生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 12 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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研究论文 | 本研究评估了五种代表性DNA存储编码方法的生物安全风险，分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统地评估了DNA信息存储中人工合成DNA序列的生物安全风险，并提出了缓解潜在风险的随机化策略 | 研究仅评估了五种编码方法，可能未涵盖所有潜在风险 | 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 | 五种DNA存储编码方法（Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码） | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法 |
| 2 | 2025-05-24 |
Room temperature storage and shipping of encapsulated synthetic RNAs as quality control materials for SARS-CoV-2 molecular diagnostic assays
2025-Apr-25, Journal of virological methods
IF:2.2Q3
DOI:10.1016/j.jviromet.2025.115169
PMID:40288444
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研究论文 | 本文介绍了一种在室温下存储和运输封装合成RNA的方法，作为SARS-CoV-2分子诊断检测的质量控制材料 | 开发了一种新型的RNA封装技术，可在室温下长期稳定存储RNA，解决了传统RNA需要低温存储和运输的问题 | 研究主要针对SARS-CoV-2病毒，对其他RNA病毒的适用性需要进一步验证 | 开发一种稳定、经济的RNA质量控制材料，用于分子诊断检测 | 封装合成RNA的质量控制材料 | 分子诊断 | COVID-19 | RT-PCR, RT-LAMP | NA | 分子生物学数据 | 多个实验室使用不同设备和试剂盒进行测试 |
| 3 | 2025-05-10 |
Engineered Living Memory Microspheroid-Based Archival File System for Random Accessible In Vivo DNA Storage
2025-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202415358
PMID:39981833
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research paper | 该研究介绍了一种基于工程活体记忆微球（ELMM）的新型DNA数据存储、检索和管理材料 | 提出了一种将DNA数据与质粒功能配对的随机访问策略，并通过微流控技术快速封装细菌 | 仅演示了荧光表达作为质粒功能的原型数据库，未涉及更大规模的实际应用验证 | 开发高效且可随机访问的DNA数据存储系统以满足全球对数据存储的日益增长需求 | DNA数据存储、检索和管理系统 | 生物信息存储技术 | NA | 微流控技术、荧光分选 | NA | DNA数据 | 每个文件类型至少10个副本，使用N个光学通道检索2种文件类型 |
| 4 | 2025-05-07 |
Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues
2025-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117198
PMID:39893948
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研究论文 | 构建了一种分层DNA电路，用于临床组织中特定位点N6-甲基腺苷-MALAT1的单分子分析 | 首次构建了用于单分子分析的分层DNA电路，具有极高的灵敏度和特异性 | NA | 开发一种准确、灵敏的方法来分析RNA中的mA修饰 | 临床组织中的mA-MALAT1 | 分子生物学 | 乳腺癌 | 分层DNA电路，单分子检测 | NA | 分子数据 | 多种癌细胞和乳腺癌患者的临床样本 |
| 5 | 2025-04-27 |
ReLume: Enhancing DNA storage data reconstruction with flow network and graph partitioning
2025-Apr-21, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.022
PMID:40268154
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research paper | 提出了一种基于流网络和图划分技术的DNA存储数据重建方法ReLume，显著提高了数据重建的准确性和效率 | ReLume方法在流网络和图划分技术的基础上，显著提高了序列恢复率，降低了内存使用，并增强了数据的持久性 | 未提及具体的技术实现细节和在不同硬件环境下的适用性测试 | 解决DNA存储中的数据重建问题，提高数据恢复的准确性和效率 | DNA存储数据 | machine learning | NA | flow network, graph partitioning | NA | DNA序列数据 | 数百万reads |
| 6 | 2025-04-23 |
Locked Nucleic Acid-Enhanced Entropy-Driven Amplifier Combined with Catalytic Hybridization Reaction-Based DNA Circuit for Dual Amplified Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and Asymmetric Encryption of Gene Information
2025-Apr-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00529
PMID:40197003
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research paper | 开发了一种基于锁核酸增强的双信号放大策略，用于高对比度检测KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性（SNPs） | 结合熵驱动扩增和催化杂交反应，通过锁核酸修饰增强DNA计算电路的热力学稳定性和反应动力学，提高了SNPs检测的灵敏度和特异性 | 方法在人类血清样本中的应用潜力尚需进一步验证 | 开发高灵敏度、高特异性的SNPs检测方法，并探索其在基因信息加密中的应用 | KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性（SNPs） | 生物医学工程 | 癌症 | 锁核酸（LNA）增强的熵驱动扩增和催化杂交反应 | DNA计算电路 | 荧光和共振瑞利散射信号 | NA |
| 7 | 2025-04-22 |
On-Demand Regulation of Catalytic DNA Circuits Using Phosphorylated Charge Reversal Peptides
2025-Apr-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425113
PMID:40249733
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研究论文 | 本研究开发了一种多功能酶响应肽（ERP），用于高效负载和特异性细胞内递送及释放催化电路探针，通过基于磷酸化的电荷反转过程实现精确、空间可控的体内microRNA（miRNA）成像 | 利用磷酸化电荷反转肽实现催化DNA电路的可控调节，首次探索了肽作为载体在DNA电路递送系统中的应用 | 未明确说明实验样本的具体数量及类型 | 开发安全高效的体内催化DNA电路递送系统，用于疾病诊断 | 催化DNA电路、microRNA（miRNA） | 生物传感 | 肿瘤 | 磷酸化电荷反转技术 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 8 | 2025-04-17 |
What does a consent conversation for whole genome sequencing look like in the NHS Genomic Medicine Service? An observational study
2025-Apr, European journal of human genetics : EJHG
IF:3.7Q2
DOI:10.1038/s41431-024-01749-x
PMID:39592828
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研究论文 | 本研究观察了英格兰基因组医学服务中关于全基因组测序（WGS）的同意对话内容与结构 | 首次对NHS基因组医学服务中WGS的同意对话进行录音和分析，揭示了实践中对话的内容和结构 | 样本量较小（n=26），仅覆盖了7个NHS信托机构 | 了解NHS基因组医学服务中WGS同意对话的实际内容和结构 | 罕见病患儿的父母与医疗保健专业人员之间的同意预约 | 基因组医学 | 罕见病 | 全基因组测序（WGS） | NA | 音频记录 | 26次同意预约，涉及7个NHS信托机构 |
| 9 | 2025-04-16 |
Homogeneous Multicycle Cascaded DNA Circuit for Sensitive "Signal On-Off-Super On" PEC Biosensing
2025-Apr-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00373
PMID:40175284
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research paper | 该研究提出了一种基于均相多周期级联DNA电路和SnSe/CdS光阳极的'信号开-关-超级开'光电化学生物传感器，用于敏感检测生物标志物miRNA-222 | 采用'信号开-关-超级开'策略，结合均相多周期级联DNA电路和Z型SnSe/CdS异质结，显著提高了生物传感器的灵敏度和准确性 | 未提及在实际临床样本中的应用验证 | 开发高灵敏度生物传感器用于早期疾病诊断 | 生物标志物miRNA-222 | 生物传感器 | 癌症 | 光电化学生物传感技术，级联DNA电路 | NA | 电化学信号 | 线性范围从1 fM到10 nM |
| 10 | 2025-04-15 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Apr-07, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 本文设计了一种基于DNA的电路，用于在原生细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 设计了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路，使原生细胞能够感知并响应活细胞释放的信号，自主调节与活细胞的相互作用 | 未提及具体实验规模或实际应用中的潜在限制 | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导，编程期望的细胞行为 | 原生细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-04-11 |
Low-cost and automated magnetic bead-based DNA data writing via digital microfluidics
2025-Apr-08, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00106d
PMID:40070261
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研究论文 | 本研究介绍了一种集成数字微流控（DMF）平台和E47 DNAzyme连接化学的低成本、自动化DNA数据写入方法 | 利用DNAzyme作为生物催化剂，实现室温下无酶连接过程，显著降低成本，并通过DNAzyme辅助的磁珠纯化方法简化了传统纯化步骤 | 目前仅为概念验证阶段，尚未进行大规模商业化应用测试 | 开发低成本、自动化的DNA数据存储解决方案 | DNA数据存储技术 | 数字微流控技术 | NA | 数字微流控（DMF）、DNAzyme连接化学 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 12 | 2025-04-10 |
Effective IDS Error Correction Algorithms for DNA Storage Channels with Multiple Output Sequences
2025-Apr-08, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3558853
PMID:40198284
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研究论文 | 本文研究了DNA数据存储中针对多输出序列的IDS错误的有效校正算法 | 提出了分段渐进匹配(SPM)算法、基于隐马尔可夫模型的同步解码算法(SDH)和迭代外部解码(IED)算法，显著降低了误码率(BER) | 未提及算法在实际DNA存储系统中的实现和测试结果 | 提高DNA数据存储系统的解码性能和可靠性 | DNA数据存储中的IDS错误校正 | 生物信息学 | NA | DNA数据存储技术 | LDPC码, 隐马尔可夫模型(HMM) | DNA序列数据 | NA |