生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 6 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-10-25 |
A Unimolecular Entropy-Driven DNA Circuit for Orthogonal Logic-Gated Imaging of Cancer Cells
2026-Sep-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6c04022
PMID:42915927
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研究论文 | 本文设计了一种单分子熵驱动DNA电路（iEDC），通过正交AND逻辑门控实现对癌细胞内APE1和miR-155双标志物的高特异性成像 | 将传统多链熵驱动电路（EDC）整合为单分子结构，利用纳米尺度空间邻近效应加速反应，并采用双钥匙（APE1和miR-155）正交激活机制降低背景泄漏 | 摘要未明确提及 | 克服标准熵驱动电路多组分扩散限制，提高细胞内逻辑门控成像的效率和特异性 | 癌细胞（具体类型未在摘要中说明） | DNA计算与生物成像 | 癌症（具体类型未在摘要中说明） | DNA逻辑门、熵驱动电路、荧光成像 | NA | 图像（荧光成像数据） | NA | DNA | NA | DNA计算 | NA |
| 2 | 2026-10-13 |
D2Sim: A Computational Simulator for Nanopore Sequencing Based DNA Data Storage
2026 Sep-Oct, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3716589
PMID:42490283
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研究论文 | 本文设计了一个名为D2Sim的计算通道模拟器，用于模拟基于纳米孔测序的DNA数据存储过程 | 提出了D2Sim模拟器，集成DeepSimulator，能够生成与真实纳米孔DNA存储信号高度相似的信号，相比单独使用DeepSimulator，样本差异偏差降低了16.7%至88.7% | 该模拟器依赖于DeepSimulator，可能无法完全覆盖所有真实实验中的复杂误差模式 | 简化DNA数据存储中物理冗余和逻辑冗余设计及数据重建方法的评估过程，避免耗时且昂贵的真实实验 | 基于纳米孔测序的DNA数据存储系统 | DNA数据存储 | NA | 纳米孔测序 | DeepSimulator | 信号数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高存储密度和持久性 |
| 3 | 2026-10-13 |
A Molecular Perceptron Based on DNA Circuit
2026 Sep-Oct, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3728103
PMID:42664104
|
研究论文 | 本文通过理想化反应构建阶跃函数，并利用该函数实现一种新型分子感知机，用于DNA逻辑电路 | 首次在DNA电路中实现阶跃激活函数，并构建分子感知机，将DNA半逻辑电路转化为逻辑电路 | 摘要未提及 | 解决DNA电路中激活函数实现难题，推动DNA电路在人工智能中的应用 | DNA电路、分子感知机、逻辑门 | 分子计算、DNA计算 | NA | DNA电路 | 分子感知机 | NA | NA | DNA | NA | DNA计算、分子计算 | NA |
| 4 | 2026-09-22 |
Logic-Responsive Superspherical Nucleic Acid Enables Tumor-Specific Multiplexed Gene Silencing for Efficient Cancer Therapy
2026-Sep-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.7096315
PMID:42479910
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研究论文 | 本文描述了一种逻辑响应超球形核酸（SSNA），能实现对肿瘤特异性的多基因沉默，用于高效癌症治疗 | SSNA架构具有耐核酸酶的球形核酸核心，密集涂覆Y形DNA电路外壳，选择性响应APE1，实现肿瘤特异性多重基因沉默 | 未明确提及具体的局限性，如潜在的长期安全性或临床转化挑战 | 开发一种肿瘤特异性激活的多重基因沉默平台，用于精准癌症治疗 | MCF-7肿瘤细胞和小鼠MCF-7异种移植模型 | 癌症治疗，基因治疗，纳米技术 | 乳腺癌 | DNA电路，反义寡核苷酸，DNAzyme，球形核酸 | NA | 体外和体内实验数据 | 小鼠MCF-7异种移植模型（具体数量未提及） | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 5 | 2026-09-19 |
Label-free and enzyme-free fluorescent biosensor for ultrasensitive detection of tobramycin via cascade signal amplification
2026-Sep-17, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d6ay01366j
PMID:42578809
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研究论文 | 本研究开发了一种基于级联信号放大策略的无酶无标记荧光生物传感器，通过整合熵驱动DNA电路和催化发夹组装，实现对妥布霉素的超灵敏检测 | 首次将熵驱动DNA电路与催化发夹组装相结合构建级联信号放大策略，实现了无酶无标记的妥布霉素超灵敏荧光检测，检测限低至92 fM | 目前仅在牛奶样品中验证了实际应用性，尚未在临床样本或更复杂的食品基质中进行验证 | 开发一种简单、灵敏的无酶无标记荧光生物传感器用于妥布霉素的超灵敏检测，以应对其滥用带来的健康风险 | 妥布霉素（TOB）及其适配体，以及牛奶样品中的妥布霉素残留 | 生物传感器 | 肾脏疾病, 听力损失 | 荧光生物传感, 熵驱动DNA电路, 催化发夹组装, 适配体识别 | NA | 荧光信号 | 牛奶样品（具体数量未提及） | DNA | NA | DNA计算 | 检测限92 fM，线性范围3 pM至30 nM |
| 6 | 2026-09-12 |
Catalytic BiFeO3/g-C3N4 Heterojunction Nanosheets Coupled with DNAzyme/Low-Leakage Sequential DNA Circuit for Ultrasensitive Electrochemical Aptamer-Based Detection of Colorectal Cancer Exosomes
2026-09-01, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6c04171
PMID:42689616
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研究论文 | 本文报道了一种超灵敏电化学适配体传感器，通过整合适配体邻近连接、DNAzyme步行器、低泄漏顺序DNA电路与BiFeO3/g-C3N4异质结纳米片，实现结直肠癌外泌体的超灵敏检测 | 将催化性BiFeO3/g-C3N4异质结纳米片与DNAzyme/低泄漏顺序DNA电路耦合，通过双适配体识别、DNAzyme步行器和预封闭的ISD电路实现多级信号放大，显著降低背景泄漏并提高检测灵敏度 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一种超灵敏电化学适配体传感器，用于结直肠癌外泌体的早期诊断和液体活检 | SW620细胞来源的外泌体（SW620-Exo）及稀释人血清中的外泌体 | 生物传感器、电化学生物分析 | 结直肠癌 | 电化学适配体传感、DNAzyme步行器、杂交链式反应（HCR）、顺序DNA电路、催化纳米材料（BiFeO3/g-C3N4异质结纳米片） | NA | 电化学信号、核酸序列数据 | SW620-Exo浓度范围1 × 10^2至1 × 10^8 particles/mL，检测限为119 particles/mL，并在稀释人血清中进行检测 | DNA | NA | 分子计算、DNA计算 | 线性响应范围1 × 10^2至1 × 10^8 particles/mL，检测限119 particles/mL |