生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 11 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-03-05 |
High fault-tolerant DNA image storage system based on VAE
2025-Feb-21, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3544401
PMID:40031865
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研究论文 | 本文设计了一种基于VAE的高容错DNA图像存储系统，用于DNA存储中的图像压缩 | 1) 使用VAE将图像压缩为统一大小的潜在变量块，并通过SVD进一步压缩；2) 对潜在变量块中的浮点数进行量化，并对生成的三元序列应用旋转编码，有效确保同聚物运行长度和GC含量的正约束；3) 优化纠错方案以最好地恢复每种类型的错误 | NA | 减少基于DNA存储的图像压缩的错误率 | 图像数据 | 数字病理 | NA | DNA存储 | VAE, SVD | 图像 | NA |
| 2 | 2025-03-01 |
CRISPR-Cas12a-Assisted DNA Circuit for Nonmicroscopic Detection of Cell Surface Receptor Clustering
2025-Feb-28, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.4c02770
PMID:39924908
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研究论文 | 本文设计了一种基于CRISPR-Cas12a的DNA电路，用于非显微镜检测细胞表面受体聚集事件 | 提出了一种不依赖显微镜的检测方法，通过将局部蛋白质-蛋白质相互作用转化为DNA条形码，并利用Cas12a进行信号生成 | 实验中发现了一些泄漏反应，并进行了最小化处理 | 开发一种非显微镜依赖的方法来检测细胞表面受体聚集事件 | 人类乳腺癌细胞系模型中的HER2同源二聚体和与HER1、HER3的异源二聚体 | 生物技术 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas12a, DNA电路 | NA | DNA条形码 | 人类乳腺癌细胞系模型 |
| 3 | 2025-02-26 |
Molecular Circuit-Controlled Nanoparticle Folders for Programmable DNA Information Access
2025-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c13882
PMID:39945285
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研究论文 | 本文提出了一种可编程的DNA数据访问策略，通过DNAzyme电路控制的纳米粒子文件夹实现特定信息的操作 | 创新点在于使用DNAzyme电路控制的纳米粒子文件夹进行动态和可编程的数据访问，超越了传统的PCR和DNA杂交方法 | 未明确提及具体限制 | 研究目的是开发一种高效、准确的DNA数据访问方法，以提升分子数据读取的效率和准确性 | 研究对象是DNA数据存储和访问技术 | 分子计算 | NA | DNAzyme电路 | NA | DNA数据 | 未明确提及样本数量 |
| 4 | 2025-02-26 |
Ultrafast and Accurate DNA Storage and Reading Integrated System Via Microfluidic Magnetic Beads Polymerase Chain Reaction
2025-Feb-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c17817
PMID:39946680
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研究论文 | 本研究构建了一种基于自制微流控PCR和DNA磁珠的集成系统，用于快速、准确且可重复的DNA存储和读取 | 开发了一种名为MMBP的自制微流控PCR和DNA磁珠系统，具有时间短、偏差低的优势，能够更快速、更准确地读取信息，并在较低的测序深度下实现 | 尚未与DNA电化学合成集成，未来需要开发便携式微流控设备以实现DNA合成-保存-读取的一体化 | 解决大数据时代电子信息技术面临的存储和管理海量数据的困境，实现高效可靠的DNA存储和读取 | DNA存储和读取系统 | 生物信息学 | NA | 微流控PCR, DNA磁珠 | NA | DNA序列数据 | NA |
| 5 | 2025-02-25 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 该方法结合了光响应性o-硝基苄基磷酸酯笼状DNA发夹与“静默”反应模块，实现了对DNA电路/网络动态瞬态操作的光调控 | NA | 研究目的是开发一种光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 研究对象是DNA反应电路和网络 | 生物化学 | NA | 光调控技术 | 计算动力学模型 | 实验数据 | NA |
| 6 | 2025-02-25 |
Integrating an entropy-driven DNA circuit with a tetrahedral scaffold as a generic in situ electrochemical biosensor for amplified detection of microRNAs
2025-Feb-24, The Analyst
DOI:10.1039/d4an01528b
PMID:39925032
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研究论文 | 本文提出了一种通用的电化学生物传感器，通过将熵驱动DNA电路（EDC）与四面体支架合理整合，用于敏感和有效地检测与致癌相关的miRNAs | 本工作的关键进展是直接在电极表面实现了四面体DNA纳米结构（TDNs）作为EDC的支架和底物，增强了杂交效率并促进了EDC内的结构相互作用，实现了与均相液相反应相当的性能 | NA | 开发一种高度敏感和可靠的分析方法，用于检测与致癌相关的miRNAs | 与致癌相关的miRNAs | 生物传感器 | 癌症 | 电化学生物传感器，熵驱动DNA电路（EDC），四面体DNA纳米结构（TDNs） | NA | 电化学信号 | 使用B[]PDE暴露的细胞衍生的生物样本进行验证 |
| 7 | 2025-02-19 |
Performance of cellulose-based card for direct genetic testing of spinal muscular atrophy
2025-Feb-14, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00938-2
PMID:39953527
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研究论文 | 本文开发了一种基于纤维素的卡片，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的直接基因检测，并验证了其性能 | 开发了一种新型的基于纤维素的卡片，作为DBS制备的替代滤纸，适用于SMA的基因检测，包括直接PCR-RFLP和多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | 研究主要针对印度尼西亚等发展中国家，可能在其他地区的适用性需要进一步验证 | 开发一种适用于SMA基因检测的纤维素基卡片，以替代标准滤纸 | 脊髓性肌萎缩症（SMA）患者 | 基因检测 | 脊髓性肌萎缩症 | 直接PCR-RFLP、多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | NA | 血液样本 | NA |
| 8 | 2025-02-19 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
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研究论文 | 本研究揭示了质子泵抑制剂奥美拉唑对蛋白质体放电行为的显著影响，为非常规计算领域带来了变革性的转变 | 通过应用不同浓度的奥美拉唑，观察到蛋白质体放电特性的显著改变，包括幅度、频率和时间模式的显著变化，揭示了蛋白质体作为非常规计算基础的未开发潜力 | NA | 探索奥美拉唑对蛋白质体放电行为的影响及其在非常规计算中的应用 | 蛋白质体和奥美拉唑 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑技术 | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-02-07 |
Data Readout Techniques for DNA-Based Information Storage
2025-Feb-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412926
PMID:39910849
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综述 | 本文综述了DNA信息存储中的数据读出技术，包括序列和结构两种主要存储单元及其对应的读出方法，并讨论了该领域的局限性和挑战 | 系统性地介绍了DNA数据存储系统中的读出技术，特别是存储系统设计与读出技术选择之间的关联 | 缺乏对DNA数据存储系统中读出技术的系统性讨论，尤其是在存储系统设计与读出技术选择之间的关联方面 | 探讨DNA信息存储中的数据读出技术及其发展 | DNA数据存储系统中的读出技术 | 生物信息学 | NA | 测序和非测序方法 | NA | DNA序列和结构 | NA |
| 10 | 2025-01-14 |
Turning waste into wealth: Enzyme-activated DNA sensor based on reactant recycle for spatially selective imaging microRNA toward target cells
2025-Feb-01, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343557
PMID:39800513
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研究论文 | 本文开发了一种基于反应物循环的酶激活DNA传感器，用于在目标细胞中实现空间选择性成像microRNA | 首次开发了APE1激活的反应物循环催化DNA电路，实现了细胞和动物体内的高空间选择性microRNA成像，并提高了成像的信噪比 | NA | 开发一种高效的DNA传感器，用于癌症细胞中microRNA的成像 | 癌症细胞中的microRNA | 生物医学工程 | 癌症 | DNA传感器技术 | NA | 生物分子数据 | NA |
| 11 | 2024-12-11 |
Endogenous enzyme-activated AND-gate DNA nanomachines for intracellular miRNA detection and cell-selective imaging
2025-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.127087
PMID:39471719
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研究论文 | 本研究开发了一种内源性酶激活的AND逻辑电路，用于细胞内miRNA检测和细胞选择性成像 | 首次利用内源性酶（APE1和TE）作为控制开关，构建了AND逻辑电路，实现了对细胞内miRNA-21和miRNA-210的同时检测，并能区分不同类型的癌细胞 | NA | 开发一种高效、简单且敏感的miRNA成像方法，用于疾病的早期诊断、治疗和药物开发 | miRNA-21和miRNA-210的检测，以及癌细胞和正常细胞的区分 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |