生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 12 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-05 |
Engineered 3D DNA Crystals: A Molecular Design Perspective
2025-Jun, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401455
PMID:39777863
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综述 | 本文从分子设计角度探讨工程化3D DNA晶体的研究进展与应用前景 | 提出基于'晶体键取向'的DNA晶体结构分类方法，系统分析分子设计、自组装和晶体修饰等关键方面 | 未涉及具体实验验证数据，主要基于现有文献进行理论分析和展望 | 推动工程化3D DNA晶体领域的发展 | 3D DNA晶体材料 | 材料科学 | NA | DNA自组装技术 | NA | NA | NA | DNA | NA | DNA计算 | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
On-Demand Regulation of Catalytic DNA Circuits Using Phosphorylated Charge Reversal Peptides
2025-Jun-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425113
PMID:40249733
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研究论文 | 本研究开发了一种酶响应多肽用于催化DNA电路的可控递送和释放，实现microRNA的精准活体成像 | 首次利用磷酸化电荷反转多肽实现催化DNA电路的可编程调控，通过内源性磷酸化引导的探针释放机制减少非特异性信号泄漏 | 未明确说明动物模型的具体类型和实验规模，缺乏长期安全性和稳定性评估数据 | 开发安全高效的体内递送系统用于疾病诊断 | 催化DNA电路和microRNA生物标志物 | 生物传感 | 肿瘤 | 磷酸化电荷反转技术，催化DNA电路技术 | NA | 生物分子数据，成像数据 | NA | DNA, 肽 | NA | 分子计算，DNA计算 | 高负载容量，优异的生物相容性，特异性结合能力 |
| 3 | 2025-10-05 |
Programmable PCR-like Nonenzymatic DNA Molecular Circuit for Split-Free Autocatalytic Amplification
2025-Jun-10, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c01612
PMID:40442030
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研究论文 | 开发了一种无需分裂设计的PCR样非酶DNA自催化扩增电路，用于高效生物传感 | 首次实现无需分裂设计的自催化DNA电路，模拟PCR三步骤但无需酶和精确温控 | 未明确说明具体应用场景中的检测限和实际样本验证结果 | 开发高效的非酶DNA自催化扩增系统用于生物传感 | DNA分子电路和低丰度生物标志物 | 分子计算 | NA | 非酶DNA自催化扩增 | DNA分子电路 | 分子信号 | NA | DNA | NA | DNA计算,分子计算 | 指数级信号放大，最小信号泄漏 |
| 4 | 2025-06-12 |
Challenges and opportunities in DNA computing and data storage
2025-Jun-10, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-025-01937-w
PMID:40494931
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-10-05 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路，用于实现原始细胞与活细胞群落间的自主调控双向通信 | 开发了具有识别、激活和反馈模块的DNA电路，使原始细胞能够感知并响应活细胞释放的信号，实现自主调控的细胞间通信 | 未明确说明系统的长期稳定性和在复杂生物环境中的适用性 | 开发合成生物学工具以调控细胞间信号传导和编程细胞行为 | 原始细胞与活细胞组成的混合群落 | 合成生物学 | NA | DNA电路技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 分子信号编码 | 分子计算, DNA计算 | 支持连续与多个目标活细胞相互作用的可再生反馈能力 |
| 6 | 2025-10-05 |
Data Readout Techniques for DNA-Based Information Storage
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412926
PMID:39910849
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综述 | 本文系统介绍了DNA信息存储中的数据读取技术及其与存储系统设计的关联 | 首次系统梳理DNA数据存储系统中存储单元设计与读取技术选择的关联性，并介绍了微流控和荧光探针等新兴辅助技术 | 未提供具体实验数据验证不同读取技术的性能比较 | 探讨DNA数据存储技术中的数据读取方法发展现状与挑战 | DNA数据存储系统的读取技术 | 生物信息存储 | NA | DNA测序, 非测序方法, 微流控技术, 荧光探针 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高存储密度、长寿命、低维护能耗 |
| 7 | 2025-10-05 |
Leveraging Demethylase Activation in DNA Circuits to Overcome Signal Leakage for Reliable MicroRNA Bioimaging
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412843
PMID:40211605
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研究论文 | 设计了一种去甲基化酶激活的DNA组装电路，通过顺序激活机制实现细胞内microRNA的可靠生物成像 | 通过整合去甲基化酶激活的DNAzyme模块和microRNA识别的HCR信号放大模块，利用顺序激活机制有效阻断信号泄漏 | 未明确说明该电路在更复杂细胞内环境中的稳定性和适用性范围 | 开发可靠的细胞内microRNA检测和生物成像方法 | 细胞内microRNA生物标志物 | 分子计算 | 癌症 | DNA电路、杂交链式反应(HCR)、去甲基化酶激活 | DNAzyme、HCR探针系统 | 分子信号、荧光成像数据 | 癌细胞和正常细胞的比较研究 | DNA | 甲基化修饰、toehold介导的链置换 | DNA计算、分子计算 | 高信噪比、高灵敏度检测、有效的癌细胞鉴别能力 |
| 8 | 2025-10-05 |
Dual-Signal Probing of Molecular Subtypes of Breast Cancer: Synergistic Chirality and Charge-Transfer Effect Enable Enhanced Accuracy
2025-Jun-03, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c01620
PMID:40388600
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研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA纳米技术的双信号探针系统，用于乳腺癌分子分型的快速检测 | 利用具有独特电荷和手性转移特性的荧光团对，通过DNA级联反应实现圆二色性和荧光双信号放大，显著提高检测准确性 | 未明确说明样本规模的详细信息和临床验证的广泛性 | 开发快速简便的肿瘤分子分型检测方法 | 乳腺癌分子亚型及其关键生物标志物（雌激素受体ER和人表皮生长因子受体2 HER2） | DNA纳米技术 | 乳腺癌 | DNA纳米技术、光谱测量、DNA级联反应 | NA | 光谱数据（圆二色性CD和荧光） | NA | DNA | NA | 分子计算 | 1小时内完成检测，具有高精度和通用性 |
| 9 | 2025-10-05 |
Investigating enhanced stability in CTAB(C)-compacted DNA under aging conditions for data storage
2025-Jun-02, Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
DOI:10.1088/1361-648X/addbb7
PMID:40398454
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研究论文 | 研究表面活性剂介导的DNA压缩和环糊精驱动解压缩方法在长期数据存储中的有效性 | 首次系统比较CTAB和CTAC压缩的天然与合成DNA在加速老化条件下的稳定性，并证明压缩合成DNA在热应力下优于原始DNA | 仅测试了4-70°C温度范围和12天内的加速老化条件，未评估更长期或更极端环境下的稳定性 | 开发高效的DNA长期数据存储方法 | 鲑鱼来源DNA和定制合成DNA | DNA数据存储 | NA | 吸光度测量，定量PCR，桑格测序 | NA | DNA序列数据 | 在4°C至70°C温度和50%相对湿度条件下进行4、8和12天的加速老化测试 | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量未明确说明，但强调高信息密度和长寿命特性，解压缩DNA在50°C和60°C的半衰期与硅胶基质保存的DNA相当 |
| 10 | 2025-10-05 |
DP-ID: Interleaving and Denoising to Improve the Quality of DNA Storage Image
2025-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00671-6
PMID:39578306
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研究论文 | 提出一种名为DP-ID的新型DNA存储编码解码方法，用于提高图像存储的信息密度和重建质量 | 通过动态规划算法压缩图像、DNA序列交织和椒盐噪声中值滤波，有效应对插入删除错误，在高错误率下仍能重建高质量图像 | 未明确说明方法对特定类型图像的适用性限制 | 提高DNA存储中图像存储的信息密度和重建质量 | 数字图像 | DNA存储 | NA | 动态规划算法、中值滤波、DNA测序 | NA | 图像 | NA | DNA | 二进制编码、DNA碱基映射 | DNA计算 | 5倍测序深度下重建高质量图像，显著降低DNA存储成本 |
| 11 | 2025-10-05 |
Engineering DNA circuit powered by entropy integrated into robust and elegant photoelectrochemical and photothermal dual-mode biosensing
2025-Jun, Analytical and bioanalytical chemistry
IF:3.8Q1
DOI:10.1007/s00216-025-05848-6
PMID:40131437
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研究论文 | 开发了一种基于熵驱动DNA电路的光电化学和光热双模式生物传感器，用于检测microRNA-221 | 优化设计的熵驱动DNA电路使输出DNA产量翻倍并显著提高传感器灵敏度，同时采用电沉积制备的ZnO纳米棒光电信标提高了稳定性和可控性 | NA | 开发具有自我验证检测结果能力的双信号模式生物传感器 | microRNA-221 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、光热检测、DNA电路 | NA | 光电信号、温度信号 | NA | DNA | 碱基配对 | DNA计算 | 检测范围：1.0 fmol/L-50.0 pmol/L（光电模式）和5.0×10 fmol/L-5.0 nmol/L（光热模式） |
| 12 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
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综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径，整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |