生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['DNA storage', 'DNA computing', 'DNA circuit', 'biological computing', 'biological circuit']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 799 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2024-08-07 |
Construction of an enzyme-free concatenated DNA circuit for signal amplification and intracellular imaging
2018-Jul-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c8sc01981a
PMID:30079197
|
研究论文 | 本文通过整合催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR）两种信号放大方法，建立了一种等温无酶放大策略，用于高灵敏度和选择性的核酸检测 | 本文创新性地构建了串联的CHA-HCR系统，实现了高效的荧光共振能量转移（FRET）信号读出，并可转换为通用传感平台，用于检测癌症生物标志物 | NA | 开发一种新型的无酶核酸放大系统，用于生物标志物的高灵敏度检测和细胞内成像 | 核酸检测技术及其在生物标志物检测和细胞内成像中的应用 | 生物工程 | 癌症 | 催化发夹组装（CHA），杂交链反应（HCR） | NA | 核酸 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 542 | 2024-08-07 |
Entropy-driven DNA logic circuits regulated by DNAzyme
2018-09-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky663
PMID:30053158
|
research paper | 本研究开发了由DNAzyme调控的催化DNA逻辑电路，提出了一种基于共价修饰的调控策略，结合DNAzyme消化和熵驱动的链置换两种反应机制。 | 本研究提出了一种新的策略，通过共价修饰诱导构象变化来调控催化DNA电路，不仅依赖于toehold介导的机制。 | NA | 开发新的催化DNA逻辑电路调控策略，实现更复杂的DNA工程功能和信号传输。 | 催化DNA逻辑电路的调控机制。 | NA | NA | DNAzyme | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 543 | 2024-08-07 |
DNA Logic Operation with Nanopore Decoding To Recognize MicroRNA Patterns in Small Cell Lung Cancer
2018-07-17, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.8b01586
PMID:29952206
|
研究论文 | 本研究提出了一种利用纳米孔解码的DNA逻辑运算方法，用于识别小细胞肺癌中的microRNA模式 | 开发了一种快速、无标记的纳米孔测量解码方法，用于诊断分子输出，并设计了能够自主识别特定microRNA并形成四通结构的自组装DNA | NA | 探索DNA逻辑运算在早期癌症诊断中的应用 | 小细胞肺癌中的microRNA模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 纳米孔测量 | NA | 电流阻断持续时间 | 涉及两种microRNA，miR-20a和miR-17-5p | NA | NA | NA | NA |
| 544 | 2024-08-07 |
iBioSim 3: A Tool for Model-Based Genetic Circuit Design
2019-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00078
PMID:29944839
|
研究论文 | 本文介绍了iBioSim工具的新功能，该工具用于通过基于模型的设计策略促进遗传电路的设计 | iBioSim工具整合了DNA电路设计、设计分析和设计合成的新功能，支持系统化构建新的遗传电路 | NA | 开发和改进用于遗传电路设计的iBioSim工具 | 遗传电路的设计和分析 | 生物技术 | NA | 基于模型的设计策略 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 545 | 2024-08-07 |
Synthesis of comb-shaped DNA using a non-nucleosidic branching phosphoramidite
2018-07-07, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/c8ob00626a
PMID:29881861
|
研究论文 | 本文报道了一种使用非核苷酸分支磷酰胺合成梳状DNA的方法 | 开发了一种简便的合成方法，使用易于获得的δ-戊内酯和1,3-二氨基丙-2-醇合成具有正交保护基团的分支单体 | NA | 探索和优化分支DNA的合成方法，以促进其在分子诊断和DNA纳米技术中的应用 | 梳状分支DNA的合成及其在分子诊断和DNA纳米技术中的应用 | DNA纳米技术 | NA | 荧光显微镜 | NA | DNA | 三种不同的DNA臂 | NA | NA | NA | NA |
| 546 | 2024-08-07 |
Effects of preservation method on canine (Canis lupus familiaris) fecal microbiota
2018, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.4827
PMID:29844978
|
研究论文 | 本研究评估了不同保存方法对犬粪便微生物群DNA的影响 | 首次综合评估了温度控制和保存缓冲液结合使用对犬粪便微生物群DNA保存的影响 | 仅使用了一个犬供体的粪便样本，可能限制了结果的普遍性 | 确定犬粪便DNA保存的最佳方法 | 犬粪便微生物群 | NA | NA | 16S rRNA基因分析 | NA | DNA | 一个犬供体的粪便样本 | NA | NA | NA | NA |
| 547 | 2024-08-07 |
Spatiotemporal control of DNA-based chemical reaction network via electrochemical activation in microfluidics
2018-04-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-018-24659-7
PMID:29686392
|
研究论文 | 本文展示了通过电化学触发使用DNA接枝的微加工金电极来控制DNA基化学反应网络，特别是在微流控通道中触发反应扩散自催化前沿 | 提出了一种新的电化学触发方法，使用DNA接枝的微加工金电极来实时控制DNA基化学反应网络，这种方法易于实施、多功能且可扩展 | 受限于Au-S键的稳定性 | 开发一种新的方法来实时交互控制DNA基化学反应网络 | DNA基化学反应网络的实时控制 | 生物化学 | NA | 电化学触发 | NA | 微流控通道 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 548 | 2024-08-07 |
Multiple advanced logic gates made of DNA-Ag nanocluster and the application for intelligent detection of pathogenic bacterial genes
2018-Feb-21, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c7sc05246d
PMID:29675221
|
研究论文 | 本文开发了一种基于DNA-银纳米簇（DNA-AgNCs）平台的简单而强大的策略，用于构建多种逻辑门并实现高级逻辑功能 | 首次使用基于DNA-AgNCs的多路复用器作为智能生物传感器来识别病原基因，并展示了高灵敏度 | NA | 实现DNA计算中多逻辑门在通用平台上的集成，以执行高级逻辑功能 | DNA逻辑门及其在病原基因检测中的应用 | 生物技术 | NA | DNA-AgNCs | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 549 | 2024-08-07 |
Enzyme-Regulated DNA-Based Logic Device
2018-05-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00088
PMID:29668271
|
研究论文 | 本文报道了一种咔唑（Cz）配体，该配体在与人类端粒G四链体（h-TELO）和核酸酶酶相互作用时显示出独特的开启荧光信号 | 利用Cz稳定化的h-TELO与核酸酶的独特荧光特征，设计了新型DNA装置，用于选择性检测DNase I的酶活性并执行逻辑操作 | NA | 开发基于酶调控的DNA逻辑设备，用于生物计算和信息处理 | 咔唑配体与人类端粒G四链体及核酸酶的相互作用 | 生物技术 | NA | 荧光信号检测 | DNA逻辑门 | 荧光信号 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 550 | 2024-08-07 |
Dehydrated DNA in B-form: ionic liquids in rescue
2018-05-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky253
PMID:29669113
|
研究论文 | 本文研究了离子液体在低水活性条件下维持DNA的B型构象中的作用 | 首次展示了离子液体能够诱导DNA构象转变，并在脱水条件下维持DNA的B型构象 | NA | 探索离子液体在DNA存储和构象调控中的应用 | DNA的构象转变及离子液体的影响 | NA | NA | 圆二色谱分析，分子动力学模拟 | NA | DNA | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 551 | 2024-08-07 |
Petri-net-based 2D design of DNA walker circuits
2018, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-018-9671-4
PMID:29576759
|
研究论文 | 本文研究基于Petri网的DNA步行器电路的二维设计，通过自动识别泄漏转换来优化电路设计 | 提出了一种基于有色随机Petri网的二维建模方法，能够集成功能性、拓扑结构和维度于一个二维模型中 | 目前仅限于二维模型，尚未扩展到三维系统 | 优化DNA电路布局，最小化计算误差和电路面积 | DNA步行器电路的设计和优化 | NA | NA | Petri网 | Petri网 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 552 | 2024-08-07 |
Ternary DNA computing using 3 × 3 multiplication matrices
2015-Feb-01, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c4sc02930e
PMID:29560214
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用三值寡核苷酸输入构建3×3乘法表的DNA计算方法 | 首次将DNA作为功能材料用于三进制计算，并展示了如何使用三值输入构建乘法表 | NA | 探索非布尔计算在多值变量操作上的应用，特别是使用DNA进行三进制计算 | 三值寡核苷酸输入和荧光/淬灭功能发夹结构 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA序列 | 系统包含两个三值输入（-1; 0; +1）和九种纳米结构 | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2024-08-07 |
Simultaneous G-Quadruplex DNA Logic
2018-Apr-03, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.201800756
PMID:29446498
|
research paper | 本文报道了三种基于G-四链体DNA的逻辑门，这些逻辑门能在单一反应容器中同时操作 | 与现代计算机执行大量并行逻辑门不同，大多数分子逻辑实现仅限于单一计算任务或传感应用，而本文的逻辑门能在单一反应容器中同时操作 | NA | 探索基于DNA的分子逻辑门在单一反应容器中同时操作的可能性 | G-四链体DNA逻辑门 | NA | NA | Gel electrophoresis | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 554 | 2024-08-07 |
DNA Computing Systems Activated by Electrochemically-triggered DNA Release from a Polymer-brush-modified Electrode Array
2017-02, Electroanalysis
IF:2.7Q3
DOI:10.1002/elan.201600389
PMID:29379265
|
研究论文 | 研究利用电化学刺激从聚合物刷修饰的铟锡氧化物（ITO）电极阵列中释放DNA，并激活基于DNA的逻辑门 | 首次将DNA化学过程与电子输入信号结合，用于DNA计算 | NA | 开发一种新的DNA计算系统，通过电化学方法激活DNA逻辑门 | 基于DNA的逻辑门和电化学激活的DNA释放机制 | 生物技术 | NA | 电化学 | NA | DNA | 使用了四个独立的ITO电极阵列 | NA | NA | NA | NA |
| 555 | 2024-08-07 |
DNA Cryptography and Deep Learning using Genetic Algorithm with NW algorithm for Key Generation
2017-Dec-05, Journal of medical systems
IF:3.5Q2
DOI:10.1007/s10916-017-0851-z
PMID:29204890
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合DNA序列和深度学习的加密技术，并提出了基于遗传算法和Needleman-Wunsch算法的密钥生成方法以及基于DNA计算的加密和解密方法 | 本文创新性地提出了DNA深度学习加密概念，并结合遗传算法和Needleman-Wunsch算法生成密钥，以及使用生物操作（转录、翻译、DNA测序和深度学习）进行加密和解密 | NA | 研究如何通过强算法、强密钥和强加密解密概念来实现安全的通信 | DNA序列和深度学习在加密技术中的应用 | 机器学习 | NA | 遗传算法, Needleman-Wunsch算法 | 深度学习 | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 556 | 2024-08-07 |
A domain-based DNA circuit for smart single-nucleotide variant identification
2018-Feb-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c7cc07733e
PMID:29177325
|
研究论文 | 本文构建了基于四个同源寡核苷酸的差异信息的两个域基编码器，用于智能单核苷酸变异识别。 | 通过输入与输出的逐一对应关系，实现了单核苷酸变异及其域级位置的识别。 | NA | 开发一种基于域的DNA电路，用于智能识别单核苷酸变异。 | 单核苷酸变异及其在域级的位置。 | NA | NA | NA | NA | 分子信息 | 四个同源寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 557 | 2024-08-07 |
Design and Analysis of Compact DNA Strand Displacement Circuits for Analog Computation Using Autocatalytic Amplifiers
2018-01-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.6b00390
PMID:29202579
|
研究论文 | 本文提出了一种新颖的架构，用于构建紧凑的DNA链置换电路，以模拟方式计算广泛的功能 | 该架构利用自催化放大器进行对数和指数转换，结合了链浓度和时间编码的计算值 | NA | 构建使用最少DNA链的DNA电路，以计算指定功能 | DNA链置换电路的设计和分析 | 分子计算 | NA | DNA链置换 | 自催化放大器 | DNA链浓度 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 558 | 2024-08-07 |
A signal-amplifiable biochip quantifies extracellular vesicle-associated RNAs for early cancer detection
2017-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01942-1
PMID:29162835
|
研究论文 | 本文报道了一种基于纳米粒子的生物芯片，能够无需分离直接捕获循环中的外泌体，并在单一步骤中增强包裹的RNA荧光信号，实现早期癌症检测 | 该生物芯片采用核心-壳-冠结构的阳离子脂质-聚合物混合纳米粒子（LPHN），通过催化发夹DNA电路（CHDC）与外泌体相关RNA结合，实现信号的原位放大 | NA | 开发一种新型的生物芯片技术，用于早期癌症的检测 | 外泌体相关RNA的检测及早期癌症的诊断 | 生物技术 | 胰腺癌 | 纳米粒子技术 | NA | RNA | 包括人工外泌体、癌细胞及癌细胞衍生的外泌体 | NA | NA | NA | NA |
| 559 | 2024-08-07 |
Synthetic Ion Channels and DNA Logic Gates as Components of Molecular Robots
2018-02-19, Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/cphc.201700982
PMID:29124837
|
综述 | 本文综述了合成离子通道和DNA计算技术作为分子机器人潜在组件的最新研究 | 介绍了合成离子通道和DNA逻辑门在分子机器人中的应用，这些技术使得分子机器人能够感知环境并进行计算 | NA | 探讨合成离子通道和DNA计算技术在分子机器人中的应用 | 合成离子通道和DNA逻辑门 | 生物化学 | NA | DNA计算技术 | DNA逻辑门 | 离子或化学物质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 560 | 2024-08-07 |
Model Checking Temporal Logic Formulas Using Sticker Automata
2017, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2017/7941845
PMID:29119114
|
研究论文 | 本文提出了一种使用DNA分子进行时间逻辑公式模型检查的方法，特别是针对计算树逻辑（CTL）、区间时间逻辑（ITL）和投影时间逻辑（PTL） | 首次提出了一种基于DNA的模型检查方法，用于检查CTL、ITL和PTL的基本公式 | NA | 解决DNA计算环境下时间逻辑模型检查问题 | 时间逻辑公式和系统模型 | NA | NA | DNA分子 | 贴纸自动机 | DNA分子 | NA | NA | NA | NA | NA |