生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-07 |
Bioorthogonal information storage in L-DNA with a high-fidelity mirror-image Pfu DNA polymerase
2021-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00969-6
PMID:34326549
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research paper | 本文通过化学合成90 kDa高保真镜像Pfu DNA聚合酶，实现了在L-DNA中准确组装千碱基大小的镜像基因，并在L-DNA中编码了Louis Pasteur提出的1860段镜像生物学信息 | 首次使用高保真镜像Pfu DNA聚合酶在L-DNA中实现信息存储，并通过D-DNA/L-DNA嵌合分子实现手性隐写术 | NA | 开发下一代镜像分子工具，推动镜像生物学系统的发展 | L-DNA中的信息存储及手性隐写术 | 生物化学 | NA | 化学合成 | NA | DNA | 1个L-DNA条形码样本 |
| 322 | 2024-08-07 |
A Biological Circuit Involving Mef2c, Mef2d, and Hdac9 Controls the Immunosuppressive Functions of CD4+Foxp3+ T-Regulatory Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.703632
PMID:34290714
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研究论文 | 研究Mef2c、Mef2d和Hdac9在CD4+Foxp3+ T调节细胞免疫抑制功能中的生物电路作用 | 揭示了Mef2c在Treg细胞中缺失导致Hdac9表达增加，进而影响Mef2d的转录抑制功能，增强抗肿瘤免疫的新机制 | NA | 探讨Mef2/Hdac9轴在CD4+Foxp3+ Treg功能调控中的作用 | CD4+Foxp3+ T调节细胞 | 免疫学 | 肺癌 | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-07 |
A fluorescent microarray platform based on catalytic hairpin assembly for MicroRNAs detection
2021-Aug-15, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2021.338666
PMID:34172148
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研究论文 | 本文开发了一种基于催化发夹组装（CHA）的荧光微阵列平台，用于同时检测多种miRNA | 该方法利用固体相CHA产生的双链在芯片特定位置固定并释放荧光信号，无需不同的荧光标记，提高了检测的灵敏度和特异性 | NA | 开发一种高灵敏度和特异性的miRNA检测方法 | 人类癌症相关miRNA（如miR-21和miR-155） | 生物传感技术 | 癌症 | 催化发夹组装（CHA） | NA | miRNA | 在人类血清和癌细胞中进行了目标miRNA的分析 |
| 324 | 2024-08-07 |
A multi-commodity network model for optimal quantum reversible circuit synthesis
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0253140
PMID:34157035
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研究论文 | 本文提出了一种优化模型，用于合成具有最低实现成本的量子电路，以降低错误率 | 模型结合了弧子集选择问题与传统的多商品网络流模型，具有统一且直接的结构，用于利用量子门的操作特性 | NA | 提高量子计算的输出保真度，通过有效合成量子电路减少量子计算算法中的错误 | 量子电路合成，特别是多控制Toffoli门的电路合成 | 量子计算 | NA | 多商品网络流模型 | 优化模型 | NA | NA |
| 325 | 2024-08-07 |
DNA Computing: NOT Logic Gates See the Light
2021-07-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00062
PMID:34142811
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研究论文 | 本文开发了一种新型DNA门设计，利用光笼组防止门功能直到特定时间点照射，从而实现对电路性能的时间控制 | 通过使用光笼组，实现了对DNA计算电路中NOT逻辑门的时间控制，防止了过早计算导致的不可逆错误 | NA | 开发一种新型的DNA计算电路设计，实现对逻辑门操作的时间控制 | DNA计算电路中的NOT逻辑门 | 生物信息学 | NA | 光笼组 | NA | DNA序列 | NA |
| 326 | 2024-08-07 |
Image Encoding Using Multi-Level DNA Barcodes with Nanopore Readout
2021-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202100711
PMID:34133074
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA纳米结构和固态纳米孔传感平台的二维灰度图像存储和加密方法 | 利用DNA多路连接结构在纳米孔中的电流阻断特性实现四进制编码，相比传统二进制系统容量翻倍 | NA | 实现基于DNA纳米结构的高容量和可编程性的图像存储系统 | 二维灰度图像的存储和加密 | 生物信息学 | NA | 纳米孔传感 | NA | 图像 | 16个DNA载体 |
| 327 | 2024-08-07 |
Programmable, Multiplexed DNA Circuits Supporting Clinically Relevant, Electrochemical Antibody Detection
2021-06-25, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.1c00790
PMID:34129321
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研究论文 | 本文报道了一种电化学DNA电路的设计，该电路能够定量响应多种特定抗体 | 采用合成抗原偶联的核酸链，通过理性设计引发链置换反应并释放修饰有氧化还原报告分子的链，实现了对抗体的快速、灵敏和便捷检测 | NA | 开发一种快速、灵敏且便捷的平台用于特定抗体的检测 | 多种特定抗体，包括三种临床相关抗体 | 生物技术 | NA | 电化学DNA电路 | NA | 核酸 | 五种不同抗体 |
| 328 | 2024-08-07 |
Using Artificial Neural Networks to Model Errors in Biochemical Manipulation of DNA Molecules
2022 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3088525
PMID:34115591
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研究论文 | 本文利用人工神经网络预测DNA序列在生物化学操作中是否容易出错 | 提出了一种端到端的方法，通过计算机系统模拟体外DNA分子的生物化学错误 | NA | 研究生物化学操作中DNA序列的错误模式 | DNA序列在生物化学操作中的错误倾向 | 机器学习 | NA | 人工神经网络 | 人工神经网络 | DNA序列数据 | 基于DNA存储研究生成的数据 |
| 329 | 2024-08-07 |
Promiscuous molecules for smarter file operations in DNA-based data storage
2021-06-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23669-w
PMID:34112775
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研究论文 | 本文利用生物分子相互作用的温度调节，实现了DNA存储中数据访问和组织的有用功能 | 通过调节DNA浓度和温度，实现了从大型背景数据库中可切换访问完整图像文件或低分辨率文件预览版本 | NA | 探讨如何有效组织、访问和操作DNA存储中的数据 | DNA存储中的数据访问和组织功能 | 生物技术 | NA | 生物分子相互作用的温度调节 | NA | 图像 | 四个JPEG图像 |
| 330 | 2024-08-07 |
Stable DNA Sequence Over Close-Ending and Pairing Sequences Constraint
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644484
PMID:34079580
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研究论文 | 本文提出了一种改进的混沌鲸优化算法，用于设计满足配对序列约束和封闭端约束的稳定DNA序列 | 引入了新的捕食-猎物策略和正弦余弦函数，提高了算法的优化性能 | NA | 优化DNA序列设计，提高DNA计算的准确性 | DNA序列及其稳定性 | 分子生物技术 | NA | 混沌鲸优化算法 | NA | DNA序列 | 23个基准函数 |
| 331 | 2024-08-07 |
Addition of mirror-image L-DNA elements to DNA amplification circuits to distinguish leakage from target signal
2021-Sep-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2021.113354
PMID:34034212
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研究论文 | 本文提出了一种结合自然存在的右旋D-DNA电路元件和合成左旋L-DNA电路元件的策略，以区分目标信号与电路泄漏 | 引入左旋L-DNA元件作为无目标控制反应，与右旋D-DNA元件在同一管中进行，以区分目标特异性扩增和电路泄漏 | 传统的DNA扩增电路需要单独的“无目标”控制反应来估计非特异性扩增或电路泄漏 | 开发一种适用于生物样本中目标检测的新型DNA扩增电路 | DNA扩增电路的特异性扩增与电路泄漏的区分 | NA | NA | 催化发夹组装（CHA） | NA | DNA | 在不同条件下（包括背景DNA、增加的盐浓度、增加的温度和尿液）进行了广泛的实验验证 |
| 332 | 2024-08-07 |
Toward living neuroprosthetics: developing a biological brain pacemaker as a living neuromodulatory implant for improving parkinsonian symptoms
2021-06-08, Journal of neural engineering
IF:3.7Q2
DOI:10.1088/1741-2552/ac02dd
PMID:34010821
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研究论文 | 本研究旨在开发一种生物脑起搏器，作为活体神经调节植入物，用于改善帕金森病症状 | 提出了一种全新的生物脑起搏器，完全由生物和生物相容性组件构建，旨在解决现有电子神经植入物的硬件问题和生物相容性问题 | 目前研究仍处于初步阶段，需要进一步的实验验证和临床试验 | 开发一种生物脑起搏器，用于治疗帕金森病 | 帕金森病患者 | 生物医学工程 | 帕金森病 | 组织工程 | 3D多细胞电路设计 | 细胞材料 | NA |
| 333 | 2024-08-07 |
CLGBO: An Algorithm for Constructing Highly Robust Coding Sets for DNA Storage
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644945
PMID:34017354
|
研究论文 | 本研究提出了一种基于增强梯度优化器CLGBO的算法，用于构建高度鲁棒的DNA存储编码集 | 引入Cauchy和Levy变异策略的CLGBO算法，提高了DNA存储编码集的下限，增加了4.3-13.5%的鲁棒性 | NA | 开发新的算法以提高DNA存储的鲁棒性和容量 | DNA存储编码集 | 生物信息学 | NA | CLGBO算法 | 梯度优化器 | DNA序列 | NA |
| 334 | 2024-08-07 |
[The current status and future prospects of DNA computing]
2021-Apr-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.200408
PMID:33973429
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综述 | 本文综述了DNA计算的基本原理及其最新研究进展，并讨论了其面临的挑战 | DNA计算因其低能耗和并行性而受到关注 | 文章讨论了DNA计算面临的挑战 | 探讨DNA计算的现状与未来前景 | DNA计算及其在分子信息调控和处理中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-07 |
A hairpin probe-mediated DNA circuit for the detection of the mecA gene of Staphylococcus aureus based on exonuclease III and DNAzyme-mediated signal amplification
2021-Jun-07, The Analyst
DOI:10.1039/d1an00028d
PMID:33954316
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研究论文 | 本文报道了一种基于发夹探针介导的DNA电路，用于检测金黄色葡萄球菌的mecA基因，该电路结合了外切酶III辅助的循环信号放大和DNA酶介导的切割反应 | 该生物传感器通过发夹探针与mecA基因的识别和杂交，触发了外切酶III和DNA酶介导的信号放大，从而增强了荧光响应，实现了对mecA基因的灵敏和特异性检测 | NA | 开发一种简单、高度敏感的生物传感器，用于检测金黄色葡萄球菌，以保障人类健康和安全 | 金黄色葡萄球菌的mecA基因 | 生物传感器 | 细菌感染 | 外切酶III和DNA酶 | NA | 荧光信号 | 检测范围从1 fM到1 nM，检测限为0.5 fM，并应用于临床样本分析 |
| 336 | 2024-08-07 |
Cooperative sequence clustering and decoding for DNA storage system with fountain codes
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab246
PMID:33904574
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研究论文 | 本文针对使用喷泉码和里德-所罗门码的DNA存储系统，提出了一系列提高解码性能的技术 | 通过协同序列聚类、异常序列读取的丢弃、里德-所罗门错误校正以及基于质量分数的序列排序，提高了DNA存储系统的解码性能 | NA | 旨在减少DNA存储系统中由读写成本权衡引起的读取成本，同时不增加写入成本 | DNA存储系统中的序列聚类和解码过程 | NA | NA | 喷泉码，里德-所罗门码 | NA | DNA序列 | 513.6 KB数据被合成到DNA寡核苷酸池中，并使用Illumina MiSeq仪器成功测序 |
| 337 | 2024-08-07 |
Nanopore decoding for a Hamiltonian path problem
2021-Mar-28, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d0nr09031j
PMID:33885605
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研究论文 | 本文描述了一种使用纳米孔技术快速解码DNA计算输出结果的方法，用于解决有向哈密顿路径问题（HPP） | 提出了一种基于纳米孔技术的快速且无标记的解码方法，用于数学DNA计算中的并行自组装 | 仅证明了小图的HPP解码可行性，尚未验证更大规模问题的解码能力 | 开发一种快速解码DNA计算输出结果的方法 | 有向哈密顿路径问题（HPP） | 生物计算 | NA | 纳米孔技术 | NA | DNA | 小图的HPP |
| 338 | 2024-08-07 |
Biocomputing Based on DNA Strand Displacement Reactions
2021-06-16, Chemphyschem : a European journal of chemical physics and physical chemistry
IF:2.3Q2
DOI:10.1002/cphc.202100140
PMID:33871136
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综述 | 本文综述了基于DNA链置换反应（SDR）的生物计算设计原理及其应用 | 介绍了DNA-only、酶辅助、其他分子参与和外部刺激控制等多种SDR设计策略 | 讨论了基于SDR计算的优势与挑战 | 探讨DNA在生物计算领域的应用及其设计原理 | DNA链置换反应及其在生物计算中的应用 | 生物计算 | NA | DNA链置换反应 | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-07 |
Dynamically elongated associative toehold for tuning DNA circuit kinetics and thermodynamics
2021-05-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab212
PMID:33849054
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研究论文 | 本文通过使用发夹锁设计动态延长有效关联脚长度，解决了DNA电路中关联脚长度与泄漏率之间的权衡问题 | 提出了一种发夹锁设计，动态延长有效关联脚长度，以提高电路性能 | 未提及具体限制 | 优化DNA电路的反应动力学和平衡信号 | DNA电路中的关联脚长度 | 生物技术 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | 三种不同组合的发夹引发剂（4 → 6 nt, 5 → 8 nt 和 6 → 9 nt） |
| 340 | 2024-08-07 |
Intracellular enzyme-powered DNA circuit with a tunable amplifier for miRNA imaging
2021-Apr-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d1cc00536g
PMID:33876121
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research paper | 本文描述了一种基于细胞内酶驱动的DNA电路探针，具有可调节放大器，用于miRNA的灵敏和选择性检测 | 该方法成功应用于活细胞内miRNA-21的荧光原位成像，并通过使用化学物质提高APE1表达水平，实现了放大强度的可调节，增强了成像应用的灵活性 | NA | 开发一种新型的DNA电路探针，用于细胞内miRNA的灵敏和选择性检测 | miRNA-21的荧光成像 | NA | NA | NA | NA | image | 活细胞 |