生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 757 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-09-14 |
GradHC: highly reliable gradual hash-based clustering for DNA storage systems
2024-05-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae274
PMID:38648049
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GradHC的基于哈希的渐进式聚类算法，用于DNA存储系统中的DNA读取聚类 | GradHC算法能够以高精度聚类各种类型的设计，包括不同长度的链、不同大小的簇以及不同错误范围 | NA | 解决DNA存储系统中DNA读取聚类的挑战 | DNA存储系统中的DNA读取 | NA | NA | 聚类算法 | GradHC | DNA序列 | NA |
| 102 | 2024-09-14 |
A dual-rule encoding DNA storage system using chaotic mapping to control GC content
2024-03-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btae113
PMID:38419588
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研究论文 | 本文提出了一种使用混沌映射控制GC含量的双规则编码DNA存储系统 | 该系统通过两种GC含量互补的编码规则对二进制数据进行编码，解决了早期编码方案忽视DNA序列生物约束性的问题 | NA | 解决DNA存储中合成和测序困难的问题 | DNA存储编码方案 | 生物信息学 | NA | 混沌映射 | NA | DNA序列 | 代表性文档和图像文件格式 |
| 103 | 2024-09-14 |
GCNSA: DNA storage encoding with a graph convolutional network and self-attention
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106231
PMID:36876131
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研究论文 | 本文提出了一种基于图卷积网络和自注意力机制的DNA存储编码系统GCNSA | GCNSA系统在基本约束下平均提高了14.4%的DNA存储码，在其他约束下提高了5%-40%，有效提升了DNA存储系统的存储密度 | NA | 提高DNA存储系统的编码效率和速度 | DNA存储编码系统 | NA | NA | 图卷积网络、自注意力机制 | 图卷积网络、自注意力机制 | DNA序列 | NA |
| 104 | 2024-09-14 |
The compact integration of a cascaded HCR circuit for highly reliable cancer cell discrimination
2023-Feb-22, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d2sc05568f
PMID:36845932
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研究论文 | 本文设计了一种紧凑的级联DNA电路，用于高可靠性的癌细胞鉴别 | 提出了结合传统级联DNA电路与多重局部响应特性的新型DNA电路，通过精细设计两个超发夹反应物，实现了电路组件的简化和局部增强的级联信号放大 | NA | 开发一种高可靠性的癌细胞鉴别方法 | 癌细胞与正常细胞的鉴别 | 生物医学工程 | 癌症 | DNA电路 | NA | 细胞影像 | NA |
| 105 | 2024-09-14 |
DNAsmart: Multiple attribute ranking tool for DNA data storage systems
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.02.016
PMID:36851917
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研究论文 | 本文介绍了一个名为DNAsmart的交互式可视化分析框架，用于DNA数据存储系统中的多属性排序 | 提出了一个交互式和可视化的分析框架，帮助用户通过设置不同权重和组合多个属性来找到最佳的编码和解码方法 | 仅通过任务特定的用户研究验证了其有效性，未涉及更广泛的实际应用场景 | 开发一个工具，帮助用户在DNA数据存储系统中进行多属性排序，以优化编码和解码方法 | DNA数据存储系统中的编码和解码方法 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | 涉及的样本为领域专家，具体数量未明确 |
| 106 | 2024-09-13 |
Enabling technology and core theory of synthetic biology
2023-08, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2214-2
PMID:36753021
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review | 本文综述了合成生物学的使能技术和核心理论进展 | 介绍了合成生物学的新范式和未来发展方向 | NA | 探讨合成生物学的使能技术和核心理论 | 合成生物学的各种原理和技术 | NA | NA | 基因编辑、分子进化、从头设计功能蛋白、细胞和基因电路工程、无细胞合成生物学、人工智能辅助合成生物学 | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-09-13 |
DNA-Aeon provides flexible arithmetic coding for constraint adherence and error correction in DNA storage
2023-02-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36297-3
PMID:36746948
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DNA-Aeon的DNA数据存储编码方案，支持生成可变长度的编码序列，并能遵守特定的GC含量、同聚物长度限制和避免不希望的基序 | DNA-Aeon能够纠正替换错误、插入、删除以及整个DNA链的丢失，并且在类似冗余水平下具有更好的错误纠正能力，同时降低了DNA合成成本 | NA | 开发一种灵活的DNA数据存储编码方案，以提高DNA存储的可靠性和效率 | DNA数据存储中的错误纠正和约束遵守 | NA | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 108 | 2024-09-05 |
Monitoring and modulating a catalytic hybridization circuit for self-adaptive bioorthogonal DNA assembly
2022-Sep-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d2sc03757b
PMID:36277649
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研究论文 | 本文开发了一种自适应的局部催化电路（LCC），用于在拥挤的细胞内环境中实现DNA纳米海绵的自持续生物正交组装 | 提出了一种新型的自适应局部催化电路，通过利用LCC生成的DNA支架作为多功能模板，实现了LCC反应物的近距离限制，从而加速了反应速率和效率 | NA | 构建人工多米诺纳米结构，特别是与活细胞内生物功能激活相关的动态DNA电路，以调节各种生物实体的行为和命运 | DNA纳米海绵的生物正交组装 | 生物技术 | NA | 荧光相关光谱（FCS） | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-09-04 |
Design of DNA Storage Coding with Enhanced Constraints
2022-Aug-19, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24081151
PMID:36010815
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研究论文 | 本文提出了一种增强DNA存储编码鲁棒性的方法，通过引入重复串联序列约束和改进的DTW距离约束，以及结合随机对立学习与涡流跳跃策略的ROEAO算法，来提高编码质量并降低错误率。 | 本文创新性地引入了重复串联序列约束和改进的DTW距离约束，以及结合随机对立学习与涡流跳跃策略的ROEAO算法，以提高DNA存储编码的鲁棒性和质量。 | NA | 旨在解决传统存储介质无法满足全球数据存储需求的问题，特别是通过增强DNA存储编码的鲁棒性来降低错误率。 | DNA存储编码的鲁棒性和质量。 | 生物信息学 | NA | DNA存储编码 | ROEAO算法 | DNA序列 | NA |
| 110 | 2024-09-02 |
From deep learning to mechanistic understanding in neuroscience: the structure of retinal prediction
2019-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:35283616
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研究论文 | 本文通过结合降维和现代归因方法，开发了一种系统方法来从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，并应用于视网膜的深度网络模型，揭示了视网膜作为预测特征提取器的工作原理 | 本文提出了一种新的系统方法，通过结合降维和现代归因方法，从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，为深度网络作为神经科学模型提供了更坚实的理论基础 | 本文主要关注于从深度网络模型中提取计算机制，并应用于视网膜模型，但未涉及其他生物神经网络模型 | 研究如何从深度神经网络模型中提取和理解计算机制，并将其应用于神经科学领域 | 视网膜的深度网络模型 | 神经科学 | NA | 深度学习 | 深度前馈神经网络 | 视觉刺激 | NA |
| 111 | 2024-08-31 |
Evolution of Brains and Computers: The Roads Not Taken
2022-May-09, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e24050665
PMID:35626550
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研究论文 | 本文探讨了大脑和计算机发展过程中的相似性和差异性，以及这些相似性和差异性如何影响人工智能的设计和发展 | 提出了大脑和计算机在进化过程中的相似性和差异性，并讨论了这些因素如何影响人工智能的设计 | 文章主要集中在理论探讨，缺乏具体的实验数据或实际应用案例 | 探讨大脑和计算机在进化过程中的相似性和差异性，以及这些因素如何影响人工智能的设计和发展 | 大脑和计算机的发展历程及其对人工智能设计的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 人工神经网络 | NA | NA |
| 112 | 2024-08-24 |
The art of designed coiled-coils for the regulation of mammalian cells
2024-Aug-15, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2024.06.001
PMID:38971158
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综述 | 本文综述了合成生物学中利用卷曲螺旋（CC）二聚体形成模块作为调控蛋白质组装和生物过程的构建块的潜力 | CC模块提供了高度特异性和正交的蛋白质-蛋白质相互作用，设计规则允许对这些相互作用进行精确控制和可调性 | NA | 探讨CC在哺乳动物细胞中的多样化应用潜力 | 卷曲螺旋（CC）模块在哺乳动物细胞中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-23 |
Advances and Challenges in Random Access Techniques for In Vitro DNA Data Storage
2024-Aug-21, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c07235
PMID:39110103
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综述 | 本文综述了DNA存储技术中随机访问功能的最新进展、面临的挑战及当前解决方案 | 总结了实现DNA存储中随机访问功能的新技术 | 现有DNA存储技术在实现快速准确的随机访问功能方面存在困难，限制了其在工业中的实际应用 | 帮助研究人员更好地理解随机访问步骤对DNA存储整体发展的重要性，并探讨其未来研究趋势 | DNA存储技术中的随机访问功能 | NA | NA | DNA存储技术 | NA | DNA数据 | NA |
| 114 | 2024-08-22 |
The Promise and Potential of Brain Organoids
2024-Aug, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202302745
PMID:38252094
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综述 | 本文综述了脑类器官的生成技术、当前和潜在应用以及该领域的未来方向 | 脑类器官作为一种颠覆性技术，具有复杂的结构，包含多种神经细胞类型、突触和髓鞘，能够用于毒理学测试、疾病建模、感染研究、个性化医疗和基因-环境相互作用研究 | NA | 探讨脑类器官在神经科学研究中的应用，以及其在疾病建模、药物开发和人类大脑发育与障碍理解方面的潜力 | 脑类器官及其在多个领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-20 |
Ionic liquid-based aqueous biphasic system as an alternative tool for enhanced bacterial DNA extraction
2024-Sep-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343045
PMID:39155099
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研究论文 | 本文探讨了基于离子液体的水相双相系统在增强细菌DNA提取中的应用 | 提出了使用基于离子液体的水相双相系统作为DNA提取的新方法，该方法成本效益高且环境友好 | 在DNA回收率和双相系统可重复使用性方面仍有改进空间 | 开发一种替代且环保的DNA提取方法 | 细菌DNA的提取 | NA | NA | 基于离子液体的水相双相系统 | NA | DNA | 使用了鲑鱼精DNA和细菌质粒DNA进行实验 |
| 116 | 2024-08-20 |
Endogenous Glutathione-Activated Nucleic Acid Molecular Circuitry for Cell-Specific MicroRNA Imaging
2024-08-06, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c02570
PMID:39042763
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研究论文 | 本研究开发了一种内源性谷胱甘肽（GSH）调控的杂交链反应（HCR）电路，用于高对比度的miRNA成像 | 通过内源性GSH分子激活HCR系统，实现了对miRNA-21的选择性放大检测，避免了非目标细胞中的信号泄露 | NA | 开发一种新型的内源性激活DNA电路，用于提高活细胞中miRNA成像的敏感性和可靠性 | miRNA-21在特定肿瘤细胞中的成像 | 生物技术 | 肿瘤 | 杂交链反应（HCR） | NA | 分子 | 特定肿瘤细胞 |
| 117 | 2024-08-13 |
Cascade Strand Displacement and Bipedal Walking Based DNA Logic System for miRNA Diagnostics
2021-Jun-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.1c00277
PMID:34235264
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研究论文 | 开发了一种基于双足DNA步行器的放大电化学方法，用于miRNA检测，并构建了多种逻辑电路，实现了多重miRNA的分析 | 整合了DNA逻辑门与丰富的计算功能和信号放大，实现了超高的灵敏度，并成功建立了多种逻辑门 | NA | 开发一种新的DNA逻辑系统，用于miRNA的诊断和多重分析 | miRNA的检测和多重分析 | 生物技术 | NA | DNA逻辑门，双足DNA步行器，电化学方法 | NA | DNA | NA |
| 118 | 2024-08-11 |
Preservation and Encryption in DNA Digital Data Storage
2022-Jul-04, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202200183
PMID:35856827
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综述 | 本文综述了DNA数字数据存储的工作流程，并重点介绍了DNA数字数据存储的存储步骤，以及根据不同信息存储形式的DNA信息加密方法 | 介绍了DNA数字数据存储的新一代高密度数字数据存储技术，并强调了其在信息加密方面的创新 | 未明确指出具体的技术限制 | 探讨DNA数字数据存储及其信息加密方法的发展和优化 | DNA数字数据存储及其信息加密技术 | NA | NA | DNA合成与测序技术 | NA | DNA数据 | NA |
| 119 | 2024-08-08 |
DNA stability: a central design consideration for DNA data storage systems
2021-03-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-21587-5
PMID:33649304
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研究论文 | 本文分析了影响DNA稳定性的存储条件、分子机制和稳定化策略，并提出了未来DNA存储系统的具体设计配置和场景 | 探讨了DNA存储技术在现代信息存储中的潜在变革性解决方案 | NA | 研究DNA存储系统的稳定性设计 | DNA存储条件、分子机制和稳定化策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-07 |
A Dual-Recognition Fluorescence Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for Specific Detection of Intact Lipid Nanoparticles via a Localized Scaffolding Autocatalytic DNA Circuit Amplifier
2024-07-16, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c00455
PMID:38967035
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研究论文 | 开发了一种双识别荧光酶联免疫吸附测定法（DR-FELISA），用于直接分离和检测完整的脂质纳米颗粒（i-LNPs） | 结合双识别分离与一步信号放大策略，通过局部支架自催化DNA电路系统进行信号放大，提高了检测的灵敏度和效率 | NA | 开发一种新方法，用于特异性和敏感地检测完整的脂质纳米颗粒（i-LNPs） | 完整的脂质纳米颗粒（i-LNPs） | 生物技术 | NA | 荧光酶联免疫吸附测定法（FELISA） | 局部支架自催化DNA电路（SADC） | 脂质纳米颗粒 | 检测范围从0.2到1.25 mg/mL，检测限为0.1 mg/mL，血清样本中不同配方的i-LNPs回收率在94.8%到116.3%之间 |