生物计算机与DNA存储相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
521	2024-08-07	Evolving Transport Networks With Cellular Automata Models Inspired by Slime Mould 2015-Sep, IEEE transactions on cybernetics IF:9.4Q1 DOI:10.1109/TCYB.2014.2361731 PMID:25438333	研究论文	本文提出了一种基于细胞自动机的网络设计模型，灵感来源于黏菌的传播策略和计算能力	该模型通过模拟黏菌的传播策略和网络形成能力，提供了一种高效的生物启发计算设备设计方法	使用活体黏菌构建的计算设备速度极慢，需要数天时间执行计算	旨在开发一种高效的生物启发计算设备，用于解决难以通过传统算法解决的计算智能问题	研究对象为黏菌Physarum polycephalum及其在网络设计中的应用	计算智能	NA	细胞自动机(CA)	细胞自动机(CA)	网络数据	NA
522	2024-08-07	Parts & pools: a framework for modular design of synthetic gene circuits 2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2014.00042 PMID:25340051	研究论文	本文介绍了Parts & Pools框架，该框架用于模块化设计细菌和真核细胞的合成基因电路	Parts & Pools框架首次实现了对真核生物电路组件的适当形式化描述，并采用了基于规则的建模技术	NA	开发一个用于自动设计和可视化模块化合成基因电路的框架	细菌和真核细胞的合成基因电路	生物工程	NA	基于规则的建模	NA	NA	NA
523	2024-08-07	Freezing and storage at -20 °C provides adequate preservation of Toxoplasma gondii DNA for retrospective molecular analysis 2014-Nov, Diagnostic microbiology and infectious disease IF:2.1Q3 DOI:10.1016/j.diagmicrobio.2014.08.007 PMID:25241642	研究论文	本文研究了在-20°C和-80°C条件下储存的弓形虫DNA对实时PCR检测的影响	本文首次比较了不同储存温度对弓形虫DNA检测的影响	NA	探讨弓形虫DNA在不同储存条件下的长期保存效果	弓形虫DNA的储存条件	NA	弓形虫病	实时PCR	NA	DNA	NA
524	2024-08-07	Neural networks and neuroscience-inspired computer vision 2014-Sep-22, Current biology : CB IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.cub.2014.08.026 PMID:25247371	综述	本文回顾了神经科学和计算机科学之间的历史联系，并展望了基于生物启发计算机视觉和实验神经科学方法的快速发展，可能带来的新合作时代。	探讨了神经科学启发算法在计算机视觉中的成功应用和现有局限，并指出了未来可能取得进展的领域。	文章主要为综述性质，未提供具体的研究数据或实验结果。	探讨神经科学与计算机科学之间的交叉合作，特别是在生物启发计算机视觉领域的应用。	神经科学启发算法在计算机视觉中的应用及其效果。	计算机视觉	NA	NA	NA	NA	NA
525	2024-08-07	Cross-kingdom chemical communication drives a heritable, mutually beneficial prion-based transformation of metabolism 2014-Aug-28, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2014.07.025 PMID:25171409	研究论文	研究报告了一种跨界的化学通讯系统，通过该系统细菌可以遗传性地改变酵母的代谢	首次报道了细菌通过分泌化学因子诱导酵母中的[GAR(+)]元素，从而改变酵母的代谢，使其在葡萄糖存在下利用多种碳源	NA	探索生物界间的化学通讯及其对代谢的遗传性影响	细菌与酵母的相互作用及其对酵母代谢的影响	NA	NA	NA	NA	NA	NA
526	2024-08-07	A Cerebellar Neuroprosthetic System: Computational Architecture and in vivo Test 2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2 DOI:10.3389/fbioe.2014.00014 PMID:25152887	研究论文	本文展示了通过计算模型替换小脑电路以实现神经假体系统的可行性，并进行了活体测试	开发了一种小脑神经假体系统，通过计算模型模拟小脑微电路的学习功能，并在活体动物中验证了其有效性	生物信号的非平稳性限制了小脑模型的性能	验证通过神经假体系统替换受损神经回路的可行性，并实现对小脑学习功能的恢复	小脑电路及其在条件反射学习中的作用	NA	NA	计算模型	小脑微电路模型	生理记录数据	实验涉及多只麻醉大鼠
527	2024-08-07	Strip biosensor for amplified detection of nerve growth factor-beta based on a molecular translator and catalytic DNA circuit 2014-Oct-07, The Analyst DOI:10.1039/c4an00908h PMID:25068151	研究论文	本文展示了一种基于分子翻译器和催化DNA电路的新型视觉检测方法，用于检测神经生长因子-β（NGF-β）	该方法利用基于结合诱导的DNA链置换反应的分子翻译器将输入蛋白转换为输出DNA信号，并通过催化DNA电路进行信号放大，实现了高灵敏度和选择性的检测	NA	开发一种新型的生物传感器，用于高灵敏度和选择性地检测神经生长因子-β	神经生长因子-β（NGF-β）	生物传感器	NA	DNA链置换反应	催化DNA电路	DNA	动态响应范围从10 fM到10 pM，检测限为10 fM的NGF-β
528	2024-08-07	Intelligent layered nanoflare: "lab-on-a-nanoparticle" for multiple DNA logic gate operations and efficient intracellular delivery 2014-Aug-07, Nanoscale IF:5.8Q1 DOI:10.1039/c4nr01676a PMID:24969570	研究论文	本研究开发了一种新型DNA纳米装置——智能分层纳米闪光，它通过在单个金纳米颗粒上自组装DNA闪光，实现了纳米尺度的DNA计算	智能分层纳米闪光能够执行多种布尔逻辑门操作，并能作为单个实体进行细胞内DNA逻辑门传递，无需商业转染剂或其他辅助载体	NA	解决裸DNA结构细胞内化不足及多组分分离的问题，扩展DNA电路在生物系统中的应用	DNA纳米装置的开发及其在细胞内传递和逻辑门操作中的应用	纳米技术	NA	DNA自组装	NA	纳米颗粒	NA
529	2024-08-07	Assessment of DNA encapsulation, a new room-temperature DNA storage method 2014-Jun, Biopreservation and biobanking IF:1.2Q3 DOI:10.1089/bio.2013.0082 PMID:24955733	研究论文	评估一种新的常温DNA存储方法，即在无氧和无水的环境中，将来自人体组织、细菌和植物的DNA样本存储在激光密封的不锈钢胶囊（DNAshells®）中的小玻璃瓶内	首次展示了DNAshells®在常温下存储DNA的长期稳定性和保护性能，即使在极端条件下也能保持DNA的完整性	在76°C存储30小时后，需要调整过程以避免DNA损失	评估一种新的常温DNA存储方法的稳定性和保护性能	人体组织、细菌和植物的DNA样本	分子生物学	NA	聚合酶链反应、脉冲场凝胶电泳、扩增片段长度多态性分析	NA	DNA	多个来自人体组织、细菌和植物的DNA样本
530	2024-08-07	Label-free logic modules and two-layer cascade based on stem-loop probes containing a G-quadruplex domain 2014-Sep, Chemistry, an Asian journal DOI:10.1002/asia.201402199 PMID:24909844	研究论文	设计了一种基于脚跟介导的链置换和茎环探针的无标记DNA计算策略，构建了完整的逻辑门和双层逻辑级联	利用含有G四链体域的茎环探针，通过链置换实现逻辑门的构建，并使用G四链体/NMM复合物的荧光信号作为输出读出	NA	开发一种多目标诊断的通用计算系统	疾病特异性核苷酸序列	生物技术	NA	脚跟介导的链置换	逻辑门	DNA序列	NA
531	2024-08-07	Diagnostic applications of nucleic acid circuits 2014-Jun-17, Accounts of chemical research IF:16.4Q1 DOI:10.1021/ar500059c PMID:24828239	研究论文	本文讨论了核酸电路在分析应用中的重要性，特别是其在诊断应用中的潜在用途	介绍了核酸电路的模块化特性，以及其在信号放大和分析模式转换中的应用	NA	探讨核酸电路在诊断应用中的潜力	核酸电路及其在诊断中的应用	分子编程	NA	核酸放大反应，如催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR）	核酸电路	核酸	NA
532	2024-08-07	The neural basis of human tool use 2014, Frontiers in psychology IF:2.6Q2 DOI:10.3389/fpsyg.2014.00310 PMID:24782809	综述	本文综述提出，人类自发多样化工具使用的神经基础是位于左前顶上小叶（aSMG）的一个区域，该区域负责执行和观察工具动作	提出aSMG可能是通过猴子AIP的复制和来自PPC的传入神经入侵而产生的，这一复制可能发生在Homo Habilis或Homo Erectus时期，从而产生了Oldowan或Acheulean工业复合体	NA	探讨人类工具使用的神经基础及其在进化中的起源	人类工具使用的神经机制	神经科学	NA	NA	NA	NA	NA
533	2024-08-07	The value of DNA storage and pedigree analysis in rare diseases: a 17-year-old boy with X-linked lymphoproliferative disease (XLP) caused by a de novo SH2D1A mutation 2014-Dec, European journal of pediatrics IF:3.0Q1 DOI:10.1007/s00431-014-2313-7 PMID:24723092	病例报告	本文报告了一例因X连锁淋巴组织增生性疾病（XLP）导致的17岁男性患者致命的Epstein-Barr病毒感染，通过存储的患者DNA和家系分析确认了SH2D1A基因的新发突变。	强调了DNA存储、家系分析和多学科护理在罕见疾病患者及其家庭中的重要性。	NA	探讨DNA存储和家系分析在罕见疾病诊断中的应用价值。	一例X连锁淋巴组织增生性疾病患者及其家系。	NA	X连锁淋巴组织增生性疾病	DNA诊断	NA	DNA	单个病例
534	2024-08-07	Design and implementation of a microfluidic half adder chip based on double-stranded DNA 2014-Jun, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2014.2311792 PMID:24691162	研究论文	本文设计并实现了一种基于双链DNA的微流控半加器芯片	该研究采用生物反应方法在微流控芯片上实现了半加器，结合生物芯片技术，使用玻璃和聚二甲基硅氧烷制作微型混合芯片，通过控制双链DNA的退火和变性来实现半加器的功能	NA	开发一种基于DNA计算的生物芯片，作为DNA分子计算机发展的关键领域	半加器作为各种算术单元的基本单元，其复杂结构直接影响计算机的整体结构复杂性	生物技术	NA	DNA计算	微流控芯片	DNA	NA
535	2024-08-07	Nucleocytoplasmic shuttling of a GATA transcription factor functions as a development timer 2014-Mar-21, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.1249531 PMID:24653039	研究论文	本文报道了在Dictyostelium discoideum中，GtaC转录因子通过核质穿梭响应cAMP波，调控细胞发育	首次揭示了GtaC转录因子通过核质穿梭响应cAMP波的机制，以及这种行为如何影响发育基因表达	NA	探究GtaC转录因子在Dictyostelium discoideum中的核质穿梭行为及其对细胞发育的调控作用	GtaC转录因子及其在Dictyostelium discoideum中的功能	NA	NA	核质穿梭分析，磷酸化检测	NA	生物信号	NA
536	2024-08-07	Parallel molecular computation of modular-multiplication with two same inputs over finite field GF(2(n)) using self-assembly of DNA tiles 2014-Jun, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2014.01.004 PMID:24534382	研究论文	本文提出了一种利用DNA瓦片自组装模型在有限域GF(2(n))上进行并行模平方和模乘运算的方法	该系统通过同时执行平方和约简操作，比先前的分子计算系统在步骤上更少	NA	探索DNA计算在大型并行计算、海量数据存储和密码学中的应用	利用DNA瓦片自组装模型在有限域GF(2(n))上进行基本运算	生物信息学	NA	DNA计算	DNA瓦片自组装模型	DNA序列	NA
537	2024-08-07	Efficiency of a novel forensic room-temperature DNA storage medium 2014-Mar, Forensic science international. Genetics DOI:10.1016/j.fsigen.2013.11.009 PMID:24528585	研究论文	本研究评估了一种新型法医室温DNA存储介质在长时间内保存混合人类DNA样本的能力	开发了一种基于脱水生物学原理的新技术，允许DNA在室温下存储	研究显示，经过两年室温老化后，观察到的等位基因数量和峰值高度有所下降	评估新型室温DNA存储技术在长时间内保存法医样本的能力	混合人类DNA样本	NA	NA	Short Tandem Repeat (STR) genotyping	NA	DNA	混合人类DNA样本，来自2或3人，浓度较低，存储时间为6个月至2年
538	2024-08-07	Design and application of cotranscriptional non-enzymatic RNA circuits and signal transducers 2014-Apr, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gku074 PMID:24493736	研究论文	本文探讨了使用RNA作为信息存储和处理的催化发夹组装核酸电路的设计和应用	开发了适用于RNA电路的工程设计原则，并展示了RNA发夹在体外转录后无需纯化即可进行放大反应的能力	NA	探索RNA电路在诊断和合成生物学中的应用潜力	RNA电路的设计和其在细胞中的应用	合成生物学	NA	催化发夹组装	NA	RNA	NA
539	2024-08-07	Design of a reversible single precision floating point subtractor 2014-Jan-04, SpringerPlus DOI:10.1186/2193-1801-3-11 PMID:24455466	研究论文	本文提出了一种高效的单精度可逆浮点减法器设计	本文提出了两个新的3x3可逆门来实现可逆1位比较器，并在可逆门数量、晶体管数量和垃圾输出数量上进行了优化	NA	研究可逆逻辑以减少低功耗数字电路设计中的功耗	单精度可逆浮点减法器	数字信号处理	NA	可逆逻辑	可逆门	数字电路	32位可逆浮点减法器
540	2024-08-07	Towards 3D in silico modeling of the sea urchin embryonic development 2013-Sep-13, Journal of chemical biology DOI:10.1007/s12154-013-0101-x PMID:24386014	研究论文	本文讨论了通过时间推移成像技术重建三维数字胚胎，以模拟海胆胚胎发育的方法	提出了一种新的方法，通过时间推移成像技术重建三维数字胚胎，以模拟生物系统的内在特性	目前的方法如“组学”方法提供的信息是静态的，时间分辨率低，并且通常是群体平均的，掩盖了细胞尺度上的快速或可变特征	探索整合分子、遗传和细胞动力学，以更好地理解胚胎发育的动态过程	海胆胚胎发育过程	数字病理学	NA	时间推移成像技术	三维数字模型	图像	特定海胆物种