生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-07 |
IWO Algorithm Based on Niche Crowding for DNA Sequence Design
2017-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-016-0160-0
PMID:27013509
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研究论文 | 本文研究基于小生境拥挤的入侵杂草优化算法在DNA序列设计中的应用 | 提出了一种改进的空间分散策略，并结合小生境拥挤技术优化入侵杂草优化算法 | NA | 提高DNA计算的准确性和效率 | DNA序列设计 | 生物信息学 | NA | 入侵杂草优化算法 | NA | DNA序列 | NA |
| 502 | 2024-08-07 |
Multi-objective optimization framework to obtain model-based guidelines for tuning biological synthetic devices: an adaptive network case
2016-Mar-11, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-016-0269-0
PMID:26968941
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研究论文 | 本文提出了一种多目标优化框架，用于获取基于模型的指导原则，以调整生物合成设备的参数，实现预定的电路行为 | 本文创新性地使用了多目标优化调整框架，为生物设备的参数选择提供了一套基于模型的指导原则 | 确定涉及部件参数的精确值不是一个现实的方法，生物部件的特性存在不确定性 | 旨在提供有效的指导原则，通过调整生物参数以实现预期的电路行为 | 生物合成设备的参数调整 | 合成生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-08-07 |
Implementing a two-layer feed-forward catalytic DNA circuit for enzyme-free and colorimetric detection of nucleic acids
2016-Mar-03, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2016.01.013
PMID:26873470
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研究论文 | 本研究开发了一种高灵敏度和特异性的生物传感平台，用于无酶和比色法检测核酸 | 该平台由两个DNA纳米结构和两个燃料链组成，构建了一个前馈催化DNA电路，能够通过释放能够将无色底物转化为有色物质的血红素结合适配体来检测目标DNA | NA | 开发一种无酶的催化DNA电路，作为基于酶的生物传感器的敏感替代方法，用于特定和成本效益高的核酸检测 | 核酸的检测 | 生物传感技术 | NA | DNA纳米技术 | 前馈催化DNA电路 | 核酸 | 在血清样本中可以检测到4 pM的目标DNA，延长孵育时间至3小时后可以检测到1 pM的目标DNA |
| 504 | 2024-08-07 |
Logic Gate Operation by DNA Translocation through Biological Nanopores
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0149667
PMID:26890568
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研究论文 | 本文提出了一种利用生物纳米孔与DNA分子结合的逻辑操作系统 | 首次成功实现了无标记DNA的快速NAND逻辑操作，并在四液滴网络中进行了操作 | NA | 开发一种基于生物纳米孔的逻辑操作系统 | DNA分子和生物纳米孔 | 生物技术 | NA | 生物纳米孔技术 | NA | DNA | NA |
| 505 | 2024-08-07 |
High-speed DNA-based rolling motors powered by RNase H
2016-Feb, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/nnano.2015.259
PMID:26619152
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research paper | 本文报道了一种基于DNA的滚动马达，其速度和进程性比传统DNA马达高出三个数量级 | 开发了一种新型DNA滚动马达，通过使用DNA涂层的球形颗粒与表面修饰的互补RNA结合，并通过RNase H的加入实现运动，速度和进程性显著提高 | NA | 研究基于DNA的机器在传感器、药物输送平台和生物计算等应用中的潜力 | 基于DNA的滚动马达及其在单核苷酸多态性检测中的应用 | 生物计算 | NA | RNase H | NA | DNA | NA |
| 506 | 2024-08-07 |
Polarizability of Six-Helix Bundle and Triangle DNA Origami and Their Escape Characteristics from a Dielectrophoretic Trap
2015-Dec-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5b02524
PMID:26570981
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研究论文 | 本文通过实验测定了六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率，并研究了它们在介电电泳陷阱中的逃逸特性 | 首次实验测定了六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率，并利用改进的Kramer速率模型分析了它们的逃逸特性 | NA | 研究DNA折纸在介电电泳中的迁移和定位方法 | 六螺旋束和三角形DNA折纸的极化率和逃逸特性 | 纳米技术 | NA | 介电电泳(iDEP) | NA | 实验数据 | 六螺旋束和三角形DNA折纸 |
| 507 | 2024-08-07 |
A Reversible DNA Logic Gate Platform Operated by One- and Two-Photon Excitations
2016-Jan-04, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.201507249
PMID:26530026
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研究论文 | 本文展示了一种利用不同波长范围的激发光作为输入，远程触发自组装DNA设备（D-OR）响应的可逆DNA逻辑门平台 | 这是首个光响应DNA逻辑门系统，同时也是一个生物相容的、多波长激发系统，能够响应紫外和近红外光 | NA | 探索光响应DNA基系统作为DNA计算、显示设备、光学通信和生物学中的多功能工具的概念 | 自组装DNA设备（D-OR）及其在细胞内的应用 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-08-07 |
Coupling a universal DNA circuit with graphene sheets/polyaniline/AuNPs nanocomposites for the detection of BCR/ABL fusion gene
2015-Aug-19, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.06.050
PMID:26343430
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研究论文 | 本文介绍了一种新型方法，通过将通用DNA电路与石墨烯片/聚苯胺/金纳米粒子纳米复合材料（GS/PANI/AuNPs）结合，用于高灵敏度和特异性地检测慢性髓性白血病（CML）中的BCR/ABL融合基因（bcr/abl）。 | 设计了一种转换器发夹（HP）以获得具有良好信噪比的通用DNA电路，并引入了具有优异导电性和扩大有效区域的GS/PANI/AuNPs，进一步提高了信号放大。 | NA | 开发一种高灵敏度和特异性的方法，用于检测慢性髓性白血病中的BCR/ABL融合基因。 | BCR/ABL融合基因（bcr/abl） | 生物传感 | 慢性髓性白血病 | 催化发夹组装（CHA） | NA | DNA | 检测范围从10 pM到20 nM，检测限为1.05 pM |
| 509 | 2024-08-07 |
Universal strategy to engineer catalytic DNA hairpin assemblies for protein analysis
2015-Aug-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5b02504
PMID:26237634
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研究论文 | 本文展示了一种合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为有效催化剂，加速催化发夹组装（CHA）反应，从而扩展CHA在蛋白质分析中的应用 | 提出了一种通用策略，通过使用合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为催化剂，来构建蛋白质响应的CHA | NA | 开发针对多种重要蛋白质生物标志物的特定CHA，并探索其在人类血清样本和癌细胞中检测特定蛋白质生物标志物的应用潜力 | 人α-凝血酶、人前列腺特异性抗原和人表皮生长因子受体2等蛋白质生物标志物 | 生物传感 | NA | 催化发夹组装（CHA） | NA | DNA | NA |
| 510 | 2024-08-07 |
Optimizing Storage and Handling of DNA Extracts
2010-Jul, Forensic science review
PMID:26242592
|
综述 | 本文综述了核酸样本存储在法医学、流行病学、临床和遗传实验室中的重要性，并探讨了优化DNA提取物存储和处理的方法 | NA | NA | 探讨和优化DNA提取物的存储和放大方法，以确保从各种类型的样本中成功恢复基因型 | DNA/RNA样本的存储和处理方法 | 法医学 | NA | PCR | NA | DNA/RNA | 数百万生物样本，包括细胞、病毒和DNA/RNA |
| 511 | 2024-08-07 |
Design of a DNA-based reversible arithmetic and logic unit
2015-Aug, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2014.0056
PMID:26224353
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研究论文 | 本研究利用脱氧核糖核酸（DNA）实现了一个算术逻辑单元（ALU），该ALU在计算过程中保持逻辑可逆性，并能执行四种逻辑（与、或、异或和非）和三种算术（加、减和乘）操作 | 相较于硅基计算，提出的ALU由于并行性、复制特性、紧凑性和DNA链的形成，速度更快且所需空间和功率更少。此外，与现有的DNA基系统相比，每个步骤所需的信号更少，且所需的生物步骤也更少 | NA | 实现基于DNA的算术逻辑单元 | 基于DNA的算术逻辑单元及其在逻辑和算术操作中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
| 512 | 2024-08-07 |
Signal-to-Noise Ratio Measures Efficacy of Biological Computing Devices and Circuits
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00093
PMID:26177070
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研究论文 | 本文通过定量信号-噪声比分析，探讨了生物计算设备和电路的效能提升方法 | 提出了一种基于信号-噪声比分析的方法，用于评估和改进生物计算设备的性能 | 目前没有足够的库能满足通用电路工程的需求 | 提高生物计算设备和电路的可预测性和有效性 | 生物计算设备及其在复杂环境中的性能 | 生物工程 | NA | 信号-噪声比分析 | NA | 输入/输出曲线和表达噪声数据 | 涉及当前抑制剂库的分析 |
| 513 | 2024-08-07 |
An analytical approach to bistable biological circuit discrimination using real algebraic geometry
2015-Jul-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.0288
PMID:26109633
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研究论文 | 本文探讨了利用19世纪的实代数几何工具——斯图姆定理，来比较功能等效的双稳态生物电路的可行性，无需数值模拟 | 首次将斯图姆定理应用于生物分子电路的分析，提供了一种新的方法来比较不同电路设计的参数空间 | NA | 研究不同双稳态生物电路之间的差异，特别是为合成生物学家选择最佳电路设计提供理论支持 | 双稳态生物分子电路及其在参数空间中的行为 | 生物技术 | NA | 实代数几何 | NA | 电路拓扑结构 | NA |
| 514 | 2024-08-07 |
Chemical computing with reaction-diffusion processes
2015-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2014.0219
PMID:26078345
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研究论文 | 本文探讨了化学反应扩散过程在信息处理中的应用，特别是通过Belousov-Zhabotinsky（BZ）反应及其光敏变体来展示化学信息处理的思路 | 展示了信息处理的计算普遍性，并描述了不同信息编码方法下最简单的信号处理设备的构建 | NA | 探讨化学反应扩散过程是否能被用于生成化学信息处理设备 | 化学反应扩散过程及其在信息处理中的应用 | NA | NA | Belousov-Zhabotinsky（BZ）反应 | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-08-07 |
A parallel algorithm for solving the n-queens problem based on inspired computational model
2015-May, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2015.03.004
PMID:25817410
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研究论文 | 本文提出了一种基于生物启发计算模型的并行DNA算法，用于解决n皇后问题 | 利用DNA分子操作解决n皇后问题，简化了计算复杂度并验证了DNA算法的可行性 | NA | 开发一种新的并行算法来解决计算难题 | n皇后问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | DNA分子 | NA |
| 516 | 2024-08-07 |
Enzyme-regulated the changes of pH values for assembling a colorimetric and multistage interconnection logic network with multiple readouts
2015-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.02.026
PMID:25819791
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研究论文 | 本文开发了一种基于酶反应触发pH值变化和生物计算的新型多级互联生物网络，具有多个易于检测的信号输出 | 与传统的化学计算相比，基于酶的生物系统能够克服反应间的干扰或单个计算门的不兼容性，为组装多组分/多功能逻辑电路提供了独特的机会 | NA | 开发一种新型的多级互联生物网络，用于实现成本效益高、无需标记且可通过肉眼进行颜色逻辑操作的方法 | 酶输入（β-半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶、酯酶和脲酶）以及信号转导器（金纳米颗粒和酸碱指示剂）或pH计 | 生物计算 | NA | 酶反应 | 多级互联生物网络 | 信号输出 | 包括四种酶输入 |
| 517 | 2024-08-07 |
Versatile G-quadruplex-mediated strategies in label-free biosensors and logic systems
2015-Apr-21, The Analyst
DOI:10.1039/c4an02282c
PMID:25705973
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研究论文 | 本文探讨了G-四链体（G4）在无标记生物传感器和逻辑系统中的应用 | 利用G4的过氧化物酶样活性和G4增强的发光特性，结合G4与其他功能性核酸的耦合，扩展了其应用范围 | 存在抗干扰能力低和多重分析能力有限的问题 | 研究G-四链体在生物分析和复杂DNA计算中的应用潜力 | G-四链体及其复合物在生物传感器和逻辑系统中的应用 | 生物传感器 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-08-07 |
Comparison of eleven methods for genomic DNA extraction suitable for large-scale whole-genome genotyping and long-term DNA banking using blood samples
2015, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0115960
PMID:25635817
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研究论文 | 本研究比较了十一种从绵羊血液样本中提取基因组DNA的方法，以确定它们在大规模全基因组基因分型和长期DNA存储中的相对有效性 | 本研究首次系统比较了多种DNA提取方法，并确定了四种最适合大规模微阵列基因分型和长期DNA存储的方法 | 研究仅限于绵羊血液样本，可能不适用于其他物种或其他类型的样本 | 评估不同DNA提取方法在大规模基因分型和长期DNA存储中的有效性 | 绵羊血液样本中的基因组DNA | 基因组学 | NA | 下一代测序技术，微阵列技术 | NA | 基因组DNA | 600个个体 |
| 519 | 2024-08-07 |
DNA storage under high temperature conditions does not affect performance in human leukocyte antigen genotyping via next-generation sequencing (DNA integrity maintained in extreme conditions)
2014-Dec, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2014.0036
PMID:25496152
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研究论文 | 本研究测试了在极端条件下长期存储于GenTegra DNA稳定化矩阵中的基因组DNA的完整性，并通过下一代测序（NGS）进行人类白细胞抗原（HLA）基因分型。 | 本研究展示了GenTegra产品在高温和温度波动条件下作为基因组DNA保存工具的有效性。 | NA | 测试在极端条件下长期存储的基因组DNA的完整性，并评估其在下游分子应用中的性能。 | 基因组DNA的完整性和性能。 | 分子生物学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | DNA | 多个基因组DNA样本 |
| 520 | 2024-08-07 |
How MAP kinase modules function as robust, yet adaptable, circuits
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/cc.29349
PMID:25483189
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研究论文 | 本文通过计算模拟研究了MAP激酶模块的3层拓扑结构及其在生物电路中的稳健性和适应性 | 提出了一个基本的2层电路拓扑结构，该结构可以通过反馈回路和支架重新配置，生成多样化的信号输出，从而形成既稳健又适应的3层模块化配置 | NA | 理解稳健且适应性强的模块如何影响真核生物的进化，并为进化生物学和合成生物学提供信息 | MAP激酶模块及其在生物电路中的功能 | 生物学 | NA | 计算模拟 | NA | NA | NA |