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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics
2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202416004
PMID:39606901
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的集成化DNA数据存储系统,实现从合成到测序的完整流程 | 采用200纳米磁珠和数字微流控技术构建紧凑型DNA存储管道,结合三酶级联反应和重复焦磷酸测序,显著提升存储速度至49分钟/字节 | 概念验证仅存储8字节数据,样本规模较小 | 开发高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统 | DNA数据存储系统 | 分子计算 | NA | 数字微流控、焦磷酸测序、磷酰胺化学合成 | NA | 数字数据 | 8字节数据 | DNA | 霍夫曼编码, 里德-所罗门纠错码 | DNA计算 | 存储速度49分钟/字节,核苷酸准确率超过95% |
| 102 | 2025-10-05 |
Adaptive Arithmetic Coding-Based Encoding Method Toward High-Density DNA Storage
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0697
PMID:39544175
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研究论文 | 提出一种基于自适应算术编码的高密度DNA存储编码方法 | 将自适应算术编码应用于DNA存储,通过三阶段编码流程(压缩、纠错、映射)提高存储密度和数据完整性 | 仅通过仿真实验验证,未在实际生物环境中测试 | 开发高密度、高可靠性的DNA数据存储编码方法 | 文本、图片和音频等多种格式的数字文件 | DNA存储 | NA | 自适应算术编码(AAC)、预测部分匹配(PPM)、八进制汉明码 | NA | 文本、图像、音频 | 多种格式文件的编码验证 | DNA | 自适应算术编码, 八进制汉明码, 3-2码映射 | DNA计算 | 平均编码密度达每个核苷酸3.25个碱基,GC含量稳定在50%,同聚物长度不超过2 |
| 103 | 2025-10-05 |
Cost-Effective DNA Storage System with DNA Movable Type
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411354
PMID:39555674
|
研究论文 | 提出了一种受活字印刷启发的DNA可移动类型存储系统,用于实现经济高效的大数据存储 | 引入DNA可移动类型概念,通过预制的DNA片段重复使用,避免每次存储都需要从头合成完整DNA序列 | 仅测试了43.7KB数据,尚未验证更大规模数据的存储能力 | 开发成本效益高的DNA数据存储系统 | 数字数据文件(文本、图像、音频、视频) | DNA存储技术 | NA | DNA合成、酶连接组装、喷墨打印技术 | NA | 多格式数据(文本、图像、音频、视频) | 43.7KB数据文件,使用350个DNA可移动类型 | DNA | 特定有效载荷、地址和校验和数据编码 | DNA计算 | 存储成本$122/MB,每个DNA可移动类型可重复使用10000次 |
| 104 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
|
综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径,整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |
| 105 | 2025-10-05 |
Solving Minimum Spanning Tree Problems Based on DNA Chemical Reaction Networks
2025-Mar-18, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA链置换反应网络解决最小生成树问题的新型计算方法 | 首次将DNA链置换反应网络应用于图论中的最小生成树问题求解,创新性地整合了加权、阈值和求和三个反应模块 | 目前仅通过软件模拟验证,尚未进行实际生物实验验证 | 探索DNA计算在解决图论经典问题中的应用潜力 | 图论中的最小生成树问题 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应 | DNA化学反应网络模型 | DNA序列数据 | NA | DNA | DNA序列编码 | DNA计算,分子计算 | 通过荧光强度进行阈值筛选,能够处理复杂图论问题 |
| 106 | 2025-10-05 |
Biotechnological tools boost the functional diversity of DNA-based data storage systems
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.02.002
PMID:40027441
|
综述 | 本文总结了生物技术工具如何增强DNA数据存储系统的功能多样性 | 系统阐述了基于DNA分子序列特异性、封装和高维结构的生物技术工具如何实现随机访问、搜索和数据操作等新功能 | 使用生化反应会阻碍更精确高效信息存储系统的发展 | 探讨DNA数据存储系统的功能扩展和技术发展 | DNA数据存储系统 | 生物信息学 | NA | 分子生物学、纳米技术 | NA | DNA序列数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、数据密度、访问时间、错误率、耐久性 |
| 107 | 2025-10-05 |
Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits
2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202420787
PMID:39757120
|
研究论文 | 介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | 将光响应性邻硝基苯基磷酸酯笼状DNA发夹与'静默'反应模块集成,实现光控瞬态DNA电路/网络的动态操作 | NA | 开发光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法 | DNA反应电路、宪法动态网络(CDN)、凝血酶催化纤维蛋白原凝固过程 | 分子计算 | NA | 光解保护技术、DNA计算 | 计算动力学模型 | 分子反应数据 | NA | DNA | DNA碱基编码 | DNA计算,分子计算 | NA |
| 108 | 2025-10-05 |
Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids
2025-Feb-11, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.4c10790
PMID:39959035
|
研究论文 | 本研究揭示质子泵抑制剂奥美拉唑对类蛋白质自发放电特性的显著影响及其在非常规计算领域的应用潜力 | 首次发现奥美拉唑可调控类蛋白质的放电特性,并将其与布尔逻辑结合开拓生物计算新范式 | 研究仅聚焦单一药物作用,尚未系统探索其他质子调节剂的影响机制 | 探索药物调控下生物分子系统的计算潜力 | 类蛋白质(proteinoids)与奥美拉唑的相互作用系统 | 生物电子学 | NA | 布尔逻辑分析、电信号记录 | NA | 电生理信号 | NA | 蛋白质 | 布尔编码 | 分子计算, 生物计算 | 通过药物浓度调控实现放电模式的可编程性 |
| 109 | 2025-10-05 |
A practical DNA data storage using an expanded alphabet introducing 5-methylcytosine
2025, GigaByte (Hong Kong, China)
DOI:10.46471/gigabyte.147
PMID:39906332
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于5-甲基胞嘧啶扩展分子字母表的实用DNA数据存储转码方案R+ | 首次将5-甲基胞嘧啶作为额外分子字母引入DNA数据存储系统,提高了信息密度 | 仅对代表性文件进行了实验验证,样本规模有限 | 开发基于修饰碱基的高密度DNA数据存储系统 | DNA分子作为数据存储介质 | DNA数据存储 | NA | 纳米孔测序 | NA | 数字文件 | 多个1.3∼1.6 kbps DNA片段 | DNA | R+转码方案 | DNA计算 | 数据恢复率:有参考时98.97%,无参考时86.91% |
| 110 | 2024-12-11 |
Endogenous enzyme-activated AND-gate DNA nanomachines for intracellular miRNA detection and cell-selective imaging
2025-Feb-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.127087
PMID:39471719
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研究论文 | 本研究开发了一种内源性酶激活的AND逻辑电路,用于细胞内miRNA检测和细胞选择性成像 | 首次利用内源性酶(APE1和TE)作为控制开关,构建了AND逻辑电路,实现了对细胞内miRNA-21和miRNA-210的同时检测,并能区分不同类型的癌细胞 | NA | 开发一种高效、简单且敏感的miRNA成像方法,用于疾病的早期诊断、治疗和药物开发 | miRNA-21和miRNA-210的检测,以及癌细胞和正常细胞的区分 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |