生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 754 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-07 |
Groove binding mechanism of ionic liquids: a key factor in long-term stability of DNA in hydrated ionic liquids?
2012-Dec-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja304519d
PMID:23181803
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研究论文 | 本文通过分子动力学模拟和光谱实验研究了水合离子液体（ILs）中DNA的稳定机制 | 揭示了离子液体通过疏水和极性相互作用在DNA小沟中的结合机制，以及这种机制如何帮助稳定DNA | NA | 理解离子液体与DNA的结合特性和分子机制，以指导新型离子液体的发展，用于核酸溶质 | DNA在水合离子液体中的稳定性 | 生物技术 | NA | 分子动力学模拟，光谱实验 | NA | DNA | NA |
| 602 | 2024-08-07 |
Highly sensitive detection of telomerase activity in tumor cells by cascade isothermal signal amplification based on three-way junction and base-stacking hybridization
2013-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2012.10.009
PMID:23122231
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研究论文 | 本文报道了一种简单且高灵敏度的端粒酶活性检测方法，结合了两种连续的等温信号放大过程：三路结触发的DNA机器（3WJ-DNAM）和碱基堆积杂交辅助的“生物电路”DNA机器（BSHBC-DNAM） | 该传感策略允许在3-5000个Hela细胞范围内测量端粒酶活性，与大多数先前报道的方法相比，具有相当的甚至更优的性能 | NA | 开发一种高灵敏度的端粒酶活性检测方法 | 端粒酶活性在肿瘤细胞中的检测 | 生物技术 | 肿瘤 | 等温信号放大 | NA | DNA | 3-5000个Hela细胞 |
| 603 | 2024-08-07 |
Catalytic deoxyribozyme-modified nanoparticles for RNAi-independent gene regulation
2012-Oct-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/nn3034265
PMID:22966955
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研究论文 | 研究通过合成多价脱氧核酶“10-23”金纳米粒子（DzNP）偶联物，探讨了立体环境和金表面化学对催化作用的影响，并展示了其在细胞内对GDF15基因表达的调控能力 | 首次展示了脱氧核酶金纳米粒子在细胞内对基因表达的调控能力，并利用金表面的不对称敏感性调节催化活性 | NA | 研究脱氧核酶在细胞内的非毒性递送及其功能维持，以及其在基因调控中的应用 | 脱氧核酶“10-23”金纳米粒子偶联物及其在细胞内的催化活性和基因表达调控 | 生物技术 | 乳腺癌 | 金纳米粒子合成 | NA | DNA | NA |
| 604 | 2024-08-07 |
Highly-efficient gating of solid-state nanochannels by DNA supersandwich structure containing ATP aptamers: a nanofluidic IMPLICATION logic device
2012-Sep-19, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja3053333
PMID:22954022
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研究论文 | 本文展示了一种基于DNA超级三明治结构和ATP门控的纳米流体器件，具有高ON-OFF比率（高达10^6）和在关闭状态下达到吉欧姆级别的完美电密封 | 该器件的ON-OFF比率明显高于现有的化学修饰纳米流体门控系统，并且其吉欧姆密封性能可与离子通道电生理记录和某些脂质双层涂层的纳米孔传感器相媲美 | NA | 开发模拟生物离子通道门控功能的生物混合纳米系统，并提高人工系统的门控效率 | DNA超级三明治结构和ATP门控的纳米流体器件 | 纳米技术 | NA | 自组装DNA超级三明治结构 | NA | 电信号 | NA |
| 605 | 2024-08-07 |
EGNAS: an exhaustive DNA sequence design algorithm
2012-Jun-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/1471-2105-13-138
PMID:22716030
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研究论文 | 本文介绍了一种全面的DNA序列设计算法EGNAS，该算法能够生成具有定义属性的序列集合，并控制序列间的相互作用和内部结构。 | EGNAS算法能够生成比以往软件更大规模的序列集合，并保持相同的约束条件。 | NA | 开发一种新的软件工具，用于设计独特的核酸序列。 | DNA序列的设计及其在分子识别、DNA纳米技术和DNA计算中的应用。 | DNA计算 | NA | DNA序列设计算法 | NA | DNA序列 | NA |
| 606 | 2024-08-07 |
Biomolecular computing systems: principles, progress and potential
2012-Jun-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg3197
PMID:22688678
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综述 | 本文综述了生物分子计算系统的原理、进展和潜在应用 | 探讨了通过合理设计和工程化生物计算系统来增强研究和控制生物系统的能力 | NA | 介绍生物分子计算系统的关键概念并讨论最新进展 | 生物分子计算系统及其在组织工程、再生医学和医疗治疗中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 607 | 2024-08-07 |
DNA extraction, preservation, and amplification
2012, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-61779-591-6_14
PMID:22684962
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研究论文 | 本文详细描述了样品准备、DNA分离、DNA储存、PCR扩增、PCR产物质量控制和PCR产物清理的标准协议和流程方案 | 介绍了硅胶膜方法在核酸分离中的应用，该方法易于操作、适用于高样本通量、成本相对较低，并能提供高质量、高数量和高纯度的DNA | NA | 探讨DNA条形码在生物多样性研究中的有效性，特别是DNA提取方法和PCR条件的优化 | DNA提取、保存和扩增的方法及其在生物多样性研究中的应用 | 生物技术 | NA | PCR | NA | DNA | 高样本通量 |
| 608 | 2024-08-07 |
Chromatin computation
2012, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0035703
PMID:22567109
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research paper | 本文定义了一种新的计算模型，其中染色质修饰作为信息单元，可以写入核小体的一维串中，类似于图灵机磁带上的符号，而染色质修饰复合体被建模为对有限相邻核小体进行操作的读写规则 | 提出了名为“染色质计算机”的新计算模型，证明其计算上具有通用性，比用于模拟转录因子调控基因表达的逻辑电路更强大 | NA | 探索染色质作为计算机的功能，并提出新的医学干预方法和生物计算机器的工程基础 | 染色质修饰及其在计算模型中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 609 | 2024-08-07 |
Synthetic in vitro transcription circuits
2012 Mar-Apr, Transcription
DOI:10.4161/trns.19734
PMID:22414749
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research paper | 本文通过使用RNA聚合酶和核糖核酸酶这两种酶，实现了体外简化版的转录调控电路 | 能够在体外模拟自然发生的生化网络，探索生物电路设计原理，并实现强大的计算模型 | NA | 探索生物电路设计原理及其实现 | 转录调控电路 | NA | NA | RNA聚合酶，核糖核酸酶 | NA | NA | NA |
| 610 | 2024-08-07 |
A molecular cryptosystem for images by DNA computing
2012-Mar-19, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201107156
PMID:22308004
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-07 |
An evolution based biosensor receptor DNA sequence generation algorithm
2010, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s100100330
PMID:22315543
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研究论文 | 本研究探讨了作为生物受体的DNA特性，并提出了一种基于DNA计算的混合进化DNA序列生成算法，用于识别适合与真实目标物质稳定杂交的DNA生物受体识别分子 | 本研究提出了一种基于DNA计算的混合进化DNA序列生成算法，并应用旅行商问题（TSP）方法评估生成DNA序列的安全性和适应性，提高了DNA序列生成的效率和稳定性 | NA | 旨在进一步开发DNA生物传感器，识别适合真实目标分析物样本的识别分子 | DNA生物受体及其与真实目标物质的杂交稳定性 | 生物传感器 | NA | DNA计算 | 混合进化算法 | DNA序列 | NA |
| 612 | 2024-08-07 |
Robust design of biological circuits: evolutionary systems biology approach
2011, Journal of biomedicine & biotechnology
DOI:10.1155/2011/304236
PMID:22187523
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研究论文 | 本研究提出了一种非线性随机系统模型，用于模拟宿主细胞中生物系统的内在参数波动和环境分子噪声，并通过进化系统生物学算法优化目标基因电路的设计参数，以实现对所需生物功能的稳健跟踪。 | 本研究采用进化系统生物学算法，使基因电路的设计参数能够进化到特定值，以稳健地跟踪所需的生物功能，即使在存在内在和环境噪声的情况下。 | NA | 构建更复杂的生物电路系统，提高生物电路设计的稳定性和确定性。 | 人工基因电路在微生物细胞中的功能实现，如开关、计时器、振荡器和布尔逻辑门。 | 合成生物学 | NA | 进化系统生物学算法 | 非线性随机系统 | 模拟数据 | NA |
| 613 | 2024-08-07 |
Ultrasensitive DNA detection by cycle isothermal amplification based on nicking endonuclease and its application to logic gates
2011-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2011.09.019
PMID:22000757
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研究论文 | 本文设计了一系列基于切割内切酶（NEase）的循环等温扩增技术的三输入DNA逻辑门，显著提高了检测限 | 通过设计一个简单灵活的生物电路，实现了对特定DNA序列的检测和扩增，从而在输出信号中实现了指数级扩增 | NA | 开发基于指数扩增的DNA逻辑系统，以提高其灵敏度和简化逻辑操作 | DNA逻辑门及其在超灵敏DNA检测中的应用 | 生物技术 | NA | 循环等温扩增 | DNA逻辑门 | DNA序列 | NA |
| 614 | 2024-08-07 |
The use of gold nanoparticle aggregation for DNA computing and logic-based biomolecular detection
2008-Oct-01, Nanotechnology
IF:2.9Q2
DOI:10.1088/0957-4484/19/39/395103
PMID:21832585
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研究论文 | 本文介绍了一种基于金纳米颗粒聚集引起颜色变化的快速简单可视化技术，用于展示DNA计算过程的结果，并应用于基于逻辑的生物分子检测。 | 提出了一种新的基于金纳米颗粒聚集的颜色变化可视化技术，用于DNA计算和逻辑控制生物系统的分析。 | NA | 开发一种有效的可视化方法，用于DNA计算和逻辑控制生物系统的分析。 | DNA分子和金纳米颗粒 | 生物分子检测 | NA | 金纳米颗粒聚集 | NA | 颜色变化 | NA |
| 615 | 2024-08-07 |
Abstractions for DNA circuit design
2012-Mar-07, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2011.0343
PMID:21775321
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研究论文 | 本文介绍了一种用于设计DNA链置换装置的编程语言，支持不同级别的分子细节分析 | 提出了一种新的编程语言，允许在不同细节级别上分析DNA链置换装置设计，无需修改程序 | 未提及 | 开发一种编程语言，用于设计能够维持精确反应动力学的DNA链置换装置 | DNA链置换装置的设计和分析 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA |
| 616 | 2024-08-07 |
Neural network computation with DNA strand displacement cascades
2011-Jul-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature10262
PMID:21776082
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研究论文 | 本文展示了如何利用DNA计算和链置换电路构建分子系统，使其表现出类似大脑的自主行为 | 首次实现了将任意线性阈值电路（一种人工神经网络模型）系统地转化为DNA链置换级联，这些级联可以作为小型神经网络运行 | 目前仅实现了包含四个完全连接的人工神经元的Hopfield联想记忆模型 | 探索分子系统如何模拟大脑的认知功能，如模式识别、决策和环境响应 | DNA链置换级联及其在人工神经网络中的应用 | 生物技术 | NA | DNA计算，链置换电路 | 人工神经网络 | DNA序列 | 四个完全连接的人工神经元 |
| 617 | 2024-08-07 |
Electronic microarrays in DNA computing
2011-Jun, Journal of nanoscience and nanotechnology
DOI:10.1166/jnn.2011.38844717
PMID:21770097
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研究论文 | 本研究将微电子学与分子生物学技术结合，通过DNA实现信息的存储和基本算术运算 | 利用电子微阵列存储4位信息并通过荧光信号强度读取数据，展示了荧光标记DNA的加减运算可能性 | NA | 探索DNA计算的实际应用 | DNA信息存储和基本算术运算 | 生物技术 | NA | 电子微阵列 | NA | DNA序列 | 16种不同的互补DNA序列 |
| 618 | 2024-08-07 |
An unenumerative DNA computing model for vertex coloring problem
2011-Jun, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2011.2160996
PMID:21742570
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研究论文 | 本文提出了一种新的非枚举DNA计算模型，用于解决图的顶点着色问题 | 通过排序顶点序列和减少颜色编码数量，有效减少了候选解的枚举，从而避免了解决方案空间的指数爆炸 | NA | 解决DNA计算中由于候选解枚举导致的解决方案空间指数爆炸问题 | 图的顶点着色问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | 非枚举DNA计算模型 | 图 | 12个顶点的图，初始解决方案空间包含283个DNA链 |
| 619 | 2024-08-07 |
[DNA computing]
2011, Postepy biochemii
PMID:21735816
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研究论文 | 本文探讨了DNA计算作为一种替代传统硅基计算机的可能性，并介绍了其在不同领域的应用前景 | 首次实现了使用DNA寡聚物和DNA连接酶解决哈密顿路径问题，并提出了基于限制酶FokI的分子两态有限自动机模型 | DNA计算的研究仍处于进展中，尚未实现大规模应用 | 探索DNA计算在计算机科学中的突破潜力 | DNA计算的模型和应用 | NA | 癌症 | DNA计算 | 分子两态有限自动机 | DNA寡聚物 | NA |
| 620 | 2024-08-07 |
Rational, modular adaptation of enzyme-free DNA circuits to multiple detection methods
2011-Sep-01, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkr504
PMID:21693555
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研究论文 | 本文设计并表征了一种基于催化发夹组装机制的简化DNA电路，并将其应用于多种不同的分析格式 | 通过优化先前基于发夹的催化组装设计，实现了几乎零背景和高催化效率，并展示了电路的固有模块性，可轻松适应检测RNA和小分子分析物 | NA | 探索酶免信号放大在低成本即时诊断中的应用 | 酶免DNA电路的效率和模块性是否适用于多种分析应用 | 分子检测 | NA | 催化发夹组装 | NA | DNA电路 | NA |