生物计算机与DNA存储相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-03	Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform 2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202309867 PMID:38048539	研究论文	介绍了一种使用微流控超大规模集成（mVLSI）平台从DNA存储中快速检索信息的方法	利用mVLSI平台实现高度并行和快速的DNA数据读取，并通过芯片熔解曲线分析解码DNA中的多状态数据	未提及该方法在成本、准确率或大规模应用中的具体表现	开发一种快速、高效的DNA数据检索技术	DNA存储的数据	生物技术	NA	微流控超大规模集成（mVLSI）平台、DNA识别、熔解曲线分析	NA	DNA数据	NA
2	2025-01-15	Efficient data reconstruction: The bottleneck of large-scale application of DNA storage 2024-04-23, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2024.113699 PMID:38517891	综述	本文回顾了现有的先进DNA存储方法，分析了数据写入和读取各阶段生物技术方法的特点和性能，并从数据重建的角度讨论了影响DNA存储的潜在因素	从数据重建的角度分析DNA存储的挑战和影响因素，为大规模应用DNA存储提供了新的视角	未提出具体的解决方案，主要集中于现有方法的回顾和分析	探讨DNA存储在大规模应用中的数据重建瓶颈	DNA存储技术	生物信息学	NA	DNA合成与测序技术	NA	数字数据	NA
3	2024-12-28	An Encoding Table Corresponding to ASCII Codes for DNA Data Storage and a New Error Correction Method HMSA 2024-04, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2024.3356522 PMID:38252580	研究论文	本文提出了一种与ASCII码对应的DNA数据存储编码表及新的错误校正方法HMSA	结合ASCII码构建了ASCII-DNA编码表，并提出了新的错误校正方法HMSA，能够校正Reads中的替换、插入和删除错误，以及连续错误	未提及具体实验数据或实际应用中的限制	标准化DNA编码系统，提高DNA数据存储的编码密度和错误校正能力	DNA数据存储系统	数据存储	NA	DNA编码、错误校正	HMSA	文本、音频、视频	NA
4	2024-12-28	DNA Sequences Under Multiple Guanine-Cytosine (GC) Base Pairs Constraint 2024-04, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2023.3316431 PMID:37721871	研究论文	本文提出了一种基于麻雀进化搜索算法（SESA）的DNA序列设计方法，并引入了多重GC碱基对约束以提高DNA序列的质量	提出了麻雀进化搜索算法（SESA）和多重GC碱基对约束，显著提高了DNA序列设计的效率和质量	未提及具体实验样本量或实际应用场景的验证	提高DNA序列设计的效率和质量，以优化DNA计算的结果	DNA序列	生物信息学	NA	DNA计算	麻雀进化搜索算法（SESA）	DNA序列数据	NA
5	2024-12-28	A Novel Algorithm for Solving the Prize Collecting Traveling Salesman Problem Based on DNA Computing 2024-04, IEEE transactions on nanobioscience IF:3.7Q3 DOI:10.1109/TNB.2023.3307458 PMID:37607150	研究论文	本文提出了一种基于DNA计算的新算法，用于解决奖励收集旅行商问题（PCTSP）	使用Adleman-Lipton模型基于DNA计算解决PCTSP，并通过模拟实验验证了该模型的可行性	NA	解决奖励收集旅行商问题（PCTSP）及其他组合优化问题	奖励收集旅行商问题（PCTSP）的开放实例	计算机科学	NA	DNA计算	Adleman-Lipton模型	NA	NA
6	2024-12-09	"Cell Disk" DNA Storage System Capable of Random Reading and Rewriting 2024-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202305921 PMID:38332565	研究论文	本文介绍了一种名为“Cell Disk”的DNA存储系统，能够在体内实现高密度DNA数据存储，并支持随机读取和重写	该系统利用酵母细胞作为存储单元，通过定制的CRISPR/Cas9模块实现对目标细胞块的选择性检索、擦除或重写，并开发了具有无损压缩能力的编解码算法以提高信息密度	NA	实现DNA存储系统中的随机读取和重写功能	酵母细胞中的DNA数据存储	生物信息学	NA	CRISPR/Cas9	NA	DNA数据	最多包含10个‘块’的模拟细胞‘磁盘’
7	2024-08-05	Multiply Guaranteed Catalytic DNA Circuit for Cancer-Cell-Selective Imaging of miRNA and Robust Evaluation of Drug Resistance 2024-04-09, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.4c00018 PMID:38529650	研究论文	提出了一种新颖的DNA电路激活策略，用于选择性成像细胞内miRNA和评估药物耐药性	利用DNA修复酶（APE1）激活策略，增强了miRNA探测的信号与背景比，并提高了癌细胞的选择性成像	未提及特定的局限性	实现癌细胞选择性成像和药物耐受性评估的工具开发	研究癌细胞中的miRNA及其在药物耐药性中的作用	数字病理学	癌症	DNA电路	NA	荧光信号	NA
8	2024-08-06	FEN1-assisted DNA logic amplifier circuit for fast and compact DNA computing 2024-Apr-23, Chemical communications (Cambridge, England) DOI:10.1039/d4cc00203b PMID:38577866	研究论文	本研究开发了利用FEN1催化信号放大反应的DNA放大逻辑门，用于快速和紧凑的DNA计算	该论文创新性地使用FEN1催化的信号放大反应来构建能在低于1 nM浓度下工作的DNA逻辑电路	没有提及具体的局限性	研究快速和紧凑的DNA计算方法	DNA放大逻辑门电路	计算机视觉	NA	NA	NA	NA	NA
9	2024-08-06	A novel activation function based on DNA enzyme-free hybridization reaction and its implementation on nonlinear molecular learning systems 2024-Apr-17, Physical chemistry chemical physics : PCCP IF:2.9Q1 DOI:10.1039/d3cp02811a PMID:38567416	研究论文	提出了一种基于DNA无酶杂交反应的新激活函数，并在非线性分子学习系统中实现	创新点在于提出了一种新激活函数，能够方便地通过DNA无酶杂交反应实现，并具备良好的嵌套属性	DNA电路无法独立完成人工智能的所有功能，仍需依赖电子计算机来进行训练和学习	开发一种新的激活函数以促进DNA计算的应用，尤其是在人工智能领域	研究DNA分子的特性及其在非线性神经网络中的应用	计算机科学	NA	DNA计算	非线性神经网络	NA	NA
10	2024-08-06	A DNA circuit that records molecular events 2024-Apr-05, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adn3329 PMID:38578999	研究论文	该文章报道了一种能够记录分子事件的DNA电路的开发	创新点在于使用链置换反应网络和引物交换反应来处理和编码分子信号信息	暂未提及具体的局限性	旨在理解信号转导和基因调控网络的运作	分子信号的出现时间、强度和持续时间	生物工程	NA	DNA测序	链置换反应网络	分子信号信息	NA
11	2024-08-07	Latent Toehold-Mediated DNA Circuits Based on a Bulge-Loop Structure for Leakage Reduction and Its Application to Signal-Amplifying DNA Logic Gates 2024-Apr-03, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1 DOI:10.1021/acsami.3c19344 PMID:38508218	研究论文	本研究设计和开发了一种新的潜在抓手介导DNA电路系统，以减少泄漏。	开发了一种基于翘曲环结构的潜在抓手介导DNA电路系统，并确定了其在降低泄漏和加速电路速度方面的显著作用。	对大于7个核苷酸的翘曲环增加了泄漏率，并未详细探讨更大翘曲环的影响。	开发一种新型DNA电路，以减少背景泄漏并提高信号放大能力。	研究对象为基于翘曲环的潜在抓手介导DNA电路系统。	DNA纳米技术	NA	DNA电路	NA	信号输出	实验中探讨的核苷酸密度为4到8个
12	2024-08-06	Colorimetric and fluorescent independent dual "signal on" biosensor for accurate detection of ochratoxin A based on aptamer-triggered biocatalytic reactions 2024-Apr-22, Analytica chimica acta IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.aca.2024.342440 PMID:38499428	研究论文	本文开发了一种基于适配体触发的双通道“信号开启”生物传感器，用于准确检测赭曲霉毒素A。	该生物传感器具有一个识别过程和两个独立的信号输出，提高了对赭曲霉毒素A的检测灵敏度。	目前研究仍然面临系统内校正和与“信号关闭”相关的假阳性挑战。	本研究的目的是提高对赭曲霉毒素A的检测准确性与可靠性。	研究对象为赭曲霉毒素A及其在葡萄汁和白酒中的检测。	数字病理学	NA	生物催化反应	NA	荧光和比色数据	研究中涉及的样本包括葡萄汁和白酒
13	2024-08-06	An electrochemical biosensor designed with entropy-driven autocatalytic DNA circuits for sensitive detection of ovarian cancer-derived exosomes 2024-Apr-15, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2024.116060 PMID:38278121	研究论文	本文设计了一种电化学生物传感器，用于灵敏检测卵巢癌来源的外泌体	文章中提出了一种基于熵驱动自催化DNA电路的传感器，能够显著提高信号放大能力	NA	实现卵巢癌外泌体的灵敏和准确检测	卵巢癌细胞来源的外泌体	数字病理	卵巢癌	电化学传感	自催化DNA电路	电化学信号	NA