生物计算机与DNA存储相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 存储介质 编码方案 计算范式 可扩展性指标
1 2026-02-03
DVOUG enables robust DNA sequence assembly and reconstruction with a dynamic, variable-order graph
2025-Dec-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本文介绍了一种动态可变阶单元图组装图(DVOUG),用于在低覆盖度或高噪声条件下提高DNA序列组装和重建的鲁棒性 DVOUG通过动态调整k值,在低覆盖度或高噪声区域逐步降低k值,解决了路径纠缠问题,显著提升了基因组组装和DNA存储数据重建的性能 未明确提及具体限制,但可能涉及对极端噪声或极低覆盖度条件的适应性 开发一种鲁棒的DNA序列组装和重建方法,以应对低覆盖度或错误倾向的测序条件 DNA序列数据,包括基因组组装和DNA存储数据 生物信息学 NA DNA测序,图神经网络(GNNs) 图神经网络(GNNs) DNA序列数据 NA DNA NA 分子计算 组装准确性、连通性和可学习性增强,在低覆盖度下表现优异
2 2025-12-29
Enzyme-driven triplex structure-based DNA logic circuits
2025-Dec-24, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究介绍了一种基于酶驱动的三链DNA逻辑电路,通过输入-门级联形成三链结构,简化了链设计,并利用Bst 3.0聚合酶实现高效操作 创新点在于引入酶驱动的三链DNA逻辑电路,通过输入-门级联简化链设计,减少信号泄漏和衰减,提高反应速率,并支持大规模计算操作 尽管在泄漏和速率方面有改进,但仍面临信号泄漏和衰减的挑战,可能限制更复杂计算系统的发展 研究目标是开发高效、低泄漏的DNA逻辑电路,以促进生物计算在生物传感、数据存储和合成生物学中的应用 研究对象是基于三链结构的DNA逻辑电路,包括单门电路、多级级联电路和复杂逻辑电路 分子计算 NA 酶驱动系统,使用Bst 3.0聚合酶 DNA逻辑电路 DNA序列数据 NA DNA 三链结构编码 DNA计算 存储容量未指定,但支持大规模平方根运算,链复杂度降低24.3%,反应速率提高25%
3 2025-11-18
Value saturation: Architecture of subjective necessity
2025-Dec, Bio Systems
研究论文 提出价值饱和理论来解释意识如何从生物架构中产生 提出意识等同于在视角困局下由稳态重要性饱和的显式递归自我建模 理论需要实证验证,预测仍需临床和发育研究证实 解释生物系统如何在热力学约束下产生意识 意识产生的生物架构和机制 认知科学 NA NA 递归自我建模 理论模型 NA NA NA 生物计算 NA
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