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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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561 | 2024-08-07 |
Coupling a universal DNA circuit with graphene sheets/polyaniline/AuNPs nanocomposites for the detection of BCR/ABL fusion gene
2015-Aug-19, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.06.050
PMID:26343430
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研究论文 | 本文介绍了一种新型方法,通过将通用DNA电路与石墨烯片/聚苯胺/金纳米粒子纳米复合材料(GS/PANI/AuNPs)结合,用于高灵敏度和特异性地检测慢性髓性白血病(CML)中的BCR/ABL融合基因(bcr/abl)。 | 设计了一种转换器发夹(HP)以获得具有良好信噪比的通用DNA电路,并引入了具有优异导电性和扩大有效区域的GS/PANI/AuNPs,进一步提高了信号放大。 | NA | 开发一种高灵敏度和特异性的方法,用于检测慢性髓性白血病中的BCR/ABL融合基因。 | BCR/ABL融合基因(bcr/abl) | 生物传感 | 慢性髓性白血病 | 催化发夹组装(CHA) | NA | DNA | 检测范围从10 pM到20 nM,检测限为1.05 pM |
562 | 2024-08-07 |
Universal strategy to engineer catalytic DNA hairpin assemblies for protein analysis
2015-Aug-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5b02504
PMID:26237634
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研究论文 | 本文展示了一种合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为有效催化剂,加速催化发夹组装(CHA)反应,从而扩展CHA在蛋白质分析中的应用 | 提出了一种通用策略,通过使用合理设计的蛋白质-DNA结合复合体作为催化剂,来构建蛋白质响应的CHA | NA | 开发针对多种重要蛋白质生物标志物的特定CHA,并探索其在人类血清样本和癌细胞中检测特定蛋白质生物标志物的应用潜力 | 人α-凝血酶、人前列腺特异性抗原和人表皮生长因子受体2等蛋白质生物标志物 | 生物传感 | NA | 催化发夹组装(CHA) | NA | DNA | NA |
563 | 2024-08-07 |
Optimizing Storage and Handling of DNA Extracts
2010-Jul, Forensic science review
PMID:26242592
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综述 | 本文综述了核酸样本存储在法医学、流行病学、临床和遗传实验室中的重要性,并探讨了优化DNA提取物存储和处理的方法 | NA | NA | 探讨和优化DNA提取物的存储和放大方法,以确保从各种类型的样本中成功恢复基因型 | DNA/RNA样本的存储和处理方法 | 法医学 | NA | PCR | NA | DNA/RNA | 数百万生物样本,包括细胞、病毒和DNA/RNA |
564 | 2024-08-07 |
Design of a DNA-based reversible arithmetic and logic unit
2015-Aug, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/iet-nbt.2014.0056
PMID:26224353
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研究论文 | 本研究利用脱氧核糖核酸(DNA)实现了一个算术逻辑单元(ALU),该ALU在计算过程中保持逻辑可逆性,并能执行四种逻辑(与、或、异或和非)和三种算术(加、减和乘)操作 | 相较于硅基计算,提出的ALU由于并行性、复制特性、紧凑性和DNA链的形成,速度更快且所需空间和功率更少。此外,与现有的DNA基系统相比,每个步骤所需的信号更少,且所需的生物步骤也更少 | NA | 实现基于DNA的算术逻辑单元 | 基于DNA的算术逻辑单元及其在逻辑和算术操作中的应用 | 生物计算 | NA | DNA计算 | NA | DNA | NA |
565 | 2024-08-07 |
Signal-to-Noise Ratio Measures Efficacy of Biological Computing Devices and Circuits
2015, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2015.00093
PMID:26177070
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研究论文 | 本文通过定量信号-噪声比分析,探讨了生物计算设备和电路的效能提升方法 | 提出了一种基于信号-噪声比分析的方法,用于评估和改进生物计算设备的性能 | 目前没有足够的库能满足通用电路工程的需求 | 提高生物计算设备和电路的可预测性和有效性 | 生物计算设备及其在复杂环境中的性能 | 生物工程 | NA | 信号-噪声比分析 | NA | 输入/输出曲线和表达噪声数据 | 涉及当前抑制剂库的分析 |
566 | 2024-08-07 |
An analytical approach to bistable biological circuit discrimination using real algebraic geometry
2015-Jul-06, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2015.0288
PMID:26109633
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研究论文 | 本文探讨了利用19世纪的实代数几何工具——斯图姆定理,来比较功能等效的双稳态生物电路的可行性,无需数值模拟 | 首次将斯图姆定理应用于生物分子电路的分析,提供了一种新的方法来比较不同电路设计的参数空间 | NA | 研究不同双稳态生物电路之间的差异,特别是为合成生物学家选择最佳电路设计提供理论支持 | 双稳态生物分子电路及其在参数空间中的行为 | 生物技术 | NA | 实代数几何 | NA | 电路拓扑结构 | NA |
567 | 2024-08-07 |
Chemical computing with reaction-diffusion processes
2015-Jul-28, Philosophical transactions. Series A, Mathematical, physical, and engineering sciences
DOI:10.1098/rsta.2014.0219
PMID:26078345
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研究论文 | 本文探讨了化学反应扩散过程在信息处理中的应用,特别是通过Belousov-Zhabotinsky(BZ)反应及其光敏变体来展示化学信息处理的思路 | 展示了信息处理的计算普遍性,并描述了不同信息编码方法下最简单的信号处理设备的构建 | NA | 探讨化学反应扩散过程是否能被用于生成化学信息处理设备 | 化学反应扩散过程及其在信息处理中的应用 | NA | NA | Belousov-Zhabotinsky(BZ)反应 | NA | NA | NA |
568 | 2024-08-07 |
A parallel algorithm for solving the n-queens problem based on inspired computational model
2015-May, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2015.03.004
PMID:25817410
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研究论文 | 本文提出了一种基于生物启发计算模型的并行DNA算法,用于解决n皇后问题 | 利用DNA分子操作解决n皇后问题,简化了计算复杂度并验证了DNA算法的可行性 | NA | 开发一种新的并行算法来解决计算难题 | n皇后问题 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | NA | DNA分子 | NA |
569 | 2024-08-07 |
Enzyme-regulated the changes of pH values for assembling a colorimetric and multistage interconnection logic network with multiple readouts
2015-Apr-22, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2015.02.026
PMID:25819791
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研究论文 | 本文开发了一种基于酶反应触发pH值变化和生物计算的新型多级互联生物网络,具有多个易于检测的信号输出 | 与传统的化学计算相比,基于酶的生物系统能够克服反应间的干扰或单个计算门的不兼容性,为组装多组分/多功能逻辑电路提供了独特的机会 | NA | 开发一种新型的多级互联生物网络,用于实现成本效益高、无需标记且可通过肉眼进行颜色逻辑操作的方法 | 酶输入(β-半乳糖苷酶、葡萄糖氧化酶、酯酶和脲酶)以及信号转导器(金纳米颗粒和酸碱指示剂)或pH计 | 生物计算 | NA | 酶反应 | 多级互联生物网络 | 信号输出 | 包括四种酶输入 |
570 | 2024-08-07 |
Versatile G-quadruplex-mediated strategies in label-free biosensors and logic systems
2015-Apr-21, The Analyst
DOI:10.1039/c4an02282c
PMID:25705973
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研究论文 | 本文探讨了G-四链体(G4)在无标记生物传感器和逻辑系统中的应用 | 利用G4的过氧化物酶样活性和G4增强的发光特性,结合G4与其他功能性核酸的耦合,扩展了其应用范围 | 存在抗干扰能力低和多重分析能力有限的问题 | 研究G-四链体在生物分析和复杂DNA计算中的应用潜力 | G-四链体及其复合物在生物传感器和逻辑系统中的应用 | 生物传感器 | NA | NA | NA | NA | NA |
571 | 2024-08-07 |
Comparison of eleven methods for genomic DNA extraction suitable for large-scale whole-genome genotyping and long-term DNA banking using blood samples
2015, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0115960
PMID:25635817
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研究论文 | 本研究比较了十一种从绵羊血液样本中提取基因组DNA的方法,以确定它们在大规模全基因组基因分型和长期DNA存储中的相对有效性 | 本研究首次系统比较了多种DNA提取方法,并确定了四种最适合大规模微阵列基因分型和长期DNA存储的方法 | 研究仅限于绵羊血液样本,可能不适用于其他物种或其他类型的样本 | 评估不同DNA提取方法在大规模基因分型和长期DNA存储中的有效性 | 绵羊血液样本中的基因组DNA | 基因组学 | NA | 下一代测序技术,微阵列技术 | NA | 基因组DNA | 600个个体 |
572 | 2024-08-07 |
DNA storage under high temperature conditions does not affect performance in human leukocyte antigen genotyping via next-generation sequencing (DNA integrity maintained in extreme conditions)
2014-Dec, Biopreservation and biobanking
IF:1.2Q3
DOI:10.1089/bio.2014.0036
PMID:25496152
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研究论文 | 本研究测试了在极端条件下长期存储于GenTegra DNA稳定化矩阵中的基因组DNA的完整性,并通过下一代测序(NGS)进行人类白细胞抗原(HLA)基因分型。 | 本研究展示了GenTegra产品在高温和温度波动条件下作为基因组DNA保存工具的有效性。 | NA | 测试在极端条件下长期存储的基因组DNA的完整性,并评估其在下游分子应用中的性能。 | 基因组DNA的完整性和性能。 | 分子生物学 | NA | 下一代测序(NGS) | NA | DNA | 多个基因组DNA样本 |
573 | 2024-08-07 |
How MAP kinase modules function as robust, yet adaptable, circuits
2014, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.4161/cc.29349
PMID:25483189
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研究论文 | 本文通过计算模拟研究了MAP激酶模块的3层拓扑结构及其在生物电路中的稳健性和适应性 | 提出了一个基本的2层电路拓扑结构,该结构可以通过反馈回路和支架重新配置,生成多样化的信号输出,从而形成既稳健又适应的3层模块化配置 | NA | 理解稳健且适应性强的模块如何影响真核生物的进化,并为进化生物学和合成生物学提供信息 | MAP激酶模块及其在生物电路中的功能 | 生物学 | NA | 计算模拟 | NA | NA | NA |
574 | 2024-08-07 |
Evolving Transport Networks With Cellular Automata Models Inspired by Slime Mould
2015-Sep, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2014.2361731
PMID:25438333
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞自动机的网络设计模型,灵感来源于黏菌的传播策略和计算能力 | 该模型通过模拟黏菌的传播策略和网络形成能力,提供了一种高效的生物启发计算设备设计方法 | 使用活体黏菌构建的计算设备速度极慢,需要数天时间执行计算 | 旨在开发一种高效的生物启发计算设备,用于解决难以通过传统算法解决的计算智能问题 | 研究对象为黏菌Physarum polycephalum及其在网络设计中的应用 | 计算智能 | NA | 细胞自动机(CA) | 细胞自动机(CA) | 网络数据 | NA |
575 | 2024-08-07 |
Parts & pools: a framework for modular design of synthetic gene circuits
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00042
PMID:25340051
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研究论文 | 本文介绍了Parts & Pools框架,该框架用于模块化设计细菌和真核细胞的合成基因电路 | Parts & Pools框架首次实现了对真核生物电路组件的适当形式化描述,并采用了基于规则的建模技术 | NA | 开发一个用于自动设计和可视化模块化合成基因电路的框架 | 细菌和真核细胞的合成基因电路 | 生物工程 | NA | 基于规则的建模 | NA | NA | NA |
576 | 2024-08-07 |
Freezing and storage at -20 °C provides adequate preservation of Toxoplasma gondii DNA for retrospective molecular analysis
2014-Nov, Diagnostic microbiology and infectious disease
IF:2.1Q3
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研究论文 | 本文研究了在-20°C和-80°C条件下储存的弓形虫DNA对实时PCR检测的影响 | 本文首次比较了不同储存温度对弓形虫DNA检测的影响 | NA | 探讨弓形虫DNA在不同储存条件下的长期保存效果 | 弓形虫DNA的储存条件 | NA | 弓形虫病 | 实时PCR | NA | DNA | NA |
577 | 2024-08-07 |
Neural networks and neuroscience-inspired computer vision
2014-Sep-22, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2014.08.026
PMID:25247371
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综述 | 本文回顾了神经科学和计算机科学之间的历史联系,并展望了基于生物启发计算机视觉和实验神经科学方法的快速发展,可能带来的新合作时代。 | 探讨了神经科学启发算法在计算机视觉中的成功应用和现有局限,并指出了未来可能取得进展的领域。 | 文章主要为综述性质,未提供具体的研究数据或实验结果。 | 探讨神经科学与计算机科学之间的交叉合作,特别是在生物启发计算机视觉领域的应用。 | 神经科学启发算法在计算机视觉中的应用及其效果。 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA |
578 | 2024-08-07 |
Cross-kingdom chemical communication drives a heritable, mutually beneficial prion-based transformation of metabolism
2014-Aug-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2014.07.025
PMID:25171409
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研究论文 | 研究报告了一种跨界的化学通讯系统,通过该系统细菌可以遗传性地改变酵母的代谢 | 首次报道了细菌通过分泌化学因子诱导酵母中的[GAR(+)]元素,从而改变酵母的代谢,使其在葡萄糖存在下利用多种碳源 | NA | 探索生物界间的化学通讯及其对代谢的遗传性影响 | 细菌与酵母的相互作用及其对酵母代谢的影响 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
579 | 2024-08-07 |
A Cerebellar Neuroprosthetic System: Computational Architecture and in vivo Test
2014, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2014.00014
PMID:25152887
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研究论文 | 本文展示了通过计算模型替换小脑电路以实现神经假体系统的可行性,并进行了活体测试 | 开发了一种小脑神经假体系统,通过计算模型模拟小脑微电路的学习功能,并在活体动物中验证了其有效性 | 生物信号的非平稳性限制了小脑模型的性能 | 验证通过神经假体系统替换受损神经回路的可行性,并实现对小脑学习功能的恢复 | 小脑电路及其在条件反射学习中的作用 | NA | NA | 计算模型 | 小脑微电路模型 | 生理记录数据 | 实验涉及多只麻醉大鼠 |
580 | 2024-08-07 |
Strip biosensor for amplified detection of nerve growth factor-beta based on a molecular translator and catalytic DNA circuit
2014-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/c4an00908h
PMID:25068151
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研究论文 | 本文展示了一种基于分子翻译器和催化DNA电路的新型视觉检测方法,用于检测神经生长因子-β(NGF-β) | 该方法利用基于结合诱导的DNA链置换反应的分子翻译器将输入蛋白转换为输出DNA信号,并通过催化DNA电路进行信号放大,实现了高灵敏度和选择性的检测 | NA | 开发一种新型的生物传感器,用于高灵敏度和选择性地检测神经生长因子-β | 神经生长因子-β(NGF-β) | 生物传感器 | NA | DNA链置换反应 | 催化DNA电路 | DNA | 动态响应范围从10 fM到10 pM,检测限为10 fM的NGF-β |