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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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441 | 2024-08-07 |
Isothermal digital detection of microRNAs using background-free molecular circuit
2020-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay5952
PMID:32010788
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研究论文 | 本文报道了一种使用等温扩增化学和液滴数字读出的高灵敏度微小RNA检测方法 | 设计了一种基于分子编程概念的DNA电路,能够转换、阈值、放大并报告特定微小RNA的存在,并通过泄漏吸收机制抑制非特异性扩增 | NA | 开发一种高灵敏度和定量性的微小RNA检测方法 | 微小RNA的准确量化 | 分子生物学 | NA | 等温扩增化学 | DNA电路 | 微小RNA | 单个微小RNA |
442 | 2024-08-07 |
Atomic-level reconstruction of biomolecules by a rigid-fragment- and local-frame-based (RF-LF) strategy
2020-Jan-21, Journal of molecular modeling
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s00894-020-4298-7
PMID:31965325
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研究论文 | 本文提出了一种基于刚性片段和局部框架的(RF-LF)反向映射方法,用于从粗粒度模型重建生物分子的原子级结构 | 提出的RF-LF方法是一种通用的、无参数的反向映射方法,能够有效地从粗粒度模型重建原子级结构 | NA | 旨在开发一种新的方法,用于从粗粒度模型重建生物分子的原子级结构 | 蛋白质、DNA和RNA系统的原子级结构重建 | 生物计算 | NA | 粗粒度模型反向映射 | RF-LF方法 | 原子级结构 | NA |
443 | 2024-08-07 |
Current and Emerging Methods for the Synthesis of Single-Stranded DNA
2020-01-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes11020116
PMID:31973021
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综述 | 本文综述了合成任意单链DNA(ssDNA)片段的代表性方法及其面临的挑战 | 介绍了多种合成用户自定义ssDNA序列的方法,以克服不同长度、纯度和产量的限制 | 文章未提及具体的技术局限性 | 旨在帮助读者做出明智的合成方法选择,并促进高效ssDNA合成技术的持续发展 | 单链DNA的合成方法及其应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
444 | 2024-08-07 |
Adaption of an autonomously cascade DNA circuit for amplified detection and intracellular imaging of polynucleotide kinase with ultralow background
2020-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2019.111994
PMID:31941614
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研究论文 | 本文提出了一种基于串联杂交链反应(Con-HCR)的PNK传感平台,用于超灵敏PNK检测和细胞内成像 | 该方法通过多重响应识别PNK/核酸酶和Con-HCR的双重放大,实现了对PNK的灵敏和选择性检测,并可用于筛选PNK抑制剂 | NA | 开发一种新的方法用于实时追踪和监测PNK,以解决当前PNK传感策略在复杂生物环境中的局限性 | 研究对象为多核苷酸激酶(PNK)及其在细胞内的表达水平 | 生物技术 | NA | 串联杂交链反应(Con-HCR) | NA | DNA | NA |
445 | 2024-08-07 |
Correction to An Autonomous Nonenzymatic Concatenated DNA Circuit for Amplified Imaging of Intracellular ATP
2020-01-21, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b05866
PMID:31920068
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
446 | 2024-08-07 |
Ten-Input Cube Root Logic Computation with Rational Designed DNA Nanoswitches Coupled with DNA Strand Displacement Process
2020-Jan-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b15180
PMID:31867943
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research paper | 本文通过设计一个多功能DNA反应平台,结合多种荧光底物作为输出报告器,首次构建了一个能够计算10位二进制数(十进制数1000以内)立方根的逻辑电路。 | 本文首次构建了一个能够计算10位二进制数立方根的逻辑电路,展示了DNA在生物计算领域的强大能力。 | 目前的架构大多只能实现有限的逻辑电路,无法处理更复杂的数学运算。 | 推动计算设备向更高功能复杂度的阶段发展。 | 设计一个能够计算10位二进制数立方根的逻辑电路。 | 生物计算 | NA | DNA链置换过程 | 逻辑电路 | 二进制数 | 10位输入和4位输出 |
447 | 2024-08-07 |
DNA storage in everyday objects
2020-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0376-8
PMID:31853050
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
448 | 2024-08-07 |
A DNA-of-things storage architecture to create materials with embedded memory
2020-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0356-z
PMID:31819259
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研究论文 | 本文提出了一种名为'DNA-of-things'(DoT)的存储架构,用于在材料中嵌入不可变的记忆 | DoT架构允许在各种材料中嵌入DNA分子记录的数据,并展示了在三维打印物体中存储和传递信息的能力 | NA | 开发一种新的DNA存储技术,用于在材料中嵌入记忆 | DNA存储技术及其在材料中的应用 | NA | NA | DNA存储 | NA | DNA | 45 kB数字DNA蓝图和1.4 MB视频 |
449 | 2024-08-07 |
Evidence of Robustness in a Two-Component System Using a Synthetic Circuit
2020-01-29, Journal of bacteriology
IF:2.7Q3
DOI:10.1128/JB.00672-19
PMID:31792012
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研究论文 | 本文通过实验验证了双组分系统(TCS)信号通路的鲁棒性,设计了一个合成电路并系统地改变组件浓度以监测输出信号 | 本文提供了实验证据来验证TCS信号通路的鲁棒性,并设计了一个合成电路来分析基因调控网络中不同组件之间的关系 | NA | 验证双组分系统信号通路的鲁棒性 | 双组分系统(TCS)及其在不同组件浓度下的输出鲁棒性 | 生物电路 | NA | NA | NA | 信号输出 | 使用了代表性的TCS,MprAB,并在不同条件下进行了实验 |
450 | 2024-08-07 |
The cooperative interaction of triplex forming oligonucleotides on DNA-triplex formation at electrode surface: Molecular dynamics studies and experimental evidences
2020-Mar, Colloids and surfaces. B, Biointerfaces
DOI:10.1016/j.colsurfb.2019.110648
PMID:31767411
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研究论文 | 本研究详细探讨了三链形成寡核苷酸(TFOs)与双链DNA在电极表面形成三链DNA结构的协同作用 | 本研究通过分子动力学模拟和实验证据,证明了TFOs序列距离和TA*T三联体单元的数量对协同效应的有效性至关重要 | NA | 研究TFOs与双链DNA在电极表面形成三链DNA结构的协同作用及其机制 | 三链形成寡核苷酸(TFOs)与双链DNA的相互作用 | 分子生物学 | NA | 分子动力学模拟(MD) | Luzar和Chandler模型 | DNA | TFO1和TFO2探针与双链DNA的相互作用 |
451 | 2024-08-07 |
Interactions between PHD3-Bromo of MLL1 and H3K4me3 Revealed by Single-Molecule Magnetic Tweezers in a Parallel DNA Circuit
2019-12-18, Bioconjugate chemistry
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acs.bioconjchem.9b00665
PMID:31714753
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研究论文 | 本文利用单分子磁力钳在并行DNA电路中研究了PHD3-Bromo与H3K4me3之间的蛋白质-蛋白质相互作用 | 提出了一种使用单分子磁力钳和并行DNA电路的新策略,避免了蛋白质聚集问题,并扩展了生物正交偶联的选择 | NA | 揭示PHD3-Bromo与H3K4me3之间的蛋白质-蛋白质相互作用的详细机制 | PHD3-Bromo与H3K4me3之间的相互作用 | 生物技术 | 白血病 | 单分子磁力钳 | NA | 蛋白质相互作用 | NA |
452 | 2024-08-07 |
An Autonomous Nonenzymatic Concatenated DNA Circuit for Amplified Imaging of Intracellular ATP
2019-12-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b04126
PMID:31668059
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研究论文 | 构建了一种基于自主非酶级联杂交链反应(Ca-HCR)电路的鲁棒ATP适体传感器,用于细胞内成像 | 该适体传感器通过FRET转导机制,利用双层HCR电路实现高信号增益,并可通过MATLAB模拟整个反应过程 | NA | 开发一种高灵敏度和选择性的ATP适体传感器,用于细胞内ATP的检测和成像 | 细胞内ATP的表达 | 生物技术 | NA | 杂交链反应(HCR) | NA | 图像 | NA |
453 | 2024-08-07 |
DNA-strand molecular beacon optical processor
2019-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2019.e02389
PMID:31687539
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研究论文 | 本文提出了一种基于DNA分子的光学处理器模型,该模型能够提高并行性并大幅减少人工干预 | 该模型能够在单一层次上解决包含多种类型门电路的布尔电路,提高了并行性并减少了氮基的使用 | NA | 探索和优化基于DNA计算的并行处理能力 | DNA计算模型及其在布尔电路中的应用 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | NA |
454 | 2024-08-07 |
Correlates of longitudinal leukocyte telomere length in the Costa Rican Longevity Study of Healthy Aging (CRELES): On the importance of DNA collection and storage procedures
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0223766
PMID:31603943
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研究论文 | 研究旨在识别拉丁美洲人群中白细胞端粒长度(LTL)的协变量,特别是LTL与36个社会人口统计学、早期童年和健康特征以及DNA样本收集和存储程序的关联 | 发现样本收集程序和DNA冰箱存储时间与LTL有强烈关联,并提出了在LTL研究中控制这些因素的重要性 | 由于未观察到的测量变异成分,统计控制可能不如标准化数据收集程序有效 | 研究白细胞端粒长度与多种因素的关联,并探讨DNA收集和存储程序对LTL的影响 | 来自哥斯达黎加长寿与健康衰老研究(CRELES)的1,261名60岁以上的个体 | NA | NA | 随机效应回归模型 | 随机效应回归模型 | 面板数据 | 1,261名60岁以上的个体 |
455 | 2024-08-07 |
Autocatalytic DNA circuit for Hg2+ detection with high sensitivity and selectivity based on exonuclease III and G-quadruplex DNAzyme
2020-Jan-15, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2019.120258
PMID:31594619
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研究论文 | 本文提出了一种基于外切酶III(Exo III)辅助级联信号放大的超灵敏无标记自催化DNA电路,用于Hg检测,利用G-四链体作为信号报告探针 | 该传感器通过T-Hg-T配位化学触发Exo III的消化反应,实现对Hg的高选择性和高灵敏度检测 | NA | 开发一种用于Hg检测的超灵敏无标记自催化DNA电路 | Hg检测 | 生物传感器 | NA | 外切酶III(Exo III) | G-四链体DNAzyme | 荧光强度 | 检测范围从10 fM到100 nM |
456 | 2024-08-07 |
Simulating the Monty Hall problem in a DNA sequencing machine
2019-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究在高通量DNA测序机中模拟并证明了蒙提霍尔问题,通过简单的编码方式,所有可能的情景由DNA寡核苷酸表示,游戏决策通过从特定位置测序这些寡核苷酸实现 | 本研究首次在高通量DNA测序机中模拟蒙提霍尔问题,展示了DNA测序技术在DNA计算问题中的新应用 | NA | 探索并证明蒙提霍尔问题在DNA测序机中的模拟 | 蒙提霍尔问题的模拟与证明 | NA | NA | DNA测序 | NA | DNA寡核苷酸 | 超过12,000,000次独立游戏模拟 |
457 | 2024-08-07 |
Nicking-Assisted Reactant Recycle To Implement Entropy-Driven DNA Circuit
2019-10-30, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b07521
PMID:31539231
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研究论文 | 本文介绍了一种基于切割辅助的反应物回收策略,用于在熵驱动的DNA电路中实现反应物的回收 | 提出了一种新的切割辅助回收策略,使双链DNA废物能够转化为活性成分,参与下一轮反应 | NA | 开发新的反应物回收方法,提高熵驱动DNA电路反应的可回收性 | 单层电路和多层双层电路的设计与分析 | 分子编程 | NA | DNA电路 | NA | DNA | NA |
458 | 2024-08-07 |
Coupling of DNA Circuit and Templated Reactions for Quadratic Amplification and Release of Functional Molecules
2019-10-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.9b05688
PMID:31538784
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研究论文 | 本文展示了将DNA电路与模板反应耦合,以实现小分子输出的高级别放大 | 首次实现了DNA电路与模板反应的耦合,使得小分子输出的放大成为可能 | NA | 探索DNA电路与模板反应耦合的可能性,以实现小分子的高级别放大 | DNA电路与模板反应的耦合机制 | NA | NA | DNA电路,模板反应 | NA | 核酸 | NA |
459 | 2024-08-07 |
A catalytic DNA circuit-programmed and enzyme-powered autonomous DNA machine for nucleic acid detection
2019-Oct-07, The Analyst
DOI:10.1039/c9an01568j
PMID:31528926
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研究论文 | 本文设计了一种催化DNA电路,利用切割内切酶在三链DNA探针上的作用,自主驱动酶动力DNA机器进行一步、等温且自催化的核酸分析 | 创新性地设计了催化DNA电路,实现了自主驱动的酶动力DNA机器 | 未提及 | 开发一种新型的核酸检测方法 | 催化DNA电路和酶动力DNA机器 | NA | NA | DNA电路 | NA | DNA | 未提及 |
460 | 2024-08-07 |
An enzyme-free DNA circuit for the amplified detection of Cd2+ based on hairpin probe-mediated toehold binding and branch migration
2019-Oct-01, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/c9cc06311k
PMID:31531427
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研究论文 | 设计了一种基于发夹探针介导的脚趾结合和分支迁移的无酶DNA电路,用于放大检测Cd2+ | 利用Cd2+特异性适配体识别Cd2+,并通过G-四链体报告检测信号,实现了无酶的放大检测方法 | NA | 开发一种新型的无酶DNA电路,用于高灵敏度检测Cd2+ | Cd2+的检测 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | 检测限为5 pM |