生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 767 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2024-08-07 |
Deconstructing the core dynamics from a complex time-lagged regulatory biological circuit
2009-Mar, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/iet-syb.2007.0028
PMID:19292565
|
研究论文 | 本文通过简化生物条件，利用动态模块识别和模型简化方法，分析了一个蛋白质-蛋白质网络的动态非线性计算模型中的周期性振荡 | 首次通过引入显式时间延迟和使用'撕裂-放大'方法，将系统简化为一个包含两个变量的分段线性系统，从而能够分析和证明系统稳定性的全局条件 | NA | 理解复杂生物调控网络的动态规律 | 蛋白质-蛋白质网络的动态模型 | 计算生物学 | NA | NA | 非线性计算模型 | NA | NA |
| 662 | 2024-08-07 |
System identification: DNA computing approach
2009-Jul, ISA transactions
IF:6.3Q1
DOI:10.1016/j.isatra.2009.01.006
PMID:19249778
|
研究论文 | 提出了一种基于电子-离子相互作用势（EIIP）解码方案的DNA计算算法（DNACA），用于识别一类传递函数 | DNACA包括酶和病毒操作符，提供了一个高度模块化、灵活和准确的自组织结构环境 | NA | 识别一类传递函数 | DNA计算算法及其性能 | 计算生物学 | NA | DNA计算 | 遗传算法 | 函数 | 基于De Jong的测试函数进行模拟研究 |
| 663 | 2024-08-07 |
The role of predictive modelling in rationally re-engineering biological systems
2009-04, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/nrmicro2107
PMID:19252506
|
综述 | 本文综述了预测建模在合理重构生物系统中的作用，并探讨了系统生物学与合成生物学融合的可能途径 | NA | NA | 探讨系统生物学与合成生物学融合的可能途径 | 生物系统的重构与优化 | 系统生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 664 | 2024-08-07 |
Production of random DNA oligomers for scalable DNA computing
2009-Jan, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.200800224
PMID:19156734
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于PCR扩增少量随机模板序列来生产大量不同DNA寡聚物的新方法 | 提出了一种利用PCR技术扩增随机模板序列以生成大量不同DNA寡聚物的方法 | NA | 开发一种经济可行的方法来生产大量不同的DNA寡聚物，以支持DNA计算 | DNA寡聚物的自动合成 | 生物技术 | NA | PCR | NA | DNA序列 | 约30种不同的模板分子 |
| 665 | 2024-08-07 |
A new solution for maximal clique problem based sticker model
2009-Feb, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2008.09.007
PMID:18992786
|
研究论文 | 本文利用贴纸构建DNA的最大团问题（MCP）解空间，并在此基础上开发了一种基于贴纸模型的DNA算法 | 提出了一种新的基于贴纸模型的DNA算法来解决最大团问题，并展示了DNA计算解决NP完全问题的能力 | NA | 开发一种新的算法来解决最大团问题 | 最大团问题（MCP） | NA | NA | DNA计算 | 贴纸模型 | DNA | NA |
| 666 | 2024-08-07 |
Modeling convergent ON and OFF pathways in the early visual system
2008-Nov, Biological cybernetics
IF:1.7Q4
DOI:10.1007/s00422-008-0252-y
PMID:19011919
|
研究论文 | 本文探讨了早期视觉系统中ON和OFF通路的收敛模型，并介绍了从实验数据中获取并行滤波器集的具体技术 | 提出了使用多个并行滤波器来调整线性-非线性（LN）模型，以更好地捕捉生物电路结构的响应特征 | NA | 理解感觉系统中单个神经元的计算和功能，以及感觉刺激与神经元响应之间的关系 | 早期视觉系统中的神经元响应模型 | 计算机视觉 | NA | 线性-非线性（LN）模型 | 并行滤波器模型 | 实验数据 | NA |
| 667 | 2024-08-07 |
DNA computing, computation complexity and problem of biological evolution rate
2008-Dec, Acta biotheoretica
IF:1.4Q4
DOI:10.1007/s10441-008-9055-8
PMID:18787960
|
研究论文 | 本文探讨了生物进化与复杂计算问题之间的类比，并指出在没有先验信息的情况下，这类问题属于NP类，无法在多项式步骤内解决 | 提出了对进化机制的重新审视，并讨论了确定性进化方法的想法 | NA | 探讨生物进化与计算复杂性问题之间的关系 | 生物进化与复杂计算问题 | 计算生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 668 | 2024-08-07 |
Autonomous DNA computing machine based on photochemical gate transition
2008-Aug-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/ja802583z
PMID:18613667
|
研究论文 | 本文报道了一种基于光化学门转换的自主DNA计算机的构建，并使用该机器进行了二进制数字加法运算 | 该系统利用光化学DNA操作，通过一次性366 nm照射在单一试管中自主完成二进制数字加法，并通过DNA芯片的荧光读出验证了结果的准确性 | NA | 开发一种基于光化学门转换的自主DNA计算机器，并验证其在二进制数字加法中的应用 | 自主DNA计算机器及其在二进制数字加法中的应用 | NA | NA | 光化学DNA操作（光裂解、杂交和光连接） | NA | DNA | 单一试管中的DNA样本 |
| 669 | 2024-08-07 |
DNA solution based on sequence alignment to the Minimum Spanning Tree problem
2008, International journal of bioinformatics research and applications
DOI:10.1504/IJBRA.2008.018345
PMID:18490262
|
研究论文 | 本文将序列比对引入DNA计算领域，提出互补比对和反向互补比对的定义，给出计算互补比对和反向互补比对得分的方法，并通过反向互补比对设计了一种DNA编码方法和相应的DNA算法来解决最小生成树（MST）问题 | 本文的创新点在于将序列比对技术应用于DNA计算，扩展了DNA计算解决优化问题的范围 | NA | 研究目的是将序列比对技术应用于DNA计算，解决最小生成树问题 | 研究对象是DNA序列及其互补序列的比对 | 生物信息学 | NA | 序列比对 | NA | DNA序列 | NA |
| 670 | 2024-08-07 |
Participant characteristics that influence consent for genetic research in a population-based survey: the Baltimore epidemiologic catchment area follow-up
2008, Community genetics
DOI:10.1159/000113880
PMID:18376114
|
研究论文 | 本研究旨在探讨社会人口统计和健康特征对参与纵向社区调查者捐赠DNA样本及同意测试和长期存储该样本意愿的影响 | 研究揭示了影响捐赠生物样本意愿与同意遗传测试或存储样本意愿的不同因素 | NA | 调查社会人口统计和健康特征对捐赠DNA样本及同意测试和长期存储意愿的影响 | 参与纵向社区调查的1,071名参与者 | NA | NA | NA | NA | NA | 1,071名参与者中，83%同意捐赠生物样本 |
| 671 | 2024-08-07 |
OptCircuit: an optimization based method for computational design of genetic circuits
2008-Mar-03, BMC systems biology
DOI:10.1186/1752-0509-2-24
PMID:18315885
|
研究论文 | 本文介绍了OptCircuit，一种基于优化的框架，用于自动识别满足特定功能的遗传电路组件及其连接方式 | OptCircuit框架能够自动识别电路组件及其连接方式，以实现所需功能，并且能够设计出超越传统数字逻辑设计原则的电路配置 | 目前遗传电路元素间的相互作用使用确定性常微分方程建模，未来可能需要考虑更复杂的随机模拟 | 开发一种基于优化的方法，用于计算设计遗传电路 | 遗传电路的设计及其组件的优化选择 | 生物工程 | NA | 优化方法 | 常微分方程 | 文本 | NA |
| 672 | 2024-08-07 |
Spontaneous deadlock breaking on amoeba-based neurocomputer
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.08.004
PMID:17889990
|
研究论文 | 本文研究了基于变形虫的神经计算机如何自发地打破死锁情况 | 利用变形虫细胞膜的自发振荡产生多种时空模式来解决死锁问题 | NA | 探索生物计算范式与人工计算范式的本质差异 | 基于变形虫的神经计算机及其在死锁情况下的表现 | 计算机视觉 | NA | 光学反馈控制 | 循环神经网络 | 细胞信息处理 | 单个光敏变形虫细胞 |
| 673 | 2024-08-07 |
An evolutionary Monte Carlo algorithm for predicting DNA hybridization
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.07.005
PMID:17897776
|
research paper | 本文提出了一种基于群体的蒙特卡罗算法，用于模拟反应DNA分子的微观模型，以预测DNA杂交反应。 | 该算法使用DNA分子的两个基本热力学量：结合的DNA链的结合能和未结合链的熵，来模拟微观模型。 | NA | 开发一种新的算法来预测DNA杂交反应，并验证其在逻辑推理问题中的应用。 | DNA杂交反应及其在DNA计算、DNA纳米组装和DNA生物芯片等技术中的应用。 | NA | NA | 蒙特卡罗算法 | NA | NA | NA |
| 674 | 2024-08-07 |
Solving the SAT problem using a DNA computing algorithm based on ligase chain reaction
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.08.006
PMID:17904730
|
研究论文 | 本文展示了一种基于连接酶链反应的DNA计算算法，用于解决SAT问题 | 该算法通过逐步生成部分满足SAT公式的解决方案，并利用连接酶链反应进行错误修剪，显著减少了所需的DNA链数量，提高了空间效率和容错性 | NA | 开发一种新的DNA计算算法，以解决复杂的SAT问题 | SAT问题 | NA | NA | 连接酶链反应 (LCR) | NA | DNA链 | 当n=50时，最大所需的DNA链数量为2(0.48n) |
| 675 | 2024-08-07 |
Enzymatic ligation assisted by nucleases: simultaneous ligation and digestion promote the ordered assembly of DNA
2007, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2007.325
PMID:17853876
|
研究论文 | 本文介绍了一种酶联辅助核酸酶技术（ELAN），用于在单管中大规模制备特定DNA分子的有序组装 | ELAN方法通过明智选择限制酶位点并结合同时进行的消化和连接反应，将非目标产物转化为底物，从而产生单一产物 | NA | 开发一种高效的方法用于DNA分子的有序组装 | DNA分子的有序组装 | 分子克隆 | NA | 酶联辅助核酸酶技术（ELAN） | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 |
| 676 | 2024-08-07 |
DNA approach to solve clustering problem based on a mutual order
2008-Jan, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2007.06.002
PMID:17669585
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的聚类技术，旨在处理大规模数据集、未知数量的聚类以及数据的异质性问题 | 本文创新性地将DNA计算应用于聚类问题，通过DNA计算机制实现聚类技术的核心组件 | NA | 提出一种基于DNA计算的聚类技术 | 大规模数据集、未知数量的聚类以及数据的异质性 | 机器学习 | NA | DNA计算 | NA | 高维数据 | NA |
| 677 | 2024-08-07 |
Physarum machines: encapsulating reaction-diffusion to compute spanning tree
2007-Dec, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-007-0276-5
PMID:17603779
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用Physarum polycephalum的plasmodium作为计算基质的生物计算设备——Physarum机器，并展示了其在构建生成树方面的应用 | 本文通过在反应扩散系统中封装具有少数‘生长点’的膜，解决了反应扩散计算机无法独立构建某些邻近图的问题 | NA | 探索和验证Physarum机器在计算生成树方面的可行性 | Physarum polycephalum的plasmodium和反应扩散系统 | 生物计算 | NA | 反应扩散计算 | NA | 生物模式 | NA |
| 678 | 2024-08-07 |
Modeling molecular computing systems by an artificial chemistry - its expressive power and application
2007, Artificial life
IF:1.6Q2
DOI:10.1162/artl.2007.13.3.223
PMID:17567243
|
研究论文 | 本文探讨了使用人工化学模型来模拟分子计算系统的可能性，并展示了其在分子计算建模中的应用 | 提出了一种基于字符串模式匹配和重组的人工化学模型，并证明了其在计算上的通用性 | NA | 探索人工化学在模拟分子计算系统中的应用 | 分子计算系统 | NA | NA | 人工化学 | 人工化学模型 | NA | NA |
| 679 | 2024-08-07 |
Directed assembly of DNA molecules via simultaneous ligation and digestion
2007-Jan, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/000112283
PMID:17269489
|
research paper | 本文介绍了一种通过同时连接和消化DNA分子的定向组装技术 | 提出了一种名为ELAN的新策略，通过酶辅助核酸酶将非目标连接产物转化为底物，显著提高了目标产物的产量 | NA | 开发一种高产量的DNA连接技术，以支持从标准分子克隆到生物物理学和DNA计算等多种下游应用 | DNA分子的定向组装 | NA | NA | ELAN (enzymatic ligation assisted by nucleases) | NA | DNA | 四个DNA片段，八种限制酶 |
| 680 | 2024-08-07 |
Estimating the sequence complexity of a random oligonucleotide population by using in vitro thermal melting and Cot analyses
2005-Sep, Nanomedicine : nanotechnology, biology, and medicine
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.nano.2005.06.003
PMID:17292083
|
研究论文 | 本研究开发了一种非线性动力学模型，用于估计大型未知多核苷酸群体的序列复杂性，并通过体外重退火实验和热熔实验进行实验验证 | 开发了一种新的非线性动力学模型，用于估计随机寡核苷酸群体的序列复杂性 | NA | 实现随机寡核苷酸在DNA计算和纳米尺度自组装应用中的潜力 | 随机生成的20碱基对寡核苷酸群体的序列复杂性 | 生物医学 | NA | 体外重退火实验和热熔实验 | 非线性动力学模型 | 寡核苷酸序列 | 随机生成的20碱基对寡核苷酸群体 |