生物计算机与DNA存储相关文章
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当前共找到 6 篇文献。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-06 |
Limit and screen sequences with high degree of secondary structures in DNA storage by deep learning method
2023-11, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107548
PMID:37801922
|
研究论文 | 本文研究了如何通过深度学习方法筛选和限制DNA存储中具有高二级结构程度的序列 | 提出了一个双向长短期记忆（BiLSTM）-注意力深度学习模型来预测DNA序列的自由能，并筛选出可能产生更多错误和低测序拷贝的序列 | NA | 研究如何避免DNA序列中高二级结构对DNA存储信息写入和读取的干扰 | DNA序列的二级结构及其对DNA存储的影响 | 机器学习 | NA | 深度学习 | BiLSTM-注意力模型 | DNA序列 | 在模拟实验中使用了随机生成的DNA序列，并在真实数据集中筛选了94个预测自由能中的70个 |
| 2 | 2024-10-13 |
Processing DNA Storage through Programmable Assembly in a Droplet-Based Fluidics System
2023-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202303197
PMID:37755129
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研究论文 | 本文开发了一种在液滴控制流体系统中使用接头连接进行主动DNA数据编辑的方法 | 首次在液滴控制流体系统中实现了DNA数据的可编程组装和处理 | NA | 开发一种在DNA池中主动处理和编辑DNA数据的方法 | 合成短序列DNA池中的DNA数据处理 | 生物信息学 | NA | 接头连接 | NA | DNA序列 | 八个90 bps DNA池和八个270 bps DNA池 |
| 3 | 2024-08-06 |
Tick extracellular vesicles impair epidermal homeostasis through immune-epithelial networks during hematophagy
2023-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.10.566612
PMID:37986907
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研究论文 | 这篇文章探讨蜱的细胞外囊泡如何通过免疫上皮网络损害表皮的稳态 | 揭示了蜱细胞外囊泡对组织修复网络的影响，尤其是影响了表皮γδ T细胞频率和功能 | 研究主要集中于三种医学相关蜱，从而可能限制了结果的广泛适用性 | 研究蜱如何通过细胞外囊泡影响皮肤修复和宿主的免疫反应 | 蜱的细胞外囊泡和小鼠模型 | 数字病理学 | 脊椎动物疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）、流式细胞术、小鼠遗传学、体内显微镜 | NA | 皮肤样本 | 涉及三种医学相关蜱 |
| 4 | 2024-08-07 |
Toward Minute-Level DNA Computing: An Ultrafast, Cost-Effective, and Universal System for Lighting Up Various Concurrent DNA Logic Nanodevices (CDLNs) and Concatenated Circuits
2023-11-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c03793
PMID:37906527
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研究论文 | 本文报道了一种超快速且成本效益高的系统，用于工程化并发DNA逻辑纳米器件（CDLNs），通过结合聚胸腺嘧啶铜纳米簇（CuNCs）与SYBR Green I（SG I）作为通用双输出生产者 | 该系统利用无标记发光剂和无链置换设计的快速响应，实现了所有CDLNs在10分钟内完成，操作时间和成本分别仅为先前工作的1/12和1/4 | NA | 开发一种超快速、成本效益高且通用的系统，用于实现并发DNA逻辑纳米器件和串联电路 | 并发DNA逻辑纳米器件（CDLNs）及其串联电路 | 分子计算 | 癌症相关疾病 | DNA逻辑纳米器件 | NA | NA | NA |
| 5 | 2024-08-07 |
Flexible Self-Powered Sensing System Based on Novel DNA Circuit Strategy and Graphdiyne for Thalassemia Gene by Rapid Naked-Eye Tracking and Open-Circuit Voltage
2023-11-07, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c03841
PMID:37871958
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研究论文 | 开发了一种基于长链分支DNA纳米结构可控瞬时自组装能力和无酶核酸扩增协同效应的高灵敏度、高特异性的自供电生物传感平台 | 利用二维石墨二炔和金纳米粒子修饰的柔性碳布，通过目标地中海贫血基因CD122触发的双催化发夹组装反应，实现了对地中海贫血基因的高效双模式自供电检测 | NA | 建立一种高效的双模式自供电传感平台，用于检测地中海贫血基因CD122 | 地中海贫血基因CD122 | 生物传感技术 | 地中海贫血 | DNA纳米技术，石墨二炔，金纳米粒子 | NA | DNA，颜色信号 | 目标浓度范围为0.0001-10,000 pM，电化学模式检测限为36.3 aM，比色模式检测限为12.1 aM |
| 6 | 2024-08-07 |
Nanoclusters with specific DNA overhangs: modifying configurability, engineering contrary logic pairs and the parity generator/checker for error detection
2023-Nov-09, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d3nr04167k
PMID:37847391
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研究论文 | 本文研究了具有特定DNA悬垂的纳米团簇，通过改进其配置性，设计了相反逻辑对和奇偶生成/检查器用于错误检测 | 提出了使用DNA悬垂改进DNA纳米团簇的适应性，并设计了能够执行基本和复杂逻辑操作的纳米团簇，以及用于错误检测的奇偶生成器和检查器 | NA | 探索下一代分子计算机的替代方案，即使用DNA作为主要构建块执行布尔操作的生物计算 | DNA纳米团簇及其在生物传感应用中的潜力 | 生物计算 | NA | DNA纳米技术 | DNA纳米团簇 | DNA | NA |