生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 6 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
DNA attachment to polymeric, soft and quantum materials: mechanisms and applications
2025-Aug-20, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc03552j
PMID:40777751
|
综述 | 综述DNA在聚合物、软材料和量子材料上的附着机制及其在生物医学、分析和环境领域的应用 | 系统总结了DNA在多种无金属材料上的吸附机制，并探讨了刺激响应系统在DNA可控吸附与释放中的应用 | 未涉及金属材料体系，主要聚焦于无金属材料的研究现状 | 探讨DNA与不同材料表面的相互作用机制及其功能化应用 | 聚多巴胺(PDA)、水凝胶、微塑料、纤维素晶体、纳米金刚石和碳量子点等材料 | 材料科学 | NA | DNA寡核苷酸附着技术 | NA | 实验数据 | NA | DNA | NA | NA | 高密度DNA存储 |
| 2 | 2025-10-05 |
Inverted Molecular Beacons as Reaction-Based Hybridization Probes for Small-Molecule Activation by Nucleic Acid Inputs
2025-Aug-15, ACS chemical biology
IF:3.5Q2
DOI:10.1021/acschembio.5c00333
PMID:40662663
|
研究论文 | 开发了一种新型发夹结构核酸报告探针，通过模板诱导的邻近反应激活小分子荧光团 | 采用单分子发夹结构设计，仅需未修饰的核酸输入即可激活小分子，简化了上游电路设计 | 未明确说明该方法的检测灵敏度限制和可能存在的非特异性激活问题 | 扩展DNA计算的应用范围，实现以化学反应为最终输出的报告系统 | 核酸杂交探针和小分子荧光激活系统 | 分子计算 | NA | 分子信标技术，逆电子需求Diels-Alder反应 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | 核酸杂交编码 | DNA计算，分子计算 | NA |
| 3 | 2025-10-05 |
Nanopore-Based Single-Molecule Logic Unit (sMOLU)
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202501560
PMID:40462731
|
研究论文 | 开发了一种基于纳米孔的单分子逻辑单元(sMOLU)，利用α-溶血素纳米孔在脂质双分子层中实现DNA基AND逻辑门 | 首次将单分子DNA计算与纳米孔技术结合，在脂质膜上实现三链DNA连接体固定的纳米孔逻辑门系统 | 未提及系统的大规模集成能力和实际应用场景的验证 | 推进纳米尺度计算系统的发展，整合DNA计算和纳米孔技术实现精确分子分析 | 单分子逻辑单元(sMOLU)、α-溶血素纳米孔、三链DNA连接体、巨型单层囊泡(GUVs) | 分子计算 | NA | 纳米孔技术、DNA计算、荧光测量、电生理测量 | AND逻辑门 | 分子信号 | NA | DNA | 逻辑门编码 | DNA计算, 分子计算 | 单分子水平操作精度 |
| 4 | 2025-10-05 |
Light-Triggered Phase Separation for Enhanced DNA Computing
2025-Aug, ChemPlusChem
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/cplu.202500074
PMID:40464587
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用光触发相分离增强DNA计算速度的新方法 | 首次将光控相分离技术应用于DNA计算系统，通过形成无膜共凝聚微滴提高DNA分子局部浓度，显著加速计算速度 | 未提及该方法在更复杂计算场景下的适用性限制 | 开发高效DNA计算方法以推动生物传感和临床诊断领域发展 | DNA计算系统，包括基本链置换反应和复杂神经元计算 | 分子计算 | NA | 光触发相分离技术 | DNA计算电路 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算 | 计算速度提升：基本链置换反应约4.3倍，复杂神经元计算约3倍 |
| 5 | 2025-10-05 |
Dna-storalator: a computational simulator for DNA data storage
2025-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06222-0
PMID:40760650
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研究论文 | 开发了一个名为DNA-Storalator的跨平台软件工具，用于模拟DNA数据存储中的生物和计算过程 | 提供了一个完整的DNA数据存储模拟器，能够模拟合成、PCR和测序等昂贵且复杂的生物过程，并集成编码和算法组件 | 基于简化的数字视角进行模拟，可能无法完全反映真实生物过程的复杂性 | 为DNA数据存储系统开发算法和编码解决方案 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | DNA合成、PCR、测序技术 | 聚类算法、重构算法 | DNA序列数据 | NA | DNA | 错误校正码 | DNA计算 | 支持自定义错误率和扩增过程控制，能够分析新数据集并建立错误模型 |
| 6 | 2025-10-05 |
ReLume: Enhancing DNA storage data reconstruction with flow network and graph partitioning
2025-Aug, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.022
PMID:40268154
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研究论文 | 提出一种基于流网络和图分割技术的DNA存储数据重建方法ReLume，显著提升数据恢复率和耐久性 | 首次将流网络和图分割技术应用于DNA存储数据重建，在普通笔记本电脑上实现百万级读取数据重建 | 未明确说明对特定类型错误的处理极限，实验数据集规模有限 | 解决DNA存储中的数据重建问题，提高数据恢复准确性和系统耐久性 | DNA存储系统中的数据重建过程 | DNA存储 | NA | 流网络、图分割技术 | NA | DNA测序数据 | 百万级读取数据 | DNA | NA | DNA计算 | 24GB内存笔记本电脑处理百万读取，内存使用降低60%，数据耐久性100年 |