生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 779 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-07 |
A Quaternary Code Correcting a Burst of at Most Two Deletion or Insertion Errors in DNA Storage
2021-Nov-27, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e23121592
PMID:34945898
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research paper | 本文提出了一种适用于DNA存储的四进制码设计，用于纠正最多两个连续的删除或插入错误 | 提出了新的四进制码设计，并证明了其能纠正最多两个连续的删除或插入错误 | NA | 解决DNA存储中的错误纠正问题 | DNA存储中的错误纠正码设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-07 |
Fractal construction of constrained code words for DNA storage systems
2022-03-21, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1209
PMID:34908135
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研究论文 | 本文提出了一种基于混沌游戏表示法的新方法，用于生成符合用户定义约束（如GC含量、同聚物和不良基序）的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | 本文的创新点在于采用混沌游戏表示法生成满足特定约束的DNA编码词，以提高DNA存储系统的可靠性。 | NA | 研究如何利用DNA作为存储介质，生成满足特定约束的DNA编码词，以构建可靠的DNA存储系统。 | DNA编码词及其在DNA存储系统中的应用。 | 计算机科学 | NA | 混沌游戏表示法 | NA | DNA序列 | NA |
| 363 | 2024-08-07 |
Enzyme Method-Based Microfluidic Chip for the Rapid Detection of Copper Ions
2021-Nov-10, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi12111380
PMID:34832792
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research paper | 本文报道了一种基于酶法的微流控芯片，用于快速检测海水中的铜离子 | 该芯片采用铜离子抑制辣根过氧化物酶（HRP）活性的方法，实现了对铜离子的快速检测，并具有裸眼和分光光度计两种检测模式 | NA | 开发一种快速检测海水铜污染的方法 | 海水中的铜离子 | NA | NA | 微流控技术 | NA | 溶液 | 使用了三个真实海水样本 |
| 364 | 2024-08-07 |
Development of Synthetic DNA Circuit and Networks for Molecular Information Processing
2021-Nov-04, Nanomaterials (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/nano11112955
PMID:34835719
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综述 | 本文总结了近年来合成DNA电路及其在分子信息处理中的应用和研究进展 | 合成DNA电路通过其可编程设计和模块化特性，能够放大微弱信号并建立可编程的级联系统，适用于生物传感检测 | NA | 探讨合成DNA电路的机制和应用，为建立更先进的人工基因调控系统和智能分子传感工具提供基础 | 合成DNA电路及其在基因网络调控和分子信息处理中的应用 | 生物技术 | NA | DNA电路 | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-07 |
Scaling DNA data storage with nanoscale electrode wells
2021-Nov-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abi6714
PMID:34818035
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research paper | 本文开发了一种纳米级DNA存储写入器，旨在提高DNA数据存储的写入密度 | 首次开发了纳米级DNA存储写入器，预计将DNA写入密度提高到25 × 10序列每平方厘米，比现有DNA合成阵列提高了三个数量级 | NA | 提高DNA数据存储的写入密度和容量 | DNA数据存储技术 | NA | NA | DNA合成技术 | NA | DNA序列 | NA |
| 366 | 2024-08-07 |
Design of Constraint Coding Sets for Archive DNA Storage
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3127271
PMID:34762590
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研究论文 | 本文提出了一种新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），用于增加约束编码集的下界，以提高DNA存储的准确性 | 提出了新的海洋捕食者算法（QRSS-MPA），增加了约束编码集的下界，提高了DNA存储的准确性 | NA | 提高DNA存储的准确性和可靠性 | 约束编码集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | DNA存储技术 | 海洋捕食者算法（QRSS-MPA） | DNA序列 | NA |
| 367 | 2024-08-07 |
Real-Time Investigation of Intracellular Polynucleotide Kinase Using a Cascaded Amplification Circuit
2021-11-23, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c04033
PMID:34748706
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研究论文 | 本文开发了一种通过整合催化DNA组装和杂交链反应电路的级联DNA放大电路，实现了通过Förster共振能量转移（FRET）原理准确评估细胞内多核苷酸激酶（PNK）活性 | 提出了一个创新的级联DNA放大电路，通过λ核酸酶特异性消化5'-磷酸DNA和高信号增益的级联电路，实现了对PNK活性的敏感分析 | NA | 开发一种新的方法来实时监测和评估细胞内多核苷酸激酶的活性 | 细胞内多核苷酸激酶的活性 | 生物技术 | NA | Förster共振能量转移（FRET） | NA | DNA | 在HeLa细胞中进行了广泛探索 |
| 368 | 2024-08-07 |
Rational design of allosterically regulated toehold mediated strand displacement circuits for sensitive and on-site detection of small molecule metabolites
2021-Nov-22, The Analyst
DOI:10.1039/d1an01488a
PMID:34734587
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研究论文 | 本文开发了一种基于别构转录因子（aTF）调控的脚手架介导的链置换（TMSD）电路的生物传感器，用于非侵入性唾液样本中尿酸（UA）的检测 | 通过理性设计双通道TMSD电路，克服了天然HucR低配体亲和力的影响，提高了输出信号的富集和生物传感器的灵敏度 | NA | 开发快速、去中心化的小分子检测方法，满足日常健康监测和快速诊断的需求 | 尿酸（UA）的检测 | 生物传感器 | NA | 脚手架介导的链置换（TMSD）电路 | NA | 唾液样本 | NA |
| 369 | 2024-08-07 |
An Efficient Method for DNA Purification-Free PCR from Plant Tissue
2021-Nov, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.289
PMID:34748285
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研究论文 | 本文介绍了一种无需DNA纯化的高通量PCR方法，用于从植物组织中扩增基因组DNA片段 | 该方法无需DNA纯化或特殊样品存储设备，使用商业化或自制的DNA存储卡，直接从植物组织中进行PCR扩增 | NA | 开发一种低成本、高通量的PCR方法，使植物DNA分子诊断技术更易于在资源有限的条件下进行 | 至少包括拟南芥、番茄、大豆、马铃薯、棉花和稻在内的十一种植物 | 分子生物学 | NA | PCR | NA | DNA | 至少十一种植物物种 |
| 370 | 2024-08-07 |
CRISPR-Powered DNA Computing and Digital Display
2021-11-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00431
PMID:34704742
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研究论文 | 本文报道了一种基于CRISPR技术的DNA计算和数字显示系统，该系统通过编程的DNA目标作为输入，并通过ON/OFF荧光信号表示TRUE/FALSE输出 | 该系统能够建立输入与输出之间的一对一关系，实现多级DNA逻辑计算，并通过预CRISPR反应选择性维持或抑制CRISPR反应性来扩展输入大小 | NA | 开发一种新型的CRISPR驱动的DNA计算和数字显示系统 | CRISPR技术在DNA计算和分子编程中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR技术 | NA | DNA | NA |
| 371 | 2024-08-07 |
DNA storage: research landscape and future prospects
2020-Jun, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaa007
PMID:34692128
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综述 | 本文综述了DNA存储的基本理论、研究历史和技术挑战，并从定量角度评估了DNA作为新型数据存储介质的前景 | DNA作为一种稳定、资源和能源高效且可持续的数据存储解决方案 | NA | 探讨DNA存储的研究现状及未来前景 | DNA存储的理论、历史和技术挑战 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-07 |
Enhancing Physical and Thermodynamic Properties of DNA Storage Sets With End-Constraint
2022-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3121278
PMID:34662278
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research paper | 本文提出了一种新的方法来设计高质量的DNA存储集，通过引入随机开关和双权重后代策略在双策略黑寡妇优化算法（DBWO）中，提高了算法的探索和利用能力，并应用于设计DNA存储集，同时提出了末端约束以改善序列的稳定性。 | 本文创新地引入了随机开关和双权重后代策略在DBWO算法中，提高了算法的性能，并提出了末端约束方法来增强DNA存储集的物理和热力学性质。 | NA | 提高DNA存储集的质量和稳定性 | DNA存储集的设计和优化 | 生物信息学 | NA | 双策略黑寡妇优化算法（DBWO） | DBWO | DNA序列 | 26个基准函数 |
| 373 | 2024-08-07 |
Scaling up DNA digital data storage by efficiently predicting DNA hybridisation using deep learning
2021-10-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97238-y
PMID:34654863
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research paper | 本文通过深度学习方法有效预测DNA杂交过程，以扩大DNA数字数据存储的应用 | 首次全面研究机器学习方法在预测DNA杂交任务中的应用，并引入了一个包含超过250万个数据点的模拟杂交数据集 | NA | 控制和预测DNA杂交过程，以推动混合分子-电子计算的未来发展 | DNA杂交过程及其在DNA数字数据存储和计算中的应用 | machine learning | NA | deep learning | NA | DNA序列数据 | 超过250万个数据点 |
| 374 | 2024-08-07 |
A Loser-Take-All DNA Circuit
2021-11-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00318
PMID:34623152
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研究论文 | 本文介绍了一种新型DNA电路——失败者全取电路，该电路通过DNA链置换实现，能够在输入中选择最小模拟值的信号 | 引入了一种新的DNA电路类型——失败者全取电路，与传统的赢家全取电路互补，能够识别基于最小相似性的分子模式 | NA | 开发一种新型的DNA电路，用于分子模式识别任务 | DNA电路的设计和性能 | NA | NA | DNA链置换 | NA | NA | 成功演示了一个包含九种独特输入组合的三输入失败者全取电路 |
| 375 | 2024-08-07 |
Stochastic Hazard Analysis of Genetic Circuits in iBioSim and STAMINA
2021-10-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.1c00159
PMID:34606710
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研究论文 | 本文通过使用STAMINA工具对三种已知具有故障行为的遗传电路实现进行随机分析，预测故障倾向，并通过与iBioSim中的随机模拟结果对比验证了STAMINA的有效性 | 本文展示了随机验证在遗传设计中的应用，帮助设计者评估设计选择和输入限制，以实现所需的运行可靠性 | NA | 研究如何通过随机分析预测遗传电路中的故障倾向，并提高电路的运行可靠性 | 三种已知具有故障行为的遗传电路实现 | 合成生物学 | NA | 随机验证 | NA | 遗传电路数据 | 三种遗传电路实现 |
| 376 | 2024-08-07 |
Integrated Iontronic Circuits Based on Single Nanochannels
2021-Oct-13, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.1c12324
PMID:34585930
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研究论文 | 本文介绍了一种基于并行单个聚二甲基硅氧烷（PDMS）纳米通道的离子电子电路的发明，用于实现有效的电子信号操控 | 该电路能够作为双极结型晶体管或离子整流器，通过不对称地装饰带电聚电解质在纳米通道上来调控离子传输 | NA | 开发新型离子电子集成电路，以改进生物计算和传感技术 | 离子电子电路及其在生物计算和传感中的应用 | NA | NA | 离子电子技术 | 离子电子电路 | NA | NA |
| 377 | 2024-08-07 |
Modular DNA Circuits for Point-of-Care Colorimetric Assay of Infectious Pathogens
2021-10-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02597
PMID:34506117
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研究论文 | 本文介绍了一种基于核酸等温扩增技术和DNA酶介导比色读出的模块化DNA电路，用于即时检测多种传染性病原体 | 该研究设计了一种固定模块和灵活模块组成的模块化DNA电路，能够同时检测多种遗传目标，并通过尿素处理和磁分离实现固定模块的重复使用 | NA | 开发一种准确、特异且经济的检测方法，用于同时检测多种传染性病原体，以提高人类健康和安全 | 传染性病原体的检测 | 生物技术 | 传染性疾病 | 核酸等温扩增技术 | DNA电路 | 遗传目标 | NA |
| 378 | 2024-08-07 |
In Situ Programmable DNA Circuit-Promoted Electrochemical Characterization of Stemlike Phenotype in Breast Cancer
2021-10-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.1c06436
PMID:34495654
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研究论文 | 本文报道了一种电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型，提供了一种低成本且稳健的选择，替代昂贵且依赖经验的流式细胞术。 | 设计了一种原位可编程DNA电路，使用捕获探针引入DNA组装的触发点和效应探针加速背景信号的移除，提高了电化学表型方法的灵敏度和准确性。 | NA | 开发一种新的电化学表型方法，用于表征乳腺癌中的干细胞样表型。 | 乳腺癌干细胞样表型。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 电化学表型方法 | NA | 细胞 | 涉及乳腺癌细胞和小鼠乳腺癌异种移植瘤模型。 |
| 379 | 2024-08-07 |
A Hierarchical Error Correction Strategy for Text DNA Storage
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00476-x
PMID:34463928
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研究论文 | 本文提出了一种用于文本DNA存储的分层错误纠正策略 | 该策略通过设计针对常见字符的鲁棒代码，逐步纠正DNA读取中的错误，并能处理多个插入或删除错误 | NA | 旨在解决DNA序列中的错误复杂性，以促进其在大量数据存储中的应用 | DNA存储中的错误纠正方法 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 380 | 2024-08-07 |
Solving the Family Traveling Salesperson Problem in the Adleman-Lipton Model Based on DNA Computing
2022-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2021.3109067
PMID:34460379
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研究论文 | 本文提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决家庭旅行商问题（FTSP） | 利用DNA计算的强大并行能力，相较于传统计算机在处理NP完全问题上具有无可比拟的优势 | NA | 探索DNA计算在解决复杂NP完全问题中的应用 | 家庭旅行商问题（FTSP） | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | DNA分子 | 一些基准实例 |