生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 11 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-09-30 |
Levy Sooty Tern Optimization Algorithm Builds DNA Storage Coding Sets for Random Access
2024-Sep-11, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e26090778
PMID:39330111
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研究论文 | 本文提出了一种基于Levy Sooty Tern优化算法的DNA存储编码集构建方法，以实现高效的随机访问DNA存储系统 | 引入Levy飞行操作改进Sooty Tern优化算法，提出Levy Sooty Tern优化算法，并利用该算法构建满足组合约束的DNA存储编码集 | 未提及具体限制 | 解决DNA存储中的低存储密度、高延迟和存储过程中的错误问题 | DNA存储编码集的构建 | 生物信息学 | NA | Levy Sooty Tern优化算法 | Levy Sooty Tern优化算法 | DNA序列 | 13个基准测试函数 |
| 2 | 2024-09-30 |
A biological circuit to anticipate trend
2024-Sep, Evolution letters
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/evlett/qrae027
PMID:39328288
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研究论文 | 本文介绍了一种简单的生物电路，用于预测环境变化的趋势 | 本文提出的生物电路通过计算短期和长期指数移动平均值的差异来测量动量，从而预测未来趋势，这一方法具有简单性和普遍性 | 本文未详细讨论该生物电路在实际生物系统中的应用和验证 | 研究如何通过生物电路预测环境变化的趋势 | 生物电路的设计和其在趋势预测中的应用 | NA | NA | 指数移动平均 | NA | NA | NA |
| 3 | 2024-09-28 |
Scalable DNA recognition circuits based on DNA strand displacement
2024-Sep-24, Nanoscale advances
IF:4.6Q2
DOI:10.1039/d4na00379a
PMID:39323422
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研究论文 | 本文提出并实现了一种基于DNA链置换技术的分子识别电路，能够实现识别和求和功能，并构建了分子比较器 | 利用DNA链置换技术开发了一种可扩展的分子识别电路，并集成了交叉抑制模块以构建分子比较器 | NA | 开发基于DNA链置换技术的分子识别电路，并探索其在智能分子电路或生物传感器中的应用 | DNA分子识别电路及其在分子计算中的应用 | NA | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-09-26 |
Rewireable Building Blocks for Enzyme-Powered DNA Computing Networks
2024-Sep-25, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c07221
PMID:39255470
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研究论文 | 本文探讨了通过酶驱动的DNA计算网络的可重构构建模块，以提高DNA神经网络的可扩展性 | 提出了三种策略来解决当前DNA神经网络架构的局限性，包括酶促合成高纯度神经元、基于网络位置的空间神经元集群模式以及在通用单链DNA骨架上编码神经元连接 | 当前DNA神经网络架构需要大量核酸来模拟单个神经元，导致组装时间长、背景信号高和组件间串扰 | 提高DNA神经网络的可扩展性，以实现便携式诊断、紧凑数据存储和芯片实验室的自主决策 | DNA神经网络的可重构构建模块和自动化操作的微流控设备 | 生物信息学 | NA | 酶促合成 | DNA神经网络 | DNA | NA |
| 5 | 2024-09-20 |
Advanced DNA Amplification for Efficient Data Storage
2024-Sep-18, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c12102
PMID:39254000
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研究论文 | 本文探讨了DNA扩增技术在数据存储中的应用及其面临的挑战 | 本文提出了优化DNA存储协议以提高可扩展性和鲁棒性的方法，并探讨了酶促过程和新扩增方法的进展 | 本文未详细讨论具体的优化方法和新技术 | 研究如何利用先进的DNA扩增策略提高数据存储的效率和可行性 | DNA扩增技术及其在数据存储中的应用 | 生物技术 | NA | 聚合酶链反应（PCR）、等温扩增 | NA | DNA | NA |
| 6 | 2024-09-20 |
Bacteriophage λ exonuclease and a 5'-phosphorylated DNA guide allow PAM-independent targeting of double-stranded nucleic acids
2024-Sep-18, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02388-9
PMID:39294394
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研究论文 | 本文研究了噬菌体λ核酸外切酶（λExo）与5'-磷酸化DNA引导序列结合，实现对双链核酸的无PAM依赖性靶向识别 | 本文发现λExo酶的活性，并展示了5'-磷酸化单链DNA（pDNA）与双链DNA和DNA-RNA杂交体的互补区域结合，无需PAM样基序，显著扩展了靶向序列的范围 | NA | 探索新的双链核酸序列特异性识别方法，减少脱靶效应 | 噬菌体λ核酸外切酶、5'-磷酸化单链DNA、双链DNA和DNA-RNA杂交体 | 分子诊断学 | NA | 单分子荧光共振能量转移分析 | NA | DNA | NA |
| 7 | 2024-09-19 |
H-ACO with Consecutive Bases Pairing Constraint for Designing DNA Sequences
2024-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00614-1
PMID:38683280
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研究论文 | 本文提出了一种新的连续碱基配对约束，并结合层次蚁群算法（H-ACO）用于设计DNA序列 | 引入了连续碱基配对约束和层次蚁群算法（H-ACO），提高了DNA序列设计的效率和能力 | 未提及 | 改进DNA计算中的DNA序列设计 | DNA序列设计 | 生物信息学 | NA | 层次蚁群算法（H-ACO） | NA | DNA序列 | 未提及 |
| 8 | 2024-08-20 |
Ionic liquid-based aqueous biphasic system as an alternative tool for enhanced bacterial DNA extraction
2024-Sep-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2024.343045
PMID:39155099
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研究论文 | 本文探讨了基于离子液体的水相双相系统在增强细菌DNA提取中的应用 | 提出了使用基于离子液体的水相双相系统作为DNA提取的新方法，该方法成本效益高且环境友好 | 在DNA回收率和双相系统可重复使用性方面仍有改进空间 | 开发一种替代且环保的DNA提取方法 | 细菌DNA的提取 | NA | NA | 基于离子液体的水相双相系统 | NA | DNA | 使用了鲑鱼精DNA和细菌质粒DNA进行实验 |
| 9 | 2024-08-05 |
Photonic crystal-enhanced fluorescence biosensor with logic gate operation based on one-pot cascade amplification DNA circuit for enzyme-free and ultrasensitive analysis of two microRNAs
2024-Sep-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.126428
PMID:38897009
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研究论文 | 开发了一种基于一锅级联扩增DNA电路的光子晶体增强荧光生物传感器，用于无酶和超灵敏分析两种微小RNA | 创新性地结合了生化识别扩增模块和物理增强模块，实现了双重逻辑门操作 | 在实际应用中可能仍需验证其适用性和稳定性 | 提高肿瘤早期筛查中微小RNA的检测灵敏度和操作简单性 | 针对两种与癌症相关的微小RNA进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 荧光传感器 | NA | 荧光信号 | NA |
| 10 | 2024-08-06 |
Construction of an exogenously and endogenously Co-activated DNA logic amplifier for highly reliable intracellular MicroRNA imaging
2024-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116409
PMID:38795495
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研究论文 | 本文介绍了一种双重激活策略的DNA逻辑放大器，用于癌细胞内miRNA的高效监测。 | 本研究创新性地结合了外部光和内部ATP的双重激活方法，从而实现了对DNA逻辑电路在特定时间和位置的控制。 | 本文并未提供现实临床应用的相关数据或长时间观察结果，限制了其转化潜力。 | 研究旨在开发稳定的DNA逻辑放大器，以提高癌细胞内miRNA成像的可靠性。 | 研究对象主要为癌细胞中的miRNA。 | 数字病理学 | 癌症 | DNA逻辑电路 | CHA模块 | 图像 | NA |
| 11 | 2024-08-06 |
SemiSynBio: A new era for neuromorphic computing
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.013
PMID:38711551
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研究论文 | 探讨了合成神经形态计算的原理和进展 | 提出了使用DNA生物分子构建合成神经形态电路的概念 | 尚未详细阐述如何克服现有的主要挑战 | 实现分子层面的神经形态计算 | 合成神经形态计算和DNA计算 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 人工神经网络（ANN） | NA | NA |