转导网络构建 |
| 212 | 2025-10-05 |
A generative adversarial network for multiple reads reconstruction in DNA storage
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83806-5
PMID:39738820
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研究论文 | 提出一种基于生成对抗网络的DNA存储多读段重建方法，将多读段转换为噪声图像并通过条件GAN生成共识序列 | 首次将生成对抗网络应用于DNA存储的多读段重建，能够处理第三代测序技术的高错误率数据 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的性能表现 | 解决DNA存储中因合成、PCR和测序过程导致的读段错误问题 | DNA存储系统中的多读段数据 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序，下一代测序 | GAN，条件生成对抗网络 | DNA测序读段，图像表示 | 两个真实数据集 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 可处理高达5.9%错误率的序列，在20%读段污染情况下仍保持鲁棒性 |
| 213 | 2025-10-05 |
Solving Minimum Spanning Tree Problems Based on DNA Chemical Reaction Networks
2025-Mar-18, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA链置换反应网络解决最小生成树问题的新型计算方法 | 首次将DNA链置换反应网络应用于图论中的最小生成树问题求解，创新性地整合了加权、阈值和求和三个反应模块 | 目前仅通过软件模拟验证，尚未进行实际生物实验验证 | 探索DNA计算在解决图论经典问题中的应用潜力 | 图论中的最小生成树问题 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应 | DNA化学反应网络模型 | DNA序列数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算,分子计算 | 通过荧光强度进行阈值筛选，能够处理复杂图论问题 |
| 214 | 2025-10-05 |
Biotechnological tools boost the functional diversity of DNA-based data storage systems
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.02.002
PMID:40027441
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综述 | 本文总结了生物技术工具如何增强DNA数据存储系统的功能多样性 | 系统阐述了基于DNA分子序列特异性、封装和高维结构的生物技术工具如何实现随机访问、搜索和数据操作等新功能 | 使用生化反应会阻碍更精确高效信息存储系统的发展 | 探讨DNA数据存储系统的功能扩展和技术发展 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | 分子生物学、纳米技术 | NA | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、数据密度、访问时间、错误率、耐久性 |
| 215 | 2025-10-05 |
Three-Point-Star Deoxyribonucleic Acid Tiles with the Core Arm Length at Three Half-Turns for Two-Dimensional Archimedean Tilings and Beyond
2024-05-14, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.4c00985
PMID:38686650
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研究论文 | 本文报道了利用核心臂长为三个半螺旋的三点星DNA瓦片构建二维阿基米德铺砌和复杂镶嵌图案的研究 | 开发了新型3PSO DNA瓦片，通过中心交叉杂交编织结构实现了多种二维铺砌图案的构建，并首次将3PSO与4PSO、2PSO瓦片组合形成复杂镶嵌 | 研究中使用的DNA寡核苷酸支架长度固定为96-nt，可能限制了结构的多样性 | 探索新型DNA瓦片在构建复杂二维纳米结构中的应用 | 三点星DNA瓦片及其组装形成的二维纳米结构 | DNA纳米技术 | NA | DNA自组装技术，交叉杂交编织 | NA | 分子结构数据 | 使用96-nt长度的环形DNA寡核苷酸作为支架 | DNA | NA | DNA计算 | 能够构建复杂的二维镶嵌图案，在纳米制造、DNA计算和生物医学中具有广泛应用潜力 |
| 216 | 2025-10-05 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
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研究论文 | 介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 将光响应性邻硝基苯基磷酸酯笼状DNA发夹与'静默'反应模块集成，实现光控瞬态DNA电路/网络的动态操作 | NA | 开发光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | DNA反应电路、宪法动态网络(CDN)、凝血酶催化纤维蛋白原凝固过程 | 分子计算 | NA | 光解保护技术、DNA计算 | 计算动力学模型 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算,分子计算 | NA |
| 217 | 2025-10-05 |
Programming and monitoring surface-confined DNA computing
2024-02, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.107080
PMID:38183684
|
综述 | 系统评述表面受限DNA计算的编程与监测方法及其应用 | 首次系统总结不同表面（DNA折纸、纳米颗粒、脂质膜和芯片）对DNA计算的限制效应及其操控方法 | 未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献的归纳分析 | 探讨表面受限DNA计算系统的设计原理、监测技术及应用前景 | 基于表面反应的DNA计算系统 | 分子计算 | NA | DNA计算，表面反应技术 | NA | 分子相互作用数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 相较于溶液体系具有更高的特异性和计算速度 |
| 218 | 2025-10-05 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种基于流式细胞分选技术的DNA数据存储方法，通过封装荧光DNA微粒增强数据稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装技术保护DNA结构完整性 | NA | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 封装荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞分选技术，层层自组装封装，微流控芯片 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高密度DNA负载，长期稳定性，随机读取能力 |
| 219 | 2025-10-05 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 开发了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于活体内microRNA成像和光热治疗 | 通过近红外激光功率调控实现时空选择性microRNA成像和成像引导的按需治疗 | 未明确说明实验样本数量和具体技术参数 | 开发精确癌症诊断和高效治疗的纳米诊疗平台 | microRNA-21和癌细胞 | 生物医学工程 | 癌症 | 熵驱动链置换反应、光热治疗、荧光成像 | DNA纳米平台 | 荧光信号、图像数据 | NA | DNA | DNA链置换编码 | 分子计算 | 时空选择性成像和按需治疗能力 |
| 220 | 2025-10-05 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
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研究论文 | 本研究揭示质子泵抑制剂奥美拉唑对类蛋白质自发放电特性的显著影响及其在非常规计算领域的应用潜力 | 首次发现奥美拉唑可调控类蛋白质的放电特性，并将其与布尔逻辑结合开拓生物计算新范式 | 研究仅聚焦单一药物作用，尚未系统探索其他质子调节剂的影响机制 | 探索药物调控下生物分子系统的计算潜力 | 类蛋白质（proteinoids）与奥美拉唑的相互作用系统 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑分析、电信号记录 | NA | 电生理信号 | NA | 蛋白质 | 布尔编码 | 分子计算, 生物计算 | 通过药物浓度调控实现放电模式的可编程性 |