生物计算机与DNA存储相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-02-26	Ultrafast and Accurate DNA Storage and Reading Integrated System Via Microfluidic Magnetic Beads Polymerase Chain Reaction 2025-Feb-25, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.4c17817 PMID:39946680	研究论文	本研究构建了一种基于自制微流控PCR和DNA磁珠的集成系统，用于快速、准确且可重复的DNA存储和读取	开发了一种名为MMBP的自制微流控PCR和DNA磁珠系统，具有时间短、偏差低的优势，能够更快速、更准确地读取信息，并在较低的测序深度下实现	尚未与DNA电化学合成集成，未来需要开发便携式微流控设备以实现DNA合成-保存-读取的一体化	解决大数据时代电子信息技术面临的存储和管理海量数据的困境，实现高效可靠的DNA存储和读取	DNA存储和读取系统	生物信息学	NA	微流控PCR, DNA磁珠	NA	DNA序列数据	NA
22	2025-02-25	Photomodulated Transient Catalytic Constitutional Dynamic Networks and Reaction Circuits 2025-Feb-24, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202420787 PMID:39757120	研究论文	本文介绍了一种通过光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法	该方法结合了光响应性o-硝基苄基磷酸酯笼状DNA发夹与“静默”反应模块，实现了对DNA电路/网络动态瞬态操作的光调控	NA	研究目的是开发一种光调控动态瞬态DNA反应电路和网络的方法	研究对象是DNA反应电路和网络	生物化学	NA	光调控技术	计算动力学模型	实验数据	NA
23	2025-02-25	Integrating an entropy-driven DNA circuit with a tetrahedral scaffold as a generic in situ electrochemical biosensor for amplified detection of microRNAs 2025-Feb-24, The Analyst DOI:10.1039/d4an01528b PMID:39925032	研究论文	本文提出了一种通用的电化学生物传感器，通过将熵驱动DNA电路（EDC）与四面体支架合理整合，用于敏感和有效地检测与致癌相关的miRNAs	本工作的关键进展是直接在电极表面实现了四面体DNA纳米结构（TDNs）作为EDC的支架和底物，增强了杂交效率并促进了EDC内的结构相互作用，实现了与均相液相反应相当的性能	NA	开发一种高度敏感和可靠的分析方法，用于检测与致癌相关的miRNAs	与致癌相关的miRNAs	生物传感器	癌症	电化学生物传感器，熵驱动DNA电路（EDC），四面体DNA纳米结构（TDNs）	NA	电化学信号	使用B[]PDE暴露的细胞衍生的生物样本进行验证
24	2025-02-19	Performance of cellulose-based card for direct genetic testing of spinal muscular atrophy 2025-Feb-14, BMC biotechnology IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12896-024-00938-2 PMID:39953527	研究论文	本文开发了一种基于纤维素的卡片，用于脊髓性肌萎缩症（SMA）的直接基因检测，并验证了其性能	开发了一种新型的基于纤维素的卡片，作为DBS制备的替代滤纸，适用于SMA的基因检测，包括直接PCR-RFLP和多重等位基因特异性扩增（multi-ASA）	研究主要针对印度尼西亚等发展中国家，可能在其他地区的适用性需要进一步验证	开发一种适用于SMA基因检测的纤维素基卡片，以替代标准滤纸	脊髓性肌萎缩症（SMA）患者	基因检测	脊髓性肌萎缩症	直接PCR-RFLP、多重等位基因特异性扩增（multi-ASA）	NA	血液样本	NA
25	2025-02-19	Proton Pump Inhibitor Omeprazole Alters the Spiking Characteristics of Proteinoids 2025-Feb-11, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.4c10790 PMID:39959035	研究论文	本研究揭示了质子泵抑制剂奥美拉唑对蛋白质体放电行为的显著影响，为非常规计算领域带来了变革性的转变	通过应用不同浓度的奥美拉唑，观察到蛋白质体放电特性的显著改变，包括幅度、频率和时间模式的显著变化，揭示了蛋白质体作为非常规计算基础的未开发潜力	NA	探索奥美拉唑对蛋白质体放电行为的影响及其在非常规计算中的应用	蛋白质体和奥美拉唑	生物电子学	NA	布尔逻辑技术	NA	NA	NA
26	2025-02-07	Data Readout Techniques for DNA-Based Information Storage 2025-Feb-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202412926 PMID:39910849	综述	本文综述了DNA信息存储中的数据读出技术，包括序列和结构两种主要存储单元及其对应的读出方法，并讨论了该领域的局限性和挑战	系统性地介绍了DNA数据存储系统中的读出技术，特别是存储系统设计与读出技术选择之间的关联	缺乏对DNA数据存储系统中读出技术的系统性讨论，尤其是在存储系统设计与读出技术选择之间的关联方面	探讨DNA信息存储中的数据读出技术及其发展	DNA数据存储系统中的读出技术	生物信息学	NA	测序和非测序方法	NA	DNA序列和结构	NA
27	2025-02-07	A practical DNA data storage using an expanded alphabet introducing 5-methylcytosine 2025, GigaByte (Hong Kong, China) DOI:10.46471/gigabyte.147 PMID:39906332	研究论文	本文介绍了一种基于扩展分子字母表的实用DNA数据存储转码方案R+，该方案引入了5-甲基胞嘧啶（5mC）	提出了使用5-甲基胞嘧啶（5mC）作为扩展分子字母表的一部分，以提高DNA数据存储的信息密度	非天然DNA序列的合成及其复杂结构带来的挑战	验证5mC在DNA存储系统中的实用性	DNA数据存储	生物信息学	NA	纳米孔测序	NA	DNA序列	多个1.3∼1.6 kbps的DNA片段
28	2025-02-04	Construction of a hierarchical DNA circuit for single-molecule profiling of locus-specific N6-methyladenosine-MALAT1 in clinical tissues 2025-Jan-28, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.117198 PMID:39893948	研究论文	本文首次构建了一种分层DNA电路，用于临床组织中特定位置N6-甲基腺苷（mA）-MALAT1的单分子分析	首次构建分层DNA电路用于单分子分析，具有阿摩尔级灵敏度和7个数量级的动态范围	未提及具体局限性	开发新方法以准确和敏感地分析RNA中特定位置的mA修饰	临床组织中的mA-MALAT1	分子生物学	肺癌	分层DNA电路，单分子检测	NA	分子数据	多种癌细胞和乳腺癌患者及健康个体的样本
29	2025-01-31	Not all is lost: resilience of microbiome samples to freezer failures and long-term storage 2025-Jan-28, mSphere IF:3.7Q2 DOI:10.1128/msphere.00603-24 PMID:39704536	研究论文	本文研究了冷冻故障和长期存储对土壤样本微生物组的影响，评估了样本解冻后的恢复能力	揭示了真菌丰富度和细菌及真菌β多样性对土壤样本解冻和长期冷冻存储的显著恢复能力，并比较了不同存储方法的有效性	研究仅针对土壤样本，未涉及其他类型的微生物组样本	评估冷冻故障和长期存储对微生物组样本的影响，比较不同存储方法的有效性	土壤样本中的细菌和真菌	微生物组研究	NA	Illumina MiSeq测序	NA	DNA序列数据	未明确提及具体样本数量
30	2025-01-24	Bead-Based DNA Synthesis and Sequencing for Integrated Data Storage Using Digital Microfluidics 2025-Jan-21, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202416004 PMID:39606901	研究论文	本研究开发了一种基于数字微流控技术的紧凑型DNA数据存储管道，实现了从合成到测序的整个流程	利用200纳米磁珠进行基于磷酸酰胺化学的DNA合成，并通过三酶级联反应的化学发光信号进行测序，显著提高了存储速度和精度	目前仅作为概念验证试验，存储容量和速度仍需进一步优化	开发一种高保真、全集成且成本效益高的DNA数据存储系统	DNA数据存储系统	数字微流控技术	NA	磷酸酰胺化学、三酶级联反应、Huffman编码算法、Reed-Solomon纠错	NA	DNA序列数据	8字节数据
31	2025-01-22	Redox-stimulated catalytic DNA circuit for high-fidelity imaging of microRNA and in situ interpretation of the relevant regulatory pathway 2025-Mar-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2024.117109 PMID:39756268	研究论文	本文提出了一种基于谷胱甘肽（GSH）激活的DNA电路，用于实现空间选择性microRNA成像，并通过非酶催化信号放大程序提高传感性能	通过将二硫键整合到预密封的核酸探针中，有效改善了电路泄漏问题，实现了高保真度的microRNA成像和相关调控通路的原位解释	该方法在目标癌细胞中依赖于高浓度的GSH和miR-21，可能限制了其在其他细胞类型或低浓度生物分子环境中的应用	开发一种高保真度的microRNA成像方法，并探索GSH与miR-21之间的相关性	癌细胞中的microRNA（miR-21）和谷胱甘肽（GSH）	生物化学	癌症	DNA电路技术	NA	生物分子数据	NA
32	2025-01-16	miR-Cabiner: A Universal microRNA Sensing Platform Based on Self-Stacking Cascaded Bicyclic DNA Circuit-Mediated CRISPR/Cas12a 2025-Jan-14, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c05370 PMID:39704707	研究论文	本文介绍了一种基于自堆叠级联双环DNA电路介导的CRISPR/Cas12a的通用miRNA传感平台miR-Cabiner	miR-Cabiner平台结合了催化发夹组装（CHA）和杂交链反应（HCR）到一个统一的电路中，并最终级联到CRISPR/Cas12a，相比CHA-Cas12a和HCR-Cas12a系统，具有显著更高的反应速率	NA	开发一种敏感且通用的miRNA分析平台，用于乳腺癌的诊断、分期和预后	与乳腺癌相关的miRNA（miR-130a, miR-10b, miR-21, 和 miR-1285）	生物技术	乳腺癌	CRISPR/Cas12a, 催化发夹组装（CHA）, 杂交链反应（HCR）	NA	NA	NA
33	2025-01-14	Turning waste into wealth: Enzyme-activated DNA sensor based on reactant recycle for spatially selective imaging microRNA toward target cells 2025-Feb-01, Analytica chimica acta IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.aca.2024.343557 PMID:39800513	研究论文	本文开发了一种基于反应物循环的酶激活DNA传感器，用于在目标细胞中实现空间选择性成像microRNA	首次开发了APE1激活的反应物循环催化DNA电路，实现了细胞和动物体内的高空间选择性microRNA成像，并提高了成像的信噪比	NA	开发一种高效的DNA传感器，用于癌症细胞中microRNA的成像	癌症细胞中的microRNA	生物医学工程	癌症	DNA传感器技术	NA	生物分子数据	NA
34	2025-01-14	Instruction-responsive programmable assemblies with DNA origami block pieces 2025-Jan-07, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkae1193 PMID:39698832	研究论文	本文介绍了一种基于DNA折纸技术的可编程组装系统，能够根据指令集将DNA折纸构建块组装成特定的二维阵列	设计了具有八个相互独立可编程边缘的DNA折纸构建块（DOBPs），并制定了相应的DNA指令集，实现了确定性和非确定性组装	未提及具体应用场景或实际生物医学应用的限制	创建更标准化和可控的DNA折纸组件，以组装成有限规模和多样化的超结构	DNA折纸构建块（DOBPs）及其组装系统	DNA纳米技术	NA	DNA折纸技术	NA	分子信息	未明确提及具体样本数量
35	2025-01-07	Energy-Transfer-Based Dual-Mode PEC-ECL Biosensor for Acetamiprid Analysis Sensitized by Two-Step DNA Circuit Amplification 2025-Jan-06, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.4c18752 PMID:39760699	研究论文	本文开发了一种基于能量转移的双模式光电化学-电化学发光生物传感器，用于检测农药啶虫脒，通过两步DNA电路放大提高检测灵敏度	结合能量转移、两步DNA电路放大和双模式传感策略，实现了啶虫脒的高灵敏度和准确分析	NA	开发一种高灵敏度和准确性的生物传感器，用于检测食品中的啶虫脒，保障食品安全	啶虫脒	生物传感器	NA	光电化学（PEC）和电化学发光（ECL）技术	NA	化学信号	NA
36	2025-01-04	Harnessing DNA computing and nanopore decoding for practical applications: from informatics to microRNA-targeting diagnostics 2025-Jan-02, Chemical Society reviews IF:40.4Q1 DOI:10.1039/d3cs00396e PMID:39471098	教程综述	本文综述了DNA计算和纳米孔解码的基础知识、技术和方法，并重点介绍了针对microRNA作为生物标志物的医学诊断中的最新进展	将DNA计算与纳米孔解码技术结合，应用于医学诊断，特别是针对microRNA的检测	实际应用中仍面临技术和实施挑战	探索DNA计算和纳米孔解码在医学诊断中的实际应用	DNA计算设备和纳米孔解码技术	分子计算	NA	DNA计算、纳米孔技术	NA	核酸分子	NA
37	2024-12-11	Endogenous enzyme-activated AND-gate DNA nanomachines for intracellular miRNA detection and cell-selective imaging 2025-Feb-01, Talanta IF:5.6Q1 DOI:10.1016/j.talanta.2024.127087 PMID:39471719	研究论文	本研究开发了一种内源性酶激活的AND逻辑电路，用于细胞内miRNA检测和细胞选择性成像	首次利用内源性酶（APE1和TE）作为控制开关，构建了AND逻辑电路，实现了对细胞内miRNA-21和miRNA-210的同时检测，并能区分不同类型的癌细胞	NA	开发一种高效、简单且敏感的miRNA成像方法，用于疾病的早期诊断、治疗和药物开发	miRNA-21和miRNA-210的检测，以及癌细胞和正常细胞的区分	数字病理学	NA	NA	NA	NA	NA