生物计算机与DNA存储相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['DNA storage', 'DNA computing', 'DNA circuit', 'biological computing', 'biological circuit']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 91 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 存储介质 | 编码方案 | 计算范式 | 可扩展性指标 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Rapid Information Retrieval from DNA Storage with Microfluidic Very Large-Scale Integration Platform
2024-04, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202309867
PMID:38048539
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控超大规模集成平台实现DNA存储数据快速读取的方法 | 结合微流控VLSI平台实现高度并行化DNA数据读取，并通过片上熔解曲线分析解码多状态DNA编码数据 | 未提及具体存储容量限制和错误率数据 | 开发快速、低成本的DNA数据检索技术 | DNA存储系统中的编码数据 | DNA存储技术 | NA | 微流控VLSI平台、熔解曲线分析、DNA识别技术 | NA | DNA编码数据 | NA | DNA | 多状态编码 | DNA计算 | 可扩展平台，支持高度并行数据读取 |
| 22 | 2025-10-05 |
A Spatially Controlled Proximity Split Tweezer Switch for Enhanced DNA Circuit Construction and Multifunctional Transduction
2024-05, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202307421
PMID:38072808
|
研究论文 | 开发了一种基于空间控制邻近分裂镊子开关的DNA电路构建策略，用于增强生物分子信号转导 | 利用双链镊子结构的刚性与发夹锁的阻碍效应协同作用，有效减少电路泄漏，并实现多类型靶标检测 | 未明确说明具体实验规模和应用场景的局限性 | 开发高效低泄漏的DNA电路构建方法，实现多功能生物分子信号转导 | 核酸、小分子和蛋白质等生物分子靶标 | 分子计算 | NA | DNA链置换反应，邻近分裂镊子开关技术 | NA | 分子信号数据 | NA | DNA | 核酸序列编码 | DNA计算，分子计算 | 可扩展的复杂性，系统兼容性，适用于复杂转导网络构建 |
| 23 | 2025-10-05 |
A generative adversarial network for multiple reads reconstruction in DNA storage
2024-12-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83806-5
PMID:39738820
|
研究论文 | 提出一种基于生成对抗网络的DNA存储多读段重建方法，将多读段转换为噪声图像并通过条件GAN生成共识序列 | 首次将生成对抗网络应用于DNA存储的多读段重建，能够处理第三代测序技术的高错误率数据 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的性能表现 | 解决DNA存储中因合成、PCR和测序过程导致的读段错误问题 | DNA存储系统中的多读段数据 | 机器学习 | NA | 纳米孔测序，下一代测序 | GAN，条件生成对抗网络 | DNA测序读段，图像表示 | 两个真实数据集 | DNA | NA | 分子计算，DNA计算 | 可处理高达5.9%错误率的序列，在20%读段污染情况下仍保持鲁棒性 |
| 24 | 2025-10-05 |
Three-Point-Star Deoxyribonucleic Acid Tiles with the Core Arm Length at Three Half-Turns for Two-Dimensional Archimedean Tilings and Beyond
2024-05-14, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acs.langmuir.4c00985
PMID:38686650
|
研究论文 | 本文报道了利用核心臂长为三个半螺旋的三点星DNA瓦片构建二维阿基米德铺砌和复杂镶嵌图案的研究 | 开发了新型3PSO DNA瓦片，通过中心交叉杂交编织结构实现了多种二维铺砌图案的构建，并首次将3PSO与4PSO、2PSO瓦片组合形成复杂镶嵌 | 研究中使用的DNA寡核苷酸支架长度固定为96-nt，可能限制了结构的多样性 | 探索新型DNA瓦片在构建复杂二维纳米结构中的应用 | 三点星DNA瓦片及其组装形成的二维纳米结构 | DNA纳米技术 | NA | DNA自组装技术，交叉杂交编织 | NA | 分子结构数据 | 使用96-nt长度的环形DNA寡核苷酸作为支架 | DNA | NA | DNA计算 | 能够构建复杂的二维镶嵌图案，在纳米制造、DNA计算和生物医学中具有广泛应用潜力 |
| 25 | 2025-10-05 |
Programming and monitoring surface-confined DNA computing
2024-02, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2023.107080
PMID:38183684
|
综述 | 系统评述表面受限DNA计算的编程与监测方法及其应用 | 首次系统总结不同表面（DNA折纸、纳米颗粒、脂质膜和芯片）对DNA计算的限制效应及其操控方法 | 未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献的归纳分析 | 探讨表面受限DNA计算系统的设计原理、监测技术及应用前景 | 基于表面反应的DNA计算系统 | 分子计算 | NA | DNA计算，表面反应技术 | NA | 分子相互作用数据 | NA | DNA | NA | DNA计算，分子计算 | 相较于溶液体系具有更高的特异性和计算速度 |
| 26 | 2025-10-05 |
Flow Cytometry Sorting for Random Access in DNA Data Storage: Encapsulation for Enhanced Stability and Sequence Integrity of DNA
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c04637
PMID:39319639
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于流式细胞分选技术的DNA数据存储方法，通过封装荧光DNA微粒增强数据稳定性和序列完整性 | 采用流式细胞分选技术实现DNA数据存储中的随机访问，并通过层层自组装封装技术保护DNA结构完整性 | NA | 提高DNA数据存储的长期稳定性和随机读取能力 | 封装荧光DNA微粒 | DNA数据存储 | NA | 流式细胞分选技术，层层自组装封装，微流控芯片 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 高密度DNA负载，长期稳定性，随机读取能力 |
| 27 | 2025-10-05 |
Titanium Carbide-Based Spatiotemporally Selectable-Activated Entropy-Driven DNA Nanoplatform for Amplified MicroRNA Imaging and Photothermal Therapy In Vivo
2024-10-08, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c03628
PMID:39342508
|
研究论文 | 开发了一种基于碳化钛的时空选择性激活熵驱动DNA纳米平台，用于活体内microRNA成像和光热治疗 | 通过近红外激光功率调控实现时空选择性microRNA成像和成像引导的按需治疗 | 未明确说明实验样本数量和具体技术参数 | 开发精确癌症诊断和高效治疗的纳米诊疗平台 | microRNA-21和癌细胞 | 生物医学工程 | 癌症 | 熵驱动链置换反应、光热治疗、荧光成像 | DNA纳米平台 | 荧光信号、图像数据 | NA | DNA | DNA链置换编码 | 分子计算 | 时空选择性成像和按需治疗能力 |
| 28 | 2025-10-05 |
Efficient data reconstruction: The bottleneck of large-scale application of DNA storage
2024-04-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.113699
PMID:38517891
|
综述 | 本文回顾DNA存储技术现状，分析数据重建瓶颈对大规模应用的影响 | 从数据重建角度系统分析DNA存储技术瓶颈，提出影响实际应用的关键因素 | 未提出具体解决方案，主要基于现有技术分析 | 探讨DNA存储技术在大规模应用中的数据重建瓶颈问题 | DNA存储技术及其数据重建过程 | 生物信息存储 | NA | DNA合成、DNA测序 | NA | 数字数据 | NA | DNA | NA | DNA计算 | 存储容量、持久性、重建成本与延迟 |
| 29 | 2025-01-05 |
High-Speed Sequential DNA Computing Using a Solid-State DNA Origami Register
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c01557
PMID:39735316
|
研究论文 | 本文介绍了一种固态DNA折纸寄存器，用于高速顺序DNA计算 | 设计了一种固态DNA折纸寄存器，将输出数据从3D溶液压缩到2D表面，实现了可重写的寄存器，并开发了液态电路和固态寄存器的异质集成架构，显著减少了寄存器介导的信号传输时间 | 之前的DNA折纸寄存器仅支持单次写入操作，信号传输涉及繁琐且耗时的寄存器移动，限制了顺序计算的速度 | 提高顺序DNA计算的速度，并增强DNA分子算法的可视调试和自动执行能力 | DNA折纸寄存器 | DNA计算 | NA | DNA折纸技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-12-31 |
Stationary DNA Origami Register Drives Fast Sequential DNA Computing
2024-Dec-25, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.4c02006
PMID:39735317
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-12-28 |
Exploring the Potential of DNA Computing for Complex Big Data Problems: A Case Study on the Traveling Car Renter Problem
2024-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3396142
PMID:38709614
|
研究论文 | 本文探讨了DNA计算在解决复杂大数据问题中的潜力，特别是针对旅行租车问题（TCRP）的案例研究 | 提出了一种基于Adleman-Lipton模型的DNA算法来解决TCRP问题，展示了DNA计算在并行计算中的潜力 | 研究仅通过模拟实验验证了算法的有效性，未在实际DNA计算环境中进行测试 | 探索DNA计算在解决NP难问题中的应用，特别是针对TCRP问题 | 旅行租车问题（TCRP） | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-12-28 |
Design of DNA Storage Coding Scheme With LDPC Codes and Interleaving
2024-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3379976
PMID:38512749
|
研究论文 | 本文提出了一种新的DNA存储编码方案，结合了低密度奇偶校验（LDPC）码和交织技术 | 通过使用优化的LDPC码和交织技术，显著减少了完美恢复所需的寡核苷酸读取次数，并开发了一个非均匀二进制对称通道的DNA通道模型 | 未提及具体实验样本数量及实际应用中的潜在限制 | 提高DNA存储的可靠性和解码性能 | DNA存储编码方案 | 机器学习 | NA | LDPC码, 交织技术 | LDPC | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-12-28 |
An Encoding Table Corresponding to ASCII Codes for DNA Data Storage and a New Error Correction Method HMSA
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2024.3356522
PMID:38252580
|
研究论文 | 本文提出了一种与ASCII码对应的DNA数据存储编码表及新的错误校正方法HMSA | 结合ASCII码构建了ASCII-DNA编码表，并提出了新的错误校正方法HMSA，能够校正Reads中的替换、插入和删除错误，以及连续错误 | 未提及具体实验数据或实际应用中的限制 | 标准化DNA编码系统，提高DNA数据存储的编码密度和错误校正能力 | DNA数据存储系统 | 数据存储 | NA | DNA编码、错误校正 | HMSA | 文本、音频、视频 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-12-28 |
DNA Sequences Under Multiple Guanine-Cytosine (GC) Base Pairs Constraint
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3316431
PMID:37721871
|
研究论文 | 本文提出了一种基于麻雀进化搜索算法（SESA）的DNA序列设计方法，并引入了多重GC碱基对约束以提高DNA序列的质量 | 提出了麻雀进化搜索算法（SESA）和多重GC碱基对约束，显著提高了DNA序列设计的效率和质量 | 未提及具体实验样本量或实际应用场景的验证 | 提高DNA序列设计的效率和质量，以优化DNA计算的结果 | DNA序列 | 生物信息学 | NA | DNA计算 | 麻雀进化搜索算法（SESA） | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-12-28 |
A Novel Algorithm for Solving the Prize Collecting Traveling Salesman Problem Based on DNA Computing
2024-04, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3307458
PMID:37607150
|
研究论文 | 本文提出了一种基于DNA计算的新算法，用于解决奖励收集旅行商问题（PCTSP） | 使用Adleman-Lipton模型基于DNA计算解决PCTSP，并通过模拟实验验证了该模型的可行性 | NA | 解决奖励收集旅行商问题（PCTSP）及其他组合优化问题 | 奖励收集旅行商问题（PCTSP）的开放实例 | 计算机科学 | NA | DNA计算 | Adleman-Lipton模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-12-28 |
Iterative Soft Decoding Algorithm for DNA Storage Using Quality Score and Redecoding
2024-01, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2023.3284406
PMID:37294652
|
研究论文 | 本文提出了一种新的迭代软解码算法，用于DNA存储系统中的错误纠正 | 提出了一种基于质量评分和重新解码的迭代软解码算法，提高了错误纠正码的纠正能力和DNA存储系统的鲁棒性 | NA | 提高DNA存储系统中错误纠正码的纠正能力和系统的鲁棒性 | DNA存储系统中的错误纠正 | 生物信息学 | NA | FASTQ文件分析 | 迭代软解码算法 | DNA测序数据 | 三组不同的测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-12-26 |
Random Sanitization in DNA Information Storage Using CRISPR-Cas12a
2024-Dec-25, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c11380
PMID:39658506
|
研究论文 | 本文提出了一种基于CRISPR-Cas12a的DNA信息存储随机消毒方法（RSDISC），用于实现元数据的安全擦除 | 利用CRISPR-Cas12a的侧链切割（trans-activity）特性，实现了对单链DNA（ssDNA）的选择性消毒，消毒效率高达99.9% | 目前的研究主要集中于存储和读取数据的过程，缺乏全面的元数据安全擦除解决方案 | 开发一种DNA信息存储中的随机消毒方法，以提高元数据的安全性和可管理性 | DNA信息存储中的元数据 | DNA信息存储 | NA | CRISPR-Cas12a | NA | DNA序列 | 28,258个寡核苷酸 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-12-25 |
Harnessing Demethylase-Regulated Catalytic DNA Circuit for In-Situ Investigation of the Regulatory Connection with MicroRNA
2024-Dec-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05225
PMID:39668155
|
研究论文 | 本文构建了一种由ALKBH5调节的催化DNA电路，用于在活细胞中进行miRNA的原位成像 | 本文创新性地将N6-甲基腺苷（mA）修饰的I-R3 DNAzyme引入电路组件，通过ALKBH5介导的去甲基化途径恢复其催化活性，实现了miRNA的高特异性和高灵敏度成像 | NA | 研究表观遗传调节因子与miRNA之间的潜在关联 | ALKBH5、miRNA、DNAzyme、催化DNA电路 | 生物分析 | NA | DNAzyme、催化DNA电路 | NA | DNA、miRNA | 活细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-12-20 |
Refined design of a DNA logic gate for implementing a DNA-based three-level circuit
2024-Dec-19, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d4nr03606a
PMID:39558877
|
研究论文 | 本文提出了一种改进的DNA逻辑门设计，用于实现基于DNA的三级电路 | 本文创新性地提出了三级电路设计，将输入信号分为“无”、逻辑“0”和逻辑“1”三种情况，从而解决了现有DNA电路中对OFF状态和逻辑“0”理解上的混淆 | NA | 旨在改进DNA计算电路的设计，解决现有电路中对OFF状态和逻辑“0”理解上的混淆 | DNA逻辑门和基于DNA的三级电路 | NA | NA | DNA计算 | NA | NA | 34种输入组合和12条DNA链 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-12-13 |
A rapid and inexpensive 96-well DNA-extraction method from blood using silicon dioxide powder (Glassmilk)
2024, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpae079
PMID:39659671
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用硅 dioxide 粉末（Glassmilk）从 EDTA 抗凝血中快速提取 DNA 的高通量方法 | 该方法在 96 孔深孔板中进行，无需 DNA 转移，成本低且快速，避免了昂贵或有毒的试剂 | NA | 开发一种快速、经济且适用于多种样本类型的 DNA 提取方法 | 从 EDTA 抗凝血中提取 DNA | 分子生物学 | NA | DNA 提取 | NA | DNA | 96 个样本 | NA | NA | NA | NA |