生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2024-08-07 |
Autocatalytic DNA circuit for Hg2+ detection with high sensitivity and selectivity based on exonuclease III and G-quadruplex DNAzyme
2020-Jan-15, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2019.120258
PMID:31594619
|
研究论文 | 本文提出了一种基于外切酶III（Exo III）辅助级联信号放大的超灵敏无标记自催化DNA电路，用于Hg检测，利用G-四链体作为信号报告探针 | 该传感器通过T-Hg-T配位化学触发Exo III的消化反应，实现对Hg的高选择性和高灵敏度检测 | NA | 开发一种用于Hg检测的超灵敏无标记自催化DNA电路 | Hg检测 | 生物传感器 | NA | 外切酶III（Exo III） | G-四链体DNAzyme | 荧光强度 | 检测范围从10 fM到100 nM | NA | NA | NA | NA |
| 502 | 2024-08-07 |
Simulating the Monty Hall problem in a DNA sequencing machine
2019-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究在高通量DNA测序机中模拟并证明了蒙提霍尔问题，通过简单的编码方式，所有可能的情景由DNA寡核苷酸表示，游戏决策通过从特定位置测序这些寡核苷酸实现 | 本研究首次在高通量DNA测序机中模拟蒙提霍尔问题，展示了DNA测序技术在DNA计算问题中的新应用 | NA | 探索并证明蒙提霍尔问题在DNA测序机中的模拟 | 蒙提霍尔问题的模拟与证明 | NA | NA | DNA测序 | NA | DNA寡核苷酸 | 超过12,000,000次独立游戏模拟 | NA | NA | NA | NA |
| 503 | 2024-08-07 |
Nicking-Assisted Reactant Recycle To Implement Entropy-Driven DNA Circuit
2019-10-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b07521
PMID:31539231
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研究论文 | 本文介绍了一种基于切割辅助的反应物回收策略，用于在熵驱动的DNA电路中实现反应物的回收 | 提出了一种新的切割辅助回收策略，使双链DNA废物能够转化为活性成分，参与下一轮反应 | NA | 开发新的反应物回收方法，提高熵驱动DNA电路反应的可回收性 | 单层电路和多层双层电路的设计与分析 | 分子编程 | NA | DNA电路 | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 504 | 2024-08-07 |
Coupling of DNA Circuit and Templated Reactions for Quadratic Amplification and Release of Functional Molecules
2019-10-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b05688
PMID:31538784
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研究论文 | 本文展示了将DNA电路与模板反应耦合，以实现小分子输出的高级别放大 | 首次实现了DNA电路与模板反应的耦合，使得小分子输出的放大成为可能 | NA | 探索DNA电路与模板反应耦合的可能性，以实现小分子的高级别放大 | DNA电路与模板反应的耦合机制 | NA | NA | DNA电路，模板反应 | NA | 核酸 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 505 | 2024-08-07 |
A catalytic DNA circuit-programmed and enzyme-powered autonomous DNA machine for nucleic acid detection
2019-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/c9an01568j
PMID:31528926
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研究论文 | 本文设计了一种催化DNA电路，利用切割内切酶在三链DNA探针上的作用，自主驱动酶动力DNA机器进行一步、等温且自催化的核酸分析 | 创新性地设计了催化DNA电路，实现了自主驱动的酶动力DNA机器 | 未提及 | 开发一种新型的核酸检测方法 | 催化DNA电路和酶动力DNA机器 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 506 | 2024-08-07 |
An enzyme-free DNA circuit for the amplified detection of Cd2+ based on hairpin probe-mediated toehold binding and branch migration
2019-Oct-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c9cc06311k
PMID:31531427
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研究论文 | 设计了一种基于发夹探针介导的脚趾结合和分支迁移的无酶DNA电路，用于放大检测Cd2+ | 利用Cd2+特异性适配体识别Cd2+，并通过G-四链体报告检测信号，实现了无酶的放大检测方法 | NA | 开发一种新型的无酶DNA电路，用于高灵敏度检测Cd2+ | Cd2+的检测 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | 检测限为5 pM | NA | NA | NA | NA |
| 507 | 2024-08-07 |
Data storage in DNA with fewer synthesis cycles using composite DNA letters
2019-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0240-x
PMID:31501560
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研究论文 | 本文介绍了一种利用复合DNA字母减少合成周期的DNA数据存储编码和解码方法 | 开发了利用复合DNA字母的编码和解码方法，减少了数据存储所需的合成周期 | NA | 探索DNA作为长期数据存档介质的可行性，并减少合成周期 | DNA数据存储技术及其编码解码方法 | NA | NA | DNA合成与测序 | NA | DNA序列 | 6.4 MB数据 | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2024-08-07 |
Enzyme-assisted waste-to-reactant transformation to engineer renewable DNA circuits
2019-Sep-24, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c9cc05941e
PMID:31501837
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研究论文 | 本文通过使用切割酶辅助的废物到反应物的转化方法，解决了可再生DNA电路中反应物耗尽和废物积累的问题 | 本文创新性地使用了切割酶辅助的废物到反应物的转化方法，同时解决了反应物耗尽和废物积累的问题 | NA | 实现可再生的DNA电路 | 可再生DNA电路 | NA | NA | 切割酶辅助的废物到反应物的转化 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 509 | 2024-08-07 |
A novel bio-heuristic computing algorithm to solve the capacitated vehicle routing problem based on Adleman-Lipton model
2019-Oct, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2019.103997
PMID:31369836
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研究论文 | 本文提出了一种基于Adleman-Lipton模型的生物启发式计算算法，用于解决容量约束的车辆路径问题 | 利用DNA分子操作和生物启发式计算模型，提出了一种并行生物计算算法，以O(n)时间复杂度搜索问题解决方案 | NA | 解决容量约束的车辆路径问题，并验证DNA并行算法的实用性 | 容量约束的车辆路径问题 | 计算数学 | NA | DNA计算 | 生物启发式计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2024-08-07 |
Monitoring long-term DNA storage via absolute copy number quantification by ddPCR
2019-10-15, Analytical biochemistry
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.ab.2019.113363
PMID:31310737
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研究论文 | 本文通过测试最先进的液滴数字PCR（ddPCR）技术，实现了无需标准曲线的绝对DNA拷贝数定量，用于监测DNA的长期存储。 | ddPCR技术能够准确确定质粒DNA标准的水平，并对由于降解或吸附导致的DNA损失敏感。此外，发现了低结合管中DNA吸附的渐进过程，这一现象之前未被注意到。 | 尽管ddPCR技术在监测DNA存储方面表现出色，但对于高度稀释的DNA（<0.2 μg/mL）的回收率影响显著，需要添加载体DNA来改善。 | 验证ddPCR技术作为监测DNA长期存储的理想方法，并提供改善高度稀释DNA回收率的有效途径。 | 研究对象包括质粒DNA标准和几种低结合管中的DNA吸附过程。 | 生物医学研究 | NA | 液滴数字PCR（ddPCR） | NA | DNA | 涉及质粒DNA标准和几种低结合管中的DNA样本 | NA | NA | NA | NA |
| 511 | 2024-08-07 |
Telomere Shortening in the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative Cohort
2019, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.3233/JAD-190010
PMID:31322561
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研究论文 | 研究阿尔茨海默病神经影像学倡议队列中端粒缩短与阿尔茨海默病诊断和进展的关系 | 本研究首次探讨了端粒长度随时间变化与阿尔茨海默病进展的关联 | 研究结果显示端粒缩短与阿尔茨海默病进展的关联不显著，可能需要更大样本和特定亚组进一步研究 | 探讨端粒长度变化与阿尔茨海默病诊断和进展的关联 | 阿尔茨海默病神经影像学倡议队列中的653名个体 | NA | 阿尔茨海默病 | 定量PCR | 混合效应模型 | T/S比率 | 1918个样本（经过质量控制） | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2024-08-07 |
A dandelion-like liposomes-encoded magnetic bead probe-based toehold-mediated DNA circuit for the amplification detection of MiRNA
2019-Aug-07, The Analyst
DOI:10.1039/c9an00887j
PMID:31268436
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research paper | 本文提出了一种基于脂质体编码磁珠探针和脚手架介导的DNA电路的miRNA检测方法 | 该方法利用脚手架介导的环状链置换反应和脂质体多标签放大，实现了miRNA-21的低至0.7 fM的定量检测，无需酶放大或精密仪器 | NA | 开发简便且灵敏的miRNA定量检测方法，用于miRNA相关疾病的早期诊断 | miRNA-21的检测 | 生物技术 | miRNA相关疾病 | 脚手架介导的环状链置换反应 | NA | miRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 513 | 2024-08-07 |
A Characterization of the DNA Data Storage Channel
2019-07-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-45832-6
PMID:31273225
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研究论文 | 本文通过分析实验数据，对DNA数据存储通道中的错误概率和分子丢失进行了定性和定量描述 | 首次对DNA数据存储通道中的错误和分子丢失进行了详细的定性和定量分析 | 仅基于已有实验数据进行分析，未涉及新的实验验证 | 为未来DNA数据存储系统的设计提供定性和定量的理解 | DNA数据存储通道中的错误和分子丢失 | NA | NA | PCR | NA | DNA | 涉及多个实验组的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 514 | 2024-08-07 |
DNA assembly for nanopore data storage readout
2019-07-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10978-4
PMID:31270330
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研究论文 | 本文展示了使用便携式纳米孔测序平台成功解码存储在合成DNA短片段中的1.67兆字节信息，并设计验证了一种用于DNA存储的组装策略，显著提高了纳米孔测序的吞吐量 | 本文设计并验证了一种新的DNA存储组装策略，该策略可显著提高纳米孔测序的吞吐量，并可推广到任何需要纳米孔测序的小DNA扩增子的应用 | NA | 实现DNA数据存储的读取 | 合成DNA短片段中的数据存储 | 生物技术 | NA | 纳米孔测序 | NA | DNA | 1.67兆字节信息 | NA | NA | NA | NA |
| 515 | 2024-08-07 |
Controlling Matter at the Molecular Scale with DNA Circuits
2019-06-04, Annual review of biomedical engineering
IF:12.8Q1
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综述 | 本文综述了利用特定序列的DNA链感知环境信息并控制物质组装、解组装和重配置的多种机制 | 介绍了能够响应化学信号、光波长、pH值或电信号释放DNA链的接口，以及指导DNA纳米结构自组装和动态重配置的DNA链，这些接口有望使化学电路对响应性材料施加算法控制 | NA | 探讨DNA电路作为化学信息处理器在化学和材料系统中编程复杂行为的可能性 | DNA电路及其在物质分子尺度控制中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 516 | 2024-08-07 |
A Novel Small RNA-Cleaving Deoxyribozyme with a Short Binding Arm
2019-06-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-44750-x
PMID:31160698
|
研究论文 | 报道了一种新型的小RNA切割脱氧核酶10-12opt，该脱氧核酶具有较小的催化基序和异常短的结合臂 | 10-12opt脱氧核酶具有独特的催化结构，不同于常见的8-17脱氧核酶，且能切割8-17无法优先切割的某些微小RNA序列 | NA | 探索新型RNA切割脱氧核酶的存在及其催化机制 | 新型RNA切割脱氧核酶10-12opt及其催化特性 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 517 | 2024-08-07 |
Nucleic Acid Databases and Molecular-Scale Computing
2019-06-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.9b02562
PMID:31117381
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综述 | 本文综述了DNA作为存储介质和分子计算平台的研究进展，包括DNA存储架构和计算技术的最新成就 | 介绍了DNA存储和计算的新技术，如随机访问、纠错和内容可重写性，以及CRISPR逻辑门等 | 讨论了DNA存储和计算面临的工程挑战和潜在问题 | 探讨DNA在信息存储和分子计算领域的应用潜力 | DNA存储系统和分子计算技术 | 生物信息学 | NA | DNA合成与测序技术 | NA | DNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 518 | 2024-08-07 |
Driving the Scalability of DNA-Based Information Storage Systems
2019-06-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.9b00100
PMID:31117362
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研究论文 | 本文利用化学标记从模拟5TB数据的复杂DNA数据库中选择性提取独特文件，并设计实施了一个嵌套文件地址系统，将DNA存储系统的理论最大容量提高了五个数量级 | 设计并实现了一个嵌套文件地址系统，显著提高了DNA存储系统的理论最大容量 | NA | 提高DNA存储系统的容量和文件访问能力 | DNA存储系统的组织和信息访问方法 | NA | NA | 化学标记 | NA | DNA数据 | 模拟5TB数据 | NA | NA | NA | NA |
| 519 | 2024-08-07 |
Cram-JS: reference-based decompression in node and the browser
2019-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz384
PMID:31099383
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cram-JS的JavaScript库，该库能够在Node和浏览器环境中对CRAM格式进行基于参考的实时解压缩 | Cram-JS是首个在JavaScript中实现CRAM格式解压缩的库 | NA | 开发一种能够在JavaScript环境中对CRAM格式进行解压缩的库 | CRAM格式的解压缩技术 | 生物信息学 | NA | CRAM格式解压缩 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 520 | 2024-08-07 |
Facile Strategy for Visible Disassembly of Spherical Nucleic Acids Programmed by Catalytic DNA Circuits
2019-Jun-05, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b02107
PMID:31083902
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研究论文 | 本文开发了一种简便策略，通过将基于DNA链置换的DNA电路与通用球形核酸聚集系统集成，实现球形核酸的可视化解体 | 该集成系统展示了快速比色响应和高灵敏度，并证明了其在单核苷酸多态性鉴别中的应用能力 | NA | 开发一种新方法用于球形核酸的可视化解体及其在DNA诊断和其他应用中的潜力 | 球形核酸的解体及其在单核苷酸多态性鉴别和复杂DNA网络中的应用 | NA | NA | DNA链置换反应 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |