生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 90 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Molecular Circuit-Controlled Nanoparticle Folders for Programmable DNA Information Access
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c13882
PMID:39945285
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研究论文 | 提出了一种通过DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现可编程DNA信息访问的新策略 | 首次利用DNAzyme电路控制纳米粒子文件夹实现动态可编程的DNA数据访问操作，突破了传统PCR和DNA杂交方法的局限 | 未明确说明系统的存储容量和错误率等性能指标 | 开发可编程的DNA数据访问方法以提高分子数据读取效率 | DNA存储系统中的信息访问机制 | 分子计算 | NA | DNAzyme电路，纳米粒子文件夹技术 | 逻辑电路模型（YES、AND、OR） | DNA分子数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 展示了多操作模式扩展能力，但未提供具体存储容量指标 |
| 62 | 2025-10-05 |
Ultrafast and Accurate DNA Storage and Reading Integrated System Via Microfluidic Magnetic Beads Polymerase Chain Reaction
2025-02-25, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c17817
PMID:39946680
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研究论文 | 开发了一种基于微流控磁珠PCR的集成系统，用于实现快速准确的DNA存储与读取 | 提出名为MMBP的自制微流控PCR和DNA磁珠技术，将随机访问时间缩短至10分钟，提高读取精度和灵敏度 | 未明确说明系统存储容量和错误率的具体数据 | 解决DNA存储中快速准确数据检索的挑战 | DNA存储系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控PCR、DNA磁珠技术、DNA电化学合成 | NA | 数字信息编码的DNA序列 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 随机访问时间10分钟，较低测序深度，成本降低 |
| 63 | 2025-10-05 |
Integrating lanthanide coordination polymer ratiometric fluorescence biosensors with a concatenated DNA circuit for locus-specific N6-methyladenosine quantification
2025-Mar-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc06742h
PMID:39992289
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研究论文 | 开发了一种整合镧系配位聚合物比率荧光生物传感器与级联DNA电路的检测方法，用于准确定量分析癌症细胞和组织中位点特异性的N6-甲基腺嘌呤 | 首次将镧系配位聚合物比率荧光传感与点击化学驱动的级联DNA电路相结合，实现位点特异性m6A的高精度检测 | NA | 开发高灵敏度和准确性的位点特异性m6A定量检测技术 | 癌症细胞和组织中的N6-甲基腺嘌呤修饰 | 生物传感 | 癌症 | 比率荧光生物传感, 级联DNA电路, 点击化学 | NA | 荧光信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | NA |
| 64 | 2025-10-05 |
Engineered Living Memory Microspheroid-Based Archival File System for Random Accessible In Vivo DNA Storage
2025-Apr, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202415358
PMID:39981833
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研究论文 | 提出一种基于工程化活记忆微球体的DNA存储系统，实现体内DNA数据的随机存取 | 首次将质粒功能与DNA数据以键值对格式结合，通过微流控技术快速封装细菌并实现基于荧光表达的文件检索 | 仅演示了2种文件类型的检索，系统容量和实际应用规模尚未验证 | 开发高效随机存取的DNA数据存储系统以满足EB-YB级数据存储需求 | DNA数据存储材料和检索系统 | DNA存储技术 | NA | 微流控技术、冻干保存、荧光分选 | NA | DNA数据、图像文件 | 每种文件类型至少10个副本，使用N个光学通道 | DNA | 键值对格式 | DNA计算, 分子计算 | 支持EB-YB级数据库，室温存储，5分钟封装时间 |
| 65 | 2025-10-05 |
Performance of cellulose-based card for direct genetic testing of spinal muscular atrophy
2025-Feb-14, BMC biotechnology
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12896-024-00938-2
PMID:39953527
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研究论文 | 开发了一种基于纤维素的卡片作为脊髓性肌萎缩症基因检测的替代滤纸 | 首次开发纤维素基卡片作为FTA卡或Guthrie卡的替代品，用于脊髓性肌萎缩症的基因检测 | 研究主要针对印度尼西亚等发展中国家，未与其他类型滤纸进行广泛比较 | 开发适用于脊髓性肌萎缩症基因检测的廉价替代滤纸 | 脊髓性肌萎缩症（SMA）患者和携带者 | 医学遗传学 | 脊髓性肌萎缩症 | 直接PCR-RFLP, 多重等位基因特异性扩增（multi-ASA） | NA | 基因检测数据 | 未明确说明具体样本数量 | DNA | NA | NA | 存储稳定性达3个月，检测结果与标准方法完全匹配 |
| 66 | 2025-10-05 |
Integrating an entropy-driven DNA circuit with a tetrahedral scaffold as a generic in situ electrochemical biosensor for amplified detection of microRNAs
2025-Feb-24, The Analyst
DOI:10.1039/d4an01528b
PMID:39925032
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研究论文 | 开发了一种集成熵驱动DNA电路与四面体支架的通用电化学生物传感器，用于高灵敏度检测microRNAs | 将四面体DNA纳米结构同时用作电极表面的支架和熵驱动DNA电路的底物，实现了接近均相液相反应性能的界面反应 | 未明确说明生物样本的具体数量和类型，实验验证范围有限 | 开发高灵敏度、高特异性的microRNA检测方法用于早期癌症诊断 | 致癌相关microRNAs（如miR-96） | 生物传感器 | 癌症 | 熵驱动DNA电路，四面体DNA纳米结构，电化学检测，qRT-PCR | NA | 电化学信号，生物分子数据 | B[a]PDE暴露细胞的生物样本 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 检测限74 aM，动态范围100 aM至100 pM |
| 67 | 2025-10-05 |
Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues
2025-Apr-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117198
PMID:39893948
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研究论文 | 构建分层DNA电路用于临床组织中位点特异性m6A-MALAT1的单分子分析 | 首次构建分层DNA电路实现单分子水平m6A-MALAT1检测，结合VMC10-DNAzyme的高特异性识别和单分子检测的超高信噪比 | 未明确说明方法在复杂临床样本中的普适性验证 | 开发高灵敏度和特异性的位点特异性m6A RNA修饰检测方法 | 临床组织样本中的m6A-MALAT1 RNA修饰 | 分子诊断 | 乳腺癌 | 分层DNA电路，VMC10-DNAzyme，单分子检测 | NA | 分子检测信号 | 多种癌细胞系及乳腺癌患者与健康个体样本 | DNA | NA | 分子计算 | 检测灵敏度1.8 aM，动态范围7个数量级，可区分0.001% m6A-MALAT1 |
| 68 | 2025-10-05 |
pH-Controlled DNA Switching Circuits with Multi-State Responsiveness for Logic Computation and Control
2025-Mar-20, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404541
PMID:39876816
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研究论文 | 提出一种pH控制的多状态DNA开关电路构建策略，实现通过三链体构象转换的动态调控 | 利用三链体独特的pH响应特性构建多状态DNA开关电路，实现三种状态间的动态调控和对杂交链式反应的逻辑计算控制 | 未明确说明电路在复杂环境中的稳定性和实际生物应用中的具体限制 | 开发动态DNA电路构建策略，实现化学反应网络的智能响应和动态调控 | DNA开关电路、三链体结构、杂交链式反应(HCR) | 分子计算 | NA | DNA计算、三链体构象转换、toehold介导的链置换反应 | DNA开关电路 | 分子信号 | NA | DNA | 三链体构象编码 | DNA计算,分子计算 | 适用于大规模化学反应网络和DNA纳米结构自组装的动态调控 |
| 69 | 2025-10-05 |
A Multi-Input Molecular Classifier Based on Digital DNA Strand Displacement for Disease Diagnostics
2025-Mar, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202413198
PMID:39891016
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研究论文 | 开发了一种基于数字DNA链置换的分子计算方法，用于疾病诊断中的生物标志物分类 | 提出数字DNA链置换（DDSD）方法，通过DNA聚合酶延伸和链释放实现目标识别和价态操作，显著减少寡核苷酸使用数量 | 未明确说明临床样本的具体数量和类型，潜在泄漏风险虽已减少但仍存在 | 开发高效的分子计算系统用于疾病诊断和生物标志物检测 | 临床血液样本中的细菌和病毒感染生物标志物 | 分子计算 | 细菌和病毒感染 | DNA链置换，DNA聚合酶延伸 | 二元分类器，多类分类器 | 分子信号 | 临床血液样本（具体数量未明确） | DNA | 价态编码 | DNA计算，分子计算 | 可同时计算14个价态，最大价态25，通过级联DDSD和多路连接DDSD实现扩展 |
| 70 | 2025-10-05 |
Turning waste into wealth: Enzyme-activated DNA sensor based on reactant recycle for spatially selective imaging microRNA toward target cells
2025-Feb-01, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343557
PMID:39800513
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研究论文 | 开发了一种基于APE1激活反应物循环的DNA传感器，用于在目标细胞中进行空间选择性microRNA成像 | 首次开发APE1激活的反应物循环催化DNA电路；实现细胞和动物体内高空间选择性的miRNA成像；提高体外和体内成像的信背比；提供自动通用的方法区分癌细胞与正常细胞中的miRNA | 需要消耗燃料DNA；依赖脂质体克服核酸递送的生物屏障 | 开发高效选择性成像癌细胞中microRNA的DNA传感器 | 癌细胞中的microRNA | 生物传感器 | 癌症 | 催化DNA电路，链置换反应，脂质体递送 | DNA传感器 | 荧光成像数据 | 细胞和动物实验 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 提高肿瘤与正常组织的对比度，降低脱瘤信号 |
| 71 | 2025-10-05 |
Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway
2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.117109
PMID:39756268
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研究论文 | 提出一种基于谷胱甘肽激活的DNA电路，通过连续响应机制实现microRNA的高保真成像及相关调控通路的原位解析 | 通过将二硫键整合到预封闭核酸探针中，有效控制电路信号泄漏，实现时空选择性microRNA成像 | 未明确说明该系统的检测灵敏度极限和在实际生物样本中的验证范围 | 开发高保真生物分子成像技术，探索生物分子相互作用网络 | microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH）的相互作用 | 分子计算 | 癌症 | DNA电路技术，非酶催化信号放大 | 催化DNA电路 | 分子成像数据 | 多种癌细胞类型 | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可实现不同生物分子相互作用的稳健分析和探索 |
| 72 | 2025-10-05 |
Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification
2025-Jan-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c18752
PMID:39760699
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研究论文 | 开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，通过两步DNA电路放大实现啶虫脒的高灵敏检测 | 结合能量转移机制、两步DNA电路放大（熵驱动DNA循环和DNA步行器）和双模式传感策略，实现了超灵敏的农药检测 | 未明确说明实际样品检测的复杂基质干扰问题 | 开发高灵敏度和准确度的啶虫脒检测方法以保障食品安全 | 农药啶虫脒 | 生物传感 | NA | 光电化学检测、电化学发光检测、DNA电路放大、核酸适配体识别 | NA | 化学传感信号 | NA | DNA | NA | 分子计算 | 检测范围0至1×10 M，检测限20.2 fM（PEC模式）和17.5 fM（ECL模式） |
| 73 | 2025-10-05 |
Not all is lost: resilience of microbiome samples to freezer failures and long-term storage
2025-Jan-28, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00603-24
PMID:39704536
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研究论文 | 评估冷冻故障和长期存储对土壤微生物组样本恢复能力的影响 | 首次系统比较冷冻故障后解冻土壤样本与长期存储DNA的微生物组恢复能力 | 仅针对土壤样本和特定存储条件进行研究，未涵盖其他类型样本 | 评估微生物组样本对冷冻故障和长期存储的耐受性 | 土壤微生物组（细菌和真菌） | 微生物组研究 | NA | Illumina MiSeq测序，16S和ITS2测序 | NA | DNA测序数据 | 冷冻故障样本与长期存储DNA样本的比较研究 | DNA | NA | NA | NA |
| 74 | 2025-10-05 |
miR-Cabiner: A Universal microRNA Sensing Platform Based on Self-Stacking Cascaded Bicyclic DNA Circuit-Mediated CRISPR/Cas12a
2025-Jan-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05370
PMID:39704707
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研究论文 | 开发基于自堆叠级联双环DNA电路介导CRISPR/Cas12a的通用microRNA检测平台miR-Cabiner | 将催化发夹组装和杂交链式反应整合为统一电路并级联至CRISPR/Cas12a系统，实现高反应速率和通用性 | 未明确说明检测限的具体数值和实际临床应用验证规模 | 开发高灵敏度通用型microRNA检测平台用于临床诊断 | 与乳腺癌诊断、分期和预后相关的microRNA（miR-130a、miR-10b、miR-21、miR-1285） | 分子诊断 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas12a、催化发夹组装、杂交链式反应、DNA电路 | NA | 核酸序列 | 四种microRNA面板分析 | DNA | NA | 分子计算 | 检测灵敏度达fM级别 |
| 75 | 2025-10-05 |
Instruction-responsive programmable assemblies with DNA origami block pieces
2025-Jan-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1193
PMID:39698832
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研究论文 | 本研究开发了具有八个可编程边缘的DNA折纸构建块，可通过指令集组装成特定二维阵列 | 设计了标准化的DNA折纸构建块和指令系统，实现了确定性和非确定性组装，并能执行布尔逻辑计算 | 未明确说明系统在更复杂结构组装中的效率和错误率 | 开发可编程的有限尺度DNA自组装系统 | DNA折纸构建块及其组装结构 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子结构数据 | NA | DNA | 二进制编码 | DNA计算,分子计算 | 双单元系统可生成48种不同DNA阵列，支持复杂二维结构组装 |
| 76 | 2025-10-05 |
Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics
2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202416004
PMID:39606901
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研究论文 | 开发了一种基于数字微流控的集成化DNA数据存储系统，实现从合成到测序的完整流程 | 采用200纳米磁珠和数字微流控技术构建紧凑型DNA存储管道，结合三酶级联反应和重复焦磷酸测序，显著提升存储速度至49分钟/字节 | 概念验证仅存储8字节数据，样本规模较小 | 开发高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统 | DNA数据存储系统 | 分子计算 | NA | 数字微流控、焦磷酸测序、磷酰胺化学合成 | NA | 数字数据 | 8字节数据 | DNA | 霍夫曼编码, 里德-所罗门纠错码 | DNA计算 | 存储速度49分钟/字节，核苷酸准确率超过95% |
| 77 | 2025-10-05 |
Adaptive Arithmetic Coding-Based Encoding Method Toward High-Density DNA Storage
2025-Mar, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2024.0697
PMID:39544175
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研究论文 | 提出一种基于自适应算术编码的高密度DNA存储编码方法 | 将自适应算术编码应用于DNA存储，通过三阶段编码流程（压缩、纠错、映射）提高存储密度和数据完整性 | 仅通过仿真实验验证，未在实际生物环境中测试 | 开发高密度、高可靠性的DNA数据存储编码方法 | 文本、图片和音频等多种格式的数字文件 | DNA存储 | NA | 自适应算术编码(AAC)、预测部分匹配(PPM)、八进制汉明码 | NA | 文本、图像、音频 | 多种格式文件的编码验证 | DNA | 自适应算术编码, 八进制汉明码, 3-2码映射 | DNA计算 | 平均编码密度达每个核苷酸3.25个碱基，GC含量稳定在50%，同聚物长度不超过2 |
| 78 | 2025-10-05 |
Cost-Effective DNA Storage System with DNA Movable Type
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411354
PMID:39555674
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研究论文 | 提出了一种受活字印刷启发的DNA可移动类型存储系统，用于实现经济高效的大数据存储 | 引入DNA可移动类型概念，通过预制的DNA片段重复使用，避免每次存储都需要从头合成完整DNA序列 | 仅测试了43.7KB数据，尚未验证更大规模数据的存储能力 | 开发成本效益高的DNA数据存储系统 | 数字数据文件（文本、图像、音频、视频） | DNA存储技术 | NA | DNA合成、酶连接组装、喷墨打印技术 | NA | 多格式数据（文本、图像、音频、视频） | 43.7KB数据文件，使用350个DNA可移动类型 | DNA | 特定有效载荷、地址和校验和数据编码 | DNA计算 | 存储成本$122/MB，每个DNA可移动类型可重复使用10000次 |
| 79 | 2025-10-05 |
Locked Nucleic Acid-Enhanced Entropy-Driven Amplifier Combined with Catalytic Hybridization Reaction-Based DNA Circuit for Dual Amplified Detection of Single Nucleotide Polymorphisms and Asymmetric Encryption of Gene Information
2025-Apr-22, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00529
PMID:40197003
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研究论文 | 开发了一种锁核酸增强的双信号放大策略，用于高对比度检测KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性并实现基因信息加密 | 结合熵驱动扩增与催化杂交反应实现双信号放大，并引入锁核酸修饰提升热力学稳定性和反应动力学 | 方法在人类血清样本中的应用潜力仅得到初步验证，需要更广泛的临床样本测试 | 开发高灵敏度单核苷酸多态性检测方法和基因信息加密技术 | KRAS_G12C基因中的单核苷酸多态性 | 分子计算 | 癌症（与KRAS基因突变相关） | 锁核酸技术、熵驱动扩增、催化杂交反应、荧光检测、共振瑞利散射 | DNA计算电路 | 基因序列信息 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 检测限0.19 fM，动态范围1 fM至0.1 nM |
| 80 | 2025-10-05 |
DNA storage: The future direction for medical cold data storage
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.03.006
PMID:40235856
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综述 | 探讨DNA存储技术在医疗冷数据管理中的应用前景和系统设计 | 提出建立区域性DNA存储中心服务多医院的实践路径，整合传统加密与DNA隐写术保障数据安全 | 人工核苷酸和DNA纳米结构等突破性技术仍处于实验室研究阶段 | 开发适用于医疗冷数据的DNA存储系统 | 医疗冷数据存储解决方案 | 生物信息存储 | NA | DNA化学合成, 下一代测序(NGS), 碱性盐混合干燥, 聚合酶链式反应(PCR) | NA | 医疗冷数据 | NA | DNA | 高密度专用编码方法 | DNA计算 | 高数据密度, 耐久性, 成本效益 |