生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 95 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
Selective Activation of Cascade Assembly Amplification for DNA Methyltransferase Detection Using a Double-Loop Interlocked DNA Circuit
2024-Jul-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c02498
PMID:39024185
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研究论文 | 本研究设计了一个动态的DNA纳米设备，用于精确监测DNA腺苷甲基转移酶的活性 | 创新性地设计了一种双环互锁DNA电路，具备出色的灵敏度、特异性和稳定性 | 现有技术依赖DNA识别探针，易受DNA降解影响，且目标灵敏度和特异性有限 | 研究DNA腺苷甲基转移酶的活性监测方法 | 监测DNA腺苷甲基转移酶在复杂生物环境中的活性 | 数字病理学 | NA | DNA纳米技术 | 双环互锁DNA电路 | NA | NA |
| 62 | 2024-08-05 |
Photonic crystal-enhanced fluorescence biosensor with logic gate operation based on one-pot cascade amplification DNA circuit for enzyme-free and ultrasensitive analysis of two microRNAs
2024-Sep-01, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2024.126428
PMID:38897009
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研究论文 | 开发了一种基于一锅级联扩增DNA电路的光子晶体增强荧光生物传感器，用于无酶和超灵敏分析两种微小RNA | 创新性地结合了生化识别扩增模块和物理增强模块，实现了双重逻辑门操作 | 在实际应用中可能仍需验证其适用性和稳定性 | 提高肿瘤早期筛查中微小RNA的检测灵敏度和操作简单性 | 针对两种与癌症相关的微小RNA进行分析 | 数字病理学 | 癌症 | 荧光传感器 | NA | 荧光信号 | NA |
| 63 | 2024-08-05 |
Neural Network Circuits for Bionic Associative Memory and Temporal Order Memory Based on DNA Strand Displacement
2024-Jul-16, IEEE transactions on neural networks and learning systems
IF:10.2Q1
DOI:10.1109/TNNLS.2024.3425060
PMID:39012737
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研究论文 | 该文章构建了基于DNA链置换的仿生关联记忆和时间顺序记忆电路 | 通过DNA链置换反应实现了DNA分子层面的Pavlovian关联记忆，拓展了生物计算的发展和神经网络的应用场景 | NA | 探讨在DNA分子层面实现关联记忆和时间顺序记忆的可能性 | DNA链置换反应构建的各种记忆电路 | 计算机视觉 | NA | DNA链置换 | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-05 |
Erasable and Field Programmable DNA Circuits Based on Configurable Logic Blocks
2024-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202400011
PMID:38698560
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研究论文 | 该文章提出了一种基于可配置逻辑块的可擦除现场可编程DNA电路 | 该电路通过使用操作控制信号的夹子链条实现了可擦除和现场可编程的功能，能高效实现多种逻辑操作 | 目前仅展示了基本的与二进制计算相关的操作，可能缺乏其他复杂电路的示范 | 研究和开发一种新的可编程DNA电路，提高其在实际应用中的可行性 | 本研究对象是基于可配置逻辑块的DNA电路 | 数字病理学 | NA | DNA电路设计 | 可配置逻辑块 | NA | NA |
| 65 | 2024-08-05 |
An Exo III-powered closed-loop DNA circuit architecture for biosensing/imaging
2024-06-14, Mikrochimica acta
DOI:10.1007/s00604-024-06476-0
PMID:38877347
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研究论文 | 本研究提出了一种Exo III驱动的闭环DNA电路架构，用于生物传感和成像 | 提出了一种新的Exo III驱动闭环DNA电路架构，集成了四个高效的AND逻辑门，提高了电路的操作效率与应用范围 | NA | 本研究旨在提高DNA逻辑电路的操作效率并扩展其应用领域 | 利用设计好的ECDC架构在体外智能确定miR-21 | 数字病理学 | 癌症 | DNA电路 | AND逻辑门 | NA | NA |
| 66 | 2024-08-05 |
DetSpace: a web server for engineering detectable pathways for bio-based chemical production
2024-Jul-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae287
PMID:38634809
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研究论文 | DetSpace是一个网络服务器，用于设计可检测的生物电路以促进生物基化学品的生产 | 提供了一种系统的方法来设计对特定目标化合物浓度响应的遗传电路 | 当前的生产效率在标度化过程中仍然面临挑战，如滴度、速率和产量 | 旨在提高生物基化学品的生产效率 | 研究生物电路的设计与应用 | 合成生物学 | NA | 生物传感器 | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-06 |
Leveraging Concentration Imbalance-Driven DNA Circuit as an Operational Amplifier to Enhance the Sensitivity of Hepatitis B Virus DNA Detection with Hybridization-Responsive DNA-Templated Silver Nanoclusters
2024-Jun-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.4c00291
PMID:38938798
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研究论文 | 本研究提出了一种通过浓度不平衡驱动的DNA电路来增强HBV DNA检测灵敏度的新方法 | 采用浓度不平衡驱动的DNA电路作为操作放大器，结合响应杂交的DNA模板银纳米簇，提升了检测灵敏度 | NA | 开发灵敏且可靠的HBV DNA检测方法 | HBV感染及其相关疾病的分子诊断 | 数字病理学 | 肝炎 | DNA模板银纳米簇 | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-06 |
Efficient DNA Coding Algorithm for Polymerase Chain Reaction Amplification Information Retrieval
2024-Jun-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25126449
PMID:38928155
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研究论文 | 提出了一种高效的编码算法以优化PCR扩增信息检索 | 该算法通过可变长度扫描和修剪优化建设代码表，最大化存储密度并满足生物学约束 | 实验结果的具体适用范围及情况下的表现未详细说明 | 改善PCR扩增过程中的非特异性配对问题 | 重点研究PCR扩增中的编码算法及其对DNA序列的影响 | 数字病理学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-06 |
DNA Reaction System That Acquires Classical Conditioning
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00459
PMID:38279958
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研究论文 | 该论文提出了一种基本的DNA反应系统设计，该设计能够获得经典条件作用。 | 创新点在于构建了一种基于五种DNA链位移反应和两种降解反应的DNA反应系统，能够通过输入历史动态地获得或失去功能。 | 设计中可能存在挑战，尤其是在利用生化反应动态特性来实现记忆和学习能力方面。 | 研究旨在设计具有记忆和学习能力的DNA反应系统。 | 研究对象是基于DNA化学反应的经典条件作用学习任务。 | 生物化学反应网络 | NA | NA | DNA电路 | NA | NA |
| 70 | 2024-08-06 |
DNA Logic Gates for Small Molecule Activation Circuits in Cells
2024-02-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.3c00474
PMID:38306634
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研究论文 | 本文报告了一种基于DNA的激活荧光报告器及其与DNA链位移电路的集成 | 提出了一种应用逆电子需求Diels-Alder反应的可激活荧光报告器，使其在哺乳动物细胞中更为有效且不受电路降解影响 | 未提及具体的局限性 | 研究可编程DNA电路在细胞内的应用 | 旨在设计和实现与特定DNA输入模式响应的DNA电路 | 数字病理学 | NA | 逆电子需求Diels-Alder反应 | NA | 荧光数据 | 细胞内的DNA逻辑电路，复杂性各异的多个实例 |
| 71 | 2024-08-06 |
Emergent digital bio-computation through spatial diffusion and engineered bacteria
2024-Jun-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-49264-3
PMID:38851790
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研究论文 | 本研究展示了使用空间模式设计细菌计算机以处理信息的工作 | 提出了一种新方法，通过空间扩散和工程化细菌实现数字逻辑和复杂功能的组合 | NA | 探索生物计算在生物工程、生物材料和生物传感中的应用 | 细菌计算和模块化细菌群落 | 生物计算 | NA | 空间模式设计 | 模块化细菌群落 | 实验数据 | NA |
| 72 | 2024-08-06 |
Two-layer cascaded catalytic hairpin assemblies based on locked nucleic acids for one-step and highly sensitive ctDNA detection
2024-Jun-06, Analytical methods : advancing methods and applications
IF:2.7Q1
DOI:10.1039/d4ay00611a
PMID:38774994
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研究论文 | 本研究提出了一种基于锁核酸的两层级联催化发夹组装用于高灵敏度ctDNA检测 | 引入了两层级联LNA辅助CCC电路，解决了单阶段系统的放大效率限制和信号泄漏问题 | NA | 开发一种高灵敏度、一体化的ctDNA检测方法 | 循环肿瘤DNA(ctDNA) | 数字病理学 | NA | 催化发夹组装 (CHA) | NA | NA | 已成功实施于临床样本分析 |
| 73 | 2024-08-06 |
Construction of an exogenously and endogenously Co-activated DNA logic amplifier for highly reliable intracellular MicroRNA imaging
2024-Sep-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116409
PMID:38795495
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研究论文 | 本文介绍了一种双重激活策略的DNA逻辑放大器，用于癌细胞内miRNA的高效监测。 | 本研究创新性地结合了外部光和内部ATP的双重激活方法，从而实现了对DNA逻辑电路在特定时间和位置的控制。 | 本文并未提供现实临床应用的相关数据或长时间观察结果，限制了其转化潜力。 | 研究旨在开发稳定的DNA逻辑放大器，以提高癌细胞内miRNA成像的可靠性。 | 研究对象主要为癌细胞中的miRNA。 | 数字病理学 | 癌症 | DNA逻辑电路 | CHA模块 | 图像 | NA |
| 74 | 2024-08-06 |
High-throughput DNA synthesis for data storage
2024-May-07, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d3cs00469d
PMID:38498347
|
综述 | 本文概述了高通量DNA合成在数据存储中的应用 | 讨论了不同合成方法的技术特征和最新进展，特别关注硅芯片微阵列合成和新型酶促DNA合成 | 未提及具体的实验数据和实证研究 | 探讨DNA作为数据存储介质的潜力及其合成技术的发展 | 涉及高通量DNA合成技术及其在数据存储中的应用 | 数字病理学 | NA | 高通量DNA合成 | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-06 |
Arbitrary Digital DNA Computing: A Programmable Molecular Perceptron Driven by Lambda Exonuclease for Lighting up Concatenated Circuits
2024-May-15, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c03486
PMID:38688864
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研究论文 | 本文提出了一种基于Lambda外核酶的可编程分子感知器，用于设计数字DNA电路 | 提出了一种新的分子感知器，通过调整权重和偏差参数来实现任意逻辑运算，增强了分子电路的多样性 | 未提及关于实际应用或实验环境的限制 | 研究可编程分子电路的设计理念，以推动生物医学研究的发展 | 研究分子电路及其逻辑运算能力 | 分子数字计算 | NA | Lambda外核酶 | 分子感知器 | 实验数据 | 未具体说明样本数量 |
| 76 | 2024-08-06 |
SemiSynBio: A new era for neuromorphic computing
2024-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.04.013
PMID:38711551
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研究论文 | 探讨了合成神经形态计算的原理和进展 | 提出了使用DNA生物分子构建合成神经形态电路的概念 | 尚未详细阐述如何克服现有的主要挑战 | 实现分子层面的神经形态计算 | 合成神经形态计算和DNA计算 | 生物计算 | NA | DNA计算 | 人工神经网络（ANN） | NA | NA |
| 77 | 2024-08-07 |
Data recovery methods for DNA storage based on fountain codes
2024-Dec, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2024.04.048
PMID:38707543
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研究论文 | 本文提出了一种基于喷泉编码的DNA存储数据恢复方法 | 提出了一种利用喷泉编码自动重构损坏或丢失的DNA存储数据的方法 | 目前方法的局限性未在摘要中提及 | 研究DNA存储系统中的数据恢复技术 | 涉及DNA存储中的损坏或丢失的数据 | 数字病理学 | NA | 喷泉编码 | NA | 文本 | 使用了体内和体外实验的评估 |
| 78 | 2024-08-06 |
Inhibition of kinetic random-distribution in DNA Seesaw gates and biosensors for complete leakage prevention
2024-Jul-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2024.116203
PMID:38531225
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法，通过DNA三重体设计有效抑制Seesaw基DNA电路的泄漏 | 发现了Seesaw基DNA电路泄漏的新源，并提出了基于DNA三重体的抑制新方法 | 尚未明确提及此方法在更复杂系统中的适用性 | 研究DNA电路和生物传感器中的泄漏问题并提出解决方案 | Seesaw基DNA电路及其相关的生物传感器 | 生物医学 | NA | DNA三重体 | NA | 实验数据 | 构建了基础Seesaw模块、AND门、OR门和DNA探测器 |
| 79 | 2024-08-06 |
FEN1-assisted DNA logic amplifier circuit for fast and compact DNA computing
2024-Apr-23, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc00203b
PMID:38577866
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研究论文 | 本研究开发了利用FEN1催化信号放大反应的DNA放大逻辑门，用于快速和紧凑的DNA计算 | 该论文创新性地使用FEN1催化的信号放大反应来构建能在低于1 nM浓度下工作的DNA逻辑电路 | 没有提及具体的局限性 | 研究快速和紧凑的DNA计算方法 | DNA放大逻辑门电路 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-06 |
A novel activation function based on DNA enzyme-free hybridization reaction and its implementation on nonlinear molecular learning systems
2024-Apr-17, Physical chemistry chemical physics : PCCP
IF:2.9Q1
DOI:10.1039/d3cp02811a
PMID:38567416
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研究论文 | 提出了一种基于DNA无酶杂交反应的新激活函数，并在非线性分子学习系统中实现 | 创新点在于提出了一种新激活函数，能够方便地通过DNA无酶杂交反应实现，并具备良好的嵌套属性 | DNA电路无法独立完成人工智能的所有功能，仍需依赖电子计算机来进行训练和学习 | 开发一种新的激活函数以促进DNA计算的应用，尤其是在人工智能领域 | 研究DNA分子的特性及其在非线性神经网络中的应用 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | 非线性神经网络 | NA | NA |