生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 757 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-02-21 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
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研究论文 | 本研究开发了一种利用流式细胞术分选技术保护和检索DNA存储过程中数据的方法，通过封装荧光DNA微粒增强其稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞术分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装荧光DNA微粒以增强其稳定性和序列完整性 | 未提及具体的数据存储容量和长期稳定性测试的时间范围 | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞术分选（FCS），层层自组装 | NA | DNA数据 | 未提及具体样本数量 |
| 42 | 2025-02-21 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
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研究论文 | 本文介绍了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于体内微RNA成像和光热治疗 | 该平台通过近红外激光功率的变化实现时空控制的miRNA-21成像和成像引导的光热治疗，创新性地结合了光热转换和熵驱动链置换反应 | NA | 开发一种能够实现时空选择性miRNA成像和成像引导治疗的纳米诊疗平台，用于精确癌症诊断和高效治疗 | miRNA-21 | 生物医学工程 | 癌症 | 光热转换技术、熵驱动链置换反应 | NA | 荧光信号 | NA |
| 43 | 2025-02-19 |
Performance of cellulose-based card for direct genetic testing of spinal muscular atrophy
2025-Feb-14, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00938-2
PMID:39953527
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研究论文 | 本文开发了一种基于纤维素的卡片，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的直接基因检测，并验证了其性能 | 开发了一种新型的基于纤维素的卡片，作为DBS制备的替代滤纸，适用于SMA的基因检测，包括直接PCR-RFLP和多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | 研究主要针对印度尼西亚等发展中国家，可能在其他地区的适用性需要进一步验证 | 开发一种适用于SMA基因检测的纤维素基卡片，以替代标准滤纸 | 脊髓性肌萎缩症（SMA）患者 | 基因检测 | 脊髓性肌萎缩症 | 直接PCR-RFLP、多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | NA | 血液样本 | NA |
| 44 | 2025-02-19 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
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研究论文 | 本研究揭示了质子泵抑制剂奥美拉唑对蛋白质体放电行为的显著影响，为非常规计算领域带来了变革性的转变 | 通过应用不同浓度的奥美拉唑，观察到蛋白质体放电特性的显著改变，包括幅度、频率和时间模式的显著变化，揭示了蛋白质体作为非常规计算基础的未开发潜力 | NA | 探索奥美拉唑对蛋白质体放电行为的影响及其在非常规计算中的应用 | 蛋白质体和奥美拉唑 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑技术 | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-02-07 |
Data Readout Techniques for DNA-Based Information Storage
2025-Feb-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412926
PMID:39910849
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综述 | 本文综述了DNA信息存储中的数据读出技术，包括序列和结构两种主要存储单元及其对应的读出方法，并讨论了该领域的局限性和挑战 | 系统性地介绍了DNA数据存储系统中的读出技术，特别是存储系统设计与读出技术选择之间的关联 | 缺乏对DNA数据存储系统中读出技术的系统性讨论，尤其是在存储系统设计与读出技术选择之间的关联方面 | 探讨DNA信息存储中的数据读出技术及其发展 | DNA数据存储系统中的读出技术 | 生物信息学 | NA | 测序和非测序方法 | NA | DNA序列和结构 | NA |
| 46 | 2025-02-07 |
A practical DNA data storage using an expanded alphabet introducing 5-methylcytosine
2025, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.147
PMID:39906332
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩展分子字母表的实用DNA数据存储转码方案R+，该方案引入了5-甲基胞嘧啶（5mC） | 提出了使用5-甲基胞嘧啶（5mC）作为扩展分子字母表的一部分，以提高DNA数据存储的信息密度 | 非天然DNA序列的合成及其复杂结构带来的挑战 | 验证5mC在DNA存储系统中的实用性 | DNA数据存储 | 生物信息学 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA序列 | 多个1.3∼1.6 kbps的DNA片段 |
| 47 | 2025-02-04 |
Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues
2025-Jan-28, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117198
PMID:39893948
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研究论文 | 本文首次构建了一种分层DNA电路，用于临床组织中特定位置N6-甲基腺苷（mA）-MALAT1的单分子分析 | 首次构建分层DNA电路用于单分子分析，具有阿摩尔级灵敏度和7个数量级的动态范围 | 未提及具体局限性 | 开发新方法以准确和敏感地分析RNA中特定位置的mA修饰 | 临床组织中的mA-MALAT1 | 分子生物学 | 肺癌 | 分层DNA电路，单分子检测 | NA | 分子数据 | 多种癌细胞和乳腺癌患者及健康个体的样本 |
| 48 | 2025-01-31 |
Not all is lost: resilience of microbiome samples to freezer failures and long-term storage
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00603-24
PMID:39704536
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研究论文 | 本文研究了冷冻故障和长期存储对土壤样本微生物组的影响，评估了样本解冻后的恢复能力 | 揭示了真菌丰富度和细菌及真菌β多样性对土壤样本解冻和长期冷冻存储的显著恢复能力，并比较了不同存储方法的有效性 | 研究仅针对土壤样本，未涉及其他类型的微生物组样本 | 评估冷冻故障和长期存储对微生物组样本的影响，比较不同存储方法的有效性 | 土壤样本中的细菌和真菌 | 微生物组研究 | NA | Illumina MiSeq测序 | NA | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 49 | 2025-01-24 |
Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics
2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202416004
PMID:39606901
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研究论文 | 本研究开发了一种基于数字微流控技术的紧凑型DNA数据存储管道，实现了从合成到测序的整个流程 | 利用200纳米磁珠进行基于磷酸酰胺化学的DNA合成，并通过三酶级联反应的化学发光信号进行测序，显著提高了存储速度和精度 | 目前仅作为概念验证试验，存储容量和速度仍需进一步优化 | 开发一种高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统 | DNA数据存储系统 | 数字微流控技术 | NA | 磷酸酰胺化学、三酶级联反应、Huffman编码算法、Reed-Solomon纠错 | NA | DNA序列数据 | 8字节数据 |
| 50 | 2025-01-22 |
Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway
2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.117109
PMID:39756268
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研究论文 | 本文提出了一种基于谷胱甘肽（GSH）激活的DNA电路，用于实现空间选择性microRNA成像，并通过非酶催化信号放大程序提高传感性能 | 通过将二硫键整合到预密封的核酸探针中，有效改善了电路泄漏问题，实现了高保真度的microRNA成像和相关调控通路的原位解释 | 该方法在目标癌细胞中依赖于高浓度的GSH和miR-21，可能限制了其在其他细胞类型或低浓度生物分子环境中的应用 | 开发一种高保真度的microRNA成像方法，并探索GSH与miR-21之间的相关性 | 癌细胞中的microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH） | 生物化学 | 癌症 | DNA电路技术 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 51 | 2025-01-16 |
miR-Cabiner: A Universal microRNA Sensing Platform Based on Self-Stacking Cascaded Bicyclic DNA Circuit-Mediated CRISPR/Cas12a
2025-Jan-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05370
PMID:39704707
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研究论文 | 本文介绍了一种基于自堆叠级联双环DNA电路介导的CRISPR/Cas12a的通用miRNA传感平台miR-Cabiner | miR-Cabiner平台结合了催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR）到一个统一的电路中，并最终级联到CRISPR/Cas12a，相比CHA-Cas12a和HCR-Cas12a系统，具有显著更高的反应速率 | NA | 开发一种敏感且通用的miRNA分析平台，用于乳腺癌的诊断、分期和预后 | 与乳腺癌相关的miRNA（miR-130a, miR-10b, miR-21, 和 miR-1285） | 生物技术 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas12a, 催化发夹组装（CHA）, 杂交链反应（HCR） | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-01-16 |
Robust multi-read reconstruction from noisy clusters using deep neural network for DNA storage
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.02.019
PMID:39807110
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研究论文 | 本文提出了一种名为RobuSeqNet的深度神经网络，用于从包含噪声的DNA存储系统中稳健地重建多个读取序列 | RobuSeqNet通过注意力机制和精心设计的网络结构，能够处理包含链断裂、重排和错误聚类的高噪声集群，有效应对链内IDS错误 | NA | 解决DNA存储系统中由于合成、扩增、测序和存储过程中引入的各种错误导致的信息恢复挑战 | DNA存储系统中的序列重建 | 机器学习 | NA | 下一代测序（NGS） | 深度神经网络 | DNA序列数据 | 三个代表性的下一代测序数据集 |
| 53 | 2025-01-15 |
Efficient data reconstruction: The bottleneck of large-scale application of DNA storage
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113699
PMID:38517891
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综述 | 本文回顾了现有的先进DNA存储方法，分析了数据写入和读取各阶段生物技术方法的特点和性能，并从数据重建的角度讨论了影响DNA存储的潜在因素 | 从数据重建的角度分析DNA存储的挑战和影响因素，为大规模应用DNA存储提供了新的视角 | 未提出具体的解决方案，主要集中于现有方法的回顾和分析 | 探讨DNA存储在大规模应用中的数据重建瓶颈 | DNA存储技术 | 生物信息学 | NA | DNA合成与测序技术 | NA | 数字数据 | NA |
| 54 | 2025-01-14 |
Turning waste into wealth: Enzyme-activated DNA sensor based on reactant recycle for spatially selective imaging microRNA toward target cells
2025-Feb-01, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343557
PMID:39800513
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研究论文 | 本文开发了一种基于反应物循环的酶激活DNA传感器，用于在目标细胞中实现空间选择性成像microRNA | 首次开发了APE1激活的反应物循环催化DNA电路，实现了细胞和动物体内的高空间选择性microRNA成像，并提高了成像的信噪比 | NA | 开发一种高效的DNA传感器，用于癌症细胞中microRNA的成像 | 癌症细胞中的microRNA | 生物医学工程 | 癌症 | DNA传感器技术 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 55 | 2025-01-14 |
Instruction-responsive programmable assemblies with DNA origami block pieces
2025-Jan-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1193
PMID:39698832
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA折纸技术的可编程组装系统，能够根据指令集将DNA折纸构建块组装成特定的二维阵列 | 设计了具有八个相互独立可编程边缘的DNA折纸构建块（DOBPs），并制定了相应的DNA指令集，实现了确定性和非确定性组装 | 未提及具体应用场景或实际生物医学应用的限制 | 创建更标准化和可控的DNA折纸组件，以组装成有限规模和多样化的超结构 | DNA折纸构建块（DOBPs）及其组装系统 | DNA纳米技术 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子信息 | 未明确提及具体样本数量 |
| 56 | 2025-01-07 |
Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification
2025-Jan-06, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c18752
PMID:39760699
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研究论文 | 本文开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，用于检测农药啶虫脒，通过两步DNA电路放大提高检测灵敏度 | 结合能量转移、两步DNA电路放大和双模式传感策略，实现了啶虫脒的高灵敏度和准确分析 | NA | 开发一种高灵敏度和准确性的生物传感器，用于检测食品中的啶虫脒，保障食品安全 | 啶虫脒 | 生物传感器 | NA | 光电化学（PEC）和电化学发光（ECL）技术 | NA | 化学信号 | NA |
| 57 | 2025-01-05 |
High-Speed Sequential DNA Computing Using a Solid-State DNA Origami Register
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c01557
PMID:39735316
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研究论文 | 本文介绍了一种固态DNA折纸寄存器，用于高速顺序DNA计算 | 设计了一种固态DNA折纸寄存器，将输出数据从3D溶液压缩到2D表面，实现了可重写的寄存器，并开发了液态电路和固态寄存器的异质集成架构，显著减少了寄存器介导的信号传输时间 | 之前的DNA折纸寄存器仅支持单次写入操作，信号传输涉及繁琐且耗时的寄存器移动，限制了顺序计算的速度 | 提高顺序DNA计算的速度，并增强DNA分子算法的可视调试和自动执行能力 | DNA折纸寄存器 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子数据 | NA |
| 58 | 2024-12-31 |
Stationary DNA Origami Register Drives Fast Sequential DNA Computing
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c02006
PMID:39735317
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2025-01-04 |
Harnessing DNA computing and nanopore decoding for practical applications: from informatics to microRNA-targeting diagnostics
2025-Jan-02, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00396e
PMID:39471098
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教程综述 | 本文综述了DNA计算和纳米孔解码的基础知识、技术和方法，并重点介绍了针对microRNA作为生物标志物的医学诊断中的最新进展 | 将DNA计算与纳米孔解码技术结合，应用于医学诊断，特别是针对microRNA的检测 | 实际应用中仍面临技术和实施挑战 | 探索DNA计算和纳米孔解码在医学诊断中的实际应用 | DNA计算设备和纳米孔解码技术 | 分子计算 | NA | DNA计算、纳米孔技术 | NA | 核酸分子 | NA |
| 60 | 2024-12-28 |
Exploring the Potential of DNA Computing for Complex Big Data Problems: A Case Study on the Traveling Car Renter Problem
2024-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3396142
PMID:38709614
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算在解决复杂大数据问题中的潜力，特别是针对旅行租车问题（TCRP）的案例研究 | 提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决TCRP问题，展示了DNA计算在并行计算中的潜力 | 研究仅通过模拟实验验证了算法的有效性，未在实际DNA计算环境中进行测试 | 探索DNA计算在解决NP难问题中的应用，特别是针对TCRP问题 | 旅行租车问题（TCRP） | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | 模拟数据 | NA |