生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价5元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 782 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-06-24 |
Engineered 3D DNA Crystals: A Molecular Design Perspective
2025-Jun, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401455
PMID:39777863
|
综述 | 本文综述了工程化3D DNA晶体的分子设计，探讨了其在材料科学中的多种应用 | 通过DNA自下而上的自组装方法，实现了具有高精度和高可编程性的3D DNA晶体 | NA | 探讨工程化3D DNA晶体的分子设计及其在先进材料设计中的应用 | 3D DNA晶体 | 材料科学 | NA | DNA自组装 | NA | NA | NA |
| 22 | 2025-06-12 |
Challenges and opportunities in DNA computing and data storage
2025-Jun, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01937-w
PMID:40494931
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-06-19 |
A DNA circuit that records molecular events
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adn3329
PMID:38578999
|
研究论文 | 开发了一种新型分子事件记录器，能够通过DNA电路记录分子事件的相对发生时间、强度和持续时间 | 利用链置换反应网络和引物交换反应处理信息，并通过DNA测序解码和量化，实现了对分子事件的多参数同时记录 | 在持续时间记录方面的准确率为75%，相对较低 | 开发能够记录分子事件相对发生时间、强度和持续时间的工具 | 分子信号 | 分子生物学 | NA | DNA测序 | NA | DNA序列 | NA |
| 24 | 2025-06-18 |
On-Demand Regulation of Catalytic DNA Circuits Using Phosphorylated Charge Reversal Peptides
2025-Jun-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425113
PMID:40249733
|
研究论文 | 本研究开发了一种多功能酶响应肽（ERP），用于高效负载和特异性细胞内递送及释放催化电路探针，通过磷酸化电荷反转过程实现精确的体内microRNA成像 | 首次利用磷酸化电荷反转肽实现催化DNA电路的可控调节，并开发了具有肿瘤细胞主动靶向和磷酸化引导释放功能的多功能肽 | 未提及临床前或临床试验结果，体内应用效果需进一步验证 | 开发安全高效的体内递送系统用于催化DNA电路的调控 | 催化DNA电路和多功能酶响应肽 | 生物传感 | 肿瘤 | 磷酸化电荷反转技术 | NA | 生物分子数据 | 未明确说明样本量 |
| 25 | 2025-06-16 |
Programmable PCR-like Nonenzymatic DNA Molecular Circuit for Split-Free Autocatalytic Amplification
2025-Jun-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c01612
PMID:40442030
|
research paper | 开发了一种无需分裂设计的PCR样非酶DNA分子电路，用于自催化扩增，具有高效的信号放大能力 | 提出了一种新型的无需分裂设计的自催化扩增DNA电路，简化了设计并提高了自催化效率 | 目前的自催化DNA电路仍存在设计复杂、自催化效率低、需要额外探针以及缺乏通用设计原则的问题 | 开发高效的非酶DNA分子电路，用于低丰度生物标志物的分析 | 非酶自催化DNA电路 | 生物化学 | NA | 非酶DNA分子电路 | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-06-15 |
Coli bond: A dual-function encryption system for secure information storage and transmission by microorganisms
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325926
PMID:40498745
|
research paper | 介绍了一种名为Coli Bond的双功能加密系统，利用微生物进行安全信息存储和传输 | 结合DNA存储的分子精确性与合成生物学的可控动态性，提供数据加密和存储的创新平台 | NA | 开发一种安全可控的信息存储和传输系统 | 利用合成生物学改造的大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | DNA编码的信息 | NA |
| 27 | 2025-06-15 |
Hyperchaotic color image encryption using eight-base DNA complementary rules and extended Zigzag transform
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325197
PMID:40505085
|
研究论文 | 本文提出了一种结合八碱基DNA互补规则和扩展Zigzag变换的超混沌彩色图像加密方案EDCREZT | 提出了5040种八碱基DNA互补规则，远超传统四碱基DNA的6种规则，并引入了新的扩展Zigzag变换，显著增加了加密的灵活性和复杂性 | NA | 开发一种更安全高效的彩色图像加密方法 | 彩色图像 | 计算机视觉 | NA | DNA计算、超混沌系统 | EDCREZT（基于4D超混沌系统的加密方案） | 图像 | NA |
| 28 | 2025-06-09 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
|
research paper | 该研究设计了一种基于DNA的电路，用于调控原生细胞与活细胞之间的自主双向通讯 | 通过设计包含识别、激活和反馈模块的DNA电路，实现了原生细胞对活细胞信号的自主感知与响应，并控制细胞间粘附 | 未提及该技术在复杂生理环境中的适用性及长期稳定性 | 开发合成生物学工具以调控细胞间信号传导并编程细胞行为 | 原生细胞与活细胞群落 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-06-07 |
ReLume: Enhancing DNA storage data reconstruction with flow network and graph partitioning
2025-Aug, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.022
PMID:40268154
|
research paper | 提出了一种基于流网络和图分区技术的DNA存储数据重建方法ReLume，显著提高了序列恢复率并降低了内存使用 | ReLume方法在笔记本电脑上实现了数百万读取的数据重建任务，序列恢复率提高了一倍以上，内存使用减少了约60%，且数据持久性提高了10倍 | NA | 解决DNA存储中的数据重建问题，提高序列恢复率和数据持久性 | DNA存储数据 | 生物信息学 | NA | 流网络和图分区技术 | NA | DNA序列数据 | 数百万读取 |
| 30 | 2025-06-06 |
Data Readout Techniques for DNA-Based Information Storage
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412926
PMID:39910849
|
综述 | 本文系统介绍了DNA信息存储中的数据读出技术，包括序列和结构两种存储单元及其对应的测序和非测序方法 | 首次系统性地总结和讨论了DNA数据存储系统中的读出技术，特别是存储系统设计与读出技术选择之间的关联 | 未提及具体的实验验证数据或性能比较 | 探讨DNA作为数字数据存储介质的读出技术发展现状与挑战 | DNA分子及其结构作为信息存储载体 | 生物信息存储技术 | NA | 测序技术、非测序方法、微流控技术、荧光探针 | NA | DNA序列数据、分子结构数据 | NA |
| 31 | 2025-06-06 |
Leveraging Demethylase Activation in DNA Circuits to Overcome Signal Leakage for Reliable MicroRNA Bioimaging
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412843
PMID:40211605
|
research paper | 该研究设计了一种去甲基化酶激活的DNA组装（DAD）电路，用于可靠且稳健地成像细胞microRNA，通过整合杂交链反应（HCR）放大器系统的顺序激活 | 利用去甲基化酶激活DNA电路来克服信号泄漏，实现可靠的microRNA生物成像 | NA | 开发一种可靠的细胞内microRNA成像方法，以区分癌细胞和正常细胞 | 细胞microRNA | 生物技术 | 癌症 | DNA电路、杂交链反应（HCR） | NA | 生物分子数据 | NA |
| 32 | 2025-06-05 |
Nanopore-Based Single-Molecule Logic Unit (sMOLU)
2025-Jun-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202501560
PMID:40462731
|
研究论文 | 开发了一种基于纳米孔技术的单分子逻辑单元（sMOLU），用于实现DNA基础的AND逻辑门 | 结合单分子DNA计算与纳米孔技术，实现了在脂质双层中的实时分子计算 | NA | 推进纳米尺度计算系统的发展，整合DNA计算和纳米孔技术 | 单分子DNA计算与纳米孔技术 | 分子计算 | NA | 纳米孔技术，荧光和电生理测量 | NA | 分子信号 | NA |
| 33 | 2025-06-04 |
Entropy-driven DNA circuit induced rolling circle transcription generates fluorescent light-up RNA aptamer for one-pot and label-free detection of miRNA-133a
2025-Nov-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128173
PMID:40262346
|
research paper | 该研究构建了一种基于熵驱动DNA电路和滚环转录的级联扩增策略，用于一锅无标记检测miRNA-133a | 结合熵驱动DNA电路和滚环转录技术，生成重复的荧光RNA适配体，实现高灵敏度和高选择性的miRNA检测 | 未提及在实际临床样本中的大规模验证 | 开发一种高灵敏度、高选择性的miRNA-133a检测方法，用于急性心肌梗死的早期诊断 | miRNA-133a | 分子诊断 | 心血管疾病 | 熵驱动DNA电路(EDC), 滚环转录(RCT) | NA | 荧光信号 | 线性范围50 pM至50 nM，检测限38.3 pM |
| 34 | 2025-06-04 |
Dual-Signal Probing of Molecular Subtypes of Breast Cancer: Synergistic Chirality and Charge-Transfer Effect Enable Enhanced Accuracy
2025-Jun-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c01620
PMID:40388600
|
研究论文 | 本研究利用DNA纳米技术构建了一种双信号探测系统，用于乳腺癌分子亚型的快速准确分类 | 通过结合手性和电荷转移效应的协同作用，提高了检测准确性，并实现了在1小时内快速检测关键生物标志物 | NA | 开发一种快速、简单的乳腺癌分子亚型检测方法 | 乳腺癌分子亚型 | DNA纳米技术 | 乳腺癌 | DNA纳米技术、光谱测量 | NA | 光学信号(圆二色性和荧光) | NA |
| 35 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
|
研究论文 | 本研究评估了五种代表性DNA存储编码方法的生物安全风险，分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统地评估了DNA信息存储中人工合成DNA序列的生物安全风险，并提出了缓解潜在风险的随机化策略 | 研究仅评估了五种编码方法，可能未涵盖所有潜在风险 | 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 | 五种DNA存储编码方法（Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码） | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法 |
| 36 | 2025-06-03 |
Investigating enhanced stability in CTAB(C)-compacted DNA under aging conditions for data storage
2025-Jun-02, Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
DOI:10.1088/1361-648X/addbb7
PMID:40398454
|
研究论文 | 研究使用表面活性剂介导的DNA压缩和环糊精驱动的解压缩技术，用于长期存储天然和合成DNA的效果 | 展示了CTAB和CTAC压缩的DNA在加速老化条件下的增强稳定性，特别是在高温下合成DNA的稳定性优于原始DNA | 研究仅在加速老化条件下进行，未验证在实际长期存储环境中的表现 | 探索DNA作为长期数据存储介质的可行性和稳定性 | 鲑鱼来源的DNA（sDNA）和定制设计的合成DNA（synDNA） | DNA数据存储 | NA | CTAB/CTAC压缩、2HP-β-CD解压缩、吸光度测量、定量PCR、Sanger测序 | NA | DNA序列数据 | 鲑鱼DNA和合成DNA样本，在不同温度（4°C至70°C）和50%相对湿度下进行4、8和12天的加速老化测试 |
| 37 | 2025-05-31 |
A Robust and Efficient Representation-based DNA Storage Architecture by Deep Learning
2025-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202400959
PMID:40114483
|
research paper | 提出了一种基于深度学习的DNA存储架构，利用自编码器和U-Net网络实现图像的表示、构建和从噪声读取中恢复 | 结合深度学习的表示能力和图像生成能力，提出了一种新的DNA存储架构，能够在存在插入-删除-替换错误的情况下恢复图像 | 在插入-删除-替换错误超过6%的情况下，图像恢复质量可能下降 | 开发一种鲁棒且高效的DNA存储解决方案，用于大规模图像应用 | 图像数据在DNA存储中的表示和恢复 | machine learning | NA | deep learning | autoencoder, U-Net | image | 14 plasmids（湿实验验证） |
| 38 | 2025-05-30 |
Circuit design in biology and machine learning. I. Random networks and dimensional reduction
2025-Mar-29, Evolution; international journal of organic evolution
DOI:10.1093/evolut/qpaf065
PMID:40439578
|
research paper | 本文探讨了生物电路与机器学习电路在设计上的相似性与差异性，通过分析随机网络和维度缩减等经典机器学习模型，为理解生物电路的设计提供了新的视角 | 通过比较生物电路与机器学习电路的设计过程，提出了生物电路设计中随机连接网络的强大作用及环境内部模型的核心角色 | 研究主要基于理论模型，缺乏具体的生物实验验证 | 探讨生物电路与机器学习电路在设计上的相似性与差异性，以理解生物电路的设计原理 | 生物电路和机器学习电路 | machine learning | NA | NA | random networks, dimensional reduction models | theoretical models | NA |
| 39 | 2025-05-29 |
High-Risk Sequence Prediction Model in DNA Storage: The LQSF Method
2025-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3424576
PMID:38976468
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LQSF的创新方法，利用深度学习模型预测DNA存储中的高风险序列，以提高存储效率和减少错误 | 引入了主动序列过滤方法LQSF，在编码阶段使用深度学习模型预测高风险序列，显著提高了DNA存储技术的效率和准确性 | 未提及具体的数据集规模限制或模型在不同类型DNA序列上的泛化能力 | 提高DNA存储技术的效率和准确性，减少合成和测序过程中的错误 | DNA存储中的序列质量预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | Alexnet, VGG16, VGG19 | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了多种神经网络和测试集进行广泛训练和测试 |
| 40 | 2025-05-28 |
DP-ID: Interleaving and Denoising to Improve the Quality of DNA Storage Image
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00671-6
PMID:39578306
|
研究论文 | 提出了一种名为DP-ID的新型DNA存储图像编码和解码方法，以提高信息密度和重建图像质量 | 通过动态规划算法压缩图像为比特流，并映射到DNA后进行交织处理，使用中值滤波去除椒盐噪声，显著提高了在高错误率下的重建图像质量 | 未明确提及方法的计算复杂度或实时性能 | 提高DNA存储图像的信息密度和重建质量 | 图像数据在DNA中的存储与重建 | DNA存储技术 | NA | 动态规划算法、中值滤波 | DP-ID（动态规划交织去噪方法） | 图像数据 | 未明确提及具体样本量，但包含湿实验验证 |