生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 784 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-07 |
Electro-Mechanical Conductance Modulation of a Nanopore Using a Removable Gate
2019-02-26, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.8b09266
PMID:30715850
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研究论文 | 本文通过结合单分子电记录和全原子分子动力学模拟，展示了一种混合纳米孔系统，该系统能够实现其电导的分步变化和非线性电流-电压依赖性 | 开发了一种使用短柔性肽门的新型纳米孔系统，该肽门的两端带有相反的电荷，能够实现电导的步进变化和非线性调节 | NA | 探索人工系统中合成离子通道的开发，以实现对外部操作的电导变化响应 | 混合纳米孔系统及其电导调节机制 | 生物计算 | NA | 单分子电记录，全原子分子动力学模拟 | NA | 电信号 | NA |
| 502 | 2024-08-07 |
Allosteric DNAzyme-based DNA logic circuit: operations and dynamic analysis
2019-02-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1245
PMID:30541100
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研究论文 | 本文提出了一种基于别构DNAzyme的DNA逻辑电路，通过DNA链置换调控DNAzyme结构，实现对其活性的控制 | 引入了一种新的别构策略来调控DNAzyme的活性，无需改变DNA序列 | NA | 探索别构DNAzyme在DNA逻辑电路中的应用及其动态分析 | 别构DNAzyme及其在DNA逻辑电路中的操作 | 生物计算 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-08-07 |
Suitability of dried DNA for long-range PCR amplification and HLA typing by next-generation sequencing
2019-Feb, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2018.12.002
PMID:30529364
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研究论文 | 本文比较了两种DNA存储方法（干燥和传统-80°C）的样本特性，评估了DNA的纯度、片段长度以及使用下一代测序进行HLA分型的能力 | 探讨了干燥状态下DNA存储的可行性，为实验室提供了一种新的样本存储和运输方法 | NA | 研究干燥状态下DNA存储的适用性及其对下游应用的影响 | DNA的存储方法及其对样本质量的影响 | 基因组学 | NA | 下一代测序 | NA | DNA | NA |
| 504 | 2024-08-07 |
Subcellular connectomic analyses of energy networks in striated muscle
2018-11-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-07676-y
PMID:30504768
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研究论文 | 本文开发了一种框架，用于定量评估肌肉线粒体网络的连接性和与细胞能量储存、利用及钙循环位点的相互作用。 | 首次展示了肌肉线粒体网络的电连接性，并开发了评估单细胞内线粒体连接性的工具。 | 目前缺乏评估单细胞内高空间分辨率器官连接性的工具。 | 探索肌肉中线粒体网络的连接性及其与细胞能量分布和钙循环的关系。 | 心脏肌、氧化肌和糖酵解肌的线粒体网络连接性及其与细胞能量储存和钙循环的相互作用。 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-08-07 |
Computing with biological switches and clocks
2018, Natural computing
IF:1.7Q2
DOI:10.1007/s11047-018-9686-x
PMID:30524215
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研究论文 | 本文回顾了生物系统中计算的历史视角，重点关注生物开关和时钟，并讨论了生物学与计算之间的相似性 | 探讨了生物系统中开关和时钟组合如何推动新型计算算法的发展 | NA | 探讨生物计算的未来愿景 | 生物系统中的开关和时钟 | 生物信息学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-08-07 |
8-Bit Adder and Subtractor with Domain Label Based on DNA Strand Displacement
2018-Nov-15, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules23112989
PMID:30445809
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research paper | 本文设计了一种基于DNA链置换的级联8位加法器/减法器，使用域标签表示信号1和信号0 | 首次设计了基于DNA链置换的带有域标签的级联8位加法器/减法器，并重构了基本逻辑门、放大门、扇出门和报告门为域标签门 | NA | 探索和扩展分子逻辑电路的应用 | 基于DNA链置换的生物逻辑电路 | 生物计算 | NA | DNA链置换 | NA | 逻辑计算模型 | NA |
| 507 | 2024-08-07 |
Single-molecule catalytic hairpin assembly for rapid and direct quantification of circulating miRNA biomarkers
2018-Dec-26, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2018.08.037
PMID:30428976
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研究论文 | 本文介绍了一种结合动态DNA电路和单分子荧光检测的高灵敏度方法，用于快速直接定量血清中的循环miRNA生物标志物 | 该方法通过单分子计数和全内反射荧光显微镜（TIRFM）检测，实现了对miRNA目标的高灵敏度和快速定量 | NA | 开发一种高灵敏度和特异性的方法来检测循环miRNA生物标志物 | 循环miRNA生物标志物，包括miR-141、miR-21和miR-16 | 数字病理学 | 前列腺癌，乳腺癌 | 全内反射荧光显微镜（TIRFM） | NA | miRNA | 29个健康样本，18个前列腺癌样本，23个乳腺癌样本 |
| 508 | 2024-08-07 |
Highly Sensitive Assay of Methyltransferase Activity Based on an Autonomous Concatenated DNA Circuit
2018-11-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.8b00738
PMID:30350594
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研究论文 | 本文开发了一种基于两层DNA电路的非酶MTase传感平台，通过上游催化发夹组装（CHA）电路和下游杂交链反应（HCR）电路的级联放大，实现了对MTase及其抑制剂的超灵敏检测。 | 该方法利用多重保证的MTase/内切酶识别特异性和级联CHA-HCR电路的协同放大特性，实现了对MTase的超灵敏检测，并可通过简单设计相应底物来探测其他不同的生物转化。 | NA | 开发一种超灵敏的MTase检测方法，以满足临床诊断和生物医学研究的需求。 | MTase及其抑制剂在血清和E. coli细胞中的检测。 | 生物技术 | NA | DNA电路，催化发夹组装（CHA），杂交链反应（HCR） | NA | DNA | 血清和E. coli细胞 |
| 509 | 2024-08-07 |
Sc-ncDNAPred: A Sequence-Based Predictor for Identifying Non-coding DNA in Saccharomyces cerevisiae
2018, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2018.02174
PMID:30258427
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于序列的预测工具Sc-ncDNAPred，用于识别酵母中的非编码DNA序列 | 开发了一种基于支持向量机的预测工具Sc-ncDNAPred，用于高效准确地预测非编码DNA序列 | NA | 开发机器学习方法以预测非编码DNA序列 | 酵母中的非编码DNA序列 | 基因组学 | NA | 支持向量机学习方法 | 支持向量机 | DNA序列 | 使用了包含单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸的特征提取策略 |
| 510 | 2024-08-07 |
Design of DNA-based innovative computing system of digital comparison
2018-10-15, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2018.09.018
PMID:30223093
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研究论文 | 本文首次构建了一种基于DNA的新型逻辑计算系统，用于比较两个或多个数字是否相等 | 利用石墨烯氧化物和DNA的简易制备和独特性质，开发了DNA杂交和GO与单链DNA有效结合的数字比较器系统 | NA | 探索基于DNA和石墨烯氧化物相互作用的新型数字比较器DNA计算系统的构建 | DNA和石墨烯氧化物在数字比较器中的应用 | 生物分子计算 | NA | DNA杂交 | 数字比较器 | DNA | 2-输入、3-输入和4-输入的数字比较器电路 |
| 511 | 2024-08-07 |
Comet-like Heterodimers "Gold Nanoflower @Graphene Quantum Dots" Probe with FRET "Off" to DNA Circuit Signal "On" for Sensing and Imaging MicroRNA In Vitro and In Vivo
2018-10-02, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.8b02854
PMID:30182713
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-08-07 |
Towards a Bioelectronic Computer: A Theoretical Study of a Multi-Layer Biomolecular Computing System That Can Process Electronic Inputs
2018-Sep-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms19092620
PMID:30181468
|
研究论文 | 本文通过理论研究探讨了一种多层生物分子计算系统，该系统能够处理电子输入并进行信息处理 | 首次提出并模拟了一种完全集成的生物分子计算系统，该系统具有多级信息处理能力，能够接受电子输入并独立运行 | 实际应用中需要显著提高系统的速度 | 探讨如何构建一种能够处理电子输入并进行逻辑操作的生物分子计算系统 | 多层生物分子计算系统及其在自主机器人导航中的应用 | NA | NA | DNA分子机器 | NA | 电子信号 | NA |
| 513 | 2024-08-07 |
Nanopore Decoding of Oligonucleotides in DNA Computing
2018-Dec, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.201800091
PMID:30076732
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综述 | 本文综述了利用无标记和电学纳米孔测量技术解码DNA计算的最新方法 | 提出将纳米孔技术作为DNA计算电学和简单解码的候选方法 | 该解码方法仍处于开发阶段，尚未被广泛接受 | 旨在向科学界介绍纳米孔解码DNA计算方法的有用性 | DNA计算的解码方法及其临床应用 | NA | 癌症 | 纳米孔技术 | NA | DNA | NA |
| 514 | 2024-08-07 |
Construction of an enzyme-free concatenated DNA circuit for signal amplification and intracellular imaging
2018-Jul-14, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/c8sc01981a
PMID:30079197
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研究论文 | 本文通过整合催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR）两种信号放大方法，建立了一种等温无酶放大策略，用于高灵敏度和选择性的核酸检测 | 本文创新性地构建了串联的CHA-HCR系统，实现了高效的荧光共振能量转移（FRET）信号读出，并可转换为通用传感平台，用于检测癌症生物标志物 | NA | 开发一种新型的无酶核酸放大系统，用于生物标志物的高灵敏度检测和细胞内成像 | 核酸检测技术及其在生物标志物检测和细胞内成像中的应用 | 生物工程 | 癌症 | 催化发夹组装（CHA），杂交链反应（HCR） | NA | 核酸 | NA |
| 515 | 2024-08-07 |
Entropy-driven DNA logic circuits regulated by DNAzyme
2018-09-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky663
PMID:30053158
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research paper | 本研究开发了由DNAzyme调控的催化DNA逻辑电路，提出了一种基于共价修饰的调控策略，结合DNAzyme消化和熵驱动的链置换两种反应机制。 | 本研究提出了一种新的策略，通过共价修饰诱导构象变化来调控催化DNA电路，不仅依赖于toehold介导的机制。 | NA | 开发新的催化DNA逻辑电路调控策略，实现更复杂的DNA工程功能和信号传输。 | 催化DNA逻辑电路的调控机制。 | NA | NA | DNAzyme | NA | DNA | NA |
| 516 | 2024-08-07 |
Accelerating DNA-Based Computing on a Supramolecular Polymer
2018-08-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.8b06146
PMID:29989400
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA功能化的苯-1,3,5-三羧酰胺（BTA）超分子聚合物作为动态支架，用于模板化DNA分子计算，显著加速了DNA电路的反应速率 | 通过选择性招募DNA电路组件到功能化的超分子BTA聚合物上，实现了100倍的链置换和链交换反应加速，并优化了聚合物组成以适应不同应用 | NA | 探索超分子BTA聚合物在DNA分子计算中的应用，提高计算效率 | DNA功能化的BTA超分子聚合物及其在DNA分子计算中的应用 | NA | NA | DNA分子计算 | NA | NA | 使用了10个核苷酸的把手链进行功能化 |
| 517 | 2024-08-07 |
DNA Logic Operation with Nanopore Decoding To Recognize MicroRNA Patterns in Small Cell Lung Cancer
2018-07-17, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.8b01586
PMID:29952206
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研究论文 | 本研究提出了一种利用纳米孔解码的DNA逻辑运算方法，用于识别小细胞肺癌中的microRNA模式 | 开发了一种快速、无标记的纳米孔测量解码方法，用于诊断分子输出，并设计了能够自主识别特定microRNA并形成四通结构的自组装DNA | NA | 探索DNA逻辑运算在早期癌症诊断中的应用 | 小细胞肺癌中的microRNA模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 纳米孔测量 | NA | 电流阻断持续时间 | 涉及两种microRNA，miR-20a和miR-17-5p |
| 518 | 2024-08-07 |
iBioSim 3: A Tool for Model-Based Genetic Circuit Design
2019-07-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.8b00078
PMID:29944839
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研究论文 | 本文介绍了iBioSim工具的新功能，该工具用于通过基于模型的设计策略促进遗传电路的设计 | iBioSim工具整合了DNA电路设计、设计分析和设计合成的新功能，支持系统化构建新的遗传电路 | NA | 开发和改进用于遗传电路设计的iBioSim工具 | 遗传电路的设计和分析 | 生物技术 | NA | 基于模型的设计策略 | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-08-07 |
Synthesis of comb-shaped DNA using a non-nucleosidic branching phosphoramidite
2018-07-07, Organic & biomolecular chemistry
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/c8ob00626a
PMID:29881861
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研究论文 | 本文报道了一种使用非核苷酸分支磷酰胺合成梳状DNA的方法 | 开发了一种简便的合成方法，使用易于获得的δ-戊内酯和1,3-二氨基丙-2-醇合成具有正交保护基团的分支单体 | NA | 探索和优化分支DNA的合成方法，以促进其在分子诊断和DNA纳米技术中的应用 | 梳状分支DNA的合成及其在分子诊断和DNA纳米技术中的应用 | DNA纳米技术 | NA | 荧光显微镜 | NA | DNA | 三种不同的DNA臂 |
| 520 | 2024-08-07 |
Effects of preservation method on canine (Canis lupus familiaris) fecal microbiota
2018, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.4827
PMID:29844978
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研究论文 | 本研究评估了不同保存方法对犬粪便微生物群DNA的影响 | 首次综合评估了温度控制和保存缓冲液结合使用对犬粪便微生物群DNA保存的影响 | 仅使用了一个犬供体的粪便样本，可能限制了结果的普遍性 | 确定犬粪便DNA保存的最佳方法 | 犬粪便微生物群 | NA | NA | 16S rRNA基因分析 | NA | DNA | 一个犬供体的粪便样本 |